More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1649 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1649  uroporphyrin-III C-methyltransferase  100 
 
 
264 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.783334  normal  0.0340554 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4999  uroporphyrin-III C-methyltransferase  90.16 
 
 
262 aa  423  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.162469  hitchhiker  0.0000174023 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3154  uroporphyrin-III C-methyltransferase  79.67 
 
 
247 aa  352  2.9999999999999997e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.345129  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1573  uroporphyrin-III C-methyltransferase  73.31 
 
 
249 aa  332  5e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.147682 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1554  uroporphyrin-III C-methyltransferase  73.73 
 
 
294 aa  331  8e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.344973  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1174  uroporphyrin-III C-methyltransferase  73.42 
 
 
269 aa  330  2e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.496299  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1654  uroporphyrin-III C-methyltransferase  73.31 
 
 
249 aa  329  3e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1585  uroporphyrin-III C-methyltransferase  72.57 
 
 
339 aa  327  9e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0657013 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1628  uroporphyrin-III C-methyltransferase  72.57 
 
 
294 aa  324  7e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.743744  normal  0.0196415 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4802  uroporphyrin-III C-methyltransferase  72.03 
 
 
249 aa  300  2e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.284814  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0322  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  56.67 
 
 
277 aa  250  1e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3532  uroporphyrin-III C-methyltransferase  54.83 
 
 
268 aa  241  6e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.607966  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3281  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  54.66 
 
 
274 aa  239  5e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.429285  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2847  uroporphyrin-III C-methyltransferase  53.04 
 
 
274 aa  238  6.999999999999999e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.817208  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1402  uroporphyrin-III C-methyltransferase  51.98 
 
 
261 aa  238  9e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.492452 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3168  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  50.59 
 
 
285 aa  236  3e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41563  uroporphyrin-III C-methyltransferase  54.35 
 
 
245 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0110837  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2332  uroporphyrin-III C-methyltransferase  50.81 
 
 
269 aa  229  3e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0126754  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2883  uroporphyrin-III C-methyltransferase  53.19 
 
 
288 aa  229  4e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3528  uroporphyrin-III C-methyltransferase  53.04 
 
 
245 aa  228  7e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0179276  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2843  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  50.81 
 
 
269 aa  228  7e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2093  uroporphyrin-III C-methyltransferase  52.81 
 
 
247 aa  227  1e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0878943  normal  0.0902648 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23340  uroporphyrin-III C-methyltransferase  51.9 
 
 
245 aa  226  4e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00949185  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2098  uroporphyrin-III C-methyltransferase  51.28 
 
 
253 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00176224  decreased coverage  0.00158802 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1778  uroporphyrin-III C-methyltransferase  52.99 
 
 
250 aa  221  7e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0293205  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2090  uroporphyrin-III C-methyltransferase  54.35 
 
 
246 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.505615  normal  0.0362421 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2321  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  53.88 
 
 
259 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.842595  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2368  uroporphyrin-III C-methyltransferase  52.16 
 
 
270 aa  220  1.9999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3650  uroporphyrin-III C-methyltransferase  53.91 
 
 
246 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000265889  normal  0.852152 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2300  uroporphyrin-III C-methyltransferase  50.43 
 
 
253 aa  219  3e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00412694  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1608  uroporphyrin-III C-methyltransferase  53.25 
 
 
246 aa  218  7e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000713921  decreased coverage  0.000000000148067 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3188  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.94 
 
 
272 aa  216  2e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2292  uroporphyrin-III C-methyltransferase  52.72 
 
 
308 aa  216  2.9999999999999998e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.318843  normal  0.152428 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3126  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.23 
 
 
273 aa  214  8e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2725  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.23 
 
 
273 aa  214  8e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000809754 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3697  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.42 
 
 
254 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.748365 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3044  uroporphyrin-III C-methyltransferase  49.36 
 
 
277 aa  212  5.999999999999999e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0672  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.96 
 
 
273 aa  209  3e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00608831 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3797  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.51 
 
 
269 aa  209  4e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000253578  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0953  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.09 
 
 
278 aa  209  5e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.553083  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0671  uroporphyrin-III C-methyltransferase  49.8 
 
 
482 aa  208  6e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.523068  normal  0.0127709 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3409  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.09 
 
 
278 aa  207  1e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0961  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.09 
 
 
281 aa  207  1e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.509191  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0927  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.09 
 
 
281 aa  207  1e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0407  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.15 
 
