55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0361 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_0361  precorrin 6A synthase  100 
 
 		 273 aa  532  1e-150  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0784549 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0376  precorrin 6A synthase  82.68 
 
 		 254 aa  393  1e-108  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2879  precorrin 6A synthase  64.08 
 
 		 239 aa  280  1e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1612  precorrin-6A synthase (deacetylating)  60.16 
 
 		 247 aa  249  4e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17580  precorrin 6A synthase  46.51 
 
 		 252 aa  188  7e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0320  precorrin 6A synthase  47.67 
 
 		 262 aa  187  1e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2657  precorrin 6A synthase  41.96 
 
 		 256 aa  174  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.14068  normal  0.163709 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4424  precorrin 6A synthase  42.59 
 
 		 254 aa  168  8e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.753252 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4338  precorrin 6A synthase  42.59 
 
 		 254 aa  168  8e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0501476  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2504  precorrin-6A synthase  41.9 
 
 		 244 aa  167  2e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.488753 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4718  precorrin 6A synthase  42.21 
 
 		 254 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.502891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1321  precorrin-6A synthase (deacetylating)  43.25 
 
 		 246 aa  164  2.0000000000000002e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3231  precorrin 6A synthase  40.23 
 
 		 252 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00310534 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2819  precorrin 6A synthase  41.86 
 
 		 256 aa  161  1e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.615759 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3763  precorrin 6A synthase  40.55 
 
 		 249 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.21445 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3385  precorrin 6A synthase  44.57 
 
 		 252 aa  160  2e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.852211 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3576  precorrin 6A synthase  45.1 
 
 		 252 aa  160  3e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.982294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3694  precorrin 6A synthase  44.19 
 
 		 252 aa  158  1e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.529674 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6988  precorrin 6A synthase  38.76 
 
 		 261 aa  156  4e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.444795  normal  0.650286 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2442  precorrin 6A synthase  38.13 
 
 		 252 aa  155  9e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0256861  decreased coverage  0.000262915 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0142  precorrin 6A synthase  41.57 
 
 		 297 aa  154  1e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2000  precorrin 6A synthase  39.76 
 
 		 249 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00310446 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7173  precorrin 6A synthase  39.53 
 
 		 254 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.92278  normal  0.266334 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3353  precorrin-6A synthase (deacetylating)  43.48 
 
 		 253 aa  152  5.9999999999999996e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.569272  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2709  tetrapyrrole methylase family protein  38.22 
 
 		 261 aa  152  7e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0861444  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2061  precorrin 6A synthase  36.47 
 
 		 251 aa  152  7e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1896  precorrin 6A synthase  37.65 
 
 		 252 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.628437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2326  precorrin 6A synthase  38.43 
 
 		 253 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.414205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2104  precorrin 6A synthase  40.16 
 
 		 251 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.749049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4201  precorrin 6A synthase  40.81 
 
 		 266 aa  150  3e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3174  precorrin 6A synthase  40.47 
 
 		 253 aa  150  3e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2387  precorrin 6A synthase  37.5 
 
 		 254 aa  149  6e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4583  precorrin 6A synthase  37.89 
 
 		 253 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2140  precorrin 6A synthase  38.58 
 
 		 249 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.1822  hitchhiker  0.0000632781 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6018  precorrin 6A synthase  37.98 
 
 		 254 aa  145  6e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0516711  normal  0.289683 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2224  precorrin 6A synthase  36.78 
 
 		 254 aa  143  4e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2970  precorrin 6A synthase  37.89 
 
 		 257 aa  142  5e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.590816  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2542  precorrin 6A synthase  39.92 
 
 		 249 aa  142  8e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.786467 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0332  precorrin 6A synthase  38.22 
 
 		 254 aa  130  3e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1538  precorrin 6A synthase  39.45 
 
 		 262 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0200089  normal  0.0986349 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2920  precorrin 6A synthase  37.45 
 
 		 246 aa  121  1.9999999999999998e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0390694 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2819  precorrin 6A synthase  38.8 
 
 		 254 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.632211  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5843  precorrin 6A synthase  36.19 
 
 		 265 aa  110  3e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1477  precorrin 6A synthase  38.8 
 
 		 254 aa  109  5e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.756738  normal  0.444029 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1527  precorrin 6A synthase  39.15 
 
 		 245 aa  106  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.626854  normal  0.483999 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2135  precorrin-2 C20-methyltransferase  30.32 
 
 		 239 aa  55.5  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0352605 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1714  precorrin-2 C20-methyltransferase  32.53 
 
 		 236 aa  54.3  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1500  precorrin-2 C20-methyltransferase  30.11 
 
 		 259 aa  53.1  0.000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1522  cobalt-precorrin-2 C(20)-methyltransferase  29.01 
 
 		 209 aa  52.4  0.000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000310651 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2314  precorrin-2 C20-methyltransferase  31.74 
 
 		 256 aa  50.8  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.144109 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4161  precorrin-2 C20-methyltransferase  38.37 
 
 		 301 aa  47.4  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0393097  normal  0.411769 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1556  precorrin-2 C20-methyltransferase  26.81 
 
 		 233 aa  44.7  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1297  precorrin-2 C20-methyltransferase  27.78 
 
 		 247 aa  42.4  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0639  cobalt-factor II C20-methyltransferase / precorrin-2 C20-methyltransferase  44.26 
 
 		 238 aa  42  0.01  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0277633  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2995  precorrin-2 C20-methyltransferase  30.41 
 
 		 236 aa  42  0.01  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>