170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2224 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2224  precorrin 6A synthase  100 
 
 		 254 aa  517  1e-146  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2542  precorrin 6A synthase  59.06 
 
 		 249 aa  286  2e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.786467 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0332  precorrin 6A synthase  54.15 
 
 		 254 aa  260  1e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2819  precorrin 6A synthase  56.75 
 
 		 254 aa  248  9e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.632211  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2920  precorrin 6A synthase  53.41 
 
 		 246 aa  245  4e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0390694 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1477  precorrin 6A synthase  56.35 
 
 		 254 aa  245  4.9999999999999997e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.756738  normal  0.444029 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2819  precorrin 6A synthase  48.43 
 
 		 256 aa  239  2.9999999999999997e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.615759 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7173  precorrin 6A synthase  47.66 
 
 		 254 aa  231  8.000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.92278  normal  0.266334 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1527  precorrin 6A synthase  54.37 
 
 		 245 aa  231  9e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.626854  normal  0.483999 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5843  precorrin 6A synthase  50.78 
 
 		 265 aa  229  4e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2326  precorrin 6A synthase  49 
 
 		 253 aa  226  3e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.414205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6018  precorrin 6A synthase  45.31 
 
 		 254 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0516711  normal  0.289683 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3231  precorrin 6A synthase  45.28 
 
 		 252 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00310534 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2387  precorrin 6A synthase  45.45 
 
 		 254 aa  212  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3694  precorrin 6A synthase  48.81 
 
 		 252 aa  209  2e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.529674 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3385  precorrin 6A synthase  48.41 
 
 		 252 aa  207  9e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.852211 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6988  precorrin 6A synthase  42.52 
 
 		 261 aa  207  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.444795  normal  0.650286 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3576  precorrin 6A synthase  47.64 
 
 		 252 aa  204  1e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.982294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3174  precorrin 6A synthase  45.06 
 
 		 253 aa  202  5e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2657  precorrin 6A synthase  44.88 
 
 		 256 aa  201  8e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.14068  normal  0.163709 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1896  precorrin 6A synthase  43.08 
 
 		 252 aa  201  8e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.628437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4338  precorrin 6A synthase  41.63 
 
 		 254 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0501476  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4424  precorrin 6A synthase  41.63 
 
 		 254 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.753252 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4718  precorrin 6A synthase  41.25 
 
 		 254 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.502891  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3353  precorrin-6A synthase (deacetylating)  46.67 
 
 		 253 aa  198  5e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.569272  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4583  precorrin 6A synthase  42.29 
 
 		 253 aa  198  9e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2104  precorrin 6A synthase  42.69 
 
 		 251 aa  196  3e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.749049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2061  precorrin 6A synthase  42.91 
 
 		 251 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1538  precorrin 6A synthase  47.24 
 
 		 262 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0200089  normal  0.0986349 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2140  precorrin 6A synthase  43.08 
 
 		 249 aa  195  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.1822  hitchhiker  0.0000632781 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3763  precorrin 6A synthase  42.29 
 
 		 249 aa  195  6e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.21445 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4201  precorrin 6A synthase  42.75 
 
 		 266 aa  194  9e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1321  precorrin-6A synthase (deacetylating)  42.86 
 
 		 246 aa  193  2e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2000  precorrin 6A synthase  41.9 
 
 		 249 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00310446 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2504  precorrin-6A synthase  41.27 
 
 		 244 aa  180  2e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.488753 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2709  tetrapyrrole methylase family protein  40.93 
 
 		 261 aa  180  2e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0861444  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2442  precorrin 6A synthase  39.76 
 
 		 252 aa  178  9e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0256861  decreased coverage  0.000262915 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2970  precorrin 6A synthase  40.78 
 
 		 257 aa  177  2e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.590816  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0142  precorrin 6A synthase  42.29 
 
 		 297 aa  176  3e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17580  precorrin 6A synthase  40.47 
 
 		 252 aa  168  8e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0320  precorrin 6A synthase  41.8 
 
 		 262 aa  157  1e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2879  precorrin 6A synthase  38.4 
 
 		 239 aa  152  5e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0376  precorrin 6A synthase  36.02 
 
 		 254 aa  133  3e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0361  precorrin 6A synthase  36.78 
 
 		 273 aa  132  6e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0784549 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1612  precorrin-6A synthase (deacetylating)  35.55 
 
 		 247 aa  123  3e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2083  precorrin-2 methyltransferase  29.56 
 
 		 252 aa  68.9  0.00000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0058  precorrin-2 C20-methyltransferase  26.25 
 
 		 240 aa  63.5  0.000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1897  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  27.47 
 
