More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3697 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_3697  uroporphyrin-III C-methyltransferase  100 
 
 
254 aa  510  1e-144  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.748365 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1341  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  70 
 
 
284 aa  299  2e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.605284 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2215  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  70.29 
 
 
271 aa  297  1e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.704087  hitchhiker  0.00815746 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1089  uroporphyrin-III C-methyltransferase  71.67 
 
 
274 aa  296  3e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.352107  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0334  uroporphyrin-III C-methyltransferase  71.67 
 
 
340 aa  295  3e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.839237  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0245  uroporphyrin-III C-methyltransferase  71.67 
 
 
340 aa  295  4e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4402  uroporphyrin-III C-methyltransferase  69.58 
 
 
256 aa  294  9e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.163503 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1669  uroporphyrin-III C-methyltransferase  71.61 
 
 
271 aa  293  2e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1254  uroporphyrin-III C-methyltransferase  71.61 
 
 
271 aa  293  2e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.206282  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1758  uroporphyrin-III C-methyltransferase  71.61 
 
 
271 aa  293  2e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0086  uroporphyrin-III C-methyltransferase  71.61 
 
 
271 aa  293  2e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.57137  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1982  uroporphyrin-III C-methyltransferase  70.12 
 
 
271 aa  292  3e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.663973  normal  0.9283 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3939  uroporphyrin-III C-methyltransferase  69.17 
 
 
283 aa  293  3e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.158955  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4145  uroporphyrin-III C-methyltransferase  71.19 
 
 
255 aa  291  9e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0746757 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1168  uroporphyrin-III C-methyltransferase  70.42 
 
 
291 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0427419  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3859  uroporphyrin-III C-methyltransferase  69.13 
 
 
253 aa  278  8e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.954911  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4509  uroporphyrin-III C-methyltransferase  69.13 
 
 
253 aa  278  8e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.000349091  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5795  uroporphyrin-III C-methyltransferase  69.13 
 
 
253 aa  278  8e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.685084 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1402  uroporphyrin-III C-methyltransferase  52.4 
 
 
261 aa  239  2.9999999999999997e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.492452 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2847  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.66 
 
 
274 aa  234  1.0000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.817208  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0322  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  49.38 
 
 
277 aa  230  1e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3532  uroporphyrin-III C-methyltransferase  53.36 
 
 
268 aa  228  7e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.607966  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2321  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  50.62 
 
 
259 aa  224  7e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.842595  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2368  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.48 
 
 
270 aa  222  4.9999999999999996e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2332  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.37 
 
 
269 aa  222  4.9999999999999996e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0126754  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2883  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.43 
 
 
288 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2843  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  48.32 
 
 
269 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3281  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  50.21 
 
 
274 aa  216  2.9999999999999998e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.429285  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2292  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.3 
 
 
308 aa  213  1.9999999999999998e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.318843  normal  0.152428 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5019  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  50.2 
 
 
261 aa  212  4.9999999999999996e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3168  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  51.52 
 
 
285 aa  211  7.999999999999999e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41563  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.86 
 
 
245 aa  207  1e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0110837  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1628  uroporphyrin-III C-methyltransferase  50 
 
 
294 aa  206  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.743744  normal  0.0196415 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2300  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.39 
 
 
253 aa  205  5e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00412694  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1585  uroporphyrin-III C-methyltransferase  50.67 
 
 
339 aa  205  5e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0657013 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2098  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.39 
 
 
253 aa  205  7e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00176224  decreased coverage  0.00158802 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1654  uroporphyrin-III C-methyltransferase  49.78 
 
 
249 aa  205  7e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3650  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45 
 
 
246 aa  204  9e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000265889  normal  0.852152 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2090  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.58 
 
 
246 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.505615  normal  0.0362421 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1174  uroporphyrin-III C-methyltransferase  49.78 
 
 
269 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.496299  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3154  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.37 
 
 
247 aa  204  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.345129  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2103  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  49.13 
 
 
286 aa  203  2e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.161364  normal  0.623336 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3528  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.83 
 
 
245 aa  203  2e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0179276  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4999  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.33 
 
 
262 aa  203  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.162469  hitchhiker  0.0000174023 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1601  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.08 
 
