163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4201 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4201  precorrin 6A synthase  100 
 
 		 266 aa  517  1e-146  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2657  precorrin 6A synthase  56.85 
 
 		 256 aa  271  8.000000000000001e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.14068  normal  0.163709 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6988  precorrin 6A synthase  51.79 
 
 		 261 aa  251  1e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.444795  normal  0.650286 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2000  precorrin 6A synthase  55.69 
 
 		 249 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00310446 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3763  precorrin 6A synthase  55.87 
 
 		 249 aa  250  2e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.21445 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2140  precorrin 6A synthase  53.25 
 
 		 249 aa  246  3e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.1822  hitchhiker  0.0000632781 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2504  precorrin-6A synthase  52.16 
 
 		 244 aa  244  9.999999999999999e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.488753 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2104  precorrin 6A synthase  52.85 
 
 		 251 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.749049  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2709  tetrapyrrole methylase family protein  48.03 
 
 		 261 aa  235  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0861444  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4583  precorrin 6A synthase  50 
 
 		 253 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1538  precorrin 6A synthase  53.39 
 
 		 262 aa  231  1e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0200089  normal  0.0986349 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2061  precorrin 6A synthase  46.75 
 
 		 251 aa  226  2e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2819  precorrin 6A synthase  46.59 
 
 		 256 aa  222  4.9999999999999996e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.615759 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1896  precorrin 6A synthase  50 
 
 		 252 aa  221  9e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.628437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2442  precorrin 6A synthase  45.38 
 
 		 252 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0256861  decreased coverage  0.000262915 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2970  precorrin 6A synthase  47.2 
 
 		 257 aa  216  2e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.590816  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3353  precorrin-6A synthase (deacetylating)  50.59 
 
 		 253 aa  212  4.9999999999999996e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.569272  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3231  precorrin 6A synthase  44.98 
 
 		 252 aa  212  5.999999999999999e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00310534 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3385  precorrin 6A synthase  50.2 
 
 		 252 aa  210  2e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.852211 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2387  precorrin 6A synthase  44.98 
 
 		 254 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3576  precorrin 6A synthase  51.2 
 
 		 252 aa  206  4e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.982294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2326  precorrin 6A synthase  43.55 
 
 		 253 aa  205  5e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.414205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3694  precorrin 6A synthase  49.8 
 
 		 252 aa  205  5e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.529674 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3174  precorrin 6A synthase  46.18 
 
 		 253 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6018  precorrin 6A synthase  43.82 
 
 		 254 aa  195  7e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0516711  normal  0.289683 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2224  precorrin 6A synthase  42.75 
 
 		 254 aa  194  1e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7173  precorrin 6A synthase  43.31 
 
 		 254 aa  193  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.92278  normal  0.266334 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0332  precorrin 6A synthase  47.79 
 
 		 254 aa  192  4e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0142  precorrin 6A synthase  46.59 
 
 		 297 aa  192  7e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1321  precorrin-6A synthase (deacetylating)  47.39 
 
 		 246 aa  191  9e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2542  precorrin 6A synthase  45.06 
 
 		 249 aa  185  8e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.786467 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0320  precorrin 6A synthase  48.44 
 
 		 262 aa  184  9e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4718  precorrin 6A synthase  45.74 
 
 		 254 aa  180  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.502891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4338  precorrin 6A synthase  45.56 
 
 		 254 aa  178  8e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0501476  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4424  precorrin 6A synthase  45.56 
 
 		 254 aa  178  8e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.753252 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17580  precorrin 6A synthase  43.8 
 
 		 252 aa  163  2.0000000000000002e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2920  precorrin 6A synthase  42.68 
 
 		 246 aa  161  9e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0390694 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0376  precorrin 6A synthase  42.31 
 
 		 254 aa  149  7e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1527  precorrin 6A synthase  43.2 
 
 		 245 aa  145  6e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.626854  normal  0.483999 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5843  precorrin 6A synthase  38.37 
 
 		 265 aa  142  7e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2819  precorrin 6A synthase  40.4 
 
 		 254 aa  141  9e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.632211  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2879  precorrin 6A synthase  40.8 
 
