176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_7173 on replicon NC_012858
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012858  Rleg_7173  precorrin 6A synthase  100 
 
 
254 aa  517  1e-146  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.92278  normal  0.266334 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6018  precorrin 6A synthase  83.79 
 
 
254 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0516711  normal  0.289683 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2819  precorrin 6A synthase  65.1 
 
 
256 aa  336  1.9999999999999998e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.615759 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3174  precorrin 6A synthase  54.4 
 
 
253 aa  269  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2326  precorrin 6A synthase  53.01 
 
 
253 aa  267  1e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.414205  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1896  precorrin 6A synthase  53.78 
 
 
252 aa  261  1e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.628437  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2061  precorrin 6A synthase  52 
 
 
251 aa  260  2e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6988  precorrin 6A synthase  50.4 
 
 
261 aa  257  1e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.444795  normal  0.650286 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3385  precorrin 6A synthase  57.37 
 
 
252 aa  255  5e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.852211 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2387  precorrin 6A synthase  51.78 
 
 
254 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3231  precorrin 6A synthase  51.39 
 
 
252 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00310534 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3694  precorrin 6A synthase  57.37 
 
 
252 aa  252  3e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.529674 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3576  precorrin 6A synthase  56.18 
 
 
252 aa  249  3e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.982294  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2657  precorrin 6A synthase  51.39 
 
 
256 aa  246  2e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.14068  normal  0.163709 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4338  precorrin 6A synthase  52.34 
 
 
254 aa  245  4e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0501476  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4424  precorrin 6A synthase  52.34 
 
 
254 aa  245  4e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.753252 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4718  precorrin 6A synthase  51.95 
 
 
254 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.502891  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2442  precorrin 6A synthase  47.6 
 
 
252 aa  237  1e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0256861  decreased coverage  0.000262915 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2224  precorrin 6A synthase  47.66 
 
 
254 aa  231  8.000000000000001e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2709  tetrapyrrole methylase family protein  47.45 
 
 
261 aa  231  9e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0861444  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2104  precorrin 6A synthase  47.39 
 
 
251 aa  229  4e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.749049  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2504  precorrin-6A synthase  49 
 
 
244 aa  225  5.0000000000000005e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.488753 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0332  precorrin 6A synthase  49 
 
 
254 aa  225  6e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4583  precorrin 6A synthase  48.02 
 
 
253 aa  222  4e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3763  precorrin 6A synthase  45.38 
 
 
249 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.21445 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2970  precorrin 6A synthase  47.64 
 
 
257 aa  218  6e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.590816  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2542  precorrin 6A synthase  48.03 
 
 
249 aa  215  5e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.786467 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2140  precorrin 6A synthase  44.58 
 
 
249 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.1822  hitchhiker  0.0000632781 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2000  precorrin 6A synthase  44.98 
 
 
249 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00310446 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1321  precorrin-6A synthase (deacetylating)  47.98 
 
 
246 aa  210  2e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3353  precorrin-6A synthase (deacetylating)  47.22 
 
 
253 aa  209  5e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.569272  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1538  precorrin 6A synthase  48.21 
 
 
262 aa  207  1e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0200089  normal  0.0986349 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5843  precorrin 6A synthase  44.96 
 
 
265 aa  202  3e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4201  precorrin 6A synthase  43.31 
 
 
266 aa  193  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0320  precorrin 6A synthase  45.67 
 
 
262 aa  190  2e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2819  precorrin 6A synthase  45.85 
 
 
254 aa  189  4e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.632211  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1477  precorrin 6A synthase  45.45 
 
 
254 aa  187  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.756738  normal  0.444029 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2920  precorrin 6A synthase  43.27 
 
 
246 aa  181  9.000000000000001e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0390694 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0142  precorrin 6A synthase  40.8 
 
 
297 aa  178  7e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17580  precorrin 6A synthase  39.68 
 
 
252 aa  175  5e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1527  precorrin 6A synthase  43.43 
 
 
245 aa  172  5e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.626854  normal  0.483999 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2879  precorrin 6A synthase  38.21 
 
 
239 aa  149  3e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0361  precorrin 6A synthase  39.77 
 
 
273 aa  146  3e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0784549 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0376  precorrin 6A synthase  37.98 
 
 
254 aa  144  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1612  precorrin-6A synthase (deacetylating)  37.84 
 
 
247 aa  138  8.999999999999999e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0058  precorrin-2 C20-methyltransferase  27.08 
 
 
240 aa  68.2  0.0000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3502  precorrin-2 C20-methyltransferase  32.32 
 
 
234 aa  67.4  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000438049  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1556  precorrin-2 C20-methyltransferase  28 
 
 
233 aa  65.5  0.0000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1714  precorrin-2 C20-methyltransferase  28.38 
 
 
236 aa  64.3  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0570  precorrin-2 C20-methyltransferase  28.35 
 
 
242 aa  64.3  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.307877  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1710  cobalt-precorrin-2 C(20)-methyltransferase  27.75 
 
 
237 aa  63.2  0.000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2135  precorrin-2 C20-methyltransferase  28.65 
 
 
239 aa  63.2  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0352605 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1091  cobalt-factor II C20-methyltransferase / precorrin-2 C20-methyltransferase  27.78 
 
