More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2624 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011989  Avi_2624  uroporphyrin-III C-methyltransferase  100 
 
 
280 aa  561  1.0000000000000001e-159  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.0021256  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1746  uroporphyrin-III C-methyltransferase  74.19 
 
 
279 aa  418  1e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.124074 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2124  uroporphyrin-III C-methyltransferase  76.38 
 
 
279 aa  412  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.931539  normal  0.0136517 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2366  uroporphyrin-III C-methyltransferase  76.38 
 
 
279 aa  412  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0198893 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1888  uroporphyrin-III C-methyltransferase  72.22 
 
 
293 aa  401  1e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1297  uroporphyrin-III C-methyltransferase  71.54 
 
 
282 aa  395  1e-109  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1260  uroporphyrin-III C-methyltransferase  71.54 
 
 
282 aa  394  1e-109  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1055  uroporphyrin-III C-methyltransferase  64.44 
 
 
301 aa  358  4e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.43178  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1692  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  63.4 
 
 
281 aa  320  1.9999999999999998e-86  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.127844  normal  0.0407168 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3362  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  58.21 
 
 
291 aa  282  4.0000000000000003e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2225  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  50 
 
 
279 aa  246  4e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00956317  normal  0.224221 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5731  uroporphyrin-III C-methyltransferase  54.66 
 
 
267 aa  238  6.999999999999999e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0409  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.96 
 
 
510 aa  226  4e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0409  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.96 
 
 
511 aa  224  9e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1148  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.31 
 
 
258 aa  224  2e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.660594  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3863  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.27 
 
 
258 aa  223  3e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.707668  hitchhiker  0.0000644403 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1977  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / uroporphyrinogen-III synthase  48.37 
 
 
513 aa  222  4e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0017868  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1481  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.87 
 
 
258 aa  222  6e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.822435  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3235  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  47.81 
 
 
513 aa  221  8e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0761379  normal  0.140873 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2236  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.69 
 
 
503 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0407  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.53 
 
 
259 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2837  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  45.31 
 
 
503 aa  219  5e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.452302  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1587  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.87 
 
 
258 aa  219  5e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00363233  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1349  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.48 
 
 
258 aa  218  7e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.758533  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1549  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.08 
 
 
258 aa  218  1e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1335  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.87 
 
 
258 aa  217  2e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1308  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.87 
 
 
258 aa  217  2e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1517  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.87 
 
 
258 aa  217  2e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.58633e-17 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1445  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.87 
 
 
258 aa  217  2e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.51628  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0652  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  44.75 
 
 
493 aa  217  2e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2173  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  45.08 
 
 
489 aa  217  2e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0672  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.98 
 
 
273 aa  215  5e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00608831 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1309  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.08 
 
 
258 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1290  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.96 
 
 
258 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1682  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.89 
 
 
264 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.577733 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0687  hypothetical protein  45.12 
 
 
505 aa  213  2.9999999999999995e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.943133  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1248  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / uroporphyrinogen-III synthase  45.49 
 
 
520 aa  211  7e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.472521 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0252  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.52 
 
 
511 aa  211  7e-54  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3452  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.37 
 
 
525 aa  211  1e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.305578  normal  0.171928 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1175  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.81 
 
 
252 aa  211  1e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.4706  normal  0.0224859 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2603  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.71 
 
 
256 aa  211  1e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3286  uroporphyrinogen III synthase/methyltransferase  48.41 
 
 
515 aa  210  2e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0927  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.57 
 
 
281 aa  210  2e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0961  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.86 
 
 
281 aa  211  2e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.509191  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3409  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.57 
 
 
278 aa  209  3e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3044  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.36 
 
 
277 aa  209  3e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0358  uroporphyrin-III C-methyltransferase  50.41 
 
 
510 aa  210  3e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3559  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.71 
 
 
261 aa  209  4e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.895893  normal  0.323938 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2892  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.36 
 
 
269 aa  209  4e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0953  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.77 
 
