More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2847 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012791  Vapar_2847  uroporphyrin-III C-methyltransferase  100 
 
 
274 aa  537  9.999999999999999e-153  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.817208  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2883  uroporphyrin-III C-methyltransferase  76.19 
 
 
288 aa  379  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2368  uroporphyrin-III C-methyltransferase  72.14 
 
 
270 aa  367  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1402  uroporphyrin-III C-methyltransferase  75.31 
 
 
261 aa  368  1e-101  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.492452 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2843  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  73.68 
 
 
269 aa  364  1e-100  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2332  uroporphyrin-III C-methyltransferase  72.33 
 
 
269 aa  364  1e-99  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0126754  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3281  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  75.41 
 
 
274 aa  362  5.0000000000000005e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.429285  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3532  uroporphyrin-III C-methyltransferase  75.3 
 
 
268 aa  357  1.9999999999999998e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.607966  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2292  uroporphyrin-III C-methyltransferase  69.29 
 
 
308 aa  342  5e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.318843  normal  0.152428 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2103  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  78.26 
 
 
286 aa  340  1e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.161364  normal  0.623336 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2321  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  63.56 
 
 
259 aa  285  4e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.842595  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0322  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  55.74 
 
 
277 aa  256  4e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3697  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.66 
 
 
254 aa  237  2e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.748365 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1174  uroporphyrin-III C-methyltransferase  52.67 
 
 
269 aa  237  2e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.496299  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1654  uroporphyrin-III C-methyltransferase  52.16 
 
 
249 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1778  uroporphyrin-III C-methyltransferase  52.89 
 
 
250 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0293205  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41563  uroporphyrin-III C-methyltransferase  51.65 
 
 
245 aa  231  7.000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0110837  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2098  uroporphyrin-III C-methyltransferase  52.77 
 
 
253 aa  231  1e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00176224  decreased coverage  0.00158802 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1628  uroporphyrin-III C-methyltransferase  51.91 
 
 
294 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.743744  normal  0.0196415 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3528  uroporphyrin-III C-methyltransferase  51.24 
 
 
245 aa  230  1e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0179276  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2300  uroporphyrin-III C-methyltransferase  52.77 
 
 
253 aa  230  2e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00412694  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1585  uroporphyrin-III C-methyltransferase  50.78 
 
 
339 aa  227  1e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0657013 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23340  uroporphyrin-III C-methyltransferase  53.02 
 
 
245 aa  226  3e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00949185  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1573  uroporphyrin-III C-methyltransferase  50.59 
 
 
249 aa  226  3e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.147682 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1554  uroporphyrin-III C-methyltransferase  50.76 
 
 
294 aa  226  4e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.344973  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2093  uroporphyrin-III C-methyltransferase  50.64 
 
 
247 aa  224  1e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0878943  normal  0.0902648 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1649  uroporphyrin-III C-methyltransferase  53.04 
 
 
264 aa  223  3e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.783334  normal  0.0340554 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0672  uroporphyrin-III C-methyltransferase  49.8 
 
 
273 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00608831 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1443  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.06 
 
 
276 aa  219  3.9999999999999997e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.224793  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3650  uroporphyrin-III C-methyltransferase  51.5 
 
 
246 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000265889  normal  0.852152 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2090  uroporphyrin-III C-methyltransferase  51.07 
 
 
246 aa  217  1e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.505615  normal  0.0362421 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2492  uroporphyrin-III C-methyltransferase  50.84 
 
 
272 aa  216  2.9999999999999998e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3154  uroporphyrin-III C-methyltransferase  49.22 
 
 
247 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.345129  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1608  uroporphyrin-III C-methyltransferase  52.1 
 
 
246 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000713921  decreased coverage  0.000000000148067 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4999  uroporphyrin-III C-methyltransferase  52.94 
 
 
262 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.162469  hitchhiker  0.0000174023 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3797  uroporphyrin-III C-methyltransferase  49.58 
 
 
269 aa  211  7e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000253578  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4802  uroporphyrin-III C-methyltransferase  49.8 
 
 
249 aa  211  7.999999999999999e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.284814  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2728  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.33 
 
 
277 aa  211  1e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1601  uroporphyrin-III C-methyltransferase  51.27 
 
 
246 aa  209  3e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000170962  hitchhiker  0.00445927 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1546  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.77 
 
 
277 aa  209  5e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.746626  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3168  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  49.16 
 
