71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0142 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0142  precorrin 6A synthase  100 
 
 		 297 aa  572  1.0000000000000001e-162  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2657  precorrin 6A synthase  52.55 
 
 		 256 aa  251  8.000000000000001e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.14068  normal  0.163709 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6988  precorrin 6A synthase  51.81 
 
 		 261 aa  246  4.9999999999999997e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.444795  normal  0.650286 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1896  precorrin 6A synthase  50.2 
 
 		 252 aa  220  3e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.628437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2442  precorrin 6A synthase  44.8 
 
 		 252 aa  218  7e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0256861  decreased coverage  0.000262915 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2104  precorrin 6A synthase  49.41 
 
 		 251 aa  218  7e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.749049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17580  precorrin 6A synthase  50.79 
 
 		 252 aa  218  1e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3763  precorrin 6A synthase  48.62 
 
 		 249 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.21445 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2709  tetrapyrrole methylase family protein  45.14 
 
 		 261 aa  215  7e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0861444  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1321  precorrin-6A synthase (deacetylating)  48.37 
 
 		 246 aa  215  7e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3231  precorrin 6A synthase  45.6 
 
 		 252 aa  212  5.999999999999999e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00310534 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2061  precorrin 6A synthase  45.2 
 
 		 251 aa  212  7e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2140  precorrin 6A synthase  49.01 
 
 		 249 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.1822  hitchhiker  0.0000632781 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2387  precorrin 6A synthase  46.06 
 
 		 254 aa  210  3e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2326  precorrin 6A synthase  46.61 
 
 		 253 aa  207  1e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.414205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2000  precorrin 6A synthase  48.22 
 
 		 249 aa  206  3e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00310446 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3576  precorrin 6A synthase  50.2 
 
 		 252 aa  206  3e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.982294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0320  precorrin 6A synthase  50 
 
 		 262 aa  206  3e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2819  precorrin 6A synthase  46.61 
 
 		 256 aa  206  4e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.615759 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2504  precorrin-6A synthase  48.19 
 
 		 244 aa  205  7e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.488753 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1538  precorrin 6A synthase  53.04 
 
 		 262 aa  205  8e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0200089  normal  0.0986349 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3385  precorrin 6A synthase  49.8 
 
 		 252 aa  202  4e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.852211 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4583  precorrin 6A synthase  44.62 
 
 		 253 aa  202  5e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3174  precorrin 6A synthase  47.01 
 
 		 253 aa  202  7e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3694  precorrin 6A synthase  49.8 
 
 		 252 aa  201  9e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.529674 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4424  precorrin 6A synthase  47.47 
 
 		 254 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.753252 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2970  precorrin 6A synthase  44.62 
 
 		 257 aa  194  2e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.590816  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4338  precorrin 6A synthase  47.47 
 
 		 254 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0501476  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4718  precorrin 6A synthase  47.47 
 
 		 254 aa  193  3e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.502891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4201  precorrin 6A synthase  46.59 
 
 		 266 aa  191  1e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6018  precorrin 6A synthase  41.6 
 
 		 254 aa  189  5e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0516711  normal  0.289683 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0332  precorrin 6A synthase  44.71 
 
 		 254 aa  188  1e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3353  precorrin-6A synthase (deacetylating)  44.88 
 
 		 253 aa  182  4.0000000000000006e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.569272  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2542  precorrin 6A synthase  44.22 
 
 		 249 aa  180  2.9999999999999997e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.786467 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7173  precorrin 6A synthase  40.8 
 
 		 254 aa  178  8e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.92278  normal  0.266334 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2224  precorrin 6A synthase  42.29 
 
 		 254 aa  176  6e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2879  precorrin 6A synthase  45.78 
 
 		 239 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2920  precorrin 6A synthase  43.37 
 
 		 246 aa  165  8e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0390694 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0376  precorrin 6A synthase  43.08 
 
 		 254 aa  157  3e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5843  precorrin 6A synthase  43.36 
 
 		 265 aa  154  1e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2819  precorrin 6A synthase  42.74 
 
 		 254 aa  150  3e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.632211  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1527  precorrin 6A synthase  44.22 
 
 		 245 aa  148  8e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.626854  normal  0.483999 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1477  precorrin 6A synthase  42.34 
 
 		 254 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.756738  normal  0.444029 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0361  precorrin 6A synthase  41.57 
 
 		 273 aa  147  3e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0784549 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1612  precorrin-6A synthase (deacetylating)  42.8 
 
 		 247 aa  133  5e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1714  precorrin-2 C20-methyltransferase  31.74 
 
 		 236 aa  61.6  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0799  precorrin-2 C20-methyltransferase  29.36 
 
 		 236 aa  60.8  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3502  precorrin-2 C20-methyltransferase  29.06 
 
 		 234 aa  59.7  0.00000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000438049  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3107  cobalt-factor II C20-methyltransferase / precorrin-2 C20-methyltransferase  30.18 
 
 		 239 aa  59.3  0.00000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2706  precorrin-2 C20-methyltransferase  35.03 
 
 		 247 aa  55.1  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000899582 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2735  precorrin-2 C20-methyltransferase  29.24 
 
 		 236 aa  50.8  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000618723  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0693  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  26.94 
 
 		 172 aa  50.4  0.00004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.152169  hitchhiker  0.0000247866 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0509  cobalt-precorrin-2 C(20)-methyltransferase  30.97 
 
 		 205 aa  50.1  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2524  precorrin-2 C20-methyltransferase  33.17 
 
 		 247 aa  49.3  0.00009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00515181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1781  precorrin-3B C17-methyltransferase  27.17 
 
 		 516 aa  47.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.629094  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2190  precorrin-3B C17-methyltransferase  29.8 
 
 		 490 aa  47.4  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.501177  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1237  cobalt-precorrin-2 C(20)-methyltransferase  26.97 
 
 		 220 aa  46.6  0.0005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.433092  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1722  cobalt-precorrin-2 C(20)-methyltransferase  28.1 
 
 		 202 aa  46.2  0.0006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1500  precorrin-2 C20-methyltransferase  27.37 
 
 		 259 aa  45.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3374  precorrin-2 C20-methyltransferase  22.62 
 
 		 246 aa  44.7  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.299047 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1091  cobalt-factor II C20-methyltransferase / precorrin-2 C20-methyltransferase  30.12 
 
 		 237 aa  43.9  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5595  Precorrin-3B methylase-like protein  28.19 
 
 		 509 aa  43.9  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0773745  normal  0.51395 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6036  precorrin-2 C20-methyltransferase  26.99 
 
 		 248 aa  43.5  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1710  cobalt-precorrin-2 C(20)-methyltransferase  25.49 
 
 		 237 aa  43.9  0.004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1271  precorrin-2 C20-methyltransferase  29.45 
 
 		 226 aa  43.1  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2300  uroporphyrin-III C-methyltransferase  29.63 
 
 		 253 aa  43.1  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00412694  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04091  precorrin-2 C20-methyltransferase  24.1 
 
 		 251 aa  42.7  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1853  cobalt-factor II C20-methyltransferase / precorrin-2 C20-methyltransferase  28.76 
 
 		 234 aa  42.7  0.007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.254503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2314  precorrin-2 C20-methyltransferase  28.74 
 
 		 256 aa  42.7  0.008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.144109 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3532  uroporphyrin-III C-methyltransferase  29.73 
 
 		 268 aa  42.4  0.009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.607966  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1431  cobalt-precorrin-2 C(20)-methyltransferase  25.66 
 
 		 220 aa  42.4  0.01  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0227456  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>