 
246 aa  202  3e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000170962  hitchhiker  0.00445927 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1573  uroporphyrin-III C-methyltransferase  49.78 
 
 
249 aa  201  8e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.147682 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1778  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.36 
 
 
250 aa  201  8e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0293205  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23340  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.08 
 
 
245 aa  201  9.999999999999999e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00949185  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1554  uroporphyrin-III C-methyltransferase  49.78 
 
 
294 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.344973  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1608  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.98 
 
 
246 aa  199  3e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000713921  decreased coverage  0.000000000148067 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1649  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.9 
 
 
264 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.783334  normal  0.0340554 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2093  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.12 
 
 
247 aa  194  8.000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0878943  normal  0.0902648 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0407  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.02 
 
 
259 aa  190  2e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0672  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.16 
 
 
273 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00608831 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4802  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.11 
 
 
249 aa  181  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.284814  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2597  siroheme synthase  43.64 
 
 
465 aa  181  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0958  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.74 
 
 
273 aa  180  2e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.297399  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30340  siroheme synthase  43.59 
 
 
465 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3188  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.61 
 
 
272 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2725  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.53 
 
 
273 aa  178  5.999999999999999e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000809754 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3126  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.53 
 
 
273 aa  178  5.999999999999999e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03694  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.31 
 
 
479 aa  178  7e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2892  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.99 
 
 
269 aa  177  1e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0953  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.34 
 
 
278 aa  175  8e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.553083  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0961  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.87 
 
 
281 aa  175  8e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.509191  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1077  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.63 
 
 
490 aa  174  9e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0490237  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0927  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.87 
 
 
281 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3797  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.3 
 
 
269 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000253578  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3344  siroheme synthase  42.13 
 
 
464 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00903193  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3174  uroporphyrin-III C-methyltransferase, C-terminal:siroheme synthase, N-terminal  42.55 
 
 
464 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.108275  normal  0.319321 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3409  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.87 
 
 
278 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0787  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.87 
 
 
273 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.464331  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1371  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.7 
 
 
502 aa  173  1.9999999999999998e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4048  siroheme synthase  37.45 
 
 
459 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3675  siroheme synthase  42.62 
 
 
459 aa  172  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3784  siroheme synthase  42.62 
 
 
457 aa  172  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3749  siroheme synthase  42.62 
 
 
457 aa  172  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.848215 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3846  siroheme synthase  42.62 
 
 
457 aa  172  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.130759  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0795  siroheme synthase (Includes: Uroporphyrin-III C-methyltransferase, Precorrin-2 dehydrogenase,Sirohydrochlorin ferrochelatase)  40.09 
 
 
275 aa  172  5.999999999999999e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.751719  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1718  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.8 
 
 
314 aa  172  5.999999999999999e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1834  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.61 
 
 
463 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000289405 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1913  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.8 
 
 
282 aa  172  6.999999999999999e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.530784  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3999  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.61 
 
 
463 aa  171  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.426226  hitchhiker  0.00756787 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28170  Uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.63 
 
 
464 aa  171  6.999999999999999e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0417  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.49 
 
 
462 aa  171  6.999999999999999e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3403  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.63 
 
 
464 aa  171  9e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.242571 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3675  siroheme synthase  42.19 
 
 
457 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3044  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40 
 
 
277 aa  171  1e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3604  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.17 
 
 
463 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.556509 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3581  precorrin-2 dehydrogenase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  42.92 
 
 
464 aa  171  1e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249196  normal  0.492888 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2313  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.17 
 
 
502 aa  171  1e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5891  siroheme synthase  42.62 
 
 
493 aa  171  1e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2492  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.51 
 
 
272 aa  171  1e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2471  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  39.91 
 
 
479 aa  170  2e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0675252  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0662  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.3 
 
 
271 aa  170  2e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2173  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  38.63 
 
 
489 aa  169  3e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1636  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.16 
 
 
478 aa  169  6e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0591457  normal  0.234749 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3728  uroporphyrin-III C-methyltransferase  39.74 
 
 
276 aa  168  6e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0173  siroheme synthase  41.06 
 
 
478 aa  168  6e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0862  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  39.57 
 
 
276 aa  169  6e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0632575  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>