84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2542 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_2542  precorrin 6A synthase  100 
 
 		 249 aa  493  9.999999999999999e-139  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.786467 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2224  precorrin 6A synthase  59.06 
 
 		 254 aa  286  2e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0332  precorrin 6A synthase  56.05 
 
 		 254 aa  269  4e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2819  precorrin 6A synthase  66.26 
 
 		 254 aa  268  7e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.632211  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1477  precorrin 6A synthase  65.04 
 
 		 254 aa  265  5e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.756738  normal  0.444029 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1527  precorrin 6A synthase  63.86 
 
 		 245 aa  252  5.000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.626854  normal  0.483999 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5843  precorrin 6A synthase  56.03 
 
 		 265 aa  249  4e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2920  precorrin 6A synthase  54.69 
 
 		 246 aa  242  3.9999999999999997e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0390694 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7173  precorrin 6A synthase  48.03 
 
 		 254 aa  215  5e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.92278  normal  0.266334 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2819  precorrin 6A synthase  46.61 
 
 		 256 aa  210  1e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.615759 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6018  precorrin 6A synthase  46.03 
 
 		 254 aa  210  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0516711  normal  0.289683 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1896  precorrin 6A synthase  43.87 
 
 		 252 aa  206  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.628437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2387  precorrin 6A synthase  44.66 
 
 		 254 aa  206  4e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4424  precorrin 6A synthase  46 
 
 		 254 aa  201  7e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.753252 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4338  precorrin 6A synthase  46 
 
 		 254 aa  201  7e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0501476  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4718  precorrin 6A synthase  45.6 
 
 		 254 aa  199  5e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.502891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3231  precorrin 6A synthase  43.6 
 
 		 252 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00310534 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2326  precorrin 6A synthase  45.38 
 
 		 253 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.414205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3174  precorrin 6A synthase  44.27 
 
 		 253 aa  193  2e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4583  precorrin 6A synthase  45.42 
 
 		 253 aa  192  5e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3763  precorrin 6A synthase  44.22 
 
 		 249 aa  191  8e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.21445 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2504  precorrin-6A synthase  45.75 
 
 		 244 aa  188  9e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.488753 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2657  precorrin 6A synthase  44.22 
 
 		 256 aa  186  2e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.14068  normal  0.163709 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2000  precorrin 6A synthase  43.82 
 
 		 249 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00310446 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2104  precorrin 6A synthase  43.2 
 
 		 251 aa  186  3e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.749049  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3353  precorrin-6A synthase (deacetylating)  45.42 
 
 		 253 aa  186  3e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.569272  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2140  precorrin 6A synthase  43.03 
 
 		 249 aa  185  6e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.1822  hitchhiker  0.0000632781 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4201  precorrin 6A synthase  45.06 
 
 		 266 aa  185  7e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1538  precorrin 6A synthase  47.43 
 
 		 262 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0200089  normal  0.0986349 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3385  precorrin 6A synthase  50.4 
 
 		 252 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.852211 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3576  precorrin 6A synthase  50.4 
 
 		 252 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.982294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2442  precorrin 6A synthase  41.11 
 
 		 252 aa  183  3e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0256861  decreased coverage  0.000262915 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6988  precorrin 6A synthase  40.16 
 
 		 261 aa  182  5.0000000000000004e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.444795  normal  0.650286 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2061  precorrin 6A synthase  40.08 
 
 		 251 aa  181  1e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0142  precorrin 6A synthase  44.22 
 
 		 297 aa  180  2e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3694  precorrin 6A synthase  49.2 
 
 		 252 aa  179  4e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.529674 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2709  tetrapyrrole methylase family protein  40.23 
 
 		 261 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0861444  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2970  precorrin 6A synthase  41.8 
 
 		 257 aa  167  1e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.590816  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1321  precorrin-6A synthase (deacetylating)  42.51 
 
 		 246 aa  166  2e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17580  precorrin 6A synthase  37.85 
 
 		 252 aa  152  5e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2879  precorrin 6A synthase  40.82 
 
 		 239 aa  149  3e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0320  precorrin 6A synthase  40.39 
 
 		 262 aa  148  9e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0376  precorrin 6A synthase  40.31 
 
 		 254 aa  138  7e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0361  precorrin 6A synthase  39.92 
 
 		 273 aa  131  7.999999999999999e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0784549 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1612  precorrin-6A synthase (deacetylating)  38.49 
 
