More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3281 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_3281  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  100 
 
 
274 aa  547  1e-155  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.429285  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1402  uroporphyrin-III C-methyltransferase  79.12 
 
 
261 aa  395  1e-109  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.492452 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2883  uroporphyrin-III C-methyltransferase  76.17 
 
 
288 aa  392  1e-108  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2332  uroporphyrin-III C-methyltransferase  76.23 
 
 
269 aa  379  1e-104  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0126754  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2843  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  76.54 
 
 
269 aa  377  1e-104  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2292  uroporphyrin-III C-methyltransferase  72.12 
 
 
308 aa  372  1e-102  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.318843  normal  0.152428 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2847  uroporphyrin-III C-methyltransferase  76.15 
 
 
274 aa  370  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.817208  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2368  uroporphyrin-III C-methyltransferase  75.9 
 
 
270 aa  369  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3532  uroporphyrin-III C-methyltransferase  76.33 
 
 
268 aa  363  1e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.607966  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2103  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  80 
 
 
286 aa  349  2e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.161364  normal  0.623336 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2321  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  67.36 
 
 
259 aa  309  2.9999999999999997e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.842595  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0322  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  56.91 
 
 
277 aa  266  2e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1778  uroporphyrin-III C-methyltransferase  55.32 
 
 
250 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0293205  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2093  uroporphyrin-III C-methyltransferase  52.89 
 
 
247 aa  238  6.999999999999999e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0878943  normal  0.0902648 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3528  uroporphyrin-III C-methyltransferase  51.67 
 
 
245 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0179276  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1585  uroporphyrin-III C-methyltransferase  53.73 
 
 
339 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0657013 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41563  uroporphyrin-III C-methyltransferase  51.67 
 
 
245 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0110837  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2090  uroporphyrin-III C-methyltransferase  53.39 
 
 
246 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.505615  normal  0.0362421 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2300  uroporphyrin-III C-methyltransferase  52.34 
 
 
253 aa  231  1e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00412694  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3650  uroporphyrin-III C-methyltransferase  52.97 
 
 
246 aa  230  2e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000265889  normal  0.852152 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23340  uroporphyrin-III C-methyltransferase  51.49 
 
 
245 aa  230  2e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00949185  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1649  uroporphyrin-III C-methyltransferase  56.49 
 
 
264 aa  230  2e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.783334  normal  0.0340554 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1654  uroporphyrin-III C-methyltransferase  54.07 
 
 
249 aa  230  2e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2098  uroporphyrin-III C-methyltransferase  52.34 
 
 
253 aa  229  4e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00176224  decreased coverage  0.00158802 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1174  uroporphyrin-III C-methyltransferase  54.07 
 
 
269 aa  229  4e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.496299  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1573  uroporphyrin-III C-methyltransferase  53.66 
 
 
249 aa  229  5e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.147682 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1628  uroporphyrin-III C-methyltransferase  53.66 
 
 
294 aa  228  6e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.743744  normal  0.0196415 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4999  uroporphyrin-III C-methyltransferase  56.05 
 
 
262 aa  228  6e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.162469  hitchhiker  0.0000174023 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1608  uroporphyrin-III C-methyltransferase  52.77 
 
 
246 aa  228  7e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000713921  decreased coverage  0.000000000148067 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3697  uroporphyrin-III C-methyltransferase  50.21 
 
 
254 aa  227  1e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.748365 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1554  uroporphyrin-III C-methyltransferase  53.66 
 
 
294 aa  227  1e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.344973  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1601  uroporphyrin-III C-methyltransferase  52.12 
 
 
246 aa  223  4e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000170962  hitchhiker  0.00445927 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3154  uroporphyrin-III C-methyltransferase  54.32 
 
 
247 aa  222  6e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.345129  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2492  uroporphyrin-III C-methyltransferase  49.8 
 
 
272 aa  221  9.999999999999999e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2728  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.22 
 
 
277 aa  219  5e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1546  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.4 
 
 
277 aa  216  2e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.746626  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3168  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  48.95 
 
 
285 aa  217  2e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1443  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.77 
 
 
276 aa  214  9.999999999999999e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.224793  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28170  Uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.32 
 
 
464 aa  214  1.9999999999999998e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0407  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.93 
 
 
259 aa  210  2e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4802  uroporphyrin-III C-methyltransferase  52.03 
 
