More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2059 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_2059  uroporphyrin-III C-methyltransferase  100 
 
 
252 aa  519  1e-146  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5405  uroporphyrin-III C-methyltransferase  68.65 
 
 
252 aa  375  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2636  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  55.47 
 
 
256 aa  281  7.000000000000001e-75  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3091  uroporphyrin-III C-methyltransferase  56.07 
 
 
263 aa  276  2e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00000546581  normal  0.020085 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2052  uroporphyrin-III C-methyltransferase  57.08 
 
 
266 aa  273  2.0000000000000002e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.754921 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4641  uroporphyrin-III C-methyltransferase  54.32 
 
 
262 aa  273  3e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1505  uroporphyrin-III C-methyltransferase  55.13 
 
 
257 aa  269  2.9999999999999997e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2619  uroporphyrin-III C-methyltransferase  52.65 
 
 
257 aa  259  3e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.923758  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6616  uroporphyrin-III C-methyltransferase  51.9 
 
 
258 aa  247  2e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0293079 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2385  uroporphyrin-III C-methyltransferase  52.14 
 
 
252 aa  241  1e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.10506  normal  0.665855 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0240  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.15 
 
 
242 aa  197  1.0000000000000001e-49  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1546  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.24 
 
 
277 aa  192  5e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.746626  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2728  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.81 
 
 
277 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0896  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.16 
 
 
506 aa  188  7e-47  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1248  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / uroporphyrinogen-III synthase  43.98 
 
 
520 aa  187  2e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.472521 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3751  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.22 
 
 
282 aa  186  3e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2089  ferrochelatase  42.74 
 
 
474 aa  186  4e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0691041  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2173  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  40.69 
 
 
489 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2162  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.37 
 
 
512 aa  182  6e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000123773  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3201  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.42 
 
 
519 aa  182  6e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3999  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.77 
 
 
463 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.426226  hitchhiker  0.00756787 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3581  precorrin-2 dehydrogenase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  43.04 
 
 
464 aa  180  2e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249196  normal  0.492888 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0789  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.43 
 
 
239 aa  180  2e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.194909  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3863  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.49 
 
 
258 aa  180  2e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.707668  hitchhiker  0.0000644403 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1834  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.77 
 
 
463 aa  180  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000289405 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3403  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.6 
 
 
464 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.242571 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2492  uroporphyrin-III C-methyltransferase  39.59 
 
 
272 aa  179  2.9999999999999997e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2131  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.96 
 
 
507 aa  179  2.9999999999999997e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0860734  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06660  putative uroporphyrin-III c-methyltransferase  41.7 
 
 
279 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.253082  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0289  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.26 
 
 
239 aa  179  4e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00797828  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1148  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.35 
 
 
258 aa  179  4e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.660594  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0608  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  42.62 
 
 
245 aa  179  4.999999999999999e-44  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.807775  normal  0.963545 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3604  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.35 
 
 
463 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.556509 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2904  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.77 
 
 
271 aa  179  5.999999999999999e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0611  putative uroporphyrin-III c-methyltransferase  41.28 
 
 
279 aa  178  8e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.33315  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3344  siroheme synthase  42.19 
 
 
464 aa  177  1e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00903193  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0652  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  38.89 
 
 
493 aa  177  1e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1668  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.92 
 
 
271 aa  177  1e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.228653  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3362  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.16 
 
 
480 aa  177  1e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3353  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.21 
 
 
504 aa  177  1e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.422788  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2762  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.55 
 
 
476 aa  177  2e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0407  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.29 
 
 
259 aa  177  2e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1125  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase, uroporphyrinogen-III synthase  40.59 
 
 
516 aa  176  2e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.325525 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28170  Uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.77 
 
 
464 aa  176  2e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3188  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.35 
 
 
272 aa  176  3e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1252  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.25 
 
 
505 aa  176  3e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0457  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.85 
 
 
249 aa  176  4e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000204102  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0343  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40 
 
 
248 aa  176  4e-43  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00230836  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1346  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.7 
 
 
511 aa  176  4e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.694338  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1549  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.63 
 
