More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2619 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_2619  uroporphyrin-III C-methyltransferase  100 
 
 
257 aa  521  1e-147  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.923758  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2052  uroporphyrin-III C-methyltransferase  63.25 
 
 
266 aa  311  4.999999999999999e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.754921 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5405  uroporphyrin-III C-methyltransferase  56.22 
 
 
252 aa  268  5e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1505  uroporphyrin-III C-methyltransferase  56.96 
 
 
257 aa  268  7e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4641  uroporphyrin-III C-methyltransferase  57.39 
 
 
262 aa  260  2e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2059  uroporphyrin-III C-methyltransferase  52.65 
 
 
252 aa  259  3e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2385  uroporphyrin-III C-methyltransferase  55.51 
 
 
252 aa  255  5e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.10506  normal  0.665855 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2636  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  50.41 
 
 
256 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3091  uroporphyrin-III C-methyltransferase  50.81 
 
 
263 aa  251  6e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00000546581  normal  0.020085 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6616  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.63 
 
 
258 aa  247  1e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0293079 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0240  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.01 
 
 
242 aa  207  1e-52  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0289  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.96 
 
 
239 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00797828  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0457  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.46 
 
 
249 aa  197  1.0000000000000001e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000204102  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1689  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.11 
 
 
239 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0861  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.19 
 
 
244 aa  196  3e-49  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.155668  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0211  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.96 
 
 
239 aa  194  1e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.283358 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0789  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.68 
 
 
239 aa  194  1e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.194909  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1668  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.15 
 
 
271 aa  194  1e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.228653  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1248  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / uroporphyrinogen-III synthase  43.64 
 
 
520 aa  189  4e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.472521 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0343  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.04 
 
 
248 aa  186  5e-46  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00230836  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1125  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase, uroporphyrinogen-III synthase  43.64 
 
 
516 aa  183  2.0000000000000003e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.325525 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2131  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.83 
 
 
507 aa  182  5.0000000000000004e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0860734  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1989  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  41.7 
 
 
246 aa  181  7e-45  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.519237  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03694  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.77 
 
 
479 aa  180  2e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3999  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.68 
 
 
463 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.426226  hitchhiker  0.00756787 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1065  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  39.04 
 
 
554 aa  178  5.999999999999999e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0953  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.64 
 
 
278 aa  178  7e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.553083  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1834  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.68 
 
 
463 aa  178  8e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000289405 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1175  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.07 
 
 
252 aa  177  1e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.4706  normal  0.0224859 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0961  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.64 
 
 
281 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.509191  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2013  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.24 
 
 
283 aa  176  3e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.757619  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3409  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.38 
 
 
278 aa  176  4e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17730  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  41.77 
 
 
329 aa  176  4e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.243259  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0927  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.95 
 
 
281 aa  176  5e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0862  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  41.53 
 
 
276 aa  175  6e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0632575  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3062  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.49 
 
 
512 aa  175  7e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00105684  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2162  uroporphyrin-III C-methyltransferase  39.69 
 
 
512 aa  175  8e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000123773  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3403  uroporphyrin-III C-methyltransferase  39.32 
 
 
464 aa  174  9e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.242571 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2337  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.28 
 
 
258 aa  174  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1397  uroporphyrin-III C-methyltransferase  39.24 
 
 
528 aa  174  9.999999999999999e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3188  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.35 
 
 
272 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06660  putative uroporphyrin-III c-methyltransferase  41.88 
 
 
279 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.253082  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3044  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.88 
 
 
277 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3201  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.22 
 
 
519 aa  174  9.999999999999999e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2286  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.28 
 
 
258 aa  174  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3073  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  41.1 
 
 
276 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.419877  normal  0.821671 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0899  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  41.1 
 
 
276 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3344  siroheme synthase  40.17 
 
 
464 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00903193  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0051  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.85 
 
 
245 aa  173  2.9999999999999996e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0142442  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3604  uroporphyrin-III C-methyltransferase  39.32 
 
 
463 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.556509 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0687  hypothetical protein  44.21 
 
 
505 aa  172  2.9999999999999996e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.943133  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0611  putative uroporphyrin-III c-methyltransferase  41.42 
 
 
279 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.33315  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0787  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.95 
 