 
285 aa  208  8e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0927  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.7 
 
 
281 aa  206  2e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0961  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.7 
 
 
281 aa  206  2e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.509191  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3728  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.06 
 
 
276 aa  206  3e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1341  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  51.53 
 
 
284 aa  206  3e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.605284 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0958  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.25 
 
 
273 aa  206  3e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.297399  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0862  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  46.06 
 
 
276 aa  206  3e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0632575  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3409  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.7 
 
 
278 aa  206  4e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0899  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  46.06 
 
 
276 aa  205  6e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0953  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.28 
 
 
278 aa  204  1e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.553083  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28170  Uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.15 
 
 
464 aa  204  1e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2383  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  47.11 
 
 
462 aa  204  1e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.806488  hitchhiker  0.00704026 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3044  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.28 
 
 
277 aa  204  1e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0407  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.75 
 
 
259 aa  203  2e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3073  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  46.06 
 
 
276 aa  204  2e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.419877  normal  0.821671 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18851  putative uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.83 
 
 
267 aa  202  4e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19041  putative uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.42 
 
 
267 aa  202  5e-51  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.166851  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0334  uroporphyrin-III C-methyltransferase  54.01 
 
 
340 aa  201  9e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.839237  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3999  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.48 
 
 
463 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.426226  hitchhiker  0.00756787 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1089  uroporphyrin-III C-methyltransferase  54.01 
 
 
274 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.352107  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0245  uroporphyrin-III C-methyltransferase  54.01 
 
 
340 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1787  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  45 
 
 
267 aa  201  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.159983  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3188  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.67 
 
 
272 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1546  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.84 
 
 
283 aa  201  9.999999999999999e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.402925  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1669  uroporphyrin-III C-methyltransferase  54.01 
 
 
271 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0086  uroporphyrin-III C-methyltransferase  54.01 
 
 
271 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.57137  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3717  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.15 
 
 
288 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1834  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.48 
 
 
463 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000289405 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1758  uroporphyrin-III C-methyltransferase  54.01 
 
 
271 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0787  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.63 
 
 
273 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.464331  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1254  uroporphyrin-III C-methyltransferase  54.01 
 
 
271 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.206282  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2356  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  44.49 
 
 
262 aa  199  3e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.463328  normal  0.682274 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2892  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.6 
 
 
269 aa  200  3e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3403  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.06 
 
 
464 aa  199  5e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.242571 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0662  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.06 
 
 
271 aa  198  7e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1324  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.68 
 
 
309 aa  198  7.999999999999999e-50  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.867605  normal  0.902463 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3751  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.66 
 
 
282 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2173  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  44.54 
 
 
489 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5795  uroporphyrin-III C-methyltransferase  55.32 
 
 
253 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.685084 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3604  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.64 
 
 
463 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.556509 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18851  putative uroporphyrin-III C-methyltransferase  45 
 
 
255 aa  197  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3275  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  46.41 
 
 
254 aa  196  3e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.413424  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3939  uroporphyrin-III C-methyltransferase  50.38 
 
 
283 aa  196  3e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.158955  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3126  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.64 
 
 
273 aa  196  4.0000000000000005e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2725  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.64 
 
 
273 aa  196  4.0000000000000005e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000809754 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4598  siroheme synthase  48.96 
 
 
467 aa  196  4.0000000000000005e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0861  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.48 
 
 
472 aa  196  5.000000000000001e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.402872  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1682  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.87 
 
 
264 aa  196  5.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.577733 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4402  uroporphyrin-III C-methyltransferase  50.38 
 
 
256 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.163503 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2597  siroheme synthase  44.44 
 
 
465 aa  195  8.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2837  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  43.51 
 
 
503 aa  195  8.000000000000001e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.452302  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2767  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.93 
 
 
503 aa  194  9e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2236  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.51 
 
 
503 aa  194  1e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1105  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  44.4 
 
 
250 aa  194  1e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000034343  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3859  uroporphyrin-III C-methyltransferase  54.89 
 
 
253 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.954911  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30340  siroheme synthase  44.03 
 
 
465 aa  194  1e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4509  uroporphyrin-III C-methyltransferase  54.89 
 
 
253 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.000349091  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2471  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  43.75 
 
 
479 aa  193  2e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0675252  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2762  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.06 
 
 
476 aa  194  2e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1168  uroporphyrin-III C-methyltransferase  54.01 
 
 
291 aa  194  2e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0427419  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>