174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3174 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3174  precorrin 6A synthase  100 
 
 		 253 aa  498  1e-140  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2326  precorrin 6A synthase  72.33 
 
 		 253 aa  371  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.414205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2387  precorrin 6A synthase  67.33 
 
 		 254 aa  353  1e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1896  precorrin 6A synthase  56.97 
 
 		 252 aa  285  4e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.628437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2657  precorrin 6A synthase  57.2 
 
 		 256 aa  273  2.0000000000000002e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.14068  normal  0.163709 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7173  precorrin 6A synthase  54.4 
 
 		 254 aa  269  2.9999999999999997e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.92278  normal  0.266334 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3231  precorrin 6A synthase  56.4 
 
 		 252 aa  268  5.9999999999999995e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00310534 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6018  precorrin 6A synthase  52.8 
 
 		 254 aa  264  8.999999999999999e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0516711  normal  0.289683 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2442  precorrin 6A synthase  52 
 
 		 252 aa  255  4e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0256861  decreased coverage  0.000262915 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2819  precorrin 6A synthase  51.2 
 
 		 256 aa  255  5e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.615759 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2104  precorrin 6A synthase  54.44 
 
 		 251 aa  255  6e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.749049  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2709  tetrapyrrole methylase family protein  51.37 
 
 		 261 aa  247  1e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0861444  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2061  precorrin 6A synthase  48.4 
 
 		 251 aa  246  3e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6988  precorrin 6A synthase  50 
 
 		 261 aa  245  4e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.444795  normal  0.650286 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2970  precorrin 6A synthase  52.17 
 
 		 257 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.590816  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2140  precorrin 6A synthase  50.2 
 
 		 249 aa  236  2e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.1822  hitchhiker  0.0000632781 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3763  precorrin 6A synthase  50.4 
 
 		 249 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.21445 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2000  precorrin 6A synthase  50 
 
 		 249 aa  231  6e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00310446 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2504  precorrin-6A synthase  51.21 
 
 		 244 aa  226  2e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.488753 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3576  precorrin 6A synthase  54.4 
 
 		 252 aa  226  4e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.982294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4583  precorrin 6A synthase  47.79 
 
 		 253 aa  225  6e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3385  precorrin 6A synthase  54.44 
 
 		 252 aa  224  9e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.852211 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4338  precorrin 6A synthase  49.41 
 
 		 254 aa  223  2e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0501476  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4424  precorrin 6A synthase  49.41 
 
 		 254 aa  223  2e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.753252 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3694  precorrin 6A synthase  54.03 
 
 		 252 aa  221  8e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.529674 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0320  precorrin 6A synthase  49.42 
 
 		 262 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4718  precorrin 6A synthase  49.02 
 
 		 254 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.502891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1538  precorrin 6A synthase  51.41 
 
 		 262 aa  207  2e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0200089  normal  0.0986349 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1321  precorrin-6A synthase (deacetylating)  47.97 
 
 		 246 aa  203  3e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2224  precorrin 6A synthase  45.06 
 
 		 254 aa  202  5e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0142  precorrin 6A synthase  47.01 
 
 		 297 aa  201  8e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0332  precorrin 6A synthase  46.27 
 
 		 254 aa  201  9.999999999999999e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4201  precorrin 6A synthase  46.18 
 
 		 266 aa  197  1.0000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2542  precorrin 6A synthase  44.27 
 
 		 249 aa  193  2e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.786467 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3353  precorrin-6A synthase (deacetylating)  45.21 
 
 		 253 aa  185  7e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.569272  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17580  precorrin 6A synthase  43.31 
 
 		 252 aa  184  1.0000000000000001e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5843  precorrin 6A synthase  45.35 
 
 		 265 aa  179  4e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2819  precorrin 6A synthase  44.49 
 
 		 254 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.632211  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1477  precorrin 6A synthase  44.49 
 
 		 254 aa  169  3e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.756738  normal  0.444029 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1527  precorrin 6A synthase  42.46 
 
 		 245 aa  168  8e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.626854  normal  0.483999 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2920  precorrin 6A synthase  40.08 
 
 		 246 aa  154  1e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0390694 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2879  precorrin 6A synthase  40.16 
 
 		 239 aa  149  5e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0376  precorrin 6A synthase  40.47 
 
 		 254 aa  145  8.000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0361  precorrin 6A synthase  40.47 
 
 		 273 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0784549 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1612  precorrin-6A synthase (deacetylating)  37.15 
 
 		 247 aa  117  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0115  precorrin-2 C20-methyltransferase  25.23 
 
 		 222 aa  77.4  0.0000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.942057  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2657  precorrin-2 C20-methyltransferase, putative  25.15 
 
 		 222 aa  65.1  0.000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1714  precorrin-2 C20-methyltransferase  26.73 
 
 		 236 aa  64.7  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1500  precorrin-2 C20-methyltransferase  33.16 
 
 		 259 aa  60.5  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1556  precorrin-2 C20-methyltransferase  26.99 
 
 		 233 aa  60.1  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2735  precorrin-2 C20-methyltransferase  28.72 
 
 		 236 aa  59.3  0.00000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000618723  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2314  precorrin-2 C20-methyltransferase  29.28 
 