 
249 aa  210  2e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.284814  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3275  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  48.32 
 
 
254 aa  207  1e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.413424  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1111  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.5 
 
 
482 aa  207  1e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2904  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.06 
 
 
271 aa  206  2e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18851  putative uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.67 
 
 
267 aa  207  2e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03694  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.41 
 
 
479 aa  206  3e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0652  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  44.22 
 
 
493 aa  206  4e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1787  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  45.83 
 
 
267 aa  205  7e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.159983  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0672  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.7 
 
 
273 aa  205  7e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00608831 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2313  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.57 
 
 
502 aa  204  1e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2173  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  43.33 
 
 
489 aa  204  1e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1546  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.27 
 
 
283 aa  204  1e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.402925  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2356  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  48.1 
 
 
262 aa  204  2e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.463328  normal  0.682274 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19041  putative uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.83 
 
 
267 aa  202  5e-51  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.166851  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4598  siroheme synthase  49.17 
 
 
467 aa  202  6e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3717  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.95 
 
 
288 aa  202  7e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3797  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.67 
 
 
269 aa  202  7e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000253578  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2089  ferrochelatase  45.67 
 
 
474 aa  201  8e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0691041  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2383  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  45.57 
 
 
462 aa  201  9e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.806488  hitchhiker  0.00704026 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3174  uroporphyrin-III C-methyltransferase, C-terminal:siroheme synthase, N-terminal  44.96 
 
 
464 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.108275  normal  0.319321 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18851  putative uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.19 
 
 
255 aa  201  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2471  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  45 
 
 
479 aa  201  9.999999999999999e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0675252  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0863  uroporphyrin-III C-methyltransferase-like  43.04 
 
 
468 aa  200  1.9999999999999998e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.147258  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3581  precorrin-2 dehydrogenase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  45.75 
 
 
464 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249196  normal  0.492888 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1290  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.77 
 
 
258 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02124  siroheme synthase  48.59 
 
 
401 aa  200  1.9999999999999998e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3344  siroheme synthase  44.96 
 
 
464 aa  199  3e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00903193  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1834  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.19 
 
 
463 aa  199  3e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000289405 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3719  siroheme synthase  46.89 
 
 
470 aa  199  3.9999999999999996e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.411824  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3999  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.19 
 
 
463 aa  199  5e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.426226  hitchhiker  0.00756787 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0232  siroheme synthase  46.89 
 
 
473 aa  199  5e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3959  siroheme synthase  46.89 
 
 
473 aa  199  5e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2236  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.51 
 
 
503 aa  199  6e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0787  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.42 
 
 
273 aa  198  7e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.464331  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1148  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.1 
 
 
258 aa  198  7.999999999999999e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.660594  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4048  siroheme synthase  47.26 
 
 
459 aa  198  9e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1481  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.51 
 
 
258 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.822435  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3188  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.42 
 
 
272 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3403  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.35 
 
 
464 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.242571 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1679  precorrin-2 dehydrogenase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  44.12 
 
 
481 aa  197  2.0000000000000003e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001708  uroporphyrinogen-III methyltransferase  49.16 
 
 
295 aa  196  3e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0861  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.82 
 
 
472 aa  196  3e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.402872  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3179  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  46.22 
 
 
264 aa  196  3e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.525633  normal  0.911093 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30340  siroheme synthase  44.4 
 
 
465 aa  196  3e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0662  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.25 
 
 
271 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3604  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.35 
 
 
463 aa  195  6e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.556509 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3863  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.26 
 
 
258 aa  195  8.000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.707668  hitchhiker  0.0000644403 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3562  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.41 
 
 
478 aa  195  8.000000000000001e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2767  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.44 
 
 
503 aa  194  9e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0927  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.03 
 
 
281 aa  194  9e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3409  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.03 
 
 
278 aa  194  1e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1335  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.92 
 
 
258 aa  194  1e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1308  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.92 
 
 
258 aa  194  1e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0961  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.03 
 
 
281 aa  194  1e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.509191  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00765  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.74 
 
 
296 aa  194  1e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1445  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.92 
 
 
258 aa  194  1e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.51628  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2725  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.64 
 
 
273 aa  194  1e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000809754 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3126  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.64 
 
 
273 aa  194  1e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1587  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.26 
 
 
258 aa  194  1e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00363233  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2597  siroheme synthase  44.4 
 
 
465 aa  194  1e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>