More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3362 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A3362  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  100 
 
 
291 aa  567  1e-161  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1888  uroporphyrin-III C-methyltransferase  60.55 
 
 
293 aa  297  1e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1297  uroporphyrin-III C-methyltransferase  61.72 
 
 
282 aa  291  9e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1260  uroporphyrin-III C-methyltransferase  61.72 
 
 
282 aa  289  3e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1055  uroporphyrin-III C-methyltransferase  61.75 
 
 
301 aa  289  4e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.43178  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2624  uroporphyrin-III C-methyltransferase  58.21 
 
 
280 aa  282  4.0000000000000003e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.0021256  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2124  uroporphyrin-III C-methyltransferase  60.3 
 
 
279 aa  281  7.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.931539  normal  0.0136517 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1746  uroporphyrin-III C-methyltransferase  58.36 
 
 
279 aa  281  8.000000000000001e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.124074 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2366  uroporphyrin-III C-methyltransferase  58.8 
 
 
279 aa  276  4e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0198893 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1692  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  57.14 
 
 
281 aa  258  7e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.127844  normal  0.0407168 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2225  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  52.99 
 
 
279 aa  238  1e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00956317  normal  0.224221 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5731  uroporphyrin-III C-methyltransferase  52.87 
 
 
267 aa  220  3e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3344  siroheme synthase  49.01 
 
 
464 aa  216  5e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00903193  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3174  uroporphyrin-III C-methyltransferase, C-terminal:siroheme synthase, N-terminal  49.41 
 
 
464 aa  216  5e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.108275  normal  0.319321 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3235  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  51.03 
 
 
513 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0761379  normal  0.140873 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03694  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.31 
 
 
479 aa  213  3.9999999999999995e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2892  uroporphyrin-III C-methyltransferase  49.42 
 
 
269 aa  211  1e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3452  uroporphyrin-III C-methyltransferase  49.59 
 
 
525 aa  211  1e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.305578  normal  0.171928 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0409  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.56 
 
 
510 aa  210  2e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0672  uroporphyrin-III C-methyltransferase  50 
 
 
273 aa  210  2e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00608831 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3581  precorrin-2 dehydrogenase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  48.61 
 
 
464 aa  210  3e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249196  normal  0.492888 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3188  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.56 
 
 
272 aa  208  7e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0409  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.96 
 
 
511 aa  208  9e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2313  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.85 
 
 
502 aa  207  1e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1698  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  42.86 
 
 
458 aa  206  3e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0715064 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2314  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  49.26 
 
 
290 aa  206  3e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0400127  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0671  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.47 
 
 
482 aa  206  4e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.523068  normal  0.0127709 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28170  Uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.21 
 
 
464 aa  206  4e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2173  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  45.53 
 
 
489 aa  205  7e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0652  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  46.34 
 
 
493 aa  205  7e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0787  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.43 
 
 
273 aa  204  1e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.464331  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0662  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.37 
 
 
271 aa  204  1e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2597  siroheme synthase  46.42 
 
 
465 aa  204  1e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06660  putative uroporphyrin-III c-methyltransferase  49.41 
 
 
279 aa  204  1e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.253082  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0581  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.62 
 
 
264 aa  204  1e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03219  fused siroheme synthase 1,3-dimethyluroporphyriongen III dehydrogenase and siroheme ferrochelatase/uroporphyrinogen methyltransferase  46.94 
 
 
457 aa  203  2e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0344  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.94 
 
 
457 aa  203  2e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4679  siroheme synthase  46.4 
 
 
457 aa  204  2e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.839222 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3275  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  47.98 
 
 
254 aa  203  2e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.413424  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3650  siroheme synthase  46.94 
 
 
457 aa  203  2e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000355794 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3564  siroheme synthase  46.94 
 
 
457 aa  203  2e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03171  hypothetical protein  46.94 
 
 
457 aa  203  2e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0958  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.06 
 
 
273 aa  203  2e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.297399  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3744  siroheme synthase  46.94 
 
