136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6988 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6988  precorrin 6A synthase  100 
 
 		 261 aa  526  1e-148  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.444795  normal  0.650286 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2657  precorrin 6A synthase  60.55 
 
 		 256 aa  310  2e-83  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.14068  normal  0.163709 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3576  precorrin 6A synthase  60.8 
 
 		 252 aa  288  5.0000000000000004e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.982294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3385  precorrin 6A synthase  59.68 
 
 		 252 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.852211 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3694  precorrin 6A synthase  59.27 
 
 		 252 aa  281  1e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.529674 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2709  tetrapyrrole methylase family protein  54.9 
 
 		 261 aa  280  2e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0861444  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2326  precorrin 6A synthase  52.99 
 
 		 253 aa  275  5e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.414205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2819  precorrin 6A synthase  52.4 
 
 		 256 aa  274  1.0000000000000001e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.615759 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3231  precorrin 6A synthase  53.2 
 
 		 252 aa  272  5.000000000000001e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00310534 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1896  precorrin 6A synthase  54.4 
 
 		 252 aa  270  1e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.628437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2061  precorrin 6A synthase  52 
 
 		 251 aa  269  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2442  precorrin 6A synthase  52 
 
 		 252 aa  268  5e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0256861  decreased coverage  0.000262915 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6018  precorrin 6A synthase  49.6 
 
 		 254 aa  259  3e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0516711  normal  0.289683 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7173  precorrin 6A synthase  50.4 
 
 		 254 aa  257  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.92278  normal  0.266334 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3763  precorrin 6A synthase  51.79 
 
 		 249 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.21445 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2104  precorrin 6A synthase  51.79 
 
 		 251 aa  253  3e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.749049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4338  precorrin 6A synthase  54.05 
 
 		 254 aa  252  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0501476  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4424  precorrin 6A synthase  54.05 
 
 		 254 aa  252  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.753252 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4718  precorrin 6A synthase  54.05 
 
 		 254 aa  252  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.502891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2140  precorrin 6A synthase  51.6 
 
 		 249 aa  251  6e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.1822  hitchhiker  0.0000632781 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2970  precorrin 6A synthase  49.41 
 
 		 257 aa  251  7e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.590816  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4583  precorrin 6A synthase  49 
 
 		 253 aa  251  9.000000000000001e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4201  precorrin 6A synthase  51.79 
 
 		 266 aa  251  1e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2000  precorrin 6A synthase  51.79 
 
 		 249 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00310446 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2387  precorrin 6A synthase  49.21 
 
 		 254 aa  247  1e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3174  precorrin 6A synthase  50 
 
 		 253 aa  245  4.9999999999999997e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0142  precorrin 6A synthase  51.81 
 
 		 297 aa  244  9e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2504  precorrin-6A synthase  49.2 
 
 		 244 aa  241  6e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.488753 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3353  precorrin-6A synthase (deacetylating)  51.75 
 
 		 253 aa  239  2e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.569272  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1538  precorrin 6A synthase  54.02 
 
 		 262 aa  239  2e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0200089  normal  0.0986349 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1321  precorrin-6A synthase (deacetylating)  48.78 
 
 		 246 aa  231  8.000000000000001e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0320  precorrin 6A synthase  49.03 
 
 		 262 aa  231  1e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17580  precorrin 6A synthase  50.39 
 
 		 252 aa  218  1e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0332  precorrin 6A synthase  46.83 
 
 		 254 aa  213  2.9999999999999995e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2224  precorrin 6A synthase  42.52 
 
 		 254 aa  207  1e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2542  precorrin 6A synthase  40.16 
 
 		 249 aa  182  5.0000000000000004e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.786467 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5843  precorrin 6A synthase  40.78 
 
 		 265 aa  177  2e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2819  precorrin 6A synthase  40.38 
 
 		 254 aa  166  4e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.632211  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1477  precorrin 6A synthase  40 
 
 		 254 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.756738  normal  0.444029 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0376  precorrin 6A synthase  38.22 
 
 		 254 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2879  precorrin 6A synthase  39.68 
 
 		 239 aa  159  6e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0361  precorrin 6A synthase  38.76 
 
 		 273 aa  154  1e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0784549 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2920  precorrin 6A synthase  39.52 
 
 		 246 aa  154  2e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0390694 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1527  precorrin 6A synthase  39.76 
 
 		 245 aa  151  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.626854  normal  0.483999 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1612  precorrin-6A synthase (deacetylating)  37.89 
 
 		 247 aa  137  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0639  precorrin-2 C20-methyltransferase  29.78 
 
 		 242 aa  63.2  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1522  cobalt-precorrin-2 C(20)-methyltransferase  29 
 
 		 209 aa  62  0.000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000310651 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1271  precorrin-2 C20-methyltransferase  30.36 
 
 		 226 aa  61.6  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2479  precorrin-3B C17-methyltransferase  30.36 
 
 		 500 aa  59.7  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0466913  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1237  cobalt-precorrin-2 C(20)-methyltransferase  30.61 
 
 		 220 aa  59.3  0.00000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.433092  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2657  precorrin-2 C20-methyltransferase, putative  24.55 
 
 		 222 aa  58.9  0.00000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1556  precorrin-2 C20-methyltransferase  28.57 
 
