More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10229_0334 on replicon NC_008835
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10229



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A0245  uroporphyrin-III C-methyltransferase  99.71 
 
 		 340 aa  665    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0334  uroporphyrin-III C-methyltransferase  100 
 
 		 340 aa  667    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.839237  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1089  uroporphyrin-III C-methyltransferase  100 
 
 		 274 aa  534  1e-151  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.352107  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1254  uroporphyrin-III C-methyltransferase  100 
 
 		 271 aa  526  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.206282  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0086  uroporphyrin-III C-methyltransferase  100 
 
 		 271 aa  526  1e-148  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.57137  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1758  uroporphyrin-III C-methyltransferase  100 
 
 		 271 aa  526  1e-148  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1669  uroporphyrin-III C-methyltransferase  100 
 
 		 271 aa  526  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1168  uroporphyrin-III C-methyltransferase  87.64 
 
 		 291 aa  397  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0427419  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1341  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  84.68 
 
 		 284 aa  350  3e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.605284 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4402  uroporphyrin-III C-methyltransferase  84.26 
 
 		 256 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.163503 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4145  uroporphyrin-III C-methyltransferase  86.32 
 
 		 255 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0746757 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3939  uroporphyrin-III C-methyltransferase  83.83 
 
 		 283 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.158955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3697  uroporphyrin-III C-methyltransferase  70.16 
 
 		 254 aa  330  2e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.748365 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3859  uroporphyrin-III C-methyltransferase  84.65 
 
 		 253 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.954911  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4509  uroporphyrin-III C-methyltransferase  84.65 
 
 		 253 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.000349091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5795  uroporphyrin-III C-methyltransferase  84.65 
 
 		 253 aa  327  3e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.685084 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2215  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  76.15 
 
 		 271 aa  312  4.999999999999999e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.704087  hitchhiker  0.00815746 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1982  uroporphyrin-III C-methyltransferase  76.57 
 
 		 271 aa  300  2e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.663973  normal  0.9283 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0322  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  53.65 
 
 		 277 aa  235  7e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1402  uroporphyrin-III C-methyltransferase  56.02 
 
 		 261 aa  231  1e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.492452 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3532  uroporphyrin-III C-methyltransferase  53.44 
 
 		 268 aa  228  1e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.607966  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2847  uroporphyrin-III C-methyltransferase  54.01 
 
 		 274 aa  228  1e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.817208  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2332  uroporphyrin-III C-methyltransferase  51.74 
 
 		 269 aa  227  2e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0126754  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2368  uroporphyrin-III C-methyltransferase  54.01 
 
 		 270 aa  227  2e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2843  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  52.97 
 
 		 269 aa  226  5.0000000000000005e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2321  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  56.96 
 
 		 259 aa  225  9e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.842595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3168  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  54.66 
 
 		 285 aa  225  9e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3650  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.95 
 
 		 246 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000265889  normal  0.852152 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2883  uroporphyrin-III C-methyltransferase  52.61 
 
 		 288 aa  224  2e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2090  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.52 
 
 		 246 aa  223  3e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.505615  normal  0.0362421 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5019  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  56.54 
 
 		 261 aa  222  9e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1608  uroporphyrin-III C-methyltransferase  50.43 
 
 		 246 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000713921  decreased coverage  0.000000000148067 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2093  uroporphyrin-III C-methyltransferase  50 
 
 		 247 aa  220  3e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0878943  normal  0.0902648 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3528  uroporphyrin-III C-methyltransferase  51.53 
 
 		 245 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0179276  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41563  uroporphyrin-III C-methyltransferase  51.53 
 
 		 245 aa  219  6e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0110837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1601  uroporphyrin-III C-methyltransferase  50.86 
 
 		 246 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000170962  hitchhiker  0.00445927 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2098  uroporphyrin-III C-methyltransferase  51.1 
 
 		 253 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00176224  decreased coverage  0.00158802 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2292  uroporphyrin-III C-methyltransferase  50.59 
 
 		 308 aa  215  9e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.318843  normal  0.152428 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2300  uroporphyrin-III C-methyltransferase  50.22 
 
 		 253 aa  212  7.999999999999999e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00412694  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3281  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  52.74 
 
 		 274 aa  209  5e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.429285  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23340  uroporphyrin-III C-methyltransferase  49.12 
 
 		 245 aa  209  7e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00949185  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1778  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.52 
 
 		 250 aa  205  1e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0293205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4999  uroporphyrin-III C-methyltransferase  50 
 
 		 262 aa  203  4e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.162469  hitchhiker  0.0000174023 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2103  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  52.38 
 
