More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_1982 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_1982  uroporphyrin-III C-methyltransferase  100 
 
 
271 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.663973  normal  0.9283 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2215  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  91.14 
 
 
271 aa  443  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.704087  hitchhiker  0.00815746 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3697  uroporphyrin-III C-methyltransferase  70.12 
 
 
254 aa  338  4e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.748365 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1168  uroporphyrin-III C-methyltransferase  77.47 
 
 
291 aa  324  1e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0427419  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1089  uroporphyrin-III C-methyltransferase  76.57 
 
 
274 aa  318  6e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.352107  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0245  uroporphyrin-III C-methyltransferase  76.57 
 
 
340 aa  318  7e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1341  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  77.22 
 
 
284 aa  318  7e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.605284 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0334  uroporphyrin-III C-methyltransferase  76.57 
 
 
340 aa  318  7e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.839237  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1254  uroporphyrin-III C-methyltransferase  76.92 
 
 
271 aa  316  3e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.206282  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0086  uroporphyrin-III C-methyltransferase  76.92 
 
 
271 aa  316  3e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.57137  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1669  uroporphyrin-III C-methyltransferase  76.92 
 
 
271 aa  316  3e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1758  uroporphyrin-III C-methyltransferase  76.92 
 
 
271 aa  316  3e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4402  uroporphyrin-III C-methyltransferase  78.75 
 
 
256 aa  311  7.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.163503 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3939  uroporphyrin-III C-methyltransferase  77.69 
 
 
283 aa  311  1e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.158955  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4145  uroporphyrin-III C-methyltransferase  77.54 
 
 
255 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0746757 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3859  uroporphyrin-III C-methyltransferase  78.95 
 
 
253 aa  296  3e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.954911  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4509  uroporphyrin-III C-methyltransferase  78.95 
 
 
253 aa  296  3e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.000349091  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5795  uroporphyrin-III C-methyltransferase  78.95 
 
 
253 aa  295  4e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.685084 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1402  uroporphyrin-III C-methyltransferase  51.55 
 
 
261 aa  240  2e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.492452 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0322  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  54.43 
 
 
277 aa  239  4e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3168  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  55.13 
 
 
285 aa  229  5e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2332  uroporphyrin-III C-methyltransferase  50.84 
 
 
269 aa  225  5.0000000000000005e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0126754  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2843  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  50.84 
 
 
269 aa  225  6e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1601  uroporphyrin-III C-methyltransferase  52.36 
 
 
246 aa  225  7e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000170962  hitchhiker  0.00445927 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3528  uroporphyrin-III C-methyltransferase  53.28 
 
 
245 aa  224  1e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0179276  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41563  uroporphyrin-III C-methyltransferase  51.68 
 
 
245 aa  224  2e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0110837  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2292  uroporphyrin-III C-methyltransferase  51.44 
 
 
308 aa  222  4e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.318843  normal  0.152428 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3650  uroporphyrin-III C-methyltransferase  51.07 
 
 
246 aa  221  7e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000265889  normal  0.852152 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5019  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  53.17 
 
 
261 aa  221  9e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2090  uroporphyrin-III C-methyltransferase  50.64 
 
 
246 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.505615  normal  0.0362421 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1608  uroporphyrin-III C-methyltransferase  50.86 
 
 
246 aa  219  5e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000713921  decreased coverage  0.000000000148067 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1585  uroporphyrin-III C-methyltransferase  54.22 
 
 
339 aa  217  1e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0657013 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3532  uroporphyrin-III C-methyltransferase  50.83 
 
 
268 aa  217  2e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.607966  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2368  uroporphyrin-III C-methyltransferase  51.05 
 
 
270 aa  217  2e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2847  uroporphyrin-III C-methyltransferase  51.07 
 
 
274 aa  215  5.9999999999999996e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.817208  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2883  uroporphyrin-III C-methyltransferase  51.48 
 
 
288 aa  215  7e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1654  uroporphyrin-III C-methyltransferase  52.44 
 
 
249 aa  215  8e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2098  uroporphyrin-III C-methyltransferase  49.37 
 
 
253 aa  214  9e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00176224  decreased coverage  0.00158802 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1174  uroporphyrin-III C-methyltransferase  52.44 
 
 
269 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.496299  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2093  uroporphyrin-III C-methyltransferase  50.22 
 
 
247 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0878943  normal  0.0902648 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2300  uroporphyrin-III C-methyltransferase  49.37 
 
 
253 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00412694  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3281  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  50.21 
 
 
274 aa  213  3.9999999999999995e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.429285  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1628  uroporphyrin-III C-methyltransferase  52 
 
 
294 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.743744  normal  0.0196415 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2321  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  51.74 
 
