197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0332 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_0332  precorrin 6A synthase  100 
 
 
254 aa  505  9.999999999999999e-143  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2542  precorrin 6A synthase  56.05 
 
 
249 aa  269  4e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.786467 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2224  precorrin 6A synthase  54.15 
 
 
254 aa  260  1e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2920  precorrin 6A synthase  56.28 
 
 
246 aa  253  3e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0390694 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2819  precorrin 6A synthase  59.68 
 
 
254 aa  248  8e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.632211  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1477  precorrin 6A synthase  59.29 
 
 
254 aa  245  4.9999999999999997e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.756738  normal  0.444029 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5843  precorrin 6A synthase  56.59 
 
 
265 aa  244  9.999999999999999e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6018  precorrin 6A synthase  49 
 
 
254 aa  225  5.0000000000000005e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0516711  normal  0.289683 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7173  precorrin 6A synthase  49 
 
 
254 aa  225  6e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.92278  normal  0.266334 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4338  precorrin 6A synthase  50.79 
 
 
254 aa  224  1e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0501476  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4424  precorrin 6A synthase  50.79 
 
 
254 aa  224  1e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.753252 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4718  precorrin 6A synthase  50.79 
 
 
254 aa  224  1e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.502891  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2819  precorrin 6A synthase  46.61 
 
 
256 aa  223  2e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.615759 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1527  precorrin 6A synthase  57.03 
 
 
245 aa  223  3e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.626854  normal  0.483999 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2326  precorrin 6A synthase  47.01 
 
 
253 aa  218  7e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.414205  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4583  precorrin 6A synthase  47.81 
 
 
253 aa  217  1e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1896  precorrin 6A synthase  46.31 
 
 
252 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.628437  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2387  precorrin 6A synthase  47.2 
 
 
254 aa  214  9e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2657  precorrin 6A synthase  49.61 
 
 
256 aa  214  9.999999999999999e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.14068  normal  0.163709 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6988  precorrin 6A synthase  46.83 
 
 
261 aa  213  2.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.444795  normal  0.650286 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3231  precorrin 6A synthase  44.4 
 
 
252 aa  204  1e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00310534 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3174  precorrin 6A synthase  46.27 
 
 
253 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3576  precorrin 6A synthase  49.61 
 
 
252 aa  195  5.000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.982294  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3763  precorrin 6A synthase  44.84 
 
 
249 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.21445 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2000  precorrin 6A synthase  44.84 
 
 
249 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00310446 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2061  precorrin 6A synthase  43.82 
 
 
251 aa  193  2e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4201  precorrin 6A synthase  47.79 
 
 
266 aa  192  3e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1538  precorrin 6A synthase  49.2 
 
 
262 aa  192  4e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0200089  normal  0.0986349 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3385  precorrin 6A synthase  50.2 
 
 
252 aa  190  2e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.852211 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2504  precorrin-6A synthase  46.75 
 
 
244 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.488753 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2709  tetrapyrrole methylase family protein  41.41 
 
 
261 aa  188  5.999999999999999e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0861444  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3694  precorrin 6A synthase  50.2 
 
 
252 aa  188  5.999999999999999e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.529674 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0142  precorrin 6A synthase  45.38 
 
 
297 aa  187  1e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2104  precorrin 6A synthase  43.43 
 
 
251 aa  186  3e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.749049  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3353  precorrin-6A synthase (deacetylating)  46.83 
 
 
253 aa  184  1.0000000000000001e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.569272  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2140  precorrin 6A synthase  43.65 
 
 
249 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.1822  hitchhiker  0.0000632781 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2442  precorrin 6A synthase  41.04 
 
 
252 aa  180  2e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0256861  decreased coverage  0.000262915 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0320  precorrin 6A synthase  44.27 
 
 
262 aa  176  4e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2970  precorrin 6A synthase  40.64 
 
 
257 aa  166  2e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.590816  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1321  precorrin-6A synthase (deacetylating)  42.11 
 
 
246 aa  165  5.9999999999999996e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17580  precorrin 6A synthase  41.27 
 
 
252 aa  160  1e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0361  precorrin 6A synthase  38.22 
 
 
273 aa  122  7e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0784549 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2879  precorrin 6A synthase  36.29 
 
 
239 aa  120  9.999999999999999e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0376  precorrin 6A synthase  37.16 
 
 
254 aa  120  3e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1612  precorrin-6A synthase (deacetylating)  39.2 
 
 
247 aa  109  5e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2995  precorrin-2 C20-methyltransferase  32.43 
 
 
236 aa  65.1  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2083  precorrin-2 methyltransferase  28.57 
 
 
252 aa  63.9  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1091  cobalt-factor II C20-methyltransferase / precorrin-2 C20-methyltransferase  27.81 
 
 
237 aa  61.2  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3107  cobalt-factor II C20-methyltransferase / precorrin-2 C20-methyltransferase  32.45 
 
 
239 aa  61.2  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2135  precorrin-2 C20-methyltransferase  28.96 
 
 
239 aa  61.2  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0352605 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6036  precorrin-2 C20-methyltransferase  28.87 
 
 
248 aa  59.3  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1714  precorrin-2 C20-methyltransferase  33.56 
 
