More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_1654 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008060  Bcen_1174  uroporphyrin-III C-methyltransferase  100 
 
 		 269 aa  472  1e-132  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.496299  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1654  uroporphyrin-III C-methyltransferase  100 
 
 		 249 aa  472  1e-132  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1628  uroporphyrin-III C-methyltransferase  97.99 
 
 		 294 aa  461  1e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.743744  normal  0.0196415 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1573  uroporphyrin-III C-methyltransferase  93.17 
 
 		 249 aa  440  1e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.147682 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1554  uroporphyrin-III C-methyltransferase  93.17 
 
 		 294 aa  437  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.344973  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4802  uroporphyrin-III C-methyltransferase  92.68 
 
 		 249 aa  414  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.284814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1585  uroporphyrin-III C-methyltransferase  88.66 
 
 		 339 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0657013 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4999  uroporphyrin-III C-methyltransferase  73.31 
 
 		 262 aa  311  7.999999999999999e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.162469  hitchhiker  0.0000174023 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3154  uroporphyrin-III C-methyltransferase  73.73 
 
 		 247 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.345129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1649  uroporphyrin-III C-methyltransferase  73.08 
 
 		 264 aa  302  4.0000000000000003e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.783334  normal  0.0340554 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0322  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  53.75 
 
 		 277 aa  239  2e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3532  uroporphyrin-III C-methyltransferase  57.81 
 
 		 268 aa  236  4e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.607966  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2847  uroporphyrin-III C-methyltransferase  54.01 
 
 		 274 aa  233  2.0000000000000002e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.817208  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1402  uroporphyrin-III C-methyltransferase  54.24 
 
 		 261 aa  231  6e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.492452 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2368  uroporphyrin-III C-methyltransferase  53.88 
 
 		 270 aa  229  4e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41563  uroporphyrin-III C-methyltransferase  53.91 
 
 		 245 aa  224  9e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0110837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3281  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  52.44 
 
 		 274 aa  222  4e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.429285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3528  uroporphyrin-III C-methyltransferase  52.81 
 
 		 245 aa  221  6e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0179276  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2843  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  53.45 
 
 		 269 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2332  uroporphyrin-III C-methyltransferase  53.45 
 
 		 269 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0126754  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2321  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  55.98 
 
 		 259 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.842595  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2090  uroporphyrin-III C-methyltransferase  51.95 
 
 		 246 aa  216  2e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.505615  normal  0.0362421 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3650  uroporphyrin-III C-methyltransferase  51.52 
 
 		 246 aa  215  4e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000265889  normal  0.852152 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2883  uroporphyrin-III C-methyltransferase  53.19 
 
 		 288 aa  214  8e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23340  uroporphyrin-III C-methyltransferase  50.42 
 
 		 245 aa  214  9.999999999999999e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00949185  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2292  uroporphyrin-III C-methyltransferase  51.88 
 
 		 308 aa  214  9.999999999999999e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.318843  normal  0.152428 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1608  uroporphyrin-III C-methyltransferase  52.16 
 
 		 246 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000713921  decreased coverage  0.000000000148067 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18851  putative uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.32 
 
 		 255 aa  214  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2300  uroporphyrin-III C-methyltransferase  50.21 
 
 		 253 aa  212  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00412694  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2098  uroporphyrin-III C-methyltransferase  49.79 
 
 		 253 aa  211  9e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00176224  decreased coverage  0.00158802 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2093  uroporphyrin-III C-methyltransferase  50 
 
 		 247 aa  211  9e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0878943  normal  0.0902648 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3168  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  49.57 
 
 		 285 aa  209  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1778  uroporphyrin-III C-methyltransferase  52.34 
 
 		 250 aa  207  1e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0293205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1787  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  45.45 
 
 		 267 aa  207  1e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.159983  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2356  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  45.16 
 
 		 262 aa  206  2e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.463328  normal  0.682274 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1601  uroporphyrin-III C-methyltransferase  50.65 
 
 		 246 aa  206  4e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000170962  hitchhiker  0.00445927 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18851  putative uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.11 
 
 		 267 aa  206  4e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19041  putative uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.68 
 
 		 267 aa  205  7e-52  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.166851  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3697  uroporphyrin-III C-methyltransferase  49.78 
 
 		 254 aa  205  7e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.748365 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2725  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.52 
 
 		 273 aa  204  1e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000809754 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2253  uroporphyrin-III C-methyltransferase  53.22 
 
 		 266 aa  204  1e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.270146  normal  0.0491456 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3126  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.52 
 
 		 273 aa  204  1e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0671  uroporphyrin-III C-methyltransferase  50.86 
 