 		 244 aa  63.2  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0807274  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0316  precorrin-2 C20-methyltransferase / precorrin-3 methyltransferase  31.25 
 
 		 511 aa  62.8  0.000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2479  precorrin-3B C17-methyltransferase  33.11 
 
 		 500 aa  62.4  0.000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0466913  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2816  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  33.95 
 
 		 257 aa  60.1  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.631326 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2995  precorrin-2 C20-methyltransferase  30.89 
 
 		 236 aa  58.9  0.00000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1288  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  30.77 
 
 		 244 aa  58.5  0.00000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1251  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  30.77 
 
 		 244 aa  58.5  0.00000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0286047  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1781  precorrin-3B C17-methyltransferase  28.93 
 
 		 516 aa  58.2  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.629094  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1710  cobalt-precorrin-2 C(20)-methyltransferase  27.27 
 
 		 237 aa  58.2  0.0000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6021  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  31.65 
 
 		 243 aa  58.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0179005  normal  0.20153 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2990  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  25.73 
 
 		 244 aa  57.4  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1645  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  29.22 
 
 		 244 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.839045  normal  0.484844 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2735  precorrin-2 C20-methyltransferase  32.03 
 
 		 236 aa  57.4  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000618723  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4822  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  29.22 
 
 		 244 aa  57  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.525292 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0153  precorrin-3B C17-methyltransferase  32.1 
 
 		 513 aa  56.6  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3283  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  29.11 
 
 		 241 aa  57  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.308493  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1163  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  28.48 
 
 		 244 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00204005  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1192  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  28.57 
 
 		 244 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0836971  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1572  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  28.57 
 
 		 244 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.477506  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1672  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  28.57 
 
 		 244 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.130434  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1604  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  28.48 
 
 		 244 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.189665  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1590  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  28.57 
 
 		 244 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.388218 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2111  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  27.85 
 
 		 244 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.414891  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0606  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  27.08 
 
 		 244 aa  55.8  0.0000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.728807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0266  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  27.85 
 
 		 244 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0493785  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1948  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  27.85 
 
 		 244 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.180512  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1965  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  27.85 
 
 		 244 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00527923  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0894  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  27.85 
 
 		 244 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.19117  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4875  precorrin-2 C20-methyltransferase  26.73 
 
 		 243 aa  55.5  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1297  precorrin-2 C20-methyltransferase  30 
 
 		 247 aa  55.5  0.0000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3374  precorrin-2 C20-methyltransferase  25.21 
 
 		 246 aa  55.5  0.0000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.299047 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2190  precorrin-3B C17-methyltransferase  29.61 
 
 		 490 aa  54.7  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.501177  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1556  precorrin-2 C20-methyltransferase  25.66 
 
 		 233 aa  54.3  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1570  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  24.71 
 
 		 244 aa  53.5  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.058507 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26510  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  26.44 
 
 		 250 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0109383  normal  0.778787 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7176  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  29.75 
 
 		 243 aa  53.1  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.789176  normal  0.206558 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2400  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  25.98 
 
 		 244 aa  52.8  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0164224  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5371  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  25.96 
 
 		 243 aa  52.8  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.160971  normal  0.506774 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4665  precorrin-2 methyltransferase  22.86 
 
 		 237 aa  52.8  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0621285 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4415  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  25.74 
 
 		 244 aa  52.4  0.000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.407013 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3020  precorrin-2 methyltransferase  24.84 
 
 		 238 aa  52.4  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2865  precorrin-2 C20-methyltransferase / cobalt-factor II C20-methyltransferase  30.07 
 
 		 234 aa  52.4  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1853  cobalt-factor II C20-methyltransferase / precorrin-2 C20-methyltransferase  28.29 
 
 		 234 aa  52.4  0.000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.254503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0036  precorrin-2 C20-methyltransferase  27.56 
 
 		 244 aa  52.4  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3502  precorrin-2 C20-methyltransferase  25.95 
 
 		 234 aa  51.2  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000438049  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3542  precorrin-2 C20-methyltransferase  27.63 
 
 		 236 aa  51.6  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0693  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  30.13 
 
 		 172 aa  51.6  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.152169  hitchhiker  0.0000247866 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2496  precorrin-3B C17-methyltransferase  28.48 
 
 		 495 aa  51.6  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.218921 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1243  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  25.48 
 
 		 243 aa  50.8  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.291896 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1522  cobalt-precorrin-2 C(20)-methyltransferase  24.68 
 
 		 209 aa  50.8  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000310651 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4705  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  26.56 
 
 		 243 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1032  precorrin-2 methyltransferase  26.62 
 
 		 245 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.627019  normal  0.324418 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03851  precorrin-2 C20-methyltransferase  27.39 
 
 		 273 aa  50.8  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>