 
236 aa  59.3  0.00000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2865  precorrin-2 C20-methyltransferase / cobalt-factor II C20-methyltransferase  30.26 
 
 
234 aa  58.5  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04401  precorrin-2-C20-methyltransferase  27.63 
 
 
251 aa  58.5  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04091  precorrin-2 C20-methyltransferase  26.97 
 
 
251 aa  57.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0768  precorrin-2 C20-methyltransferase / cobalt-factor II C20-methyltransferase  28.26 
 
 
232 aa  56.6  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.982265  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2735  precorrin-2 C20-methyltransferase  30.2 
 
 
236 aa  56.6  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000618723  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3374  precorrin-2 C20-methyltransferase  28.57 
 
 
246 aa  56.2  0.0000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.299047 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1556  precorrin-2 C20-methyltransferase  23.84 
 
 
233 aa  55.8  0.0000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0153  precorrin-3B C17-methyltransferase  31.14 
 
 
513 aa  55.8  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3265  precorrin-2 C20-methyltransferase  29.11 
 
 
247 aa  55.5  0.0000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.180313 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0316  precorrin-2 C20-methyltransferase / precorrin-3 methyltransferase  32.56 
 
 
511 aa  55.1  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2706  precorrin-2 C20-methyltransferase  27.5 
 
 
247 aa  55.1  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000899582 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0385  cobalt-factor II C20-methyltransferase  27.63 
 
 
251 aa  54.3  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3502  precorrin-2 C20-methyltransferase  26.45 
 
 
234 aa  53.9  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000438049  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3542  precorrin-2 C20-methyltransferase  30.67 
 
 
236 aa  54.7  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04401  precorrin-2 C20-methyltransferase  25.32 
 
 
242 aa  54.3  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.614023  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1723  precorrin-2 C20-methyltransferase / cobalt-factor II C20-methyltransferase  24.87 
 
 
242 aa  53.5  0.000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1012  precorrin-2 C20-methyltransferase  27.03 
 
 
238 aa  53.9  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1522  cobalt-precorrin-2 C(20)-methyltransferase  25.83 
 
 
209 aa  53.9  0.000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000310651 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0799  precorrin-2 C20-methyltransferase  28.57 
 
 
236 aa  53.9  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2479  precorrin-3B C17-methyltransferase  29.8 
 
 
500 aa  53.9  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0466913  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5690  precorrin-2 C20-methyltransferase  26.11 
 
 
255 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.23715  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3477  cobalt-precorrin-2 C(20)-methyltransferase  23.11 
 
 
289 aa  53.5  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1853  cobalt-factor II C20-methyltransferase / precorrin-2 C20-methyltransferase  28.95 
 
 
234 aa  53.1  0.000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.254503  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3020  precorrin-2 methyltransferase  25.77 
 
 
238 aa  53.1  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0476  precorrin-2 C20-methyltransferase  26.62 
 
 
256 aa  52.8  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03851  precorrin-2 C20-methyltransferase  24.36 
 
 
273 aa  52.8  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2152  precorrin-2 C20-methyltransferase  27.56 
 
 
263 aa  52.8  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.014413  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0312  precorrin-2 C20-methyltransferase  26.45 
 
 
224 aa  52.4  0.000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1711  precorrin-2 C20-methyltransferase  27.4 
 
 
265 aa  52  0.000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.458847  normal  0.0168162 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2441  precorrin-2 C20-methyltransferase  28.97 
 
 
262 aa  52  0.000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.161962  normal  0.0706437 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1436  precorrin-2 C20-methyltransferase  27.4 
 
 
265 aa  52  0.000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.29028  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0554  precorrin-2 C20-methyltransferase  26.09 
 
 
240 aa  52  0.000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1433  precorrin-2 C20-methyltransferase  26.11 
 
 
265 aa  52  0.000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.69961 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0036  precorrin-2 C20-methyltransferase  29.81 
 
 
244 aa  52  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0048  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  25.87 
 
 
229 aa  51.6  0.00001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.837851  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0058  precorrin-2 C20-methyltransferase  26.06 
 
 
240 aa  51.6  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1293  precorrin-2 C20-methyltransferase  22.3 
 
 
236 aa  51.6  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.116679 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4665  precorrin-2 methyltransferase  23.71 
 
 
237 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0621285 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1781  precorrin-3B C17-methyltransferase  26.78 
 
 
516 aa  50.8  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.629094  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2610  precorrin-2 C20-methyltransferase  29.61 
 
 
233 aa  51.2  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0693  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  25.79 
 
 
172 aa  51.2  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.152169  hitchhiker  0.0000247866 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0248  precorrin-2 C20-methyltransferase  29.12 
 
 
232 aa  51.2  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2524  precorrin-2 C20-methyltransferase  28.75 
 
 
247 aa  50.1  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00515181  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2190  precorrin-3B C17-methyltransferase  31.9 
 
 
490 aa  50.1  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.501177  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3100  precorrin-2 methyltransferase  25.16 
 
 
238 aa  49.7  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0123  precorrin-2 C20-methyltransferase  31.58 
 
 
234 aa  49.3  0.00006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3118  precorrin-2 C20-methyltransferase  27.45 
 
 
259 aa  48.9  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0995  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  21.56 
 
 
276 aa  48.9  0.00008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>