More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3939 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008391  Bamb_3939  uroporphyrin-III C-methyltransferase  100 
 
 
283 aa  554  1e-157  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.158955  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4402  uroporphyrin-III C-methyltransferase  99.22 
 
 
256 aa  495  1e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.163503 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1341  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  91.08 
 
 
284 aa  435  1e-121  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.605284 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5795  uroporphyrin-III C-methyltransferase  94.76 
 
 
253 aa  363  1e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.685084 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4145  uroporphyrin-III C-methyltransferase  90.34 
 
 
255 aa  363  2e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0746757 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3859  uroporphyrin-III C-methyltransferase  94.32 
 
 
253 aa  360  1e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.954911  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4509  uroporphyrin-III C-methyltransferase  94.32 
 
 
253 aa  360  1e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.000349091  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1089  uroporphyrin-III C-methyltransferase  83.83 
 
 
274 aa  350  2e-95  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.352107  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0245  uroporphyrin-III C-methyltransferase  83.83 
 
 
340 aa  350  2e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0334  uroporphyrin-III C-methyltransferase  83.83 
 
 
340 aa  350  2e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.839237  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0086  uroporphyrin-III C-methyltransferase  84.12 
 
 
271 aa  348  7e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.57137  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1254  uroporphyrin-III C-methyltransferase  84.12 
 
 
271 aa  348  7e-95  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.206282  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1758  uroporphyrin-III C-methyltransferase  84.12 
 
 
271 aa  348  7e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1669  uroporphyrin-III C-methyltransferase  84.12 
 
 
271 aa  348  7e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1168  uroporphyrin-III C-methyltransferase  84.26 
 
 
291 aa  341  1e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0427419  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3697  uroporphyrin-III C-methyltransferase  69.17 
 
 
254 aa  328  7e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.748365 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2215  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  77.45 
 
 
271 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.704087  hitchhiker  0.00815746 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1982  uroporphyrin-III C-methyltransferase  77.69 
 
 
271 aa  301  6.000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.663973  normal  0.9283 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0322  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  53.73 
 
 
277 aa  253  3e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1402  uroporphyrin-III C-methyltransferase  53.73 
 
 
261 aa  240  2e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.492452 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2847  uroporphyrin-III C-methyltransferase  53.81 
 
 
274 aa  236  4e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.817208  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2321  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  57.39 
 
 
259 aa  234  9e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.842595  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2090  uroporphyrin-III C-methyltransferase  51.72 
 
 
246 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.505615  normal  0.0362421 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3650  uroporphyrin-III C-methyltransferase  52.16 
 
 
246 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000265889  normal  0.852152 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2332  uroporphyrin-III C-methyltransferase  53.39 
 
 
269 aa  233  2.0000000000000002e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0126754  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2843  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  53.39 
 
 
269 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3532  uroporphyrin-III C-methyltransferase  54.17 
 
 
268 aa  233  3e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.607966  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2368  uroporphyrin-III C-methyltransferase  54.01 
 
 
270 aa  233  3e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1608  uroporphyrin-III C-methyltransferase  53.02 
 
 
246 aa  233  3e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000713921  decreased coverage  0.000000000148067 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2093  uroporphyrin-III C-methyltransferase  52.42 
 
 
247 aa  231  7.000000000000001e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0878943  normal  0.0902648 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2883  uroporphyrin-III C-methyltransferase  54.69 
 
 
288 aa  231  1e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3528  uroporphyrin-III C-methyltransferase  53.71 
 
 
245 aa  230  2e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0179276  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41563  uroporphyrin-III C-methyltransferase  53.71 
 
 
245 aa  230  2e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0110837  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2098  uroporphyrin-III C-methyltransferase  52.4 
 
 
253 aa  229  3e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00176224  decreased coverage  0.00158802 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2292  uroporphyrin-III C-methyltransferase  52.73 
 
 
308 aa  229  5e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.318843  normal  0.152428 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2300  uroporphyrin-III C-methyltransferase  51.97 
 
 
253 aa  228  9e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00412694  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3168  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  55.13 
 
 
285 aa  226  4e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23340  uroporphyrin-III C-methyltransferase  51.97 
 
 
245 aa  225  7e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00949185  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1601  uroporphyrin-III C-methyltransferase  50 
 
 
246 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000170962  hitchhiker  0.00445927 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1778  uroporphyrin-III C-methyltransferase  52.54 
 
 
250 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0293205  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5019  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  54.39 
 
 
261 aa  218  7e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3281  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  53.16 
 
 
274 aa  217  2e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.429285  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2103  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  53.68 
 
