167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_3694 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_3694  precorrin 6A synthase  100 
 
 
252 aa  495  1e-139  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.529674 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3385  precorrin 6A synthase  98.41 
 
 
252 aa  486  1e-136  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.852211 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3576  precorrin 6A synthase  92.03 
 
 
252 aa  442  1e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.982294  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6988  precorrin 6A synthase  59.27 
 
 
261 aa  288  4e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.444795  normal  0.650286 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2061  precorrin 6A synthase  54.18 
 
 
251 aa  282  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2657  precorrin 6A synthase  60.48 
 
 
256 aa  281  1e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.14068  normal  0.163709 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2442  precorrin 6A synthase  54.37 
 
 
252 aa  278  6e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0256861  decreased coverage  0.000262915 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2819  precorrin 6A synthase  55.56 
 
 
256 aa  276  2e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.615759 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3231  precorrin 6A synthase  54.58 
 
 
252 aa  271  6e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00310534 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6018  precorrin 6A synthase  56.97 
 
 
254 aa  268  5.9999999999999995e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0516711  normal  0.289683 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7173  precorrin 6A synthase  57.37 
 
 
254 aa  267  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.92278  normal  0.266334 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1538  precorrin 6A synthase  63.01 
 
 
262 aa  262  3e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0200089  normal  0.0986349 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4718  precorrin 6A synthase  57.42 
 
 
254 aa  259  2e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.502891  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4338  precorrin 6A synthase  57.03 
 
 
254 aa  258  8e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0501476  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4424  precorrin 6A synthase  57.03 
 
 
254 aa  258  8e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.753252 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2709  tetrapyrrole methylase family protein  52.34 
 
 
261 aa  258  9e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0861444  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2326  precorrin 6A synthase  53.63 
 
 
253 aa  250  1e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.414205  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1896  precorrin 6A synthase  54.03 
 
 
252 aa  248  9e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.628437  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4583  precorrin 6A synthase  50.59 
 
 
253 aa  246  4e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2504  precorrin-6A synthase  51.39 
 
 
244 aa  235  5.0000000000000005e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.488753 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3174  precorrin 6A synthase  54.03 
 
 
253 aa  232  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2387  precorrin 6A synthase  51.79 
 
 
254 aa  231  7.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3353  precorrin-6A synthase (deacetylating)  55.04 
 
 
253 aa  230  2e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.569272  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2104  precorrin 6A synthase  52.42 
 
 
251 aa  229  3e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.749049  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1321  precorrin-6A synthase (deacetylating)  51.82 
 
 
246 aa  228  7e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3763  precorrin 6A synthase  52.19 
 
 
249 aa  228  8e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.21445 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2970  precorrin 6A synthase  49.6 
 
 
257 aa  225  4e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.590816  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2224  precorrin 6A synthase  48.81 
 
 
254 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2000  precorrin 6A synthase  51.81 
 
 
249 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00310446 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2140  precorrin 6A synthase  50.6 
 
 
249 aa  219  3e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.1822  hitchhiker  0.0000632781 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4201  precorrin 6A synthase  50.2 
 
 
266 aa  213  1.9999999999999998e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0142  precorrin 6A synthase  49.8 
 
 
297 aa  212  3.9999999999999995e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0320  precorrin 6A synthase  49.43 
 
 
262 aa  202  3e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0332  precorrin 6A synthase  50.2 
 
 
254 aa  201  9.999999999999999e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17580  precorrin 6A synthase  46.83 
 
 
252 aa  198  7.999999999999999e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2542  precorrin 6A synthase  49.2 
 
 
249 aa  190  2e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.786467 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2879  precorrin 6A synthase  47.79 
 
 
239 aa  190  2e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0376  precorrin 6A synthase  43.48 
 
 
254 aa  163  3e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2819  precorrin 6A synthase  46.8 
 
 
254 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.632211  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1527  precorrin 6A synthase  46.83 
 
 
245 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.626854  normal  0.483999 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5843  precorrin 6A synthase  45.14 
 
 
265 aa  161  1e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1477  precorrin 6A synthase  46.4 
 
 
254 aa  160  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.756738  normal  0.444029 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0361  precorrin 6A synthase  44.53 
 
 
273 aa  155  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0784549 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1612  precorrin-6A synthase (deacetylating)  44.88 
 
 
247 aa  155  7e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2920  precorrin 6A synthase  42.68 
 
 
246 aa  147  2.0000000000000003e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0390694 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0570  precorrin-2 C20-methyltransferase  36.42 
 
 
242 aa  58.5  0.00000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.307877  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1293  precorrin-2 C20-methyltransferase  27.15 
 
 
236 aa  57.8  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.116679 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1271  precorrin-2 C20-methyltransferase  26.88 
 
 
226 aa  57.4  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2479  precorrin-3B C17-methyltransferase  28.74 
 
 
500 aa  56.6  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0466913  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2083  precorrin-2 methyltransferase  29.38 
 
 
252 aa  56.2  0.0000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1556  precorrin-2 C20-methyltransferase  26.83 
 
