158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1538 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1538  precorrin 6A synthase  100 
 
 
262 aa  508  1e-143  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0200089  normal  0.0986349 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3576  precorrin 6A synthase  62.5 
 
 
252 aa  275  4e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.982294  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3385  precorrin 6A synthase  62.5 
 
 
252 aa  275  4e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.852211 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3694  precorrin 6A synthase  62.5 
 
 
252 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.529674 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6988  precorrin 6A synthase  54.02 
 
 
261 aa  260  1e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.444795  normal  0.650286 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1896  precorrin 6A synthase  56.63 
 
 
252 aa  257  2e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.628437  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2061  precorrin 6A synthase  50.2 
 
 
251 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2657  precorrin 6A synthase  55.02 
 
 
256 aa  252  4.0000000000000004e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.14068  normal  0.163709 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2442  precorrin 6A synthase  50.2 
 
 
252 aa  249  4e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0256861  decreased coverage  0.000262915 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2819  precorrin 6A synthase  50.2 
 
 
256 aa  245  4.9999999999999997e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.615759 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4201  precorrin 6A synthase  53.39 
 
 
266 aa  244  8e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2326  precorrin 6A synthase  49.6 
 
 
253 aa  242  6e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.414205  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3231  precorrin 6A synthase  50.6 
 
 
252 aa  238  5.999999999999999e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00310534 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2709  tetrapyrrole methylase family protein  48.43 
 
 
261 aa  237  2e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0861444  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7173  precorrin 6A synthase  48.61 
 
 
254 aa  227  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.92278  normal  0.266334 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2504  precorrin-6A synthase  48.41 
 
 
244 aa  224  1e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.488753 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2387  precorrin 6A synthase  47.79 
 
 
254 aa  223  2e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3174  precorrin 6A synthase  51.41 
 
 
253 aa  223  3e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0142  precorrin 6A synthase  53.04 
 
 
297 aa  221  7e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1321  precorrin-6A synthase (deacetylating)  50.81 
 
 
246 aa  219  5e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6018  precorrin 6A synthase  47.01 
 
 
254 aa  218  6e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0516711  normal  0.289683 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4338  precorrin 6A synthase  48.83 
 
 
254 aa  214  9e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0501476  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4424  precorrin 6A synthase  48.83 
 
 
254 aa  214  9e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.753252 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4718  precorrin 6A synthase  49.22 
 
 
254 aa  214  9e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.502891  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2224  precorrin 6A synthase  47.24 
 
 
254 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3763  precorrin 6A synthase  48.81 
 
 
249 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.21445 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2104  precorrin 6A synthase  47.62 
 
 
251 aa  210  2e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.749049  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2140  precorrin 6A synthase  49.4 
 
 
249 aa  209  3e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.1822  hitchhiker  0.0000632781 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0332  precorrin 6A synthase  49.2 
 
 
254 aa  208  6e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2000  precorrin 6A synthase  49.21 
 
 
249 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00310446 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4583  precorrin 6A synthase  44 
 
 
253 aa  206  5e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2542  precorrin 6A synthase  47.43 
 
 
249 aa  205  6e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.786467 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17580  precorrin 6A synthase  49.8 
 
 
252 aa  203  2e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0320  precorrin 6A synthase  48.64 
 
 
262 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3353  precorrin-6A synthase (deacetylating)  48.44 
 
 
253 aa  195  8.000000000000001e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.569272  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2970  precorrin 6A synthase  46.4 
 
 
257 aa  193  2e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.590816  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2819  precorrin 6A synthase  47.47 
 
 
254 aa  172  5e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.632211  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1477  precorrin 6A synthase  47.08 
 
 
254 aa  169  3e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.756738  normal  0.444029 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2920  precorrin 6A synthase  45.71 
 
 
246 aa  169  6e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0390694 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5843  precorrin 6A synthase  45.53 
 
 
265 aa  168  6e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1527  precorrin 6A synthase  48.37 
 
 
245 aa  167  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.626854  normal  0.483999 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2879  precorrin 6A synthase  41.06 
 
 
239 aa  155  7e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0376  precorrin 6A synthase  39.69 
 
 
254 aa  145  9e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0361  precorrin 6A synthase  39.45 
 
 
273 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0784549 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1612  precorrin-6A synthase (deacetylating)  40.62 
 
 
247 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3107  cobalt-factor II C20-methyltransferase / precorrin-2 C20-methyltransferase  31.52 
 
 
239 aa  62.8  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1163  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  33.94 
 
 
244 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00204005  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1604  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  33.94 
 
 
244 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.189665  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1781  precorrin-3B C17-methyltransferase  31.33 
 
 
516 aa  61.6  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.629094  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2111  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  33.33 
 
 
244 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.414891  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2990  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  32.03 
 