 		 286 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.161364  normal  0.623336 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1174  uroporphyrin-III C-methyltransferase  50.65 
 
 		 269 aa  199  6e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.496299  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1585  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.57 
 
 		 339 aa  199  7e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0657013 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1654  uroporphyrin-III C-methyltransferase  50.65 
 
 		 249 aa  199  7e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1628  uroporphyrin-III C-methyltransferase  50.22 
 
 		 294 aa  196  7e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.743744  normal  0.0196415 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1649  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.7 
 
 		 264 aa  194  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.783334  normal  0.0340554 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0672  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.01 
 
 		 273 aa  194  3e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00608831 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1554  uroporphyrin-III C-methyltransferase  49.35 
 
 		 294 aa  192  7e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.344973  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1573  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.92 
 
 		 249 aa  192  1e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.147682 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3154  uroporphyrin-III C-methyltransferase  49.13 
 
 		 247 aa  186  4e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.345129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4802  uroporphyrin-III C-methyltransferase  49.35 
 
 		 249 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.284814  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5891  siroheme synthase  41.18 
 
 		 493 aa  181  1e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0927  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.12 
 
 		 281 aa  178  1e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3797  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.21 
 
 		 269 aa  177  2e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000253578  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0953  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.22 
 
 		 278 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.553083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3188  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.21 
 
 		 272 aa  177  2e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3717  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.6 
 
 		 288 aa  177  3e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3409  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.85 
 
 		 278 aa  176  5e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1104  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.72 
 
 		 275 aa  176  7e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.217718  normal  0.455501 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0961  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.76 
 
 		 281 aa  176  7e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.509191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0958  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.35 
 
 		 273 aa  175  8e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.297399  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3728  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.02 
 
 		 276 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0787  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.92 
 
 		 273 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.464331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3044  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.21 
 
 		 277 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0492  uroporphyrin-III C-methyltransferase  39.67 
 
 		 246 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0899  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  41.92 
 
 		 276 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1077  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.28 
 
 		 490 aa  172  6.999999999999999e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0490237  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03219  fused siroheme synthase 1,3-dimethyluroporphyriongen III dehydrogenase and siroheme ferrochelatase/uroporphyrinogen methyltransferase  40.42 
 
 		 457 aa  171  2e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0344  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.42 
 
 		 457 aa  171  2e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3650  siroheme synthase  40.42 
 
 		 457 aa  171  2e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000355794 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3559  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.22 
 
 		 261 aa  171  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.895893  normal  0.323938 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3838  siroheme synthase  40.42 
 
 		 457 aa  171  2e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0344  siroheme synthase  40.42 
 
 		 457 aa  171  2e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.898093 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03171  hypothetical protein  40.42 
 
 		 457 aa  171  2e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3564  siroheme synthase  40.42 
 
 		 457 aa  171  2e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4679  siroheme synthase  40.42 
 
 		 457 aa  171  2e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.839222 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3744  siroheme synthase  40.42 
 
 		 457 aa  171  2e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0662  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.78 
 
 		 271 aa  171  2e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2892  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.54 
 
 		 269 aa  171  2e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0862  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  42.98 
 
 		 276 aa  171  2e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0632575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4048  siroheme synthase  40.51 
 
 		 459 aa  170  3e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3073  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  41.54 
 
 		 276 aa  170  3e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.419877  normal  0.821671 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2253  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.23 
 
 		 266 aa  169  5e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.270146  normal  0.0491456 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0188  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.93 
 
 		 475 aa  169  5e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0267  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.96 
 
 		 521 aa  169  5e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30340  siroheme synthase  43.16 
 
 		 465 aa  169  6e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0795  siroheme synthase (Includes: Uroporphyrin-III C-methyltransferase, Precorrin-2 dehydrogenase,Sirohydrochlorin ferrochelatase)  40 
 
 		 275 aa  169  7e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.751719  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2356  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  42.98 
 
 		 262 aa  169  8e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.463328  normal  0.682274 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2492  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.39 
 
 		 272 aa  169  9e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0407  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.13 
 
 		 259 aa  168  1e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3675  siroheme synthase  40 
 
 		 459 aa  168  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3846  siroheme synthase  40 
 
 		 457 aa  168  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.130759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2383  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  42.31 
 
 		 462 aa  168  1e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.806488  hitchhiker  0.00704026 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3749  siroheme synthase  40 
 
 		 457 aa  168  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.848215 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1349  uroporphyrin-III C-methyltransferase  39.57 
 
 		 258 aa  168  1e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.758533  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2597  siroheme synthase  42.74 
 
 		 465 aa  168  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3784  siroheme synthase  40 
 
 		 457 aa  168  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>