177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1527 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1527  precorrin 6A synthase  100 
 
 		 245 aa  478  1e-134  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.626854  normal  0.483999 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2819  precorrin 6A synthase  85.48 
 
 		 254 aa  350  1e-95  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.632211  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1477  precorrin 6A synthase  84.23 
 
 		 254 aa  347  1e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.756738  normal  0.444029 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2542  precorrin 6A synthase  64.66 
 
 		 249 aa  286  2e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.786467 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2920  precorrin 6A synthase  61.83 
 
 		 246 aa  285  7e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0390694 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5843  precorrin 6A synthase  58.14 
 
 		 265 aa  261  1e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2224  precorrin 6A synthase  54.37 
 
 		 254 aa  256  2e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0332  precorrin 6A synthase  57.43 
 
 		 254 aa  254  8e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2819  precorrin 6A synthase  44.88 
 
 		 256 aa  204  7e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.615759 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2657  precorrin 6A synthase  46.69 
 
 		 256 aa  201  9.999999999999999e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.14068  normal  0.163709 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6018  precorrin 6A synthase  44.62 
 
 		 254 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0516711  normal  0.289683 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7173  precorrin 6A synthase  43.43 
 
 		 254 aa  193  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.92278  normal  0.266334 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4583  precorrin 6A synthase  45.45 
 
 		 253 aa  190  2e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2387  precorrin 6A synthase  42.8 
 
 		 254 aa  187  9e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3763  precorrin 6A synthase  43.48 
 
 		 249 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.21445 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2140  precorrin 6A synthase  44.27 
 
 		 249 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.1822  hitchhiker  0.0000632781 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4718  precorrin 6A synthase  46.61 
 
 		 254 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.502891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2326  precorrin 6A synthase  42.74 
 
 		 253 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.414205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4338  precorrin 6A synthase  46.61 
 
 		 254 aa  183  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0501476  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4424  precorrin 6A synthase  46.61 
 
 		 254 aa  183  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.753252 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3174  precorrin 6A synthase  42.46 
 
 		 253 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2104  precorrin 6A synthase  43.08 
 
 		 251 aa  181  9.000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.749049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1896  precorrin 6A synthase  41.27 
 
 		 252 aa  180  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.628437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2000  precorrin 6A synthase  43.08 
 
 		 249 aa  180  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00310446 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3231  precorrin 6A synthase  42.06 
 
 		 252 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00310534 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3576  precorrin 6A synthase  47.62 
 
 		 252 aa  176  2e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.982294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3385  precorrin 6A synthase  47.22 
 
 		 252 aa  176  4e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.852211 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1538  precorrin 6A synthase  48.78 
 
 		 262 aa  175  5e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0200089  normal  0.0986349 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3694  precorrin 6A synthase  47.22 
 
 		 252 aa  174  9e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.529674 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0142  precorrin 6A synthase  44.22 
 
 		 297 aa  174  9.999999999999999e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6988  precorrin 6A synthase  39.76 
 
 		 261 aa  169  3e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.444795  normal  0.650286 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4201  precorrin 6A synthase  43.2 
 
 		 266 aa  167  1e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2504  precorrin-6A synthase  43.27 
 
 		 244 aa  167  2e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.488753 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3353  precorrin-6A synthase (deacetylating)  43.03 
 
 		 253 aa  166  2.9999999999999998e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.569272  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1321  precorrin-6A synthase (deacetylating)  43.5 
 
 		 246 aa  165  5e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2061  precorrin 6A synthase  37.55 
 
 		 251 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2709  tetrapyrrole methylase family protein  38.67 
 
 		 261 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0861444  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2970  precorrin 6A synthase  40.94 
 
 		 257 aa  159  5e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.590816  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2442  precorrin 6A synthase  36.25 
 
 		 252 aa  154  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0256861  decreased coverage  0.000262915 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17580  precorrin 6A synthase  41.77 
 
 		 252 aa  149  3e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0320  precorrin 6A synthase  40.16 
 
 		 262 aa  145  8.000000000000001e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2879  precorrin 6A synthase  39.92 
 
 		 239 aa  117  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0361  precorrin 6A synthase  39.53 
 
 		 273 aa  115  8.999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0784549 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0376  precorrin 6A synthase  40.08 
 
 		 254 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1612  precorrin-6A synthase (deacetylating)  39.43 
 
 		 247 aa  99.4  4e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2816  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  30.41 
 
 		 257 aa  57.4  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.631326 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2479  precorrin-3B C17-methyltransferase  29.61 
 
 		 500 aa  56.2  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0466913  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1714  precorrin-2 C20-methyltransferase  28.44 
 
 		 236 aa  55.5  0.0000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1313  precorrin-2 C20-methyltransferase  32.45 
 
 		 239 aa  55.1  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0407603  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0385  cobalt-factor II C20-methyltransferase  27.39 
 
 		 251 aa  55.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1293  precorrin-2 C20-methyltransferase  27.21 
 
 		 236 aa  54.7  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.116679 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2735  precorrin-2 C20-methyltransferase  29.05 
 
