47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5843 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_5843  precorrin 6A synthase  100 
 
 		 265 aa  530  1e-149  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0332  precorrin 6A synthase  56.98 
 
 		 254 aa  264  1e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2542  precorrin 6A synthase  56.03 
 
 		 249 aa  262  4e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.786467 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2920  precorrin 6A synthase  53.94 
 
 		 246 aa  248  8e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0390694 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2819  precorrin 6A synthase  57.25 
 
 		 254 aa  245  6e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.632211  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1527  precorrin 6A synthase  57.36 
 
 		 245 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.626854  normal  0.483999 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1477  precorrin 6A synthase  56.86 
 
 		 254 aa  242  3.9999999999999997e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.756738  normal  0.444029 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2224  precorrin 6A synthase  50.78 
 
 		 254 aa  240  2e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2819  precorrin 6A synthase  45.74 
 
 		 256 aa  221  9.999999999999999e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.615759 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7173  precorrin 6A synthase  44.96 
 
 		 254 aa  218  7e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.92278  normal  0.266334 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6018  precorrin 6A synthase  44.57 
 
 		 254 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0516711  normal  0.289683 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4424  precorrin 6A synthase  46.62 
 
 		 254 aa  206  2e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.753252 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4338  precorrin 6A synthase  46.62 
 
 		 254 aa  206  2e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0501476  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4718  precorrin 6A synthase  46.24 
 
 		 254 aa  205  7e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.502891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2387  precorrin 6A synthase  44.09 
 
 		 254 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4583  precorrin 6A synthase  45.35 
 
 		 253 aa  201  8e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2326  precorrin 6A synthase  43.08 
 
 		 253 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.414205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1896  precorrin 6A synthase  44.71 
 
 		 252 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.628437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3174  precorrin 6A synthase  45.35 
 
 		 253 aa  192  3e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2657  precorrin 6A synthase  44.31 
 
 		 256 aa  191  8e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.14068  normal  0.163709 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2104  precorrin 6A synthase  43.8 
 
 		 251 aa  188  1e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.749049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3231  precorrin 6A synthase  42.35 
 
 		 252 aa  187  1e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00310534 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2504  precorrin-6A synthase  43.7 
 
 		 244 aa  187  2e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.488753 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3763  precorrin 6A synthase  43.75 
 
 		 249 aa  186  5e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.21445 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6988  precorrin 6A synthase  40.78 
 
 		 261 aa  184  9e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.444795  normal  0.650286 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2000  precorrin 6A synthase  43.36 
 
 		 249 aa  181  9.000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00310446 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2061  precorrin 6A synthase  39.69 
 
 		 251 aa  175  8e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3353  precorrin-6A synthase (deacetylating)  43.68 
 
 		 253 aa  172  3.9999999999999995e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.569272  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1321  precorrin-6A synthase (deacetylating)  41.7 
 
 		 246 aa  171  9e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2140  precorrin 6A synthase  41.02 
 
 		 249 aa  169  3e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.1822  hitchhiker  0.0000632781 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3576  precorrin 6A synthase  46.54 
 
 		 252 aa  169  5e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.982294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1538  precorrin 6A synthase  45.53 
 
 		 262 aa  165  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0200089  normal  0.0986349 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0142  precorrin 6A synthase  43.19 
 
 		 297 aa  165  6.9999999999999995e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3694  precorrin 6A synthase  45.14 
 
 		 252 aa  165  9e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.529674 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3385  precorrin 6A synthase  45.74 
 
 		 252 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.852211 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2709  tetrapyrrole methylase family protein  39.62 
 
 		 261 aa  160  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0861444  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2442  precorrin 6A synthase  39.15 
 
 		 252 aa  160  2e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0256861  decreased coverage  0.000262915 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2970  precorrin 6A synthase  39.53 
 
 		 257 aa  156  3e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.590816  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0320  precorrin 6A synthase  41.89 
 
 		 262 aa  156  4e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4201  precorrin 6A synthase  38.37 
 
 		 266 aa  155  6e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17580  precorrin 6A synthase  38.17 
 
 		 252 aa  138  8.999999999999999e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0361  precorrin 6A synthase  36.19 
 
 		 273 aa  112  5e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0784549 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2879  precorrin 6A synthase  34.11 
 
 		 239 aa  112  5e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0376  precorrin 6A synthase  37.55 
 
 		 254 aa  112  7.000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1612  precorrin-6A synthase (deacetylating)  37.08 
 
 		 247 aa  98.2  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1710  cobalt-precorrin-2 C(20)-methyltransferase  24.53 
 
 		 237 aa  43.1  0.005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1091  cobalt-factor II C20-methyltransferase / precorrin-2 C20-methyltransferase  26.54 
 
 		 237 aa  43.1  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>