More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2326 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_2326  precorrin 6A synthase  100 
 
 		 253 aa  514  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.414205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2387  precorrin 6A synthase  72.29 
 
 		 254 aa  382  1e-105  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3174  precorrin 6A synthase  72.33 
 
 		 253 aa  371  1e-102  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1896  precorrin 6A synthase  56.05 
 
 		 252 aa  285  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.628437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2819  precorrin 6A synthase  53.36 
 
 		 256 aa  281  5.000000000000001e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.615759 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3231  precorrin 6A synthase  53.6 
 
 		 252 aa  276  2e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00310534 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6988  precorrin 6A synthase  52.99 
 
 		 261 aa  275  4e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.444795  normal  0.650286 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2657  precorrin 6A synthase  57.03 
 
 		 256 aa  275  4e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.14068  normal  0.163709 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2442  precorrin 6A synthase  52.4 
 
 		 252 aa  269  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0256861  decreased coverage  0.000262915 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7173  precorrin 6A synthase  53.01 
 
 		 254 aa  267  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.92278  normal  0.266334 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2061  precorrin 6A synthase  51.2 
 
 		 251 aa  265  5.999999999999999e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2709  tetrapyrrole methylase family protein  52.16 
 
 		 261 aa  263  2e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0861444  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6018  precorrin 6A synthase  51 
 
 		 254 aa  259  3e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0516711  normal  0.289683 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4583  precorrin 6A synthase  49.4 
 
 		 253 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2104  precorrin 6A synthase  49.6 
 
 		 251 aa  251  7e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.749049  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3763  precorrin 6A synthase  48.8 
 
 		 249 aa  248  8e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.21445 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2140  precorrin 6A synthase  48.79 
 
 		 249 aa  247  1e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.1822  hitchhiker  0.0000632781 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2000  precorrin 6A synthase  49.2 
 
 		 249 aa  246  3e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00310446 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2970  precorrin 6A synthase  50.98 
 
 		 257 aa  241  6e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.590816  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4424  precorrin 6A synthase  53.52 
 
 		 254 aa  239  2e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.753252 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4338  precorrin 6A synthase  53.52 
 
 		 254 aa  239  2e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0501476  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4718  precorrin 6A synthase  53.12 
 
 		 254 aa  238  5e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.502891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3385  precorrin 6A synthase  54.03 
 
 		 252 aa  238  9e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.852211 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3576  precorrin 6A synthase  54.44 
 
 		 252 aa  237  2e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.982294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3694  precorrin 6A synthase  53.63 
 
 		 252 aa  236  3e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.529674 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2504  precorrin-6A synthase  50 
 
 		 244 aa  228  5e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.488753 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0320  precorrin 6A synthase  50.39 
 
 		 262 aa  228  8e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2224  precorrin 6A synthase  49 
 
 		 254 aa  226  3e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0332  precorrin 6A synthase  47.01 
 
 		 254 aa  218  7e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1538  precorrin 6A synthase  49.6 
 
 		 262 aa  218  1e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0200089  normal  0.0986349 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1321  precorrin-6A synthase (deacetylating)  47.76 
 
 		 246 aa  217  1e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0142  precorrin 6A synthase  46.8 
 
 		 297 aa  207  1e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4201  precorrin 6A synthase  43.55 
 
 		 266 aa  205  5e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3353  precorrin-6A synthase (deacetylating)  45.91 
 
 		 253 aa  197  1.0000000000000001e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.569272  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17580  precorrin 6A synthase  45.85 
 
 		 252 aa  197  1.0000000000000001e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2542  precorrin 6A synthase  45.38 
 
 		 249 aa  196  4.0000000000000005e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.786467 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5843  precorrin 6A synthase  43.08 
 
 		 265 aa  186  3e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2920  precorrin 6A synthase  41.77 
 
 		 246 aa  176  3e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0390694 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2819  precorrin 6A synthase  41.83 
 
 		 254 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.632211  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1477  precorrin 6A synthase  41.43 
 
 		 254 aa  171  9e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.756738  normal  0.444029 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1527  precorrin 6A synthase  41.94 
 
 		 245 aa  167  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.626854  normal  0.483999 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2879  precorrin 6A synthase  40.24 
 
 		 239 aa  159  3e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0361  precorrin 6A synthase  38.43 
 
 		 273 aa  144  1e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0784549 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0376  precorrin 6A synthase  36.82 
 
 		 254 aa  143  3e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1612  precorrin-6A synthase (deacetylating)  38.74 
 
 		 247 aa  139  6e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2657  precorrin-2 C20-methyltransferase, putative  27.71 
 
 		 222 aa  72.8  0.000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1556  precorrin-2 C20-methyltransferase  28.22 
 
 		 233 aa  72  0.000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1522  cobalt-precorrin-2 C(20)-methyltransferase  30.43 
 
 		 209 aa  70.5  0.00000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000310651 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04091  precorrin-2 C20-methyltransferase  25.62 
 
 		 251 aa  68.6  0.00000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0115  precorrin-2 C20-methyltransferase  25.11 
 
 		 222 aa  68.2  0.0000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.942057  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2314  precorrin-2 C20-methyltransferase  28.57 
 
 		 256 aa  67.8  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.144109 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0570  precorrin-2 C20-methyltransferase  29.61 
 
 		 242 aa  68.2  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.307877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2135  precorrin-2 C20-methyltransferase  24.11 
 