 
457 aa  203  2e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0344  siroheme synthase  46.94 
 
 
457 aa  203  2e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.898093 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3353  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.02 
 
 
504 aa  204  2e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.422788  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3863  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42 
 
 
258 aa  204  2e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.707668  hitchhiker  0.0000644403 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30340  siroheme synthase  46.59 
 
 
465 aa  204  2e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3838  siroheme synthase  46.94 
 
 
457 aa  204  2e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2089  ferrochelatase  46.27 
 
 
474 aa  203  3e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0691041  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3403  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.46 
 
 
464 aa  203  3e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.242571 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1258  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.77 
 
 
508 aa  202  4e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.323904  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3362  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.42 
 
 
480 aa  202  5e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0861  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.69 
 
 
472 aa  202  6e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.402872  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1481  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.2 
 
 
258 aa  201  8e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.822435  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3999  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.2 
 
 
463 aa  201  9e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.426226  hitchhiker  0.00756787 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3728  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.41 
 
 
276 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0358  uroporphyrin-III C-methyltransferase  50 
 
 
510 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1834  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.2 
 
 
463 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000289405 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2767  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.5 
 
 
503 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2471  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  45.93 
 
 
479 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0675252  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3797  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.8 
 
 
269 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000253578  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1248  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / uroporphyrinogen-III synthase  50.21 
 
 
520 aa  200  1.9999999999999998e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.472521 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3796  siroheme synthase  45.31 
 
 
457 aa  200  1.9999999999999998e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.01671 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0899  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  47.2 
 
 
276 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3044  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48 
 
 
277 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3286  uroporphyrinogen III synthase/methyltransferase  50 
 
 
515 aa  199  3e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0611  putative uroporphyrin-III c-methyltransferase  49.8 
 
 
279 aa  200  3e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.33315  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3073  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  47.2 
 
 
276 aa  200  3e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.419877  normal  0.821671 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1587  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.04 
 
 
258 aa  199  3e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00363233  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2383  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  47.58 
 
 
462 aa  200  3e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.806488  hitchhiker  0.00704026 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0862  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  47.2 
 
 
276 aa  200  3e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0632575  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0961  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.49 
 
 
281 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.509191  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0407  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.27 
 
 
259 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3062  uroporphyrinogen-III methylase  47.76 
 
 
513 aa  199  5e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3604  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.4 
 
 
463 aa  199  5e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.556509 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0927  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.49 
 
 
281 aa  199  5e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1262  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  50.59 
 
 
284 aa  199  5e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.454251  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1679  precorrin-2 dehydrogenase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  45.34 
 
 
481 aa  199  5e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3409  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.49 
 
 
278 aa  199  6e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1309  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.77 
 
 
258 aa  199  6e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0863  uroporphyrin-III C-methyltransferase-like  46.18 
 
 
468 aa  199  6e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.147258  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2603  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.6 
 
 
256 aa  198  7e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1549  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.04 
 
 
258 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1335  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.04 
 
 
258 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1308  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.04 
 
 
258 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3519  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.66 
 
 
480 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.605082  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1445  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.04 
 
 
258 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.51628  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3062  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.16 
 
 
512 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00105684  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1517  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.04 
 
 
258 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.58633e-17 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1668  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.82 
 
 
271 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.228653  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0953  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.49 
 
 
278 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.553083  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3751  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.22 
 
 
282 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0298  fused siroheme synthase 1,3-dimethyluroporphyriongen III dehydrogenase and siroheme ferrochelatase and uroporphyrinogen methyltransferase  46.85 
 
 
472 aa  197  1.0000000000000001e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2837  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  45.68 
 
 
503 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.452302  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1107  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.95 
 
 
487 aa  197  2.0000000000000003e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0215  siroheme synthase  44.26 
 
 
462 aa  197  2.0000000000000003e-49  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4598  siroheme synthase  46.03 
 
 
467 aa  196  3e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1065  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  44.35 
 
 
554 aa  196  3e-49  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1397  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.14 
 
 
528 aa  196  3e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>