223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1896 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1896  precorrin 6A synthase  100 
 
 		 252 aa  515  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.628437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2819  precorrin 6A synthase  55.2 
 
 		 256 aa  290  1e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.615759 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3231  precorrin 6A synthase  55.02 
 
 		 252 aa  286  2e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00310534 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2326  precorrin 6A synthase  56.05 
 
 		 253 aa  285  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.414205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3174  precorrin 6A synthase  56.97 
 
 		 253 aa  285  4e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2387  precorrin 6A synthase  53.78 
 
 		 254 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2657  precorrin 6A synthase  58.4 
 
 		 256 aa  272  4.0000000000000004e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.14068  normal  0.163709 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6988  precorrin 6A synthase  54.4 
 
 		 261 aa  270  1e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.444795  normal  0.650286 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6018  precorrin 6A synthase  54 
 
 		 254 aa  265  5e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0516711  normal  0.289683 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2061  precorrin 6A synthase  52.4 
 
 		 251 aa  262  4e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7173  precorrin 6A synthase  53.78 
 
 		 254 aa  261  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.92278  normal  0.266334 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2442  precorrin 6A synthase  49.2 
 
 		 252 aa  245  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0256861  decreased coverage  0.000262915 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4583  precorrin 6A synthase  49.8 
 
 		 253 aa  245  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2104  precorrin 6A synthase  51 
 
 		 251 aa  244  9e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.749049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4338  precorrin 6A synthase  51.17 
 
 		 254 aa  243  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0501476  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4424  precorrin 6A synthase  51.17 
 
 		 254 aa  243  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.753252 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2140  precorrin 6A synthase  51.2 
 
 		 249 aa  243  3e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.1822  hitchhiker  0.0000632781 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2000  precorrin 6A synthase  51.41 
 
 		 249 aa  243  3e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00310446 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2709  tetrapyrrole methylase family protein  48.63 
 
 		 261 aa  242  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0861444  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4718  precorrin 6A synthase  50.78 
 
 		 254 aa  241  7.999999999999999e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.502891  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3763  precorrin 6A synthase  51 
 
 		 249 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.21445 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3385  precorrin 6A synthase  54.84 
 
 		 252 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.852211 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3576  precorrin 6A synthase  54.4 
 
 		 252 aa  239  4e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.982294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1538  precorrin 6A synthase  56.63 
 
 		 262 aa  237  1e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0200089  normal  0.0986349 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3694  precorrin 6A synthase  54.03 
 
 		 252 aa  234  7e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.529674 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2504  precorrin-6A synthase  50.6 
 
 		 244 aa  231  7.000000000000001e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.488753 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2970  precorrin 6A synthase  48 
 
 		 257 aa  229  5e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.590816  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4201  precorrin 6A synthase  50 
 
 		 266 aa  221  8e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0142  precorrin 6A synthase  50.2 
 
 		 297 aa  219  3e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3353  precorrin-6A synthase (deacetylating)  47.64 
 
 		 253 aa  218  5e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.569272  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0320  precorrin 6A synthase  47.27 
 
 		 262 aa  218  7.999999999999999e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0332  precorrin 6A synthase  46.31 
 
 		 254 aa  216  2.9999999999999998e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2542  precorrin 6A synthase  43.87 
 
 		 249 aa  206  2e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.786467 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2224  precorrin 6A synthase  43.08 
 
 		 254 aa  201  8e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1321  precorrin-6A synthase (deacetylating)  47.35 
 
 		 246 aa  197  1.0000000000000001e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17580  precorrin 6A synthase  44.53 
 
 		 252 aa  184  1.0000000000000001e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5843  precorrin 6A synthase  44.71 
 
 		 265 aa  179  4.999999999999999e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2819  precorrin 6A synthase  42.63 
 
 		 254 aa  169  3e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.632211  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1477  precorrin 6A synthase  42.23 
 
 		 254 aa  167  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.756738  normal  0.444029 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2920  precorrin 6A synthase  41.22 
 
 		 246 aa  165  6.9999999999999995e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0390694 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1527  precorrin 6A synthase  41.27 
 
 		 245 aa  160  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.626854  normal  0.483999 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2879  precorrin 6A synthase  38.21 
 
 		 239 aa  150  2e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0376  precorrin 6A synthase  36.72 
 
 		 254 aa  144  1e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0361  precorrin 6A synthase  37.65 
 
 		 273 aa  143  3e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0784549 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1612  precorrin-6A synthase (deacetylating)  37.11 
 
 		 247 aa  132  6e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2314  precorrin-2 C20-methyltransferase  32.75 
 
 		 256 aa  70.1  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.144109 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3107  cobalt-factor II C20-methyltransferase / precorrin-2 C20-methyltransferase  29.24 
 
 		 239 aa  67.8  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3542  precorrin-2 C20-methyltransferase  30.63 
 
 		 236 aa  66.6  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0058  precorrin-2 C20-methyltransferase  24.8 
 
 		 240 aa  63.9  0.000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0570  precorrin-2 C20-methyltransferase  26.22 
 
 		 242 aa  63.5  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.307877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1271  precorrin-2 C20-methyltransferase  29.81 
 
 		 226 aa  60.8  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2706  precorrin-2 C20-methyltransferase  29.34 
 