 		 482 aa  202  4e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.523068  normal  0.0127709 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3275  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  47.88 
 
 		 254 aa  201  8e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.413424  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0407  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45 
 
 		 259 aa  200  9.999999999999999e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1481  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.58 
 
 		 258 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.822435  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1744  uroporphyrin-III C-methyltransferase  50.85 
 
 		 263 aa  200  1.9999999999999998e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3188  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.61 
 
 		 272 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03219  fused siroheme synthase 1,3-dimethyluroporphyriongen III dehydrogenase and siroheme ferrochelatase/uroporphyrinogen methyltransferase  47.01 
 
 		 457 aa  196  3e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0344  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.01 
 
 		 457 aa  196  3e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3744  siroheme synthase  47.01 
 
 		 457 aa  196  3e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4679  siroheme synthase  47.01 
 
 		 457 aa  196  3e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.839222 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03171  hypothetical protein  47.01 
 
 		 457 aa  196  3e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3564  siroheme synthase  47.01 
 
 		 457 aa  196  3e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3838  siroheme synthase  47.01 
 
 		 457 aa  196  3e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3650  siroheme synthase  47.01 
 
 		 457 aa  196  3e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000355794 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0344  siroheme synthase  47.01 
 
 		 457 aa  196  3e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.898093 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1349  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.58 
 
 		 258 aa  195  5.000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.758533  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0958  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.76 
 
 		 273 aa  195  6e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.297399  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1335  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.75 
 
 		 258 aa  195  7e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1308  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.75 
 
 		 258 aa  195  7e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1445  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.75 
 
 		 258 aa  195  7e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.51628  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1517  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.75 
 
 		 258 aa  195  7e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.58633e-17 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1443  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.64 
 
 		 276 aa  194  8.000000000000001e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.224793  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1549  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.44 
 
 		 258 aa  194  1e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3863  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.5 
 
 		 258 aa  194  1e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.707668  hitchhiker  0.0000644403 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1682  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.22 
 
 		 264 aa  194  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.577733 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1587  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.33 
 
 		 258 aa  194  1e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00363233  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3559  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.48 
 
 		 261 aa  194  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.895893  normal  0.323938 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1679  precorrin-2 dehydrogenase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  47.23 
 
 		 481 aa  193  2e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1371  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.93 
 
 		 502 aa  192  3e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1941  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.93 
 
 		 478 aa  192  4e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3717  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.54 
 
 		 288 aa  192  4e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3749  siroheme synthase  47.01 
 
 		 457 aa  192  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.848215 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1148  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.33 
 
 		 258 aa  192  5e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.660594  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3784  siroheme synthase  47.01 
 
 		 457 aa  192  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0672  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.99 
 
 		 273 aa  192  5e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00608831 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0953  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.61 
 
 		 278 aa  192  5e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.553083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3796  siroheme synthase  47.01 
 
 		 457 aa  192  5e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.01671 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3675  siroheme synthase  47.01 
 
 		 459 aa  192  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3846  siroheme synthase  47.01 
 
 		 457 aa  192  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.130759  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2492  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.89 
 
 		 272 aa  192  5e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0862  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  45.76 
 
 		 276 aa  192  5e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0632575  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1309  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.33 
 
 		 258 aa  191  7e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0927  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.61 
 
 		 281 aa  191  7e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2313  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.26 
 
 		 502 aa  191  7e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0961  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.61 
 
 		 281 aa  191  7e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.509191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3675  siroheme synthase  47.01 
 
 		 457 aa  191  7e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3959  siroheme synthase  45.26 
 
 		 473 aa  191  8e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1104  uroporphyrin-III C-methyltransferase  50.42 
 
 		 275 aa  191  8e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.217718  normal  0.455501 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0232  siroheme synthase  45.26 
 
 		 473 aa  191  8e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2864  uroporphyrin-III C-methyltransferase  51.32 
 
 		 510 aa  191  8e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.29074  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1687  uroporphyrinogen-III methyltransferase/synthase  39.83 
 
 		 492 aa  191  8e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0805383  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3719  siroheme synthase  45.26 
 
 		 470 aa  191  9e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.411824  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0787  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.76 
 
 		 273 aa  191  9e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.464331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3073  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  46.19 
 
 		 276 aa  191  9e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.419877  normal  0.821671 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3409  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.61 
 
 		 278 aa  191  9e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2018  siroheme synthase  48.93 
 
 		 476 aa  191  9e-48  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1718  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.28 
 
 		 314 aa  191  1e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1421  uroporphyrinogen-III methyltransferase/synthase  39.83 
 
 		 492 aa  191  1e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.16426  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>