57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1612 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1612  precorrin-6A synthase (deacetylating)  100 
 
 		 247 aa  473  1e-132  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2879  precorrin 6A synthase  67.89 
 
 		 239 aa  309  2.9999999999999997e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0376  precorrin 6A synthase  61.26 
 
 		 254 aa  267  1e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0361  precorrin 6A synthase  60.56 
 
 		 273 aa  262  4.999999999999999e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0784549 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17580  precorrin 6A synthase  50 
 
 		 252 aa  203  2e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3231  precorrin 6A synthase  40.62 
 
 		 252 aa  175  5e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00310534 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3694  precorrin 6A synthase  46.67 
 
 		 252 aa  175  6e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.529674 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0320  precorrin 6A synthase  48.26 
 
 		 262 aa  175  6e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3763  precorrin 6A synthase  45.24 
 
 		 249 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.21445 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3385  precorrin 6A synthase  46.27 
 
 		 252 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.852211 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1321  precorrin-6A synthase (deacetylating)  44.05 
 
 		 246 aa  173  2.9999999999999996e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2657  precorrin 6A synthase  43.48 
 
 		 256 aa  172  5.999999999999999e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.14068  normal  0.163709 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3576  precorrin 6A synthase  45.7 
 
 		 252 aa  170  2e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.982294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2140  precorrin 6A synthase  43.65 
 
 		 249 aa  170  2e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.1822  hitchhiker  0.0000632781 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2104  precorrin 6A synthase  44.27 
 
 		 251 aa  170  2e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.749049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2000  precorrin 6A synthase  44.31 
 
 		 249 aa  166  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00310446 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2504  precorrin-6A synthase  43.7 
 
 		 244 aa  167  2e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.488753 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2970  precorrin 6A synthase  41.57 
 
 		 257 aa  166  4e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.590816  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4718  precorrin 6A synthase  45.04 
 
 		 254 aa  165  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.502891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4424  precorrin 6A synthase  44.66 
 
 		 254 aa  165  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.753252 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2442  precorrin 6A synthase  40.94 
 
 		 252 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0256861  decreased coverage  0.000262915 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4338  precorrin 6A synthase  44.66 
 
 		 254 aa  165  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0501476  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0142  precorrin 6A synthase  44 
 
 		 297 aa  163  2.0000000000000002e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2326  precorrin 6A synthase  40.32 
 
 		 253 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.414205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2061  precorrin 6A synthase  35.55 
 
 		 251 aa  160  3e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6988  precorrin 6A synthase  38.67 
 
 		 261 aa  158  6e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.444795  normal  0.650286 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7173  precorrin 6A synthase  38.34 
 
 		 254 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.92278  normal  0.266334 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3353  precorrin-6A synthase (deacetylating)  43.19 
 
 		 253 aa  156  4e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.569272  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2709  tetrapyrrole methylase family protein  39.15 
 
 		 261 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0861444  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2819  precorrin 6A synthase  39.37 
 
 		 256 aa  155  6e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.615759 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2387  precorrin 6A synthase  40.55 
 
 		 254 aa  154  9e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6018  precorrin 6A synthase  36.76 
 
 		 254 aa  153  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0516711  normal  0.289683 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4583  precorrin 6A synthase  40 
 
 		 253 aa  150  2e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1896  precorrin 6A synthase  37.89 
 
 		 252 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.628437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4201  precorrin 6A synthase  41.7 
 
 		 266 aa  144  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1538  precorrin 6A synthase  41.57 
 
 		 262 aa  142  4e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0200089  normal  0.0986349 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2224  precorrin 6A synthase  36.58 
 
 		 254 aa  141  9e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3174  precorrin 6A synthase  39.37 
 
 		 253 aa  135  9e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2542  precorrin 6A synthase  39.68 
 
 		 249 aa  132  6.999999999999999e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.786467 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0332  precorrin 6A synthase  39.2 
 
 		 254 aa  131  9e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2920  precorrin 6A synthase  37.55 
 
 		 246 aa  110  3e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0390694 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2819  precorrin 6A synthase  42.51 
 
 		 254 aa  108  6e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.632211  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1477  precorrin 6A synthase  42.11 
 
 		 254 aa  107  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.756738  normal  0.444029 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5843  precorrin 6A synthase  37.45 
 
 		 265 aa  107  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1527  precorrin 6A synthase  40.73 
 
 		 245 aa  102  8e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.626854  normal  0.483999 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0115  precorrin-2 C20-methyltransferase  27.27 
 
 		 222 aa  52.8  0.000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.942057  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1714  precorrin-2 C20-methyltransferase  31.55 
 
 		 236 aa  48.5  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0554  precorrin-2 C20-methyltransferase  28.95 
 
 		 240 aa  48.1  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3145  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  28.87 
 
 		 251 aa  47  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.34411  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1500  precorrin-2 C20-methyltransferase  31.58 
 
 		 259 aa  46.2  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0310  precorrin-6y C5,15-methyltransferase (decarboxylating), CbiE subunit  24.82 
 
 		 203 aa  44.7  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1556  precorrin-2 C20-methyltransferase  26.06 
 
 		 233 aa  45.1  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2735  precorrin-2 C20-methyltransferase  25.65 
 
 		 236 aa  44.7  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000618723  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0312  precorrin-2 C20-methyltransferase  26.11 
 
 		 224 aa  44.7  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2314  precorrin-2 C20-methyltransferase  35.71 
 
 		 256 aa  43.9  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.144109 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24850  precorrin-2 C20-methyltransferase  31.62 
 
 		 233 aa  42.7  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0799  precorrin-2 C20-methyltransferase  33.96 
 
 		 236 aa  42  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>