 		 247 aa  59.7  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000899582 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1522  cobalt-precorrin-2 C(20)-methyltransferase  32.86 
 
 		 209 aa  59.7  0.00000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000310651 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1714  precorrin-2 C20-methyltransferase  26.99 
 
 		 236 aa  58.9  0.00000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0799  precorrin-2 C20-methyltransferase  30.34 
 
 		 236 aa  58.9  0.00000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3608  precorrin-2 C20-methyltransferase  30.71 
 
 		 236 aa  58.9  0.00000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0639  precorrin-2 C20-methyltransferase  27.27 
 
 		 242 aa  58.9  0.00000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1556  precorrin-2 C20-methyltransferase  26.51 
 
 		 233 aa  58.5  0.00000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0768  precorrin-2 C20-methyltransferase / cobalt-factor II C20-methyltransferase  29.37 
 
 		 232 aa  58.5  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.982265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3502  precorrin-2 C20-methyltransferase  25 
 
 		 234 aa  58.5  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000438049  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2524  precorrin-2 C20-methyltransferase  27.44 
 
 		 247 aa  58.2  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00515181  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0115  precorrin-2 C20-methyltransferase  23.71 
 
 		 222 aa  57.4  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.942057  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1293  precorrin-2 C20-methyltransferase  23.72 
 
 		 236 aa  57.8  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.116679 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2657  precorrin-2 C20-methyltransferase, putative  25.6 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1853  cobalt-factor II C20-methyltransferase / precorrin-2 C20-methyltransferase  30.07 
 
 		 234 aa  56.2  0.0000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.254503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0036  precorrin-2 C20-methyltransferase  26.95 
 
 		 244 aa  55.5  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6036  precorrin-2 C20-methyltransferase  24.03 
 
 		 248 aa  55.5  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1500  precorrin-2 C20-methyltransferase  28.24 
 
 		 259 aa  54.7  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2610  precorrin-2 C20-methyltransferase  26.51 
 
 		 233 aa  55.1  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2135  precorrin-2 C20-methyltransferase  23.2 
 
 		 239 aa  54.7  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0352605 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04091  precorrin-2 C20-methyltransferase  23.78 
 
 		 251 aa  54.7  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1091  cobalt-factor II C20-methyltransferase / precorrin-2 C20-methyltransferase  26.04 
 
 		 237 aa  54.3  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0248  precorrin-2 C20-methyltransferase  28.14 
 
 		 232 aa  53.9  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2190  precorrin-3B C17-methyltransferase  26.9 
 
 		 490 aa  53.9  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.501177  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2052  uroporphyrin-III C-methyltransferase  25.1 
 
 		 266 aa  53.9  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.754921 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1077  cobalt-precorrin-2 C(20)-methyltransferase  28.57 
 
 		 203 aa  54.3  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0554  precorrin-2 C20-methyltransferase  27.04 
 
 		 240 aa  54.7  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5690  precorrin-2 C20-methyltransferase  27.78 
 
 		 255 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.23715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1297  precorrin-2 C20-methyltransferase  26.54 
 
 		 247 aa  53.5  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1781  precorrin-3B C17-methyltransferase  29.86 
 
 		 516 aa  53.9  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.629094  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2995  precorrin-2 C20-methyltransferase  25.48 
 
 		 236 aa  53.1  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05231  putative precorrin-4 C11-methyltransferase  27.71 
 
 		 251 aa  53.1  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24850  precorrin-2 C20-methyltransferase  26.88 
 
 		 233 aa  52.8  0.000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1843  uroporphyrin-III C-methyltransferase  26.63 
 
 		 451 aa  52.8  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.572708  normal  0.146892 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0192  molybdopterin oxidoreductase/precorrin-4 methylase  32.89 
 
 		 607 aa  52.8  0.000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.620214  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1266  precorrin-2 C20-methyltransferase  29.2 
 
 		 240 aa  52.8  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3147  cobalt-factor II C20-methyltransferase / precorrin-2 C20-methyltransferase  30.82 
 
 		 252 aa  52.4  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.452939  normal  0.751414 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04401  precorrin-2-C20-methyltransferase  23.78 
 
 		 251 aa  52  0.000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0050  uroporphyrin-III C-methyltransferase-like  25.39 
 
 		 467 aa  52  0.000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.929104 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0322  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  30.07 
 
 		 277 aa  51.6  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1375  precorrin-2 C20-methyltransferase  23.84 
 
 		 227 aa  51.2  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0153  precorrin-3B C17-methyltransferase  26.81 
 
 		 513 aa  51.2  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0709  uroporphyrin-III C-methyltransferase  24.86 
 
 		 458 aa  50.8  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0313  precorrin-4 C11-methyltransferase  27.44 
 
 		 251 aa  50.8  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2250  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  27.4 
 
 		 250 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.44804  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1710  cobalt-precorrin-2 C(20)-methyltransferase  25.47 
 
 		 237 aa  49.3  0.00005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2083  precorrin-2 methyltransferase  25 
 
 		 252 aa  49.3  0.00006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0142  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  26.09 
 
 		 462 aa  49.3  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2385  uroporphyrin-III C-methyltransferase  25.82 
 
 		 252 aa  49.3  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.10506  normal  0.665855 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1355  cobalt-factor II C20-methyltransferase  29.2 
 
 		 228 aa  49.3  0.00006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>