57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_0376 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_0376  precorrin 6A synthase  100 
 
 		 254 aa  496  1e-139  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0361  precorrin 6A synthase  82.68 
 
 		 273 aa  392  1e-108  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0784549 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2879  precorrin 6A synthase  62.35 
 
 		 239 aa  276  3e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1612  precorrin-6A synthase (deacetylating)  60.39 
 
 		 247 aa  255  4e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0320  precorrin 6A synthase  46.92 
 
 		 262 aa  187  1e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17580  precorrin 6A synthase  44.88 
 
 		 252 aa  184  1.0000000000000001e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3763  precorrin 6A synthase  43.92 
 
 		 249 aa  176  3e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.21445 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2657  precorrin 6A synthase  41.73 
 
 		 256 aa  169  3e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.14068  normal  0.163709 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2000  precorrin 6A synthase  42.75 
 
 		 249 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00310446 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2819  precorrin 6A synthase  40.23 
 
 		 256 aa  166  4e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.615759 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6988  precorrin 6A synthase  38.22 
 
 		 261 aa  165  5e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.444795  normal  0.650286 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3694  precorrin 6A synthase  43.48 
 
 		 252 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.529674 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3385  precorrin 6A synthase  43.48 
 
 		 252 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.852211 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3576  precorrin 6A synthase  42.97 
 
 		 252 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.982294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0142  precorrin 6A synthase  43.08 
 
 		 297 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4338  precorrin 6A synthase  40.91 
 
 		 254 aa  162  3e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0501476  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4424  precorrin 6A synthase  40.91 
 
 		 254 aa  162  3e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.753252 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3353  precorrin-6A synthase (deacetylating)  43.87 
 
 		 253 aa  162  4.0000000000000004e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.569272  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3231  precorrin 6A synthase  37.74 
 
 		 252 aa  162  6e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00310534 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2104  precorrin 6A synthase  41.57 
 
 		 251 aa  161  8.000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.749049  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2504  precorrin-6A synthase  39.45 
 
 		 244 aa  160  1e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.488753 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2140  precorrin 6A synthase  41.73 
 
 		 249 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.1822  hitchhiker  0.0000632781 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4718  precorrin 6A synthase  40.53 
 
 		 254 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.502891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1321  precorrin-6A synthase (deacetylating)  40.55 
 
 		 246 aa  158  8e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2442  precorrin 6A synthase  38.52 
 
 		 252 aa  157  2e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0256861  decreased coverage  0.000262915 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4201  precorrin 6A synthase  42.31 
 
 		 266 aa  155  6e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2709  tetrapyrrole methylase family protein  37.98 
 
 		 261 aa  154  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0861444  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2970  precorrin 6A synthase  38.04 
 
 		 257 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.590816  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3174  precorrin 6A synthase  40.47 
 
 		 253 aa  151  8e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1896  precorrin 6A synthase  36.72 
 
 		 252 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.628437  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7173  precorrin 6A synthase  37.98 
 
 		 254 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.92278  normal  0.266334 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2387  precorrin 6A synthase  36.19 
 
 		 254 aa  148  6e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2542  precorrin 6A synthase  40.31 
 
 		 249 aa  148  1.0000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.786467 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2326  precorrin 6A synthase  36.82 
 
 		 253 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.414205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2061  precorrin 6A synthase  32.55 
 
 		 251 aa  143  3e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4583  precorrin 6A synthase  35.6 
 
 		 253 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1538  precorrin 6A synthase  39.69 
 
 		 262 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0200089  normal  0.0986349 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6018  precorrin 6A synthase  36.82 
 
 		 254 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0516711  normal  0.289683 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2224  precorrin 6A synthase  36.02 
 
 		 254 aa  139  6e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0332  precorrin 6A synthase  37.16 
 
 		 254 aa  127  2.0000000000000002e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2920  precorrin 6A synthase  38.15 
 
 		 246 aa  116  3.9999999999999997e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0390694 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2819  precorrin 6A synthase  40.64 
 
 		 254 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.632211  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5843  precorrin 6A synthase  37.55 
 
 		 265 aa  110  3e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1477  precorrin 6A synthase  40.64 
 
 		 254 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.756738  normal  0.444029 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1527  precorrin 6A synthase  39.37 
 
 		 245 aa  105  6e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.626854  normal  0.483999 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2135  precorrin-2 C20-methyltransferase  29.73 
 
 		 239 aa  51.6  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0352605 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1714  precorrin-2 C20-methyltransferase  32.93 
 
 		 236 aa  49.7  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1500  precorrin-2 C20-methyltransferase  31.02 
 
 		 259 aa  47.4  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1522  cobalt-precorrin-2 C(20)-methyltransferase  31.21 
 
 		 209 aa  45.4  0.0008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000310651 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4161  precorrin-2 C20-methyltransferase  39.53 
 
 		 301 aa  44.3  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0393097  normal  0.411769 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0799  precorrin-2 C20-methyltransferase  30.06 
 
 		 236 aa  43.9  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2314  precorrin-2 C20-methyltransferase  29.52 
 
 		 256 aa  44.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.144109 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1313  precorrin-2 C20-methyltransferase  28.85 
 
 		 239 aa  43.5  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0407603  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3107  cobalt-factor II C20-methyltransferase / precorrin-2 C20-methyltransferase  28.31 
 
 		 239 aa  43.1  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26510  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  28.76 
 
 		 250 aa  43.1  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0109383  normal  0.778787 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1137  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  32.14 
 
 		 314 aa  42.4  0.008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.486649  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0115  precorrin-2 C20-methyltransferase  21.76 
 
 		 222 aa  42  0.009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.942057  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>