 
278 aa  209  4e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.553083  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0863  uroporphyrin-III C-methyltransferase-like  45.12 
 
 
468 aa  208  6e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.147258  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3999  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.8 
 
 
463 aa  208  8e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.426226  hitchhiker  0.00756787 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3728  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.54 
 
 
276 aa  207  1e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2767  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.45 
 
 
503 aa  207  1e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1834  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.8 
 
 
463 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000289405 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0862  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  47.95 
 
 
276 aa  207  1e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0632575  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2089  ferrochelatase  46.91 
 
 
474 aa  207  2e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0691041  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2313  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.31 
 
 
502 aa  207  2e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2207  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.87 
 
 
507 aa  207  2e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00880064  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3073  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  47.95 
 
 
276 aa  206  2e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.419877  normal  0.821671 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0899  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  47.95 
 
 
276 aa  206  2e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3797  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.14 
 
 
269 aa  207  2e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000253578  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03694  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.03 
 
 
479 aa  206  3e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3188  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.31 
 
 
272 aa  206  3e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3403  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.02 
 
 
464 aa  205  6e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.242571 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3604  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.02 
 
 
463 aa  205  7e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.556509 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3062  uroporphyrinogen-III methylase  45.08 
 
 
513 aa  204  1e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2189  uroporphyrin-III C-methyltransferase, putative  43.44 
 
 
259 aa  204  2e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3344  siroheme synthase  44.18 
 
 
464 aa  203  3e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00903193  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3581  precorrin-2 dehydrogenase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  43.75 
 
 
464 aa  202  3e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249196  normal  0.492888 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0787  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.9 
 
 
273 aa  203  3e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.464331  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0662  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.72 
 
 
271 aa  203  3e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2922  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.31 
 
 
260 aa  202  4e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.215743  normal  0.0409844 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1679  precorrin-2 dehydrogenase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  45.68 
 
 
481 aa  202  4e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0958  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.08 
 
 
273 aa  202  5e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.297399  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3062  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.5 
 
 
512 aa  202  6e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00105684  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2471  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  43.62 
 
 
479 aa  201  9.999999999999999e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0675252  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1023  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.53 
 
 
493 aa  201  9.999999999999999e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3174  uroporphyrin-III C-methyltransferase, C-terminal:siroheme synthase, N-terminal  43.9 
 
 
464 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.108275  normal  0.319321 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2282  uroporphyrin-III C-methyltransferase-like  44.73 
 
 
264 aa  200  1.9999999999999998e-50  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2597  siroheme synthase  45.2 
 
 
465 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1160  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.29 
 
 
473 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.277445  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2610  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.89 
 
 
265 aa  200  1.9999999999999998e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0897375 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2162  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.91 
 
 
512 aa  199  3e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000123773  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1125  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase, uroporphyrinogen-III synthase  39.31 
 
 
516 aa  199  3e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.325525 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0322  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  46.41 
 
 
277 aa  199  3e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3111  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.45 
 
 
250 aa  199  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2337  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.23 
 
 
258 aa  199  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2286  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.23 
 
 
258 aa  199  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3201  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.32 
 
 
519 aa  199  3.9999999999999996e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12360  uroporphyrin-III C-methyltransferase  37.75 
 
 
579 aa  199  5e-50  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18851  putative uroporphyrin-III C-methyltransferase  41 
 
 
255 aa  199  5e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1706  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  43.61 
 
 
297 aa  199  5e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2725  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.13 
 
 
273 aa  198  7.999999999999999e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000809754 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3126  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.13 
 
 
273 aa  198  7.999999999999999e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0457  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.3 
 
 
249 aa  198  9e-50  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000204102  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3275  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  46.56 
 
 
254 aa  197  1.0000000000000001e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.413424  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2654  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  45.15 
 
 
262 aa  197  1.0000000000000001e-49  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1262  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  47.18 
 
 
284 aa  198  1.0000000000000001e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.454251  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28170  Uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.85 
 
 
464 aa  197  1.0000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>