 
259 aa  206  2e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0958  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.25 
 
 
273 aa  206  2e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.297399  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2103  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  52.42 
 
 
286 aa  205  8e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.161364  normal  0.623336 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1371  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.88 
 
 
502 aa  204  1e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18271  putative uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.38 
 
 
261 aa  204  2e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0787  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.66 
 
 
273 aa  204  2e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.464331  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18851  putative uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.96 
 
 
267 aa  202  5e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3675  siroheme synthase  48.07 
 
 
457 aa  202  6e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18851  putative uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.95 
 
 
255 aa  202  6e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19041  putative uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.16 
 
 
267 aa  202  6e-51  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.166851  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1601  uroporphyrin-III C-methyltransferase  50.87 
 
 
246 aa  201  7e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000170962  hitchhiker  0.00445927 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1055  uroporphyrin-III C-methyltransferase  49.57 
 
 
301 aa  201  8e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.43178  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3073  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  46.81 
 
 
276 aa  201  8e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.419877  normal  0.821671 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28170  Uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.84 
 
 
464 aa  201  9e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0862  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  46.38 
 
 
276 aa  201  9e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0632575  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2492  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.21 
 
 
272 aa  201  9.999999999999999e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0232  siroheme synthase  46.09 
 
 
473 aa  201  9.999999999999999e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3959  siroheme synthase  46.09 
 
 
473 aa  201  9.999999999999999e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1175  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.19 
 
 
252 aa  201  9.999999999999999e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.4706  normal  0.0224859 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3846  siroheme synthase  47.64 
 
 
457 aa  200  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.130759  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3675  siroheme synthase  47.64 
 
 
459 aa  200  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5019  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  48.73 
 
 
261 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03694  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.74 
 
 
479 aa  200  1.9999999999999998e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3749  siroheme synthase  47.64 
 
 
457 aa  200  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.848215 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3719  siroheme synthase  46.09 
 
 
470 aa  200  1.9999999999999998e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.411824  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3784  siroheme synthase  47.64 
 
 
457 aa  200  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0899  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  46.38 
 
 
276 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2236  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.07 
 
 
503 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3174  uroporphyrin-III C-methyltransferase, C-terminal:siroheme synthase, N-terminal  47.41 
 
 
464 aa  199  3e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.108275  normal  0.319321 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3581  precorrin-2 dehydrogenase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  46.64 
 
 
464 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249196  normal  0.492888 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1443  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.58 
 
 
276 aa  199  3.9999999999999996e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.224793  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2207  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.7 
 
 
507 aa  199  3.9999999999999996e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00880064  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3728  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.96 
 
 
276 aa  199  5e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1787  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  39.36 
 
 
267 aa  199  6e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.159983  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1744  uroporphyrin-III C-methyltransferase  50.64 
 
 
263 aa  198  9e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1104  uroporphyrin-III C-methyltransferase  51.72 
 
 
275 aa  197  2.0000000000000003e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.217718  normal  0.455501 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3344  siroheme synthase  46.98 
 
 
464 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00903193  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2383  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  45.99 
 
 
462 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.806488  hitchhiker  0.00704026 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4598  siroheme synthase  46.09 
 
 
467 aa  197  2.0000000000000003e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30340  siroheme synthase  46.44 
 
 
465 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2013  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.71 
 
 
283 aa  196  2.0000000000000003e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.757619  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2597  siroheme synthase  46.86 
 
 
465 aa  196  3e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3796  siroheme synthase  46.78 
 
 
457 aa  196  3e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.01671 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2837  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  43.64 
 
 
503 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.452302  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2728  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.08 
 
 
277 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3717  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.15 
 
 
288 aa  195  5.000000000000001e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1682  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.35 
 
 
264 aa  195  5.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.577733 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1679  precorrin-2 dehydrogenase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  46.12 
 
 
481 aa  196  5.000000000000001e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3201  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.19 
 
 
519 aa  195  5.000000000000001e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2337  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.03 
 
 
258 aa  195  6e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4679  siroheme synthase  45.92 
 
 
457 aa  195  6e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.839222 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2286  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.03 
 
 
258 aa  195  6e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3744  siroheme synthase  45.92 
 
 
457 aa  195  6e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1546  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.02 
 
 
283 aa  195  6e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.402925  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5891  siroheme synthase  46.15 
 
 
493 aa  195  7e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3838  siroheme synthase  45.92 
 
 
457 aa  195  7e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>