 
273 aa  171  7.999999999999999e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.464331  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1124  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.11 
 
 
491 aa  171  7.999999999999999e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.219261  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3062  uroporphyrinogen-III methylase  41.63 
 
 
513 aa  171  1e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0409  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.9 
 
 
510 aa  171  1e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0409  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.17 
 
 
511 aa  170  2e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2471  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  38.53 
 
 
479 aa  171  2e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0675252  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3174  uroporphyrin-III C-methyltransferase, C-terminal:siroheme synthase, N-terminal  39.32 
 
 
464 aa  170  3e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.108275  normal  0.319321 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3559  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.57 
 
 
261 aa  169  4e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.895893  normal  0.323938 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2433  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.78 
 
 
265 aa  169  4e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.554082  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1335  uroporphyrin-III C-methyltransferase  39.08 
 
 
258 aa  169  5e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1308  uroporphyrin-III C-methyltransferase  39.08 
 
 
258 aa  169  5e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1517  uroporphyrin-III C-methyltransferase  39.08 
 
 
258 aa  169  5e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.58633e-17 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3581  precorrin-2 dehydrogenase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  39.74 
 
 
464 aa  169  5e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249196  normal  0.492888 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1445  uroporphyrin-III C-methyltransferase  39.08 
 
 
258 aa  169  5e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.51628  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1148  uroporphyrin-III C-methyltransferase  38.08 
 
 
258 aa  168  7e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.660594  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3797  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.1 
 
 
269 aa  168  7e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000253578  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30340  siroheme synthase  40.25 
 
 
465 aa  168  7e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41563  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.13 
 
 
245 aa  168  7e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0110837  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2922  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.95 
 
 
260 aa  168  8e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.215743  normal  0.0409844 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3353  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.2 
 
 
504 aa  168  8e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.422788  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1587  uroporphyrin-III C-methyltransferase  39.08 
 
 
258 aa  168  1e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00363233  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4048  siroheme synthase  41.28 
 
 
459 aa  167  1e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1309  uroporphyrin-III C-methyltransferase  38.7 
 
 
258 aa  167  1e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23340  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.31 
 
 
245 aa  167  1e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00949185  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3676  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.38 
 
 
272 aa  167  1e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1687  uroporphyrinogen-III methyltransferase/synthase  41.1 
 
 
492 aa  167  1e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0805383  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1421  uroporphyrinogen-III methyltransferase/synthase  41.1 
 
 
492 aa  167  1e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.16426  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3325  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  40 
 
 
512 aa  168  1e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3728  uroporphyrin-III C-methyltransferase  37.65 
 
 
276 aa  167  2e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0322  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  44.02 
 
 
277 aa  166  2e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0672  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.68 
 
 
273 aa  167  2e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00608831 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3863  uroporphyrin-III C-methyltransferase  38.7 
 
 
258 aa  167  2e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.707668  hitchhiker  0.0000644403 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1107  uroporphyrin-III C-methyltransferase  36.91 
 
 
487 aa  167  2e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1481  uroporphyrin-III C-methyltransferase  39.08 
 
 
258 aa  167  2e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.822435  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2597  siroheme synthase  40.17 
 
 
465 aa  167  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1549  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.03 
 
 
258 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02124  siroheme synthase  40.34 
 
 
401 aa  166  2.9999999999999998e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3751  uroporphyrin-III C-methyltransferase  39.27 
 
 
282 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0662  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.95 
 
 
271 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1343  uroporphyrin-III C-methyltransferase  38.4 
 
 
484 aa  166  2.9999999999999998e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2313  uroporphyrin-III C-methyltransferase  38.1 
 
 
502 aa  166  4e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2356  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  38.34 
 
 
262 aa  166  4e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.463328  normal  0.682274 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3717  uroporphyrin-III C-methyltransferase  39.5 
 
 
288 aa  166  4e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0896  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.69 
 
 
506 aa  166  4e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3528  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.53 
 
 
245 aa  166  5e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0179276  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0701  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.31 
 
 
504 aa  166  5e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0581  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.43 
 
 
264 aa  165  5e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1025  uroporphyrin-III C-methyltransferase  38.27 
 
 
293 aa  165  5e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>