More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0457 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0457  uroporphyrin-III C-methyltransferase  100 
 
 
249 aa  506  9.999999999999999e-143  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000204102  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1989  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  61.89 
 
 
246 aa  322  5e-87  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.519237  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0051  uroporphyrin-III C-methyltransferase  55.56 
 
 
245 aa  282  3.0000000000000004e-75  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0142442  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0687  hypothetical protein  52.61 
 
 
505 aa  270  2e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.943133  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3353  uroporphyrin-III C-methyltransferase  51.41 
 
 
504 aa  268  5.9999999999999995e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.422788  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0701  uroporphyrin-III C-methyltransferase  52.61 
 
 
504 aa  266  2e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1587  uroporphyrin-III C-methyltransferase  52.82 
 
 
258 aa  266  2e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00363233  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1549  uroporphyrin-III C-methyltransferase  52.61 
 
 
258 aa  265  4e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3863  uroporphyrin-III C-methyltransferase  52.82 
 
 
258 aa  265  4e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.707668  hitchhiker  0.0000644403 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0407  uroporphyrin-III C-methyltransferase  54.98 
 
 
259 aa  264  1e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1252  uroporphyrin-III C-methyltransferase  52.61 
 
 
505 aa  263  2e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1309  uroporphyrin-III C-methyltransferase  51.21 
 
 
258 aa  261  6.999999999999999e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1481  uroporphyrin-III C-methyltransferase  52.02 
 
 
258 aa  261  8e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.822435  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1335  uroporphyrin-III C-methyltransferase  51.21 
 
 
258 aa  259  2e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1308  uroporphyrin-III C-methyltransferase  51.21 
 
 
258 aa  259  2e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1517  uroporphyrin-III C-methyltransferase  51.21 
 
 
258 aa  259  2e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.58633e-17 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1445  uroporphyrin-III C-methyltransferase  51.21 
 
 
258 aa  259  2e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.51628  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1125  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase, uroporphyrinogen-III synthase  50.2 
 
 
516 aa  259  3e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.325525 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2162  uroporphyrin-III C-methyltransferase  50.2 
 
 
512 aa  259  3e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000123773  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1248  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / uroporphyrinogen-III synthase  51.41 
 
 
520 aa  259  4e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.472521 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0343  uroporphyrin-III C-methyltransferase  51.38 
 
 
248 aa  258  4e-68  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00230836  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1148  uroporphyrin-III C-methyltransferase  51.21 
 
 
258 aa  258  5.0000000000000005e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.660594  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1668  uroporphyrin-III C-methyltransferase  51.04 
 
 
271 aa  258  5.0000000000000005e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.228653  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0319  uroporphyrin-III C-methyltransferase  52.21 
 
 
497 aa  257  1e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1349  uroporphyrin-III C-methyltransferase  51.61 
 
 
258 aa  256  3e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.758533  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2189  uroporphyrin-III C-methyltransferase, putative  49.38 
 
 
259 aa  255  4e-67  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1290  uroporphyrin-III C-methyltransferase  54.22 
 
 
258 aa  253  3e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3062  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.99 
 
 
512 aa  249  4e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00105684  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2837  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  49.59 
 
 
503 aa  248  5e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.452302  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1023  uroporphyrin-III C-methyltransferase  50.8 
 
 
493 aa  248  7e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1258  uroporphyrin-III C-methyltransferase  51.41 
 
 
508 aa  246  2e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.323904  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2236  uroporphyrin-III C-methyltransferase  49.6 
 
 
503 aa  246  2e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3959  siroheme synthase  47.76 
 
 
473 aa  246  3e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0232  siroheme synthase  47.76 
 
 
473 aa  246  3e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1698  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  49.18 
 
 
458 aa  245  4e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0715064 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3719  siroheme synthase  47.76 
 
 
470 aa  245  4e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.411824  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1105  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  51.05 
 
 
250 aa  245  6e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000034343  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3675  siroheme synthase  49.17 
 
 
457 aa  244  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3201  uroporphyrin-III C-methyltransferase  50.2 
 
 
519 aa  244  9.999999999999999e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0409  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.19 
 
 
510 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3796  siroheme synthase  48.76 
 
 
457 aa  243  1.9999999999999999e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.01671 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1346  uroporphyrin-III C-methyltransferase  49 
 
 
511 aa  243  1.9999999999999999e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.694338  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3235  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  48.99 
 
 
513 aa  243  3e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0761379  normal  0.140873 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3749  siroheme synthase  48.76 
 
 
457 aa  242  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.848215 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0252  uroporphyrin-III C-methyltransferase  49.01 
 
 
511 aa  243  3e-63  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0409  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.79 
 
 
511 aa  243  3e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3675  siroheme synthase  48.76 
 