 
259 aa  211  1e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.842595  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4999  uroporphyrin-III C-methyltransferase  51.28 
 
 
262 aa  211  1e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.162469  hitchhiker  0.0000174023 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1573  uroporphyrin-III C-methyltransferase  51.56 
 
 
249 aa  210  2e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.147682 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1778  uroporphyrin-III C-methyltransferase  50 
 
 
250 aa  209  5e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0293205  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23340  uroporphyrin-III C-methyltransferase  50.22 
 
 
245 aa  208  6e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00949185  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1554  uroporphyrin-III C-methyltransferase  51.11 
 
 
294 aa  207  1e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.344973  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1649  uroporphyrin-III C-methyltransferase  49.15 
 
 
264 aa  204  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.783334  normal  0.0340554 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2103  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  51.52 
 
 
286 aa  199  5e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.161364  normal  0.623336 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4802  uroporphyrin-III C-methyltransferase  52 
 
 
249 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.284814  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3154  uroporphyrin-III C-methyltransferase  49.33 
 
 
247 aa  191  1e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.345129  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2356  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  42.8 
 
 
262 aa  175  9e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.463328  normal  0.682274 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1077  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.19 
 
 
490 aa  173  1.9999999999999998e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0490237  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0672  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.59 
 
 
273 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00608831 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2767  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.13 
 
 
503 aa  171  7.999999999999999e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4048  siroheme synthase  38.78 
 
 
459 aa  171  1e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1104  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.92 
 
 
275 aa  170  2e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.217718  normal  0.455501 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18851  putative uroporphyrin-III C-methyltransferase  37.84 
 
 
255 aa  171  2e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3188  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.92 
 
 
272 aa  170  2e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3717  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.83 
 
 
288 aa  170  3e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2837  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  42.55 
 
 
503 aa  169  5e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.452302  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2725  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.26 
 
 
273 aa  168  9e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000809754 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3126  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.26 
 
 
273 aa  168  9e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2236  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.13 
 
 
503 aa  168  1e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3728  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.49 
 
 
276 aa  168  1e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0787  uroporphyrin-III C-methyltransferase  38.55 
 
 
273 aa  167  2e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.464331  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3719  siroheme synthase  37.98 
 
 
470 aa  167  2e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.411824  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2654  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  41.06 
 
 
262 aa  167  2e-40  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3959  siroheme synthase  37.98 
 
 
473 aa  167  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0958  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.63 
 
 
273 aa  167  2e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.297399  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0232  siroheme synthase  37.98 
 
 
473 aa  167  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3044  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.91 
 
 
277 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2253  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.83 
 
 
266 aa  166  2.9999999999999998e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.270146  normal  0.0491456 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1679  precorrin-2 dehydrogenase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  39.92 
 
 
481 aa  165  5.9999999999999996e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0961  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.49 
 
 
281 aa  165  6.9999999999999995e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.509191  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3409  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.49 
 
 
278 aa  165  8e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0953  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.49 
 
 
278 aa  165  8e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.553083  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0927  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.49 
 
 
281 aa  165  8e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0662  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.06 
 
 
271 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2282  uroporphyrin-III C-methyltransferase-like  39.25 
 
 
264 aa  164  1.0000000000000001e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3179  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  43.4 
 
 
264 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.525633  normal  0.911093 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2603  uroporphyrin-III C-methyltransferase  39.74 
 
 
256 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4598  siroheme synthase  40 
 
 
467 aa  164  2.0000000000000002e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3559  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.28 
 
 
261 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.895893  normal  0.323938 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1744  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.51 
 
 
263 aa  164  2.0000000000000002e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0795  siroheme synthase (Includes: Uroporphyrin-III C-methyltransferase, Precorrin-2 dehydrogenase,Sirohydrochlorin ferrochelatase)  39.91 
 
 
275 aa  163  3e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.751719  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3797  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.2 
 
 
269 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000253578  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0862  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  40.77 
 
 
276 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0632575  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1682  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.95 
 
 
264 aa  162  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.577733 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0407  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.03 
 
 
259 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2207  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.92 
 
 
507 aa  162  5.0000000000000005e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00880064  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3871  siroheme synthase  37.55 
 
 
459 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.560083  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3269  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.9 
 
 
317 aa  162  7e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.848441  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3751  uroporphyrin-III C-methyltransferase  38.2 
 
 
282 aa  162  7e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2089  ferrochelatase  39.26 
 
 
474 aa  161  8.000000000000001e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0691041  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1233  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.19 
 
 
254 aa  161  9e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.323489  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18851  putative uroporphyrin-III C-methyltransferase  40 
 
 
267 aa  161  9e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0899  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  40.77 
 
 
276 aa  161  1e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>