 		 256 aa  58.9  0.00000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.144109 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3107  cobalt-factor II C20-methyltransferase / precorrin-2 C20-methyltransferase  30.53 
 
 		 239 aa  58.9  0.00000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1271  precorrin-2 C20-methyltransferase  29.34 
 
 		 226 aa  57.8  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0799  precorrin-2 C20-methyltransferase  28.57 
 
 		 236 aa  57.8  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1293  precorrin-2 C20-methyltransferase  24.76 
 
 		 236 aa  57.4  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.116679 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04091  precorrin-2 C20-methyltransferase  26.09 
 
 		 251 aa  57.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2135  precorrin-2 C20-methyltransferase  22.92 
 
 		 239 aa  56.6  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0352605 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0312  precorrin-2 C20-methyltransferase  27.89 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1522  cobalt-precorrin-2 C(20)-methyltransferase  28.77 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000310651 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0554  precorrin-2 C20-methyltransferase  30.67 
 
 		 240 aa  54.7  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0570  precorrin-2 C20-methyltransferase  29.17 
 
 		 242 aa  53.5  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.307877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04401  precorrin-2-C20-methyltransferase  24.84 
 
 		 251 aa  53.1  0.000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0632  precorrin-2 C20-methyltransferase  29.41 
 
 		 228 aa  53.1  0.000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1710  cobalt-precorrin-2 C(20)-methyltransferase  25.67 
 
 		 237 aa  52.8  0.000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2441  precorrin-2 C20-methyltransferase  26.15 
 
 		 262 aa  52.4  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.161962  normal  0.0706437 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6036  precorrin-2 C20-methyltransferase  27.04 
 
 		 248 aa  51.2  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0310  precorrin-6y C5,15-methyltransferase (decarboxylating), CbiE subunit  23.81 
 
 		 203 aa  51.6  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0385  cobalt-factor II C20-methyltransferase  23.75 
 
 		 251 aa  51.2  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1552  precorrin-4 C11-methyltransferase  28.74 
 
 		 283 aa  50.8  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.886587 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3502  precorrin-2 C20-methyltransferase  24.37 
 
 		 234 aa  50.8  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000438049  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1012  precorrin-2 C20-methyltransferase  26 
 
 		 238 aa  51.2  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1375  precorrin-2 C20-methyltransferase  24.62 
 
 		 227 aa  51.2  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1431  cobalt-precorrin-2 C(20)-methyltransferase  25.34 
 
 		 220 aa  50.1  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0227456  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04511  precorrin-2 C20-methyltransferase  25.61 
 
 		 254 aa  50.1  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1077  cobalt-precorrin-2 C(20)-methyltransferase  25.66 
 
 		 203 aa  50.4  0.00003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1227  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  24.42 
 
 		 213 aa  50.1  0.00003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000574756  normal  0.766781 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2610  precorrin-2 C20-methyltransferase  27.61 
 
 		 233 aa  49.7  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0639  precorrin-2 C20-methyltransferase  25.5 
 
 		 242 aa  49.3  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5690  precorrin-2 C20-methyltransferase  27.4 
 
 		 255 aa  48.9  0.00007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.23715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0701  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  22.7 
 
 		 211 aa  48.9  0.00008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1321  precorrin-2 C20-methyltransferase  28.88 
 
 		 228 aa  48.9  0.00008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1968  precorrin-4 C11-methyltransferase  27.65 
 
 		 261 aa  48.5  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.264672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0995  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  28.77 
 
 		 276 aa  48.5  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1355  cobalt-factor II C20-methyltransferase  28.34 
 
 		 228 aa  48.5  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0248  precorrin-2 C20-methyltransferase  25 
 
 		 232 aa  48.1  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3374  precorrin-2 C20-methyltransferase  23.66 
 
 		 246 aa  48.1  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.299047 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6035  precorrin-4 C11-methyltransferase  26.19 
 
 		 275 aa  47.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3477  cobalt-precorrin-2 C(20)-methyltransferase  27.97 
 
 		 289 aa  47.8  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1237  cobalt-precorrin-2 C(20)-methyltransferase  25.34 
 
 		 220 aa  47.8  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.433092  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0709  uroporphyrin-III C-methyltransferase  25.27 
 
 		 458 aa  47.8  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0509  cobalt-precorrin-2 C(20)-methyltransferase  27.59 
 
 		 205 aa  47.8  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0789  uroporphyrin-III C-methyltransferase  23.3 
 
 		 239 aa  47.8  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.194909  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0289  uroporphyrin-III C-methyltransferase  23.76 
 
 		 239 aa  47.4  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00797828  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1897  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  28.97 
 
 		 244 aa  47.8  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0807274  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1433  precorrin-2 C20-methyltransferase  29.53 
 
 		 265 aa  47  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.69961 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0115  uroporphyrin-III C-methyltransferase  23.41 
 
 		 244 aa  47  0.0003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04401  precorrin-2 C20-methyltransferase  24.24 
 
 		 242 aa  47  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.614023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1330  precorrin-2 C20-methyltransferase  28.57 
 
 		 228 aa  47  0.0003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1077  uroporphyrin-III C-methyltransferase  24.48 
 
 		 490 aa  47  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0490237  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>