 		 233 aa  58.2  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3107  cobalt-factor II C20-methyltransferase / precorrin-2 C20-methyltransferase  29.95 
 
 		 239 aa  57  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3374  precorrin-2 C20-methyltransferase  26.09 
 
 		 246 aa  56.6  0.0000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.299047 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1266  precorrin-2 C20-methyltransferase  32.69 
 
 		 240 aa  55.5  0.0000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0570  precorrin-2 C20-methyltransferase  31.21 
 
 		 242 aa  55.5  0.0000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.307877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2610  precorrin-2 C20-methyltransferase  30.54 
 
 		 233 aa  55.1  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1431  cobalt-precorrin-2 C(20)-methyltransferase  29.25 
 
 		 220 aa  54.3  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0227456  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2135  precorrin-2 C20-methyltransferase  28.09 
 
 		 239 aa  54.3  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0352605 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1375  precorrin-2 C20-methyltransferase  26.83 
 
 		 227 aa  54.3  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0312  precorrin-2 C20-methyltransferase  29.75 
 
 		 224 aa  53.9  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2190  precorrin-3B C17-methyltransferase  29.52 
 
 		 490 aa  53.9  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.501177  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1500  precorrin-2 C20-methyltransferase  31.41 
 
 		 259 aa  53.1  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2816  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  29.95 
 
 		 257 aa  53.1  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.631326 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2990  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  27.32 
 
 		 244 aa  52.8  0.000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04401  precorrin-2 C20-methyltransferase  27.39 
 
 		 242 aa  52.4  0.000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.614023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1723  precorrin-2 C20-methyltransferase / cobalt-factor II C20-methyltransferase  26.71 
 
 		 242 aa  52.4  0.000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2735  precorrin-2 C20-methyltransferase  34.39 
 
 		 236 aa  51.6  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000618723  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0153  precorrin-3B C17-methyltransferase  29.68 
 
 		 513 aa  52  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1714  precorrin-2 C20-methyltransferase  29.94 
 
 		 236 aa  50.8  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1012  precorrin-2 C20-methyltransferase  26.32 
 
 		 238 aa  50.8  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3145  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  25.52 
 
 		 251 aa  50.8  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.34411  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0043  uroporphyrin-III C-methyltransferase  27.98 
 
 		 462 aa  50.8  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2314  precorrin-2 C20-methyltransferase  32.22 
 
 		 256 aa  50.1  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.144109 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04091  precorrin-2 C20-methyltransferase  24.69 
 
 		 251 aa  50.4  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0058  precorrin-2 C20-methyltransferase  23.95 
 
 		 240 aa  50.1  0.00003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0709  uroporphyrin-III C-methyltransferase  27.38 
 
 		 458 aa  50.1  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0799  precorrin-2 C20-methyltransferase  32 
 
 		 236 aa  49.7  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6036  precorrin-2 C20-methyltransferase  31.29 
 
 		 248 aa  49.7  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3283  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  26.09 
 
 		 241 aa  49.3  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.308493  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0115  precorrin-2 C20-methyltransferase  22.46 
 
 		 222 aa  49.3  0.00007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.942057  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2865  precorrin-2 C20-methyltransferase / cobalt-factor II C20-methyltransferase  25.67 
 
 		 234 aa  48.5  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1853  cobalt-factor II C20-methyltransferase / precorrin-2 C20-methyltransferase  29.3 
 
 		 234 aa  47.4  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.254503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1091  cobalt-factor II C20-methyltransferase / precorrin-2 C20-methyltransferase  29.41 
 
 		 237 aa  47.8  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1781  precorrin-3B C17-methyltransferase  28.95 
 
 		 516 aa  47.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.629094  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1710  cobalt-precorrin-2 C(20)-methyltransferase  25.49 
 
 		 237 aa  47.4  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0863  uroporphyrin-III C-methyltransferase-like  25 
 
 		 468 aa  47.4  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.147258  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5595  Precorrin-3B methylase-like protein  28.89 
 
 		 509 aa  47  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0773745  normal  0.51395 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0142  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  25 
 
 		 462 aa  47  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04401  precorrin-2-C20-methyltransferase  23.46 
 
 		 251 aa  47  0.0003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5371  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  27.23 
 
 		 243 aa  47  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.160971  normal  0.506774 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2306  uroporphyrin-III C-methyltransferase  24.85 
 
 		 351 aa  47.4  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.500417  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3210  cobalt-precorrin-2 C(20)-methyltransferase  28.39 
 
 		 203 aa  46.6  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0554  precorrin-2 C20-methyltransferase  29.75 
 
 		 240 aa  46.6  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0671  uroporphyrin-III C-methyltransferase  26.92 
 
 		 482 aa  46.2  0.0006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.523068  normal  0.0127709 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0385  cobalt-factor II C20-methyltransferase  25.77 
 
 		 251 aa  46.2  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2496  precorrin-3B C17-methyltransferase  29.11 
 
 		 495 aa  45.8  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.218921 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6021  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  26.45 
 
 		 243 aa  45.4  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0179005  normal  0.20153 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1077  cobalt-precorrin-2 C(20)-methyltransferase  30.07 
 
 		 203 aa  45.4  0.0009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1897  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  26.7 
 
 		 244 aa  45.4  0.0009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0807274  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>