More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0343 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0343  uroporphyrin-III C-methyltransferase  100 
 
 
248 aa  506  9.999999999999999e-143  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00230836  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0051  uroporphyrin-III C-methyltransferase  55.79 
 
 
245 aa  287  1e-76  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0142442  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0457  uroporphyrin-III C-methyltransferase  51.38 
 
 
249 aa  258  4e-68  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000204102  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3310  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta-component ferrodoxin domain protein  48.97 
 
 
249 aa  244  9e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.198523  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3863  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.49 
 
 
258 aa  239  4e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.707668  hitchhiker  0.0000644403 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0407  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.8 
 
 
259 aa  233  1.0000000000000001e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1587  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.67 
 
 
258 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00363233  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1989  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  46.09 
 
 
246 aa  233  2.0000000000000002e-60  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.519237  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1148  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.49 
 
 
258 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.660594  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1481  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.27 
 
 
258 aa  232  3e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.822435  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1549  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.67 
 
 
258 aa  232  5e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1309  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.27 
 
 
258 aa  232  5e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1335  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.27 
 
 
258 aa  231  6e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1308  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.27 
 
 
258 aa  231  6e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1445  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.27 
 
 
258 aa  231  6e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.51628  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1517  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.27 
 
 
258 aa  231  6e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.58633e-17 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1349  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.67 
 
 
258 aa  231  9e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.758533  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1248  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / uroporphyrinogen-III synthase  47.76 
 
 
520 aa  231  1e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.472521 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0853  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.86 
 
 
246 aa  224  1e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0687  hypothetical protein  47.35 
 
 
505 aa  223  2e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.943133  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1668  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.88 
 
 
271 aa  221  8e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.228653  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1290  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.67 
 
 
258 aa  219  1.9999999999999999e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0319  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.31 
 
 
497 aa  218  7e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3999  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.26 
 
 
463 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.426226  hitchhiker  0.00756787 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1787  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.71 
 
 
497 aa  216  2.9999999999999998e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000345374  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1834  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.26 
 
 
463 aa  215  5e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000289405 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2189  uroporphyrin-III C-methyltransferase, putative  46.44 
 
 
259 aa  214  9.999999999999999e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3604  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.44 
 
 
463 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.556509 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2162  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.67 
 
 
512 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000123773  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3403  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.44 
 
 
464 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.242571 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1125  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase, uroporphyrinogen-III synthase  44.49 
 
 
516 aa  212  4.9999999999999996e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.325525 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3201  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.12 
 
 
519 aa  211  5.999999999999999e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3581  precorrin-2 dehydrogenase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  43.5 
 
 
464 aa  211  1e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249196  normal  0.492888 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1313  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.61 
 
 
248 aa  209  2e-53  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.511728 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28170  Uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.21 
 
 
464 aa  209  4e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0701  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.08 
 
 
504 aa  208  6e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2383  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  43.32 
 
 
462 aa  208  6e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.806488  hitchhiker  0.00704026 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2236  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.9 
 
 
503 aa  208  6e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2837  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  45.9 
 
 
503 aa  207  1e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.452302  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1698  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  42.08 
 
 
458 aa  207  1e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0715064 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0862  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  47.5 
 
 
276 aa  207  1e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0632575  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1252  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.55 
 
 
505 aa  207  2e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3344  siroheme synthase  43.09 
 
 
464 aa  207  2e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00903193  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3174  uroporphyrin-III C-methyltransferase, C-terminal:siroheme synthase, N-terminal  43.09 
 
 
464 aa  207  2e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.108275  normal  0.319321 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2356  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  44.58 
 
 
262 aa  206  2e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.463328  normal  0.682274 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30340  siroheme synthase  42.68 
 
 
465 aa  206  2e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03694  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.25 
 
 
479 aa  206  3e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2597  siroheme synthase  42.68 
 
 
465 aa  206  3e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3717  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.57 
 
