157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2657 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2657  precorrin 6A synthase  100 
 
 		 256 aa  507  1e-143  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.14068  normal  0.163709 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6988  precorrin 6A synthase  60.55 
 
 		 261 aa  310  2e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.444795  normal  0.650286 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2061  precorrin 6A synthase  56 
 
 		 251 aa  296  2e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2709  tetrapyrrole methylase family protein  56.47 
 
 		 261 aa  293  3e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0861444  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2442  precorrin 6A synthase  56.8 
 
 		 252 aa  292  3e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0256861  decreased coverage  0.000262915 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3231  precorrin 6A synthase  55.2 
 
 		 252 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00310534 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2504  precorrin-6A synthase  58.8 
 
 		 244 aa  281  5.000000000000001e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.488753 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4583  precorrin 6A synthase  55.2 
 
 		 253 aa  277  1e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2326  precorrin 6A synthase  57.03 
 
 		 253 aa  275  4e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.414205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2819  precorrin 6A synthase  54.4 
 
 		 256 aa  275  7e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.615759 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3174  precorrin 6A synthase  57.2 
 
 		 253 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1896  precorrin 6A synthase  58.4 
 
 		 252 aa  272  4.0000000000000004e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.628437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4201  precorrin 6A synthase  56.85 
 
 		 266 aa  271  7e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2104  precorrin 6A synthase  56.4 
 
 		 251 aa  271  7e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.749049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2970  precorrin 6A synthase  53.31 
 
 		 257 aa  270  2e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.590816  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3763  precorrin 6A synthase  56.4 
 
 		 249 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.21445 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3385  precorrin 6A synthase  60 
 
 		 252 aa  265  4e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.852211 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2140  precorrin 6A synthase  55.6 
 
 		 249 aa  265  4e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.1822  hitchhiker  0.0000632781 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3694  precorrin 6A synthase  60 
 
 		 252 aa  265  5.999999999999999e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.529674 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2000  precorrin 6A synthase  56 
 
 		 249 aa  264  8.999999999999999e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00310446 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3576  precorrin 6A synthase  59.76 
 
 		 252 aa  264  1e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.982294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2387  precorrin 6A synthase  52.76 
 
 		 254 aa  262  4e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4338  precorrin 6A synthase  57.59 
 
 		 254 aa  257  1e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0501476  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4424  precorrin 6A synthase  57.59 
 
 		 254 aa  257  1e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.753252 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4718  precorrin 6A synthase  57.2 
 
 		 254 aa  255  5e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.502891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6018  precorrin 6A synthase  52.19 
 
 		 254 aa  251  9.000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0516711  normal  0.289683 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0142  precorrin 6A synthase  53.41 
 
 		 297 aa  249  3e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1321  precorrin-6A synthase (deacetylating)  54.88 
 
 		 246 aa  247  1e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7173  precorrin 6A synthase  51.39 
 
 		 254 aa  246  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.92278  normal  0.266334 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0320  precorrin 6A synthase  51.75 
 
 		 262 aa  233  3e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1538  precorrin 6A synthase  55.02 
 
 		 262 aa  230  1e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0200089  normal  0.0986349 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3353  precorrin-6A synthase (deacetylating)  52.49 
 
 		 253 aa  225  5.0000000000000005e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.569272  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17580  precorrin 6A synthase  50.79 
 
 		 252 aa  220  1.9999999999999999e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0332  precorrin 6A synthase  49.61 
 
 		 254 aa  214  9.999999999999999e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2224  precorrin 6A synthase  44.88 
 
 		 254 aa  201  9e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2542  precorrin 6A synthase  44.22 
 
 		 249 aa  186  2e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.786467 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1527  precorrin 6A synthase  46.3 
 
 		 245 aa  179  4e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.626854  normal  0.483999 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5843  precorrin 6A synthase  44.31 
 
 		 265 aa  174  9e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2819  precorrin 6A synthase  45.53 
 
 		 254 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.632211  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2920  precorrin 6A synthase  42.91 
 
 		 246 aa  172  5.999999999999999e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0390694 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1477  precorrin 6A synthase  44.36 
 
 		 254 aa  171  1e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.756738  normal  0.444029 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0361  precorrin 6A synthase  41.96 
 
 		 273 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0784549 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0376  precorrin 6A synthase  42.06 
 
 		 254 aa  163  3e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2879  precorrin 6A synthase  41.3 
 
 		 239 aa  159  5e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1612  precorrin-6A synthase (deacetylating)  42.29 
 
 		 247 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1714  precorrin-2 C20-methyltransferase  33.33 
 
 		 236 aa  64.7  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3107  cobalt-factor II C20-methyltransferase / precorrin-2 C20-methyltransferase  34.13 
 
 		 239 aa  61.2  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0799  precorrin-2 C20-methyltransferase  34.21 
 
 		 236 aa  59.3  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1522  cobalt-precorrin-2 C(20)-methyltransferase  30.61 
 
 		 209 aa  58.5  0.0000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000310651 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2314  precorrin-2 C20-methyltransferase  31.12 
 
 		 256 aa  57.4  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.144109 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2735  precorrin-2 C20-methyltransferase  34.25 
 
