188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_17580 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_17580  precorrin 6A synthase  100 
 
 
252 aa  500  1e-141  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0320  precorrin 6A synthase  57.69 
 
 
262 aa  257  1e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2657  precorrin 6A synthase  50.79 
 
 
256 aa  220  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.14068  normal  0.163709 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6988  precorrin 6A synthase  50.39 
 
 
261 aa  218  8.999999999999998e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.444795  normal  0.650286 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0142  precorrin 6A synthase  50.79 
 
 
297 aa  217  2e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2879  precorrin 6A synthase  50 
 
 
239 aa  204  1e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2709  tetrapyrrole methylase family protein  45 
 
 
261 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0861444  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2061  precorrin 6A synthase  43.31 
 
 
251 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2442  precorrin 6A synthase  45.14 
 
 
252 aa  199  5e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0256861  decreased coverage  0.000262915 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1321  precorrin-6A synthase (deacetylating)  47.81 
 
 
246 aa  198  7e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2326  precorrin 6A synthase  45.85 
 
 
253 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.414205  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4338  precorrin 6A synthase  45.59 
 
 
254 aa  195  5.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0501476  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4424  precorrin 6A synthase  45.59 
 
 
254 aa  195  5.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.753252 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3231  precorrin 6A synthase  43.92 
 
 
252 aa  195  7e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00310534 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4718  precorrin 6A synthase  45.59 
 
 
254 aa  195  7e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.502891  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3576  precorrin 6A synthase  47.64 
 
 
252 aa  194  1e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.982294  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2819  precorrin 6A synthase  42.75 
 
 
256 aa  188  5e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.615759 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3694  precorrin 6A synthase  46.83 
 
 
252 aa  188  7e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.529674 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2970  precorrin 6A synthase  43.31 
 
 
257 aa  188  8e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.590816  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3385  precorrin 6A synthase  46.83 
 
 
252 aa  187  1e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.852211 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2387  precorrin 6A synthase  42.75 
 
 
254 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2104  precorrin 6A synthase  44.27 
 
 
251 aa  185  6e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.749049  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1538  precorrin 6A synthase  49.8 
 
 
262 aa  184  9e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0200089  normal  0.0986349 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3174  precorrin 6A synthase  43.31 
 
 
253 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1896  precorrin 6A synthase  44.53 
 
 
252 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.628437  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4583  precorrin 6A synthase  43.7 
 
 
253 aa  183  3e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0361  precorrin 6A synthase  46.51 
 
 
273 aa  182  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0784549 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2140  precorrin 6A synthase  44.49 
 
 
249 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.1822  hitchhiker  0.0000632781 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0376  precorrin 6A synthase  44.88 
 
 
254 aa  178  7e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7173  precorrin 6A synthase  39.68 
 
 
254 aa  175  5e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.92278  normal  0.266334 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3763  precorrin 6A synthase  43.82 
 
 
249 aa  175  7e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.21445 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1612  precorrin-6A synthase (deacetylating)  50 
 
 
247 aa  174  9.999999999999999e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2504  precorrin-6A synthase  39.37 
 
 
244 aa  171  6.999999999999999e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.488753 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6018  precorrin 6A synthase  39.13 
 
 
254 aa  170  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0516711  normal  0.289683 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2000  precorrin 6A synthase  43.43 
 
 
249 aa  169  4e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00310446 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2224  precorrin 6A synthase  40.47 
 
 
254 aa  168  8e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4201  precorrin 6A synthase  43.8 
 
 
266 aa  163  2.0000000000000002e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3353  precorrin-6A synthase (deacetylating)  42.91 
 
 
253 aa  162  4.0000000000000004e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.569272  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0332  precorrin 6A synthase  41.27 
 
 
254 aa  160  1e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2542  precorrin 6A synthase  37.85 
 
 
249 aa  152  5.9999999999999996e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.786467 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2920  precorrin 6A synthase  38 
 
 
246 aa  135  6.0000000000000005e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0390694 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1527  precorrin 6A synthase  41.77 
 
 
245 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.626854  normal  0.483999 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2819  precorrin 6A synthase  41.04 
 
 
254 aa  132  6e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.632211  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1477  precorrin 6A synthase  41.04 
 
 
254 aa  130  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.756738  normal  0.444029 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5843  precorrin 6A synthase  38.17 
 
 
265 aa  127  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0115  precorrin-2 C20-methyltransferase  26.82 
 
 
222 aa  72.4  0.000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.942057  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1714  precorrin-2 C20-methyltransferase  37.11 
 
 
236 aa  68.6  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3502  precorrin-2 C20-methyltransferase  35.14 
 
 
234 aa  62.8  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000438049  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0316  precorrin-2 C20-methyltransferase / precorrin-3 methyltransferase  32.64 
 
 
511 aa  61.2  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3409  precorrin-3 methyltransferase / precorrin-2 C20-methyltransferase  33.1 
 
 
526 aa  61.6  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0799  precorrin-2 C20-methyltransferase  32.51 
 
