249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2387 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_2387  precorrin 6A synthase  100 
 
 		 254 aa  514  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2326  precorrin 6A synthase  72.29 
 
 		 253 aa  382  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.414205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3174  precorrin 6A synthase  67.33 
 
 		 253 aa  353  1e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3231  precorrin 6A synthase  55.2 
 
 		 252 aa  283  1.0000000000000001e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00310534 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1896  precorrin 6A synthase  53.78 
 
 		 252 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.628437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2657  precorrin 6A synthase  52.76 
 
 		 256 aa  262  4e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.14068  normal  0.163709 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6018  precorrin 6A synthase  50.99 
 
 		 254 aa  255  6e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0516711  normal  0.289683 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2819  precorrin 6A synthase  49.41 
 
 		 256 aa  254  1.0000000000000001e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.615759 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7173  precorrin 6A synthase  51.78 
 
 		 254 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.92278  normal  0.266334 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2061  precorrin 6A synthase  48.4 
 
 		 251 aa  253  3e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2442  precorrin 6A synthase  50.4 
 
 		 252 aa  251  7e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0256861  decreased coverage  0.000262915 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2104  precorrin 6A synthase  50.2 
 
 		 251 aa  248  5e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.749049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6988  precorrin 6A synthase  49.21 
 
 		 261 aa  247  1e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.444795  normal  0.650286 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2709  tetrapyrrole methylase family protein  49.8 
 
 		 261 aa  244  6.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0861444  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3763  precorrin 6A synthase  49.8 
 
 		 249 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.21445 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4338  precorrin 6A synthase  52.34 
 
 		 254 aa  241  7.999999999999999e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0501476  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4424  precorrin 6A synthase  52.34 
 
 		 254 aa  241  7.999999999999999e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.753252 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2000  precorrin 6A synthase  49 
 
 		 249 aa  239  4e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00310446 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2140  precorrin 6A synthase  48 
 
 		 249 aa  238  9e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.1822  hitchhiker  0.0000632781 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4718  precorrin 6A synthase  51.56 
 
 		 254 aa  237  1e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.502891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4583  precorrin 6A synthase  46.59 
 
 		 253 aa  231  8.000000000000001e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1321  precorrin-6A synthase (deacetylating)  46.53 
 
 		 246 aa  221  7e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0320  precorrin 6A synthase  48.64 
 
 		 262 aa  221  9e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3385  precorrin 6A synthase  51.79 
 
 		 252 aa  221  9e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.852211 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3694  precorrin 6A synthase  51.79 
 
 		 252 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.529674 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2970  precorrin 6A synthase  48.43 
 
 		 257 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.590816  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3576  precorrin 6A synthase  51 
 
 		 252 aa  217  1e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.982294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0332  precorrin 6A synthase  47.2 
 
 		 254 aa  214  9e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2224  precorrin 6A synthase  45.45 
 
 		 254 aa  212  3.9999999999999995e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2504  precorrin-6A synthase  45.38 
 
 		 244 aa  212  5.999999999999999e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.488753 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0142  precorrin 6A synthase  46.22 
 
 		 297 aa  209  4e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4201  precorrin 6A synthase  44.98 
 
 		 266 aa  207  2e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2542  precorrin 6A synthase  44.66 
 
 		 249 aa  206  4e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.786467 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1538  precorrin 6A synthase  47.79 
 
 		 262 aa  203  2e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0200089  normal  0.0986349 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3353  precorrin-6A synthase (deacetylating)  44.53 
 
 		 253 aa  196  3e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.569272  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5843  precorrin 6A synthase  43.75 
 
 		 265 aa  191  7e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17580  precorrin 6A synthase  42.75 
 
 		 252 aa  187  2e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2819  precorrin 6A synthase  43.87 
 
 		 254 aa  182  6e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.632211  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1477  precorrin 6A synthase  43.48 
 
 		 254 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.756738  normal  0.444029 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1527  precorrin 6A synthase  42.19 
 
 		 245 aa  171  1e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.626854  normal  0.483999 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2920  precorrin 6A synthase  42.63 
 
 		 246 aa  167  2e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0390694 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2879  precorrin 6A synthase  40 
 
 		 239 aa  156  3e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0376  precorrin 6A synthase  36.19 
 
 		 254 aa  144  1e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0361  precorrin 6A synthase  37.5 
 
 		 273 aa  142  4e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0784549 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1612  precorrin-6A synthase (deacetylating)  38.98 
 
 		 247 aa  132  3.9999999999999996e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3107  cobalt-factor II C20-methyltransferase / precorrin-2 C20-methyltransferase  29.22 
 
 		 239 aa  66.2  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1556  precorrin-2 C20-methyltransferase  28.83 
 
 		 233 aa  66.2  0.0000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1293  precorrin-2 C20-methyltransferase  27.61 
 
 		 236 aa  65.9  0.0000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.116679 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04091  precorrin-2 C20-methyltransferase  25.54 
 
 		 251 aa  65.9  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0799  precorrin-2 C20-methyltransferase  27.6 
 
 		 236 aa  64.7  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1714  precorrin-2 C20-methyltransferase  26.36 
 