 
244 aa  59.7  0.00000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0266  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  33.33 
 
 
244 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0493785  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1948  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  33.33 
 
 
244 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.180512  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1965  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  33.33 
 
 
244 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00527923  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0894  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  33.33 
 
 
244 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.19117  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2735  precorrin-2 C20-methyltransferase  32.89 
 
 
236 aa  58.2  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000618723  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2400  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  32.12 
 
 
244 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0164224  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1012  precorrin-2 C20-methyltransferase  29.14 
 
 
238 aa  57.8  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2816  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  32.92 
 
 
257 aa  57.8  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.631326 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1243  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  31.05 
 
 
243 aa  57  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.291896 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5690  precorrin-2 C20-methyltransferase  32.03 
 
 
255 aa  57  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.23715  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26510  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  31.94 
 
 
250 aa  57  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0109383  normal  0.778787 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7176  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  33.12 
 
 
243 aa  56.6  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.789176  normal  0.206558 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5371  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  30.53 
 
 
243 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.160971  normal  0.506774 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1853  cobalt-factor II C20-methyltransferase / precorrin-2 C20-methyltransferase  31.13 
 
 
234 aa  56.2  0.0000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.254503  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6021  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  33.12 
 
 
243 aa  55.8  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0179005  normal  0.20153 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0570  precorrin-2 C20-methyltransferase  29.46 
 
 
242 aa  55.5  0.0000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.307877  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2250  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  31.94 
 
 
250 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.44804  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1897  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  29.22 
 
 
244 aa  54.7  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0807274  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1288  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  29.3 
 
 
244 aa  54.3  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1251  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  29.3 
 
 
244 aa  54.3  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0286047  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3283  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  30.57 
 
 
241 aa  54.3  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.308493  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2190  precorrin-3B C17-methyltransferase  31.17 
 
 
490 aa  53.5  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.501177  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1266  precorrin-2 C20-methyltransferase  31.01 
 
 
240 aa  53.5  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2479  precorrin-3B C17-methyltransferase  29.41 
 
 
500 aa  53.5  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0466913  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4822  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  29.7 
 
 
244 aa  53.1  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.525292 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2314  precorrin-2 C20-methyltransferase  33.15 
 
 
256 aa  53.1  0.000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.144109 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0606  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  28.57 
 
 
244 aa  52.8  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.728807  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0639  precorrin-2 C20-methyltransferase  32.67 
 
 
242 aa  52.4  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1433  precorrin-2 C20-methyltransferase  29.14 
 
 
265 aa  52.4  0.000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.69961 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1590  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  29.09 
 
 
244 aa  51.6  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.388218 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0316  precorrin-2 C20-methyltransferase / precorrin-3 methyltransferase  28.03 
 
 
511 aa  52  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1711  precorrin-2 C20-methyltransferase  29.14 
 
 
265 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.458847  normal  0.0168162 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1572  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  29.09 
 
 
244 aa  51.6  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.477506  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3118  precorrin-2 C20-methyltransferase  31.82 
 
 
259 aa  52  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1522  cobalt-precorrin-2 C(20)-methyltransferase  29.22 
 
 
209 aa  52  0.00001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000310651 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1570  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  30.3 
 
 
244 aa  52  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.058507 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1436  precorrin-2 C20-methyltransferase  29.14 
 
 
265 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.29028  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2657  precorrin-2 C20-methyltransferase, putative  23.72 
 
 
222 aa  50.8  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1192  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  29.09 
 
 
244 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0836971  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2487  precorrin-3 methyltransferase / precorrin-2 C20-methyltransferase / cobalt-factor II C20-methyltransferase  31.33 
 
 
495 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.710411  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1672  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  29.09 
 
 
244 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.130434  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3502  precorrin-2 C20-methyltransferase  28.21 
 
 
234 aa  50.4  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000438049  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2532  cobalt-factor II C20-methyltransferase / precorrin-2 C20-methyltransferase / precorrin-3 methyltransferase  31.33 
 
 
495 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735838  normal  0.502246 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1077  cobalt-precorrin-2 C(20)-methyltransferase  29.7 
 
 
203 aa  50.4  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2496  precorrin-3B C17-methyltransferase  29.75 
 
 
495 aa  50.4  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.218921 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2524  precorrin-3 methyltransferase / precorrin-2 C20-methyltransferase / cobalt-factor II C20-methyltransferase  31.33 
 
 
495 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.564882  normal  0.0996134 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0799  precorrin-2 C20-methyltransferase  31.79 
 
 
236 aa  51.2  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1229  precorrin-4 C11-methyltransferase  25.11 
 
 
264 aa  50.4  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0594011 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0768  precorrin-2 C20-methyltransferase / cobalt-factor II C20-methyltransferase  27.15 
 
 
232 aa  50.4  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.982265  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>