158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3576 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_3576  precorrin 6A synthase  100 
 
 		 252 aa  496  1e-139  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.982294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3385  precorrin 6A synthase  92.06 
 
 		 252 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.852211 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3694  precorrin 6A synthase  92.03 
 
 		 252 aa  442  1e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.529674 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6988  precorrin 6A synthase  60.8 
 
 		 261 aa  297  1e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.444795  normal  0.650286 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2061  precorrin 6A synthase  54.18 
 
 		 251 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2657  precorrin 6A synthase  59.76 
 
 		 256 aa  279  3e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.14068  normal  0.163709 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2442  precorrin 6A synthase  54.76 
 
 		 252 aa  279  4e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0256861  decreased coverage  0.000262915 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2819  precorrin 6A synthase  56.75 
 
 		 256 aa  275  5e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.615759 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3231  precorrin 6A synthase  52.19 
 
 		 252 aa  267  8.999999999999999e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00310534 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1538  precorrin 6A synthase  62.5 
 
 		 262 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0200089  normal  0.0986349 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6018  precorrin 6A synthase  55.82 
 
 		 254 aa  265  4e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0516711  normal  0.289683 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7173  precorrin 6A synthase  56.63 
 
 		 254 aa  264  8.999999999999999e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.92278  normal  0.266334 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4718  precorrin 6A synthase  56.76 
 
 		 254 aa  259  4e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.502891  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2709  tetrapyrrole methylase family protein  52.34 
 
 		 261 aa  258  7e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0861444  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4338  precorrin 6A synthase  56.37 
 
 		 254 aa  257  1e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0501476  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4424  precorrin 6A synthase  56.37 
 
 		 254 aa  257  1e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.753252 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1896  precorrin 6A synthase  54.4 
 
 		 252 aa  251  6e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.628437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2326  precorrin 6A synthase  54.44 
 
 		 253 aa  251  8.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.414205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4583  precorrin 6A synthase  52 
 
 		 253 aa  246  3e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3174  precorrin 6A synthase  54.4 
 
 		 253 aa  236  2e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3763  precorrin 6A synthase  52.57 
 
 		 249 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.21445 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2104  precorrin 6A synthase  51.59 
 
 		 251 aa  231  8.000000000000001e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.749049  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2504  precorrin-6A synthase  51 
 
 		 244 aa  231  9e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.488753 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2387  precorrin 6A synthase  51 
 
 		 254 aa  229  3e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2000  precorrin 6A synthase  52.19 
 
 		 249 aa  227  2e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00310446 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3353  precorrin-6A synthase (deacetylating)  53.94 
 
 		 253 aa  226  2e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.569272  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2140  precorrin 6A synthase  51.39 
 
 		 249 aa  226  2e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.1822  hitchhiker  0.0000632781 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1321  precorrin-6A synthase (deacetylating)  51.84 
 
 		 246 aa  224  8e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2970  precorrin 6A synthase  49.6 
 
 		 257 aa  224  1e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.590816  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0142  precorrin 6A synthase  50.2 
 
 		 297 aa  218  1e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2224  precorrin 6A synthase  47.64 
 
 		 254 aa  214  9.999999999999999e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4201  precorrin 6A synthase  51.2 
 
 		 266 aa  213  1.9999999999999998e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0332  precorrin 6A synthase  49.61 
 
 		 254 aa  207  2e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0320  precorrin 6A synthase  49.23 
 
 		 262 aa  205  7e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17580  precorrin 6A synthase  47.64 
 
 		 252 aa  204  1e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2542  precorrin 6A synthase  50.4 
 
 		 249 aa  194  9e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.786467 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2879  precorrin 6A synthase  46.59 
 
 		 239 aa  186  3e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2819  precorrin 6A synthase  47.22 
 
 		 254 aa  170  2e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.632211  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1477  precorrin 6A synthase  46.83 
 
 		 254 aa  167  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.756738  normal  0.444029 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5843  precorrin 6A synthase  46.54 
 
 		 265 aa  165  6.9999999999999995e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1527  precorrin 6A synthase  47.83 
 
 		 245 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.626854  normal  0.483999 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0376  precorrin 6A synthase  43.14 
 
 		 254 aa  162  6e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0361  precorrin 6A synthase  45.1 
 
 		 273 aa  157  1e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0784549 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2920  precorrin 6A synthase  43.5 
 
 		 246 aa  151  1e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0390694 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1612  precorrin-6A synthase (deacetylating)  43.92 
 
 		 247 aa  150  3e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0570  precorrin-2 C20-methyltransferase  36.42 
 
 		 242 aa  60.5  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.307877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1293  precorrin-2 C20-methyltransferase  27.4 
 
 		 236 aa  58.5  0.00000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.116679 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1556  precorrin-2 C20-methyltransferase  28.05 
 
 		 233 aa  57.4  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2479  precorrin-3B C17-methyltransferase  29.41 
 
 		 500 aa  57  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0466913  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1714  precorrin-2 C20-methyltransferase  28.22 
 