 		 239 aa  68.2  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0352605 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2610  precorrin-2 C20-methyltransferase  28.83 
 
 		 233 aa  67.8  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2735  precorrin-2 C20-methyltransferase  31.28 
 
 		 236 aa  66.2  0.0000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000618723  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1293  precorrin-2 C20-methyltransferase  25.77 
 
 		 236 aa  66.2  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.116679 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0192  molybdopterin oxidoreductase/precorrin-4 methylase  35.06 
 
 		 607 aa  66.2  0.0000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.620214  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3107  cobalt-factor II C20-methyltransferase / precorrin-2 C20-methyltransferase  29.02 
 
 		 239 aa  65.9  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2479  precorrin-3B C17-methyltransferase  29.41 
 
 		 500 aa  65.5  0.0000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0466913  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2995  precorrin-2 C20-methyltransferase  28.43 
 
 		 236 aa  65.5  0.0000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1500  precorrin-2 C20-methyltransferase  30.3 
 
 		 259 aa  65.5  0.0000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1271  precorrin-2 C20-methyltransferase  28.76 
 
 		 226 aa  64.7  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1897  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  29.94 
 
 		 244 aa  63.9  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0807274  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6036  precorrin-2 C20-methyltransferase  30.19 
 
 		 248 aa  64.7  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2816  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  32.9 
 
 		 257 aa  63.5  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.631326 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0153  precorrin-3B C17-methyltransferase  30.25 
 
 		 513 aa  63.2  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0312  precorrin-2 C20-methyltransferase  26.86 
 
 		 224 aa  63.2  0.000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6021  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  30.97 
 
 		 243 aa  63.2  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0179005  normal  0.20153 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1710  cobalt-precorrin-2 C(20)-methyltransferase  26.73 
 
 		 237 aa  62.8  0.000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1111  uroporphyrin-III C-methyltransferase  30.18 
 
 		 482 aa  62.8  0.000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04401  precorrin-2-C20-methyltransferase  23.75 
 
 		 251 aa  62.8  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2190  precorrin-3B C17-methyltransferase  28.4 
 
 		 490 aa  62.8  0.000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.501177  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2422  uroporphyrin-III C-methyltransferase  24.5 
 
 		 325 aa  62.4  0.000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2470  uroporphyrin-III C-methyltransferase  24.5 
 
 		 325 aa  62.4  0.000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3502  precorrin-2 C20-methyltransferase  26 
 
 		 234 aa  62.4  0.000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000438049  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0639  precorrin-2 C20-methyltransferase  26.99 
 
 		 242 aa  62.4  0.000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1012  precorrin-2 C20-methyltransferase  25.13 
 
 		 238 aa  62  0.000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1077  cobalt-precorrin-2 C(20)-methyltransferase  29.41 
 
 		 203 aa  61.6  0.00000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0554  precorrin-2 C20-methyltransferase  30.07 
 
 		 240 aa  61.6  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1781  precorrin-3B C17-methyltransferase  27.92 
 
 		 516 aa  61.2  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.629094  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0799  precorrin-2 C20-methyltransferase  30.82 
 
 		 236 aa  61.2  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0115  uroporphyrin-III C-methyltransferase  27.91 
 
 		 244 aa  60.8  0.00000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1899  uroporphyrin-III C-methyltransferase  27.06 
 
 		 247 aa  60.8  0.00000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.106927 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5595  Precorrin-3B methylase-like protein  33 
 
 		 509 aa  60.8  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0773745  normal  0.51395 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23340  uroporphyrin-III C-methyltransferase  29.53 
 
 		 245 aa  60.5  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00949185  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0709  uroporphyrin-III C-methyltransferase  28.96 
 
 		 458 aa  60.1  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24850  precorrin-2 C20-methyltransferase  30.2 
 
 		 233 aa  60.5  0.00000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2524  precorrin-2 C20-methyltransferase  27.78 
 
 		 247 aa  59.7  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00515181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0671  uroporphyrin-III C-methyltransferase  29.76 
 
 		 482 aa  59.7  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.523068  normal  0.0127709 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04401  precorrin-2 C20-methyltransferase  28.21 
 
 		 242 aa  59.7  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.614023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1091  cobalt-factor II C20-methyltransferase / precorrin-2 C20-methyltransferase  29.17 
 
 		 237 aa  59.7  0.00000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0322  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  27.36 
 
 		 277 aa  59.7  0.00000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2246  cobalt-precorrin-2 C(20)-methyltransferase  24.62 
 
 		 237 aa  58.9  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.169552 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3210  cobalt-precorrin-2 C(20)-methyltransferase  27.27 
 
 		 203 aa  58.9  0.00000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2597  siroheme synthase  31.32 
 
 		 465 aa  58.9  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2146  cobalt-precorrin-2 C(20)-methyltransferase  24.62 
 
 		 237 aa  58.9  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06660  putative uroporphyrin-III c-methyltransferase  28.5 
 
 		 279 aa  58.5  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.253082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1714  precorrin-2 C20-methyltransferase  27.19 
 
 		 236 aa  58.5  0.00000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1266  precorrin-2 C20-methyltransferase  26.15 
 
 		 240 aa  58.2  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1229  precorrin-4 C11-methyltransferase  31.4 
 
 		 264 aa  57.8  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0594011 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>