 
286 aa  209  6e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.161364  normal  0.623336 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1654  uroporphyrin-III C-methyltransferase  52.19 
 
 
249 aa  202  4e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1174  uroporphyrin-III C-methyltransferase  52.19 
 
 
269 aa  202  5e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.496299  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4999  uroporphyrin-III C-methyltransferase  53.1 
 
 
262 aa  202  6e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.162469  hitchhiker  0.0000174023 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1585  uroporphyrin-III C-methyltransferase  52.44 
 
 
339 aa  201  9e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0657013 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1628  uroporphyrin-III C-methyltransferase  51.75 
 
 
294 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.743744  normal  0.0196415 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1573  uroporphyrin-III C-methyltransferase  51.32 
 
 
249 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.147682 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1649  uroporphyrin-III C-methyltransferase  52.21 
 
 
264 aa  199  6e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.783334  normal  0.0340554 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1554  uroporphyrin-III C-methyltransferase  51.32 
 
 
294 aa  199  6e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.344973  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3154  uroporphyrin-III C-methyltransferase  50.44 
 
 
247 aa  191  9e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.345129  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4802  uroporphyrin-III C-methyltransferase  51.75 
 
 
249 aa  191  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.284814  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5891  siroheme synthase  47.9 
 
 
493 aa  189  5e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0672  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.87 
 
 
273 aa  179  4e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00608831 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3062  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.74 
 
 
512 aa  179  4.999999999999999e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00105684  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2383  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  45.3 
 
 
462 aa  178  7e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.806488  hitchhiker  0.00704026 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3188  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.06 
 
 
272 aa  177  1e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2597  siroheme synthase  43.64 
 
 
465 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3559  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.4 
 
 
261 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.895893  normal  0.323938 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30340  siroheme synthase  43.64 
 
 
465 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1077  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.03 
 
 
490 aa  176  3e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0490237  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3269  uroporphyrin-III C-methyltransferase  49.19 
 
 
317 aa  176  3e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.848441  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03694  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.6 
 
 
479 aa  175  7e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2356  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  43.1 
 
 
262 aa  174  1.9999999999999998e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.463328  normal  0.682274 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1025  uroporphyrin-III C-methyltransferase  38.58 
 
 
293 aa  173  1.9999999999999998e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2296  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.68 
 
 
490 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.12544  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2864  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.44 
 
 
510 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.29074  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3717  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.53 
 
 
288 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3581  precorrin-2 dehydrogenase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  43.22 
 
 
464 aa  172  5e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249196  normal  0.492888 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1834  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.02 
 
 
463 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000289405 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0492  uroporphyrin-III C-methyltransferase  39.41 
 
 
246 aa  172  5.999999999999999e-42  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0958  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.92 
 
 
273 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.297399  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3275  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  42.55 
 
 
254 aa  172  7.999999999999999e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.413424  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2922  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.8 
 
 
260 aa  171  9e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.215743  normal  0.0409844 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3044  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.64 
 
 
277 aa  171  9e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1682  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.8 
 
 
264 aa  171  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.577733 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3999  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.59 
 
 
463 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.426226  hitchhiker  0.00756787 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0953  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.21 
 
 
278 aa  171  1e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.553083  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1104  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.24 
 
 
275 aa  171  1e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.217718  normal  0.455501 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0417  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.15 
 
 
462 aa  171  1e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1371  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.45 
 
 
502 aa  170  2e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18851  putative uroporphyrin-III C-methyltransferase  39.66 
 
 
255 aa  170  2e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0787  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.92 
 
 
273 aa  171  2e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.464331  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3344  siroheme synthase  41.84 
 
 
464 aa  170  3e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00903193  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3604  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.59 
 
 
463 aa  170  3e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.556509 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3797  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.35 
 
 
269 aa  169  4e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000253578  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3728  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.59 
 
 
276 aa  169  4e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3403  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.16 
 
 
464 aa  169  4e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.242571 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0662  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.92 
 
 
271 aa  169  5e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1175  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.68 
 
 
252 aa  169  5e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.4706  normal  0.0224859 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3179  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  42.52 
 
 
264 aa  169  6e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.525633  normal  0.911093 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28170  Uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.92 
 
 
464 aa  169  6e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0407  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.88 
 
 
259 aa  169  6e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0863  uroporphyrin-III C-methyltransferase-like  39.84 
 
 
468 aa  169  7e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.147258  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2725  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.4 
 
 
273 aa  168  7e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000809754 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3126  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.4 
 
 
273 aa  168  7e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0927  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.78 
 
 
281 aa  168  8e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0961  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.78 
 
 
281 aa  168  8e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.509191  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3409  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.78 
 
 
278 aa  168  8e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>