 		 247 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24390  uroporphyrinogen-III synthase  30.87 
 
 		 558 aa  57.8  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3283  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  28.06 
 
 		 241 aa  51.2  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.308493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2816  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  29.73 
 
 		 257 aa  51.2  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.631326 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0058  precorrin-2 C20-methyltransferase  22.31 
 
 		 240 aa  50.8  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0570  precorrin-2 C20-methyltransferase  33.55 
 
 		 242 aa  49.7  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.307877  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2995  precorrin-2 C20-methyltransferase  32.72 
 
 		 236 aa  49.7  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2135  precorrin-2 C20-methyltransferase  25.56 
 
 		 239 aa  49.3  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0352605 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1556  precorrin-2 C20-methyltransferase  23.18 
 
 		 233 aa  47.4  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0385  cobalt-factor II C20-methyltransferase  26.67 
 
 		 251 aa  47.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0316  precorrin-2 C20-methyltransferase / precorrin-3 methyltransferase  28 
 
 		 511 aa  47  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0509  cobalt-precorrin-2 C(20)-methyltransferase  24.89 
 
 		 205 aa  47  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1282  precorrin-6Y C5,15-methyltransferase (decarboxylating), CbiT subunit  23.14 
 
 		 395 aa  47  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6021  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  27.33 
 
 		 243 aa  46.2  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0179005  normal  0.20153 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1091  cobalt-factor II C20-methyltransferase / precorrin-2 C20-methyltransferase  27.56 
 
 		 237 aa  46.2  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1521  precorrin-2 C20-methyltransferase / cobalt-factor II C20-methyltransferase / precorrin-3 methyltransferase  26 
 
 		 526 aa  45.4  0.0008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0252228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0768  precorrin-2 C20-methyltransferase / cobalt-factor II C20-methyltransferase  24.66 
 
 		 232 aa  45.4  0.0009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.982265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0693  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  26.45 
 
 		 172 aa  45.4  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.152169  hitchhiker  0.0000247866 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3542  precorrin-2 C20-methyltransferase  27.22 
 
 		 236 aa  45.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1313  precorrin-2 C20-methyltransferase  27.1 
 
 		 239 aa  45.4  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0407603  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1237  cobalt-precorrin-2 C(20)-methyltransferase  24.24 
 
 		 220 aa  44.3  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.433092  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7176  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  27.45 
 
 		 243 aa  44.3  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.789176  normal  0.206558 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0639  precorrin-2 C20-methyltransferase  28.26 
 
 		 242 aa  44.3  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0949  MazG family protein  26.06 
 
 		 503 aa  43.9  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0036  precorrin-2 C20-methyltransferase  26.53 
 
 		 244 aa  43.9  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2926  putative cobalamin biosynthesis protein  27.96 
 
 		 240 aa  44.3  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1229  cobalt-precorrin-2 C(20)-methyltransferase  27.89 
 
 		 201 aa  43.5  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.207782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3502  precorrin-2 C20-methyltransferase  27.63 
 
 		 234 aa  43.5  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000438049  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2735  precorrin-2 C20-methyltransferase  26.21 
 
 		 236 aa  43.5  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000618723  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0310  precorrin-6y C5,15-methyltransferase (decarboxylating), CbiE subunit  28.43 
 
 		 203 aa  43.9  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04401  precorrin-2-C20-methyltransferase  26.17 
 
 		 251 aa  43.1  0.004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04091  precorrin-2 C20-methyltransferase  24.16 
 
 		 251 aa  43.1  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1781  precorrin-3B C17-methyltransferase  25.33 
 
 		 516 aa  42.7  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.629094  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0799  precorrin-2 C20-methyltransferase  33.1 
 
 		 236 aa  42.7  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2083  precorrin-2 methyltransferase  24.18 
 
 		 252 aa  42.7  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1266  precorrin-2 C20-methyltransferase  32.05 
 
 		 240 aa  42  0.009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1621  MazG family protein  29.17 
 
 		 506 aa  42  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.909827 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0476  precorrin-2 C20-methyltransferase  26.85 
 
 		 256 aa  42  0.009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3020  precorrin-2 methyltransferase  22.58 
 
 		 238 aa  42  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2052  uroporphyrin-III C-methyltransferase  25.66 
 
 		 266 aa  42  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.754921 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>