More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0608 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_0608  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  100 
 
 
245 aa  488  1e-137  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.807775  normal  0.963545 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0240  uroporphyrin-III C-methyltransferase  59.92 
 
 
242 aa  301  6.000000000000001e-81  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0319  uroporphyrin-III C-methyltransferase  49.8 
 
 
497 aa  228  6e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3353  uroporphyrin-III C-methyltransferase  50 
 
 
504 aa  226  2e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.422788  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0687  hypothetical protein  52.48 
 
 
505 aa  224  7e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.943133  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0457  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.35 
 
 
249 aa  224  1e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000204102  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2162  uroporphyrin-III C-methyltransferase  50.61 
 
 
512 aa  223  3e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000123773  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0701  uroporphyrin-III C-methyltransferase  49.59 
 
 
504 aa  222  4e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1023  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.96 
 
 
493 aa  215  4e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1977  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / uroporphyrinogen-III synthase  50 
 
 
513 aa  215  5e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0017868  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1346  uroporphyrin-III C-methyltransferase  51.23 
 
 
511 aa  215  5.9999999999999996e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.694338  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1668  uroporphyrin-III C-methyltransferase  50 
 
 
271 aa  211  5.999999999999999e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.228653  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0407  uroporphyrin-III C-methyltransferase  49.39 
 
 
259 aa  211  5.999999999999999e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0409  uroporphyrin-III C-methyltransferase  50.41 
 
 
511 aa  211  1e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3863  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.15 
 
 
258 aa  210  1e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.707668  hitchhiker  0.0000644403 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2837  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  47.37 
 
 
503 aa  210  2e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.452302  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1252  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.77 
 
 
505 aa  209  2e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0051  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.98 
 
 
245 aa  210  2e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0142442  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2236  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.37 
 
 
503 aa  210  2e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1125  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase, uroporphyrinogen-III synthase  46.53 
 
 
516 aa  207  1e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.325525 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1309  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.33 
 
 
258 aa  206  2e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1481  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.91 
 
 
258 aa  207  2e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.822435  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1335  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.91 
 
 
258 aa  206  3e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1308  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.91 
 
 
258 aa  206  3e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3235  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  49.37 
 
 
513 aa  206  3e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0761379  normal  0.140873 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1445  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.91 
 
 
258 aa  206  3e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.51628  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1517  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.91 
 
 
258 aa  206  3e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.58633e-17 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1587  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.91 
 
 
258 aa  205  5e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00363233  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1258  uroporphyrin-III C-methyltransferase  50 
 
 
508 aa  205  5e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.323904  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0409  uroporphyrin-III C-methyltransferase  49.59 
 
 
510 aa  205  7e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3201  uroporphyrin-III C-methyltransferase  50 
 
 
519 aa  204  7e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1549  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.91 
 
 
258 aa  204  8e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3871  siroheme synthase  46.31 
 
 
459 aa  204  1e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.560083  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4048  siroheme synthase  45.9 
 
 
459 aa  204  1e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6102  uroporphyrin-III C-methyltransferase  50 
 
 
570 aa  204  1e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.229547  normal  0.024124 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0704  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.19 
 
 
231 aa  203  2e-51  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1787  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.62 
 
 
497 aa  203  2e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000345374  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1349  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.06 
 
 
258 aa  202  3e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.758533  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1744  uroporphyrin-III C-methyltransferase  49 
 
 
263 aa  202  4e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0343  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.61 
 
 
248 aa  202  4e-51  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00230836  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3959  siroheme synthase  46.37 
 
 
473 aa  202  6e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2221  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  46.91 
 
 
426 aa  201  6e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1290  uroporphyrin-III C-methyltransferase  49.59 
 
 
258 aa  202  6e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0232  siroheme synthase  46.37 
 
 
473 aa  202  6e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3719  siroheme synthase  46.37 
 
 
470 aa  201  7e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.411824  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4679  siroheme synthase  44.81 
 
 
457 aa  201  8e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.839222 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03219  fused siroheme synthase 1,3-dimethyluroporphyriongen III dehydrogenase and siroheme ferrochelatase/uroporphyrinogen methyltransferase  44.81 
 