 		 236 aa  57.8  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000618723  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1500  precorrin-2 C20-methyltransferase  32.72 
 
 		 259 aa  57.4  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6036  precorrin-2 C20-methyltransferase  28.09 
 
 		 248 aa  56.6  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3145  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  28.06 
 
 		 251 aa  54.3  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.34411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1375  precorrin-2 C20-methyltransferase  31.76 
 
 		 227 aa  54.3  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3502  precorrin-2 C20-methyltransferase  30.77 
 
 		 234 aa  53.5  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000438049  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0115  precorrin-2 C20-methyltransferase  22.29 
 
 		 222 aa  52.4  0.000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.942057  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0639  precorrin-2 C20-methyltransferase  26.09 
 
 		 242 aa  52  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0312  precorrin-2 C20-methyltransferase  29.12 
 
 		 224 aa  52.4  0.000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1968  precorrin-4 C11-methyltransferase  25.97 
 
 		 261 aa  52  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.264672  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1556  precorrin-2 C20-methyltransferase  25.81 
 
 		 233 aa  52  0.000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24850  precorrin-2 C20-methyltransferase  27.52 
 
 		 233 aa  51.2  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0058  precorrin-2 C20-methyltransferase  28.57 
 
 		 240 aa  52  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3118  precorrin-2 C20-methyltransferase  30.63 
 
 		 259 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1237  cobalt-precorrin-2 C(20)-methyltransferase  27.45 
 
 		 220 aa  50.1  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.433092  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1271  precorrin-2 C20-methyltransferase  31.58 
 
 		 226 aa  50.4  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0043  uroporphyrin-III C-methyltransferase  26.4 
 
 		 462 aa  50.1  0.00004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0709  uroporphyrin-III C-methyltransferase  26.4 
 
 		 458 aa  50.1  0.00004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3374  precorrin-2 C20-methyltransferase  25.41 
 
 		 246 aa  49.3  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.299047 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1887  precorrin-4 C11-methyltransferase  24.73 
 
 		 262 aa  49.7  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0177135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2083  precorrin-2 methyltransferase  26.11 
 
 		 252 aa  49.3  0.00006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1775  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  30.72 
 
 		 473 aa  48.9  0.00007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0534697  normal  0.7368 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1552  precorrin-4 C11-methyltransferase  21.95 
 
 		 283 aa  48.9  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.886587 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1433  precorrin-2 C20-methyltransferase  29.38 
 
 		 265 aa  49.3  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.69961 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1711  precorrin-2 C20-methyltransferase  29.38 
 
 		 265 aa  48.9  0.00008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.458847  normal  0.0168162 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2135  precorrin-2 C20-methyltransferase  23.62 
 
 		 239 aa  48.9  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0352605 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1293  precorrin-2 C20-methyltransferase  26.97 
 
 		 236 aa  48.9  0.00008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.116679 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1436  precorrin-2 C20-methyltransferase  29.38 
 
 		 265 aa  48.9  0.00008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.29028  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0905  precorrin-4 C11-methyltransferase  26.63 
 
 		 269 aa  48.5  0.00009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1853  cobalt-factor II C20-methyltransferase / precorrin-2 C20-methyltransferase  30.87 
 
 		 234 aa  48.5  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.254503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2152  precorrin-2 C20-methyltransferase  30 
 
 		 263 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.014413  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2657  precorrin-2 C20-methyltransferase, putative  24.84 
 
 		 222 aa  47.8  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0050  uroporphyrin-III C-methyltransferase-like  27.27 
 
 		 467 aa  47.4  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.929104 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2359  cobalt-precorrin-2 C(20)-methyltransferase  27.4 
 
 		 203 aa  47.4  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0554  precorrin-2 C20-methyltransferase  30.07 
 
 		 240 aa  47.8  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05231  putative precorrin-4 C11-methyltransferase  26.16 
 
 		 251 aa  47.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0934  precorrin-4 C11-methyltransferase  26.23 
 
 		 250 aa  47.4  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0509  cobalt-precorrin-2 C(20)-methyltransferase  29.53 
 
 		 205 aa  47.8  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1710  cobalt-precorrin-2 C(20)-methyltransferase  27.1 
 
 		 237 aa  47.4  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5690  precorrin-2 C20-methyltransferase  29.19 
 
 		 255 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.23715  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2441  precorrin-2 C20-methyltransferase  27.5 
 
 		 262 aa  47  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.161962  normal  0.0706437 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2610  precorrin-2 C20-methyltransferase  28.21 
 
 		 233 aa  46.6  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1431  cobalt-precorrin-2 C(20)-methyltransferase  26.14 
 
 		 220 aa  46.6  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0227456  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2250  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  28.05 
 
 		 250 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.44804  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1897  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  26.53 
 
 		 244 aa  46.6  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0807274  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4344  precorrin-4 C11-methyltransferase  25.88 
 
 		 264 aa  46.2  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1604  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  28.12 
 
 		 244 aa  45.8  0.0006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.189665  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0266  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  28.12 
 
 		 244 aa  45.8  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0493785  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0894  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  28.12 
 
 		 244 aa  45.8  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.19117  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2111  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  28.12 
 
 		 244 aa  45.8  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.414891  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>