 
288 aa  206  3e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1124  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.2 
 
 
491 aa  206  3e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.219261  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2089  ferrochelatase  40.83 
 
 
474 aa  206  4e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0691041  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0409  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.98 
 
 
511 aa  206  4e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3073  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  47.08 
 
 
276 aa  205  7e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.419877  normal  0.821671 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0899  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  47.08 
 
 
276 aa  204  7e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1160  uroporphyrin-III C-methyltransferase  39.42 
 
 
473 aa  204  8e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.277445  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03219  fused siroheme synthase 1,3-dimethyluroporphyriongen III dehydrogenase and siroheme ferrochelatase/uroporphyrinogen methyltransferase  42.44 
 
 
457 aa  204  1e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0344  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.44 
 
 
457 aa  204  1e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0581  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.73 
 
 
264 aa  204  1e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3744  siroheme synthase  42.44 
 
 
457 aa  204  1e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03171  hypothetical protein  42.44 
 
 
457 aa  204  1e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3838  siroheme synthase  42.44 
 
 
457 aa  204  1e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1023  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.72 
 
 
493 aa  204  1e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3564  siroheme synthase  42.44 
 
 
457 aa  204  1e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0344  siroheme synthase  42.44 
 
 
457 aa  204  1e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.898093 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3650  siroheme synthase  42.44 
 
 
457 aa  204  1e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000355794 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1977  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / uroporphyrinogen-III synthase  43.1 
 
 
513 aa  204  1e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0017868  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0492  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.39 
 
 
246 aa  204  1e-51  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4679  siroheme synthase  42.44 
 
 
457 aa  204  1e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.839222 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3409  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.67 
 
 
278 aa  203  2e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3062  uroporphyrinogen-III methylase  42.56 
 
 
513 aa  203  2e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0927  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.67 
 
 
281 aa  203  2e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1346  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.31 
 
 
511 aa  203  2e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.694338  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0961  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.67 
 
 
281 aa  203  2e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.509191  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1025  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.91 
 
 
293 aa  203  2e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0953  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.67 
 
 
278 aa  202  3e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.553083  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0958  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.12 
 
 
273 aa  202  3e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.297399  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3353  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.22 
 
 
504 aa  202  3e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.422788  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0240  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.52 
 
 
242 aa  202  4e-51  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0608  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  45.61 
 
 
245 aa  202  4e-51  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.807775  normal  0.963545 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1258  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.3 
 
 
508 aa  202  5e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.323904  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4598  siroheme synthase  42.68 
 
 
467 aa  202  5e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3362  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.84 
 
 
480 aa  202  5e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0232  siroheme synthase  42.26 
 
 
473 aa  202  6e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3959  siroheme synthase  42.26 
 
 
473 aa  202  6e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0652  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  41.25 
 
 
493 aa  201  6e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3719  siroheme synthase  42.26 
 
 
470 aa  201  7e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.411824  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3519  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.42 
 
 
480 aa  201  7e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.605082  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3675  siroheme synthase  42.02 
 
 
459 aa  200  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2131  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.53 
 
 
507 aa  201  9.999999999999999e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0860734  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3728  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.08 
 
 
276 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3749  siroheme synthase  42.02 
 
 
457 aa  200  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.848215 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4048  siroheme synthase  41.6 
 
 
459 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3784  siroheme synthase  42.02 
 
 
457 aa  200  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1679  precorrin-2 dehydrogenase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  42.5 
 
 
481 aa  199  1.9999999999999998e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3846  siroheme synthase  42.02 
 
 
457 aa  200  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.130759  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0409  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.15 
 
 
510 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3675  siroheme synthase  42.02 
 
 
457 aa  199  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2767  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.08 
 
 
503 aa  199  3e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3452  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.87 
 
 
525 aa  199  3e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.305578  normal  0.171928 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1175  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.31 
 
 
252 aa  199  3e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.4706  normal  0.0224859 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>