 		 236 aa  56.6  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1266  precorrin-2 C20-methyltransferase  31.76 
 
 		 240 aa  55.5  0.0000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1271  precorrin-2 C20-methyltransferase  28.57 
 
 		 226 aa  54.7  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2083  precorrin-2 methyltransferase  26.42 
 
 		 252 aa  55.1  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2400  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  24.87 
 
 		 244 aa  53.5  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0164224  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3020  precorrin-2 methyltransferase  27.95 
 
 		 238 aa  53.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2135  precorrin-2 C20-methyltransferase  25.11 
 
 		 239 aa  53.1  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0352605 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1237  cobalt-precorrin-2 C(20)-methyltransferase  27.01 
 
 		 220 aa  52.4  0.000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.433092  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3502  precorrin-2 C20-methyltransferase  25.38 
 
 		 234 aa  52.4  0.000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000438049  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5690  precorrin-2 C20-methyltransferase  30.61 
 
 		 255 aa  52.4  0.000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.23715  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2657  precorrin-2 C20-methyltransferase, putative  26.67 
 
 		 222 aa  52.4  0.000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2995  precorrin-2 C20-methyltransferase  29.7 
 
 		 236 aa  51.2  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6036  precorrin-2 C20-methyltransferase  30.26 
 
 		 248 aa  51.6  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3374  precorrin-2 C20-methyltransferase  26.04 
 
 		 246 aa  51.2  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.299047 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1012  precorrin-2 C20-methyltransferase  25 
 
 		 238 aa  51.2  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1163  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  25.81 
 
 		 244 aa  50.8  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00204005  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2865  precorrin-2 C20-methyltransferase / cobalt-factor II C20-methyltransferase  27.1 
 
 		 234 aa  50.8  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2111  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  25.81 
 
 		 244 aa  51.2  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.414891  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3107  cobalt-factor II C20-methyltransferase / precorrin-2 C20-methyltransferase  28.07 
 
 		 239 aa  50.8  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2990  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  27.27 
 
 		 244 aa  51.2  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1604  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  25.81 
 
 		 244 aa  50.8  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.189665  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0266  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  25.81 
 
 		 244 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0493785  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1948  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  25.81 
 
 		 244 aa  51.2  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.180512  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1965  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  25.81 
 
 		 244 aa  51.2  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00527923  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0894  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  25.81 
 
 		 244 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.19117  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3542  precorrin-2 C20-methyltransferase  26.77 
 
 		 236 aa  50.8  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1500  precorrin-2 C20-methyltransferase  29.34 
 
 		 259 aa  50.8  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0799  precorrin-2 C20-methyltransferase  27.83 
 
 		 236 aa  50.4  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3100  precorrin-2 methyltransferase  26.97 
 
 		 238 aa  50.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2190  precorrin-3B C17-methyltransferase  28.8 
 
 		 490 aa  49.7  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.501177  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1897  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  26.4 
 
 		 244 aa  49.3  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0807274  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0639  precorrin-2 C20-methyltransferase  31.45 
 
 		 242 aa  49.7  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3145  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  24.46 
 
 		 251 aa  49.7  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.34411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2358  precorrin-4 C11-methyltransferase / cobalt-factor II C20-methyltransferase  25 
 
 		 243 aa  49.3  0.00006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1710  cobalt-precorrin-2 C(20)-methyltransferase  27.38 
 
 		 237 aa  48.9  0.00007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0701  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  27.38 
 
 		 211 aa  48.9  0.00007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5371  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  25.86 
 
 		 243 aa  48.9  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.160971  normal  0.506774 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0768  precorrin-2 C20-methyltransferase / cobalt-factor II C20-methyltransferase  26.42 
 
 		 232 aa  48.9  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.982265  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1288  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  25.67 
 
 		 244 aa  48.5  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0483  precorrin-4 C11-methyltransferase  28.05 
 
 		 258 aa  48.1  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1853  cobalt-factor II C20-methyltransferase / precorrin-2 C20-methyltransferase  28.65 
 
 		 234 aa  48.5  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.254503  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0153  precorrin-3B C17-methyltransferase  27.27 
 
 		 513 aa  48.5  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26510  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  25.81 
 
 		 250 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0109383  normal  0.778787 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2314  precorrin-2 C20-methyltransferase  31.74 
 
 		 256 aa  48.5  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.144109 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0693  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  22.34 
 
 		 172 aa  48.5  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.152169  hitchhiker  0.0000247866 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1251  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  25.67 
 
 		 244 aa  48.5  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0286047  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1431  cobalt-precorrin-2 C(20)-methyltransferase  26.19 
 
 		 220 aa  47.4  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0227456  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1124  uroporphyrin-III C-methyltransferase  25.9 
 
 		 491 aa  47.8  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.219261  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1433  precorrin-2 C20-methyltransferase  29.93 
 
 		 265 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.69961 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0036  precorrin-2 C20-methyltransferase  29.49 
 
 		 244 aa  47.4  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2250  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  25.41 
 
 		 250 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.44804  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>