 
236 aa  61.2  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1853  cobalt-factor II C20-methyltransferase / precorrin-2 C20-methyltransferase  28.48 
 
 
234 aa  60.1  0.00000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.254503  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2314  precorrin-2 C20-methyltransferase  30.17 
 
 
256 aa  59.7  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.144109 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5595  Precorrin-3B methylase-like protein  33.99 
 
 
509 aa  59.7  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0773745  normal  0.51395 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4875  precorrin-2 C20-methyltransferase  30.11 
 
 
243 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3145  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  30.92 
 
 
251 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.34411  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1375  precorrin-2 C20-methyltransferase  29.27 
 
 
227 aa  59.3  0.00000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2487  precorrin-3 methyltransferase / precorrin-2 C20-methyltransferase / cobalt-factor II C20-methyltransferase  35 
 
 
495 aa  58.9  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.710411  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2532  cobalt-factor II C20-methyltransferase / precorrin-2 C20-methyltransferase / precorrin-3 methyltransferase  35 
 
 
495 aa  58.9  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735838  normal  0.502246 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2524  precorrin-3 methyltransferase / precorrin-2 C20-methyltransferase / cobalt-factor II C20-methyltransferase  35 
 
 
495 aa  58.9  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.564882  normal  0.0996134 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0554  precorrin-2 C20-methyltransferase  32.65 
 
 
240 aa  58.5  0.00000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0574  precorrin-3B C17-methyltransferase  29.74 
 
 
523 aa  58.5  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.42028  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2479  precorrin-3B C17-methyltransferase  31.17 
 
 
500 aa  58.2  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0466913  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2735  precorrin-2 C20-methyltransferase  29.45 
 
 
236 aa  57.4  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000618723  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4705  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  29.89 
 
 
243 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4883  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  29.35 
 
 
243 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2496  precorrin-3B C17-methyltransferase  32.24 
 
 
495 aa  56.2  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.218921 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2190  precorrin-3B C17-methyltransferase  31.76 
 
 
490 aa  56.2  0.0000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.501177  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3510  precorrin-2 C20-methyltransferase  30.07 
 
 
249 aa  56.2  0.0000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.611734  normal  0.730494 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1077  cobalt-precorrin-2 C(20)-methyltransferase  29.08 
 
 
203 aa  56.2  0.0000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4827  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  29.35 
 
 
244 aa  55.8  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.532538 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1556  precorrin-2 C20-methyltransferase  29.41 
 
 
233 aa  55.5  0.0000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3107  cobalt-factor II C20-methyltransferase / precorrin-2 C20-methyltransferase  29.63 
 
 
239 aa  54.7  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4822  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  32.89 
 
 
244 aa  54.3  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.525292 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1645  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  31.76 
 
 
244 aa  53.5  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.839045  normal  0.484844 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1521  precorrin-2 C20-methyltransferase / cobalt-factor II C20-methyltransferase / precorrin-3 methyltransferase  31.33 
 
 
526 aa  53.5  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0252228  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4617  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  28.49 
 
 
243 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.449076 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0312  precorrin-2 C20-methyltransferase  26.67 
 
 
224 aa  53.9  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2995  precorrin-2 C20-methyltransferase  29.53 
 
 
236 aa  53.1  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1163  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  30.87 
 
 
244 aa  53.1  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00204005  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5371  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  30.85 
 
 
243 aa  53.1  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.160971  normal  0.506774 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1624  precorrin-3B C17-methyltransferase  31.29 
 
 
529 aa  53.1  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.226232  normal  0.692931 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1572  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  31.54 
 
 
244 aa  53.1  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.477506  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1590  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  31.54 
 
 
244 aa  53.1  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.388218 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3431  precorrin-3B C17-methyltransferase  35.48 
 
 
495 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.201044  normal  0.761314 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1604  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  30.87 
 
 
244 aa  53.1  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.189665  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3104  precorrin-3B C17-methyltransferase  32.54 
 
 
492 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4415  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  31.13 
 
 
244 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.407013 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2111  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  30.46 
 
 
244 aa  52.8  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.414891  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0606  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  31.13 
 
 
244 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.728807  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2637  precorrin-2 C20-methyltransferase  30.64 
 
 
244 aa  52.8  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00906453  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0768  precorrin-2 C20-methyltransferase / cobalt-factor II C20-methyltransferase  27.92 
 
 
232 aa  53.1  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.982265  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26510  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  29.35 
 
 
250 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0109383  normal  0.778787 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1948  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  30.46 
 
 
244 aa  52.8  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.180512  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1965  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  30.46 
 
 
244 aa  52.8  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00527923  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0266  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  30.46 
 
 
244 aa  52.8  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0493785  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0894  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  30.46 
 
 
244 aa  52.8  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.19117  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0153  precorrin-3B C17-methyltransferase  27.78 
 
 
513 aa  52.4  0.000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2816  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  32 
 
 
257 aa  52.4  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.631326 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1522  cobalt-precorrin-2 C(20)-methyltransferase  32.87 
 
 
209 aa  52  0.000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000310651 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>