 
258 aa  176  5e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1335  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.03 
 
 
258 aa  175  5e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1308  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.03 
 
 
258 aa  175  5e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1587  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.63 
 
 
258 aa  175  5e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00363233  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3275  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  41.45 
 
 
254 aa  175  5e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.413424  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1445  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.03 
 
 
258 aa  175  5e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.51628  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1689  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.43 
 
 
239 aa  175  5e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1517  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.03 
 
 
258 aa  175  5e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.58633e-17 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4228  uroporphyrin-III C-methyltransferase  38.72 
 
 
292 aa  175  6e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.276742  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2189  uroporphyrin-III C-methyltransferase, putative  43.22 
 
 
259 aa  175  7e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1787  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.98 
 
 
497 aa  175  7e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000345374  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0322  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  41.27 
 
 
277 aa  175  7e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0701  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.26 
 
 
504 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1989  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  43.4 
 
 
246 aa  174  9.999999999999999e-43  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.519237  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2313  uroporphyrin-III C-methyltransferase  37.97 
 
 
502 aa  174  9.999999999999999e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1481  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.03 
 
 
258 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.822435  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0861  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.76 
 
 
244 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.155668  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3519  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.31 
 
 
480 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.605082  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0211  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.28 
 
 
239 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.283358 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1309  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.03 
 
 
258 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3174  uroporphyrin-III C-methyltransferase, C-terminal:siroheme synthase, N-terminal  40.93 
 
 
464 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.108275  normal  0.319321 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2471  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  37.61 
 
 
479 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0675252  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2235  uroporphyrin-III C-methyltransferase  39.13 
 
 
470 aa  173  1.9999999999999998e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2356  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  39.57 
 
 
262 aa  173  2.9999999999999996e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.463328  normal  0.682274 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1443  uroporphyrin-III C-methyltransferase  38.43 
 
 
276 aa  173  2.9999999999999996e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.224793  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1126  uroporphyrin-III C-methyltransferase  39.68 
 
 
263 aa  172  3.9999999999999995e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0671  uroporphyrin-III C-methyltransferase  39.91 
 
 
482 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.523068  normal  0.0127709 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3562  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.49 
 
 
478 aa  172  3.9999999999999995e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2597  siroheme synthase  40.17 
 
 
465 aa  172  5e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1977  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / uroporphyrinogen-III synthase  44.07 
 
 
513 aa  172  5e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0017868  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1554  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.24 
 
 
294 aa  172  5e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.344973  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3044  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.08 
 
 
277 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0863  uroporphyrin-III C-methyltransferase-like  38.59 
 
 
468 aa  171  7.999999999999999e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.147258  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1160  uroporphyrin-III C-methyltransferase  38.98 
 
 
473 aa  171  7.999999999999999e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.277445  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1573  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.81 
 
 
249 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.147682 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0492  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.66 
 
 
246 aa  171  1e-41  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4048  siroheme synthase  41.03 
 
 
459 aa  171  1e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3728  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.93 
 
 
276 aa  170  2e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0319  uroporphyrin-III C-methyltransferase  38.89 
 
 
497 aa  170  2e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0953  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.77 
 
 
278 aa  170  2e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.553083  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0687  hypothetical protein  43.57 
 
 
505 aa  170  2e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.943133  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30340  siroheme synthase  39.74 
 
 
465 aa  170  2e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0862  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  40.65 
 
 
276 aa  170  2e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0632575  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2528  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  39.92 
 
 
493 aa  170  2e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.172889  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1628  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.24 
 
 
294 aa  169  3e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.743744  normal  0.0196415 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1349  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.03 
 
 
258 aa  169  4e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.758533  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3418  uroporphyrin-III C-methyltransferase  39.06 
 
 
485 aa  169  4e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1654  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.38 
 
 
249 aa  169  4e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1023  uroporphyrin-III C-methyltransferase  39.32 
 
 
493 aa  169  4e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3838  siroheme synthase  40.17 
 
 
457 aa  169  5e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0051  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.68 
 
 
245 aa  169  5e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0142442  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>