 
233 aa  55.8  0.0000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3502  precorrin-2 C20-methyltransferase  25.89 
 
 
234 aa  55.5  0.0000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000438049  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1266  precorrin-2 C20-methyltransferase  34.38 
 
 
240 aa  54.7  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0799  precorrin-2 C20-methyltransferase  31.61 
 
 
236 aa  53.9  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2129  precorrin-4 C11-methyltransferase  27.53 
 
 
259 aa  54.3  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000738255 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1714  precorrin-2 C20-methyltransferase  28.52 
 
 
236 aa  54.3  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0483  precorrin-4 C11-methyltransferase  29.44 
 
 
258 aa  53.5  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2135  precorrin-2 C20-methyltransferase  26.63 
 
 
239 aa  53.5  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0352605 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2657  precorrin-2 C20-methyltransferase, putative  25.14 
 
 
222 aa  52.8  0.000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2865  precorrin-2 C20-methyltransferase / cobalt-factor II C20-methyltransferase  26.45 
 
 
234 aa  52.4  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3107  cobalt-factor II C20-methyltransferase / precorrin-2 C20-methyltransferase  31.49 
 
 
239 aa  51.6  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2990  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  28.09 
 
 
244 aa  51.6  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2400  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  25.93 
 
 
244 aa  52  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0164224  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1124  uroporphyrin-III C-methyltransferase  26.29 
 
 
491 aa  51.6  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.219261  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2314  precorrin-2 C20-methyltransferase  32.53 
 
 
256 aa  51.2  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.144109 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3542  precorrin-2 C20-methyltransferase  26.26 
 
 
236 aa  50.8  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6036  precorrin-2 C20-methyltransferase  30.26 
 
 
248 aa  50.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0639  cobalt-factor II C20-methyltransferase / precorrin-2 C20-methyltransferase  36.36 
 
 
238 aa  50.4  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0277633  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0701  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  27.38 
 
 
211 aa  50.1  0.00003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0115  precorrin-2 C20-methyltransferase  21.57 
 
 
222 aa  49.7  0.00004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.942057  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2994  precorrin-4 C11-methyltransferase  27.76 
 
 
264 aa  49.7  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3020  precorrin-2 methyltransferase  26.71 
 
 
238 aa  49.7  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3374  precorrin-2 C20-methyltransferase  26.56 
 
 
246 aa  50.1  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.299047 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1237  cobalt-precorrin-2 C(20)-methyltransferase  27.84 
 
 
220 aa  49.7  0.00005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.433092  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1500  precorrin-2 C20-methyltransferase  30.73 
 
 
259 aa  49.7  0.00005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2111  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  26.34 
 
 
244 aa  48.9  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.414891  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4696  uroporphyrin-III C-methyltransferase  28.48 
 
 
478 aa  49.3  0.00007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5690  precorrin-2 C20-methyltransferase  29.25 
 
 
255 aa  48.9  0.00007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.23715  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0266  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  26.34 
 
 
244 aa  48.9  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0493785  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1948  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  26.34 
 
 
244 aa  48.9  0.00007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.180512  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1965  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  26.34 
 
 
244 aa  48.9  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00527923  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0894  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  26.34 
 
 
244 aa  48.9  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.19117  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04091  precorrin-2 C20-methyltransferase  26.09 
 
 
251 aa  48.9  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2995  precorrin-2 C20-methyltransferase  28.14 
 
 
236 aa  48.5  0.00009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1163  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  26.34 
 
 
244 aa  48.5  0.00009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00204005  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0671  uroporphyrin-III C-methyltransferase  28.99 
 
 
482 aa  48.5  0.00009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.523068  normal  0.0127709 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1604  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  26.34 
 
 
244 aa  48.5  0.00009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.189665  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2358  precorrin-4 C11-methyltransferase / cobalt-factor II C20-methyltransferase  25.73 
 
 
243 aa  48.1  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0693  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  23.4 
 
 
172 aa  48.1  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.152169  hitchhiker  0.0000247866 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1710  cobalt-precorrin-2 C(20)-methyltransferase  27.98 
 
 
237 aa  48.5  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1557  precorrin-4 C11-methyltransferase  25.17 
 
 
256 aa  47.4  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0768  precorrin-2 C20-methyltransferase / cobalt-factor II C20-methyltransferase  26.84 
 
 
232 aa  47.8  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.982265  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04401  precorrin-2-C20-methyltransferase  25.27 
 
 
251 aa  47.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1522  cobalt-precorrin-2 C(20)-methyltransferase  27.38 
 
 
209 aa  47.8  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000310651 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3100  precorrin-2 methyltransferase  25.66 
 
 
238 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1897  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  26.4 
 
 
244 aa  47.8  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0807274  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0639  precorrin-2 C20-methyltransferase  32.3 
 
 
242 aa  47.4  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0554  precorrin-2 C20-methyltransferase  24.78 
 
 
240 aa  47.4  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26510  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  24.86 
 
 
250 aa  47  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0109383  normal  0.778787 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0036  precorrin-2 C20-methyltransferase  26.92 
 
 
244 aa  46.6  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>