 
457 aa  201  9e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0344  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.81 
 
 
457 aa  201  9e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0344  siroheme synthase  44.81 
 
 
457 aa  201  9e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.898093 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03171  hypothetical protein  44.81 
 
 
457 aa  201  9e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3650  siroheme synthase  44.81 
 
 
457 aa  201  9e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000355794 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2131  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.44 
 
 
507 aa  201  9e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0860734  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3564  siroheme synthase  44.81 
 
 
457 aa  201  9e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1278  uroporphyrin-III C-methyltransferase  49.38 
 
 
504 aa  201  9e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000100069  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3744  siroheme synthase  44.81 
 
 
457 aa  201  9.999999999999999e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0652  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  46.28 
 
 
493 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3838  siroheme synthase  44.81 
 
 
457 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3310  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta-component ferrodoxin domain protein  50.21 
 
 
249 aa  200  1.9999999999999998e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.198523  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2603  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.12 
 
 
256 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3062  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.9 
 
 
512 aa  199  3e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00105684  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2528  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  49.38 
 
 
493 aa  199  3e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.172889  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2089  ferrochelatase  46.09 
 
 
474 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0691041  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28170  Uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.3 
 
 
464 aa  199  3.9999999999999996e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1148  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.76 
 
 
258 aa  198  5e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.660594  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2207  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.69 
 
 
507 aa  199  5e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00880064  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3796  siroheme synthase  46.47 
 
 
457 aa  199  5e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.01671 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1105  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  45.23 
 
 
250 aa  198  7e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000034343  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0896  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.8 
 
 
506 aa  198  7e-50  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1175  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.09 
 
 
252 aa  198  7.999999999999999e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.4706  normal  0.0224859 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3362  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.12 
 
 
480 aa  197  9e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4598  siroheme synthase  47.08 
 
 
467 aa  197  1.0000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3675  siroheme synthase  44.53 
 
 
459 aa  196  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0215  siroheme synthase  46.61 
 
 
462 aa  197  2.0000000000000003e-49  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1124  uroporphyrin-III C-methyltransferase  51.77 
 
 
491 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.219261  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0861  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.81 
 
 
244 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.155668  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1989  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  44.21 
 
 
246 aa  196  3e-49  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.519237  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2305  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.51 
 
 
402 aa  196  3e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193462  normal  0.130764 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3519  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.31 
 
 
480 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.605082  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0789  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.57 
 
 
239 aa  195  5.000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.194909  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1025  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.62 
 
 
293 aa  195  6e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3452  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.13 
 
 
525 aa  194  8.000000000000001e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.305578  normal  0.171928 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30340  siroheme synthase  45.23 
 
 
465 aa  194  8.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3286  uroporphyrinogen III synthase/methyltransferase  50.21 
 
 
515 aa  194  1e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10020  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  50.21 
 
 
422 aa  194  1e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0127568  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2471  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  44.86 
 
 
479 aa  194  1e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0675252  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0289  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.99 
 
 
239 aa  194  1e-48  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00797828  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1689  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.57 
 
 
239 aa  194  1e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2767  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.87 
 
 
503 aa  194  1e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3846  siroheme synthase  44.49 
 
 
457 aa  193  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.130759  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1734  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.28 
 
 
406 aa  193  2e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0333412  normal  0.124511 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1371  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.27 
 
 
502 aa  193  2e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3784  siroheme synthase  44.49 
 
 
457 aa  193  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2597  siroheme synthase  44.81 
 
 
465 aa  192  3e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3749  siroheme synthase  44.4 
 
 
457 aa  192  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.848215 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7364  siroheme synthase  48.51 
 
 
410 aa  192  3e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0139888  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3675  siroheme synthase  44.4 
 
 
457 aa  192  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1313  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.2 
 
 
248 aa  192  5e-48  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.511728 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1616  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  48.95 
 
 
475 aa  192  5e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.512799  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3403  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.4 
 
 
464 aa  192  5e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.242571 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1791  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  47.79 
 
 
255 aa  191  1e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.693099  normal  0.522962 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>