 
459 aa  242  3.9999999999999997e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3846  siroheme synthase  48.76 
 
 
457 aa  242  3.9999999999999997e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.130759  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3784  siroheme synthase  48.76 
 
 
457 aa  242  3.9999999999999997e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0240  uroporphyrin-III C-methyltransferase  54.1 
 
 
242 aa  241  7e-63  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1687  uroporphyrinogen-III methyltransferase/synthase  49.18 
 
 
492 aa  240  1e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0805383  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4048  siroheme synthase  46.69 
 
 
459 aa  239  2e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1421  uroporphyrinogen-III methyltransferase/synthase  48.77 
 
 
492 aa  240  2e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.16426  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03219  fused siroheme synthase 1,3-dimethyluroporphyriongen III dehydrogenase and siroheme ferrochelatase/uroporphyrinogen methyltransferase  48.76 
 
 
457 aa  239  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0344  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.76 
 
 
457 aa  239  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03171  hypothetical protein  48.76 
 
 
457 aa  239  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3744  siroheme synthase  48.76 
 
 
457 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4598  siroheme synthase  47.76 
 
 
467 aa  239  2.9999999999999997e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4679  siroheme synthase  48.76 
 
 
457 aa  239  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.839222 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3564  siroheme synthase  48.76 
 
 
457 aa  239  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0344  siroheme synthase  48.76 
 
 
457 aa  239  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.898093 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3838  siroheme synthase  48.76 
 
 
457 aa  239  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3650  siroheme synthase  48.76 
 
 
457 aa  239  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000355794 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3999  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.37 
 
 
463 aa  239  4e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.426226  hitchhiker  0.00756787 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3174  uroporphyrin-III C-methyltransferase, C-terminal:siroheme synthase, N-terminal  48.58 
 
 
464 aa  239  4e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.108275  normal  0.319321 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3871  siroheme synthase  46.69 
 
 
459 aa  239  4e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.560083  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0672  uroporphyrin-III C-methyltransferase  49.39 
 
 
273 aa  239  4e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00608831 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2383  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  47.15 
 
 
462 aa  239  4e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.806488  hitchhiker  0.00704026 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30340  siroheme synthase  46.94 
 
 
465 aa  238  5e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1834  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.37 
 
 
463 aa  238  5e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000289405 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0899  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  48.58 
 
 
276 aa  238  5.999999999999999e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3073  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  48.18 
 
 
276 aa  238  8e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.419877  normal  0.821671 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3403  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.35 
 
 
464 aa  238  8e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.242571 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0862  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  48.18 
 
 
276 aa  238  1e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0632575  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0289  uroporphyrin-III C-methyltransferase  52.5 
 
 
239 aa  236  2e-61  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00797828  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3344  siroheme synthase  48.18 
 
 
464 aa  236  3e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00903193  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3604  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.96 
 
 
463 aa  236  3e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.556509 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3362  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.11 
 
 
480 aa  236  3e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2597  siroheme synthase  46.53 
 
 
465 aa  235  4e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3062  uroporphyrinogen-III methylase  46.18 
 
 
513 aa  236  4e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2767  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.81 
 
 
503 aa  235  6e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3728  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.37 
 
 
276 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1791  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  53.56 
 
 
255 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.693099  normal  0.522962 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3581  precorrin-2 dehydrogenase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  47.97 
 
 
464 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249196  normal  0.492888 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2603  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.16 
 
 
256 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1562  uroporphyrin-III C-methyltransferase  51.64 
 
 
259 aa  233  2.0000000000000002e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2282  uroporphyrin-III C-methyltransferase-like  47.66 
 
 
264 aa  233  3e-60  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0358  uroporphyrin-III C-methyltransferase  51.41 
 
 
510 aa  233  3e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1107  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.08 
 
 
487 aa  232  4.0000000000000004e-60  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03694  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.15 
 
 
479 aa  231  6e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0215  siroheme synthase  46.91 
 
 
462 aa  231  6e-60  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0958  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46 
 
 
273 aa  231  7.000000000000001e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.297399  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0581  uroporphyrin-III C-methyltransferase  50.63 
 
 
264 aa  231  8.000000000000001e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2207  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.4 
 
 
507 aa  231  9e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00880064  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3519  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.28 
 
 
480 aa  231  9e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.605082  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0795  siroheme synthase (Includes: Uroporphyrin-III C-methyltransferase, Precorrin-2 dehydrogenase,Sirohydrochlorin ferrochelatase)  47.11 
 
 
275 aa  230  1e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.751719  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1744  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.61 
 
 
263 aa  229  2e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0662  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.36 
 
 
271 aa  229  3e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0861  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.86 
 
 
472 aa  229  3e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.402872  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1689  uroporphyrin-III C-methyltransferase  52.08 
 
 
239 aa  229  4e-59  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>