 
237 aa  62  0.000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1522  cobalt-precorrin-2 C(20)-methyltransferase  28.26 
 
 
209 aa  61.6  0.00000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000310651 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6036  precorrin-2 C20-methyltransferase  29.34 
 
 
248 aa  60.8  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1297  precorrin-2 C20-methyltransferase  33.13 
 
 
247 aa  61.2  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0639  precorrin-2 C20-methyltransferase  30.92 
 
 
242 aa  60.8  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0312  precorrin-2 C20-methyltransferase  31.65 
 
 
224 aa  59.7  0.00000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0799  precorrin-2 C20-methyltransferase  32.41 
 
 
236 aa  59.7  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3374  precorrin-2 C20-methyltransferase  27.57 
 
 
246 aa  59.7  0.00000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.299047 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2706  precorrin-2 C20-methyltransferase  29.02 
 
 
247 aa  58.9  0.00000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000899582 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2995  precorrin-2 C20-methyltransferase  29.52 
 
 
236 aa  58.5  0.00000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04401  precorrin-2 C20-methyltransferase  31.01 
 
 
242 aa  57.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.614023  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1723  precorrin-2 C20-methyltransferase / cobalt-factor II C20-methyltransferase  30.57 
 
 
242 aa  57  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2610  precorrin-2 C20-methyltransferase  30.67 
 
 
233 aa  56.6  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04091  precorrin-2 C20-methyltransferase  30.34 
 
 
251 aa  56.2  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1077  cobalt-precorrin-2 C(20)-methyltransferase  27.42 
 
 
203 aa  55.8  0.0000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1293  precorrin-2 C20-methyltransferase  28.11 
 
 
236 aa  55.8  0.0000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.116679 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3542  precorrin-2 C20-methyltransferase  29.09 
 
 
236 aa  54.7  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2359  cobalt-precorrin-2 C(20)-methyltransferase  27.08 
 
 
203 aa  54.7  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2314  precorrin-2 C20-methyltransferase  28.96 
 
 
256 aa  54.7  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.144109 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0115  precorrin-2 C20-methyltransferase  21.94 
 
 
222 aa  54.3  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.942057  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1266  precorrin-2 C20-methyltransferase  28.93 
 
 
240 aa  54.3  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1321  precorrin-2 C20-methyltransferase  27.74 
 
 
228 aa  54.3  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2479  precorrin-3B C17-methyltransferase  28.29 
 
 
500 aa  53.9  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0466913  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2524  precorrin-2 C20-methyltransferase  27.27 
 
 
247 aa  53.5  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00515181  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2865  precorrin-2 C20-methyltransferase / cobalt-factor II C20-methyltransferase  26.9 
 
 
234 aa  53.1  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1500  precorrin-2 C20-methyltransferase  28.65 
 
 
259 aa  53.1  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1330  precorrin-2 C20-methyltransferase  27.92 
 
 
228 aa  53.1  0.000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1012  precorrin-2 C20-methyltransferase  25.66 
 
 
238 aa  52.8  0.000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0632  precorrin-2 C20-methyltransferase  27.74 
 
 
228 aa  52.8  0.000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3265  precorrin-2 C20-methyltransferase  25.95 
 
 
247 aa  52.4  0.000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.180313 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04401  precorrin-2-C20-methyltransferase  29.66 
 
 
251 aa  52.4  0.000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2735  precorrin-2 C20-methyltransferase  28.28 
 
 
236 aa  52.4  0.000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000618723  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03851  precorrin-2 C20-methyltransferase  29.49 
 
 
273 aa  52  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2926  putative cobalamin biosynthesis protein  27.43 
 
 
240 aa  52  0.000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1968  precorrin-4 C11-methyltransferase  28.03 
 
 
261 aa  51.6  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.264672  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1375  precorrin-2 C20-methyltransferase  26.49 
 
 
227 aa  51.6  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1237  cobalt-precorrin-2 C(20)-methyltransferase  26.67 
 
 
220 aa  51.6  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.433092  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1355  cobalt-factor II C20-methyltransferase  27.1 
 
 
228 aa  51.6  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0248  precorrin-2 C20-methyltransferase  26.75 
 
 
232 aa  51.6  0.00001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2657  precorrin-2 C20-methyltransferase, putative  23.68 
 
 
222 aa  50.4  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3107  cobalt-factor II C20-methyltransferase / precorrin-2 C20-methyltransferase  28.48 
 
 
239 aa  51.2  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0694  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  24.29 
 
 
247 aa  50.8  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.210241  hitchhiker  0.0000263723 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0476  precorrin-2 C20-methyltransferase  26.11 
 
 
256 aa  50.1  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0905  precorrin-4 C11-methyltransferase  29.03 
 
 
269 aa  50.4  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1781  precorrin-3B C17-methyltransferase  28.39 
 
 
516 aa  50.4  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.629094  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3210  cobalt-precorrin-2 C(20)-methyltransferase  25.83 
 
 
203 aa  50.1  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0509  cobalt-precorrin-2 C(20)-methyltransferase  24.72 
 
 
205 aa  50.1  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1313  precorrin-2 C20-methyltransferase  29.33 
 
 
239 aa  49.7  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0407603  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>