 		 236 aa  64.7  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2135  precorrin-2 C20-methyltransferase  24.8 
 
 		 239 aa  64.7  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0352605 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0058  precorrin-2 C20-methyltransferase  24.12 
 
 		 240 aa  63.5  0.000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2314  precorrin-2 C20-methyltransferase  32.95 
 
 		 256 aa  62.8  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.144109 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2657  precorrin-2 C20-methyltransferase, putative  24.7 
 
 		 222 aa  62  0.000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1500  precorrin-2 C20-methyltransferase  30.3 
 
 		 259 aa  61.6  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2816  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  33.76 
 
 		 257 aa  60.1  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.631326 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1266  precorrin-2 C20-methyltransferase  30.82 
 
 		 240 aa  59.7  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1297  precorrin-2 C20-methyltransferase  32.52 
 
 		 247 aa  59.7  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04401  precorrin-2-C20-methyltransferase  24.38 
 
 		 251 aa  58.9  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1522  cobalt-precorrin-2 C(20)-methyltransferase  29.73 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000310651 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0639  precorrin-2 C20-methyltransferase  26.67 
 
 		 242 aa  58.9  0.00000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1375  precorrin-2 C20-methyltransferase  25.69 
 
 		 227 aa  58.5  0.00000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6036  precorrin-2 C20-methyltransferase  28.93 
 
 		 248 aa  58.5  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0115  precorrin-2 C20-methyltransferase  22.48 
 
 		 222 aa  57.4  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.942057  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5690  precorrin-2 C20-methyltransferase  30.26 
 
 		 255 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.23715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1091  cobalt-factor II C20-methyltransferase / precorrin-2 C20-methyltransferase  27.95 
 
 		 237 aa  57.4  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2706  precorrin-2 C20-methyltransferase  27.91 
 
 		 247 aa  57.8  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000899582 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1271  precorrin-2 C20-methyltransferase  29.63 
 
 		 226 aa  57.8  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2990  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  29.17 
 
 		 244 aa  56.6  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1897  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  29.27 
 
 		 244 aa  57  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0807274  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3502  precorrin-2 C20-methyltransferase  26.5 
 
 		 234 aa  57  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000438049  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0570  precorrin-2 C20-methyltransferase  27.63 
 
 		 242 aa  56.6  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.307877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0036  precorrin-2 C20-methyltransferase  29.87 
 
 		 244 aa  56.6  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24850  precorrin-2 C20-methyltransferase  27.27 
 
 		 233 aa  56.2  0.0000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2610  precorrin-2 C20-methyltransferase  28.22 
 
 		 233 aa  56.2  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0312  precorrin-2 C20-methyltransferase  31.29 
 
 		 224 aa  56.2  0.0000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2479  precorrin-3B C17-methyltransferase  28.71 
 
 		 500 aa  55.5  0.0000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0466913  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6021  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  29.94 
 
 		 243 aa  55.5  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0179005  normal  0.20153 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2995  precorrin-2 C20-methyltransferase  28.22 
 
 		 236 aa  54.7  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2152  precorrin-2 C20-methyltransferase  31.37 
 
 		 263 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.014413  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2441  precorrin-2 C20-methyltransferase  31.37 
 
 		 262 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.161962  normal  0.0706437 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2735  precorrin-2 C20-methyltransferase  28.88 
 
 		 236 aa  53.9  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000618723  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0147  cobalt-precorrin-2 C(20)-methyltransferase  30.45 
 
 		 202 aa  54.7  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.110313  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1781  precorrin-3B C17-methyltransferase  28.36 
 
 		 516 aa  54.3  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.629094  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1313  precorrin-2 C20-methyltransferase  26.29 
 
 		 239 aa  53.5  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0407603  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3374  precorrin-2 C20-methyltransferase  27.11 
 
 		 246 aa  53.9  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.299047 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03851  precorrin-2 C20-methyltransferase  25.44 
 
 		 273 aa  53.5  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1012  precorrin-2 C20-methyltransferase  25.45 
 
 		 238 aa  53.1  0.000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0153  precorrin-3B C17-methyltransferase  30 
 
 		 513 aa  52.8  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3283  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  26.35 
 
 		 241 aa  52.8  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.308493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1237  cobalt-precorrin-2 C(20)-methyltransferase  29.19 
 
 		 220 aa  52.8  0.000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.433092  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0192  molybdopterin oxidoreductase/precorrin-4 methylase  30.52 
 
 		 607 aa  52.4  0.000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.620214  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2083  precorrin-2 methyltransferase  27.22 
 
 		 252 aa  52  0.000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3542  precorrin-2 C20-methyltransferase  27.27 
 
 		 236 aa  52  0.000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04511  precorrin-2 C20-methyltransferase  24.38 
 
 		 254 aa  52  0.000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04401  precorrin-2 C20-methyltransferase  27.88 
 
 		 242 aa  52  0.000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.614023  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7176  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  28.66 
 
 		 243 aa  51.6  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.789176  normal  0.206558 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1111  uroporphyrin-III C-methyltransferase  28.21 
 
 		 482 aa  51.2  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0554  precorrin-2 C20-methyltransferase  30 
 
 		 240 aa  51.6  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>