 		 236 aa  55.1  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000618723  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2441  precorrin-2 C20-methyltransferase  29.05 
 
 		 262 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.161962  normal  0.0706437 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2928  precorrin-2 C20-methyltransferase  26.03 
 
 		 245 aa  54.3  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.493406  hitchhiker  0.00304132 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0153  precorrin-3B C17-methyltransferase  28.17 
 
 		 513 aa  53.9  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3477  cobalt-precorrin-2 C(20)-methyltransferase  26.25 
 
 		 289 aa  53.5  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0115  precorrin-2 C20-methyltransferase  25.69 
 
 		 222 aa  52.8  0.000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.942057  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0693  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  30 
 
 		 172 aa  52.8  0.000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.152169  hitchhiker  0.0000247866 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1433  precorrin-2 C20-methyltransferase  24.83 
 
 		 265 aa  52.4  0.000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.69961 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0933  precorrin-2 C20-methyltransferase  27.96 
 
 		 233 aa  52.4  0.000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.422723  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1897  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  26.95 
 
 		 244 aa  52.4  0.000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0807274  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1711  precorrin-2 C20-methyltransferase  24.83 
 
 		 265 aa  52  0.000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.458847  normal  0.0168162 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1077  cobalt-precorrin-2 C(20)-methyltransferase  22.9 
 
 		 203 aa  52  0.000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1436  precorrin-2 C20-methyltransferase  24.83 
 
 		 265 aa  52  0.000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.29028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2111  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  27.21 
 
 		 244 aa  51.2  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.414891  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0995  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  24.19 
 
 		 276 aa  51.2  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2379  precorrin-2 C20-methyltransferase  26.21 
 
 		 242 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0768  precorrin-2 C20-methyltransferase / cobalt-factor II C20-methyltransferase  25.35 
 
 		 232 aa  52  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.982265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3502  precorrin-2 C20-methyltransferase  27.5 
 
 		 234 aa  51.6  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000438049  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0266  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  27.21 
 
 		 244 aa  51.2  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0493785  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1948  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  27.21 
 
 		 244 aa  51.2  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.180512  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1965  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  27.21 
 
 		 244 aa  51.2  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00527923  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0894  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  27.21 
 
 		 244 aa  51.2  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.19117  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1710  cobalt-precorrin-2 C(20)-methyltransferase  25 
 
 		 237 aa  51.2  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1012  precorrin-2 C20-methyltransferase  25.17 
 
 		 238 aa  51.2  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1288  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  27.92 
 
 		 244 aa  50.4  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1163  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  27.21 
 
 		 244 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00204005  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3107  cobalt-factor II C20-methyltransferase / precorrin-2 C20-methyltransferase  30.86 
 
 		 239 aa  50.4  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1887  precorrin-2 C20-methyltransferase  27.51 
 
 		 243 aa  50.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1604  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  27.21 
 
 		 244 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.189665  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04511  precorrin-2 C20-methyltransferase  28.36 
 
 		 254 aa  50.8  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1251  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  27.92 
 
 		 244 aa  50.4  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0286047  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1266  precorrin-2 C20-methyltransferase  32.89 
 
 		 240 aa  50.8  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5690  precorrin-2 C20-methyltransferase  26.21 
 
 		 255 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.23715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2826  precorrin-2 C20-methyltransferase  27.27 
 
 		 243 aa  50.1  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0859499  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3118  precorrin-2 C20-methyltransferase  26.76 
 
 		 259 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1470  precorrin-2 C20-methyltransferase  26.62 
 
 		 243 aa  50.4  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.761996 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2706  precorrin-2 C20-methyltransferase  31.25 
 
 		 247 aa  50.4  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000899582 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2213  precorrin-2 C20-methyltransferase  27.52 
 
 		 243 aa  49.7  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1854  precorrin-2 C20-methyltransferase  32 
 
 		 243 aa  49.7  0.00004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0570  precorrin-2 C20-methyltransferase  34 
 
 		 242 aa  49.7  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.307877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3652  precorrin-2 C20-methyltransferase  32.41 
 
 		 245 aa  49.7  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0316  precorrin-2 C20-methyltransferase / precorrin-3 methyltransferase  29.66 
 
 		 511 aa  49.3  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1521  precorrin-2 C20-methyltransferase / cobalt-factor II C20-methyltransferase / precorrin-3 methyltransferase  29.53 
 
 		 526 aa  49.3  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0252228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3374  precorrin-2 C20-methyltransferase  26.11 
 
 		 246 aa  48.9  0.00007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.299047 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1520  precorrin-2 C20-methyltransferase  26.49 
 
 		 243 aa  48.9  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0389553  normal  0.0426872 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3283  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  27.52 
 
 		 241 aa  48.5  0.00009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.308493  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10020  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  31.28 
 
 		 422 aa  48.5  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0127568  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0058  precorrin-2 C20-methyltransferase  22.82 
 
 		 240 aa  48.1  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5595  Precorrin-3B methylase-like protein  28.29 
 
 		 509 aa  48.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0773745  normal  0.51395 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>