 		 239 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0361  precorrin 6A synthase  40.81 
 
 		 273 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0784549 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1477  precorrin 6A synthase  39.6 
 
 		 254 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.756738  normal  0.444029 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1612  precorrin-6A synthase (deacetylating)  40.31 
 
 		 247 aa  122  8e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3107  cobalt-factor II C20-methyltransferase / precorrin-2 C20-methyltransferase  29.47 
 
 		 239 aa  60.8  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2135  precorrin-2 C20-methyltransferase  29.35 
 
 		 239 aa  58.2  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0352605 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03851  precorrin-2 C20-methyltransferase  29.41 
 
 		 273 aa  58.2  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0058  precorrin-2 C20-methyltransferase  21.67 
 
 		 240 aa  57.8  0.0000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24850  precorrin-2 C20-methyltransferase  31.25 
 
 		 233 aa  57.8  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04091  precorrin-2 C20-methyltransferase  29.8 
 
 		 251 aa  56.6  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3374  precorrin-2 C20-methyltransferase  27.66 
 
 		 246 aa  56.2  0.0000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.299047 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0312  precorrin-2 C20-methyltransferase  29.8 
 
 		 224 aa  55.1  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3145  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  28.57 
 
 		 251 aa  54.7  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.34411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1375  precorrin-2 C20-methyltransferase  28.48 
 
 		 227 aa  55.1  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2479  precorrin-3B C17-methyltransferase  34.21 
 
 		 500 aa  54.3  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0466913  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1714  precorrin-2 C20-methyltransferase  27.89 
 
 		 236 aa  54.3  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04401  precorrin-2-C20-methyltransferase  29.05 
 
 		 251 aa  54.3  0.000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2816  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  31.63 
 
 		 257 aa  53.5  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.631326 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2865  precorrin-2 C20-methyltransferase / cobalt-factor II C20-methyltransferase  30.82 
 
 		 234 aa  53.1  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0799  precorrin-2 C20-methyltransferase  31.33 
 
 		 236 aa  53.1  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5690  precorrin-2 C20-methyltransferase  31.61 
 
 		 255 aa  52.8  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.23715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1271  precorrin-2 C20-methyltransferase  28.57 
 
 		 226 aa  52.8  0.000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0115  precorrin-2 C20-methyltransferase  23.53 
 
 		 222 aa  52.8  0.000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.942057  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1556  precorrin-2 C20-methyltransferase  26.17 
 
 		 233 aa  52  0.000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3283  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  28.99 
 
 		 241 aa  52  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.308493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5371  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  28.06 
 
 		 243 aa  50.8  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.160971  normal  0.506774 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1887  precorrin-2 C20-methyltransferase  29.23 
 
 		 243 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1243  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  28.06 
 
 		 243 aa  50.8  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.291896 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2111  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  29.59 
 
 		 244 aa  50.4  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.414891  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0266  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  29.59 
 
 		 244 aa  50.4  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0493785  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1522  cobalt-precorrin-2 C(20)-methyltransferase  28.88 
 
 		 209 aa  50.8  0.00003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000310651 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1948  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  29.59 
 
 		 244 aa  50.4  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.180512  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1965  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  29.59 
 
 		 244 aa  50.4  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00527923  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0894  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  29.59 
 
 		 244 aa  50.4  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.19117  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1237  cobalt-precorrin-2 C(20)-methyltransferase  28.76 
 
 		 220 aa  50.1  0.00004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.433092  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4060  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  33.33 
 
 		 265 aa  49.7  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6036  precorrin-2 C20-methyltransferase  30.81 
 
 		 248 aa  49.7  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0385  cobalt-factor II C20-methyltransferase  27.74 
 
 		 251 aa  49.7  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6021  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  29.59 
 
 		 243 aa  49.7  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0179005  normal  0.20153 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1078  hypothetical protein  27.78 
 
 		 237 aa  49.7  0.00005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2735  precorrin-2 C20-methyltransferase  26.46 
 
 		 236 aa  49.7  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000618723  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0554  precorrin-2 C20-methyltransferase  28.29 
 
 		 240 aa  49.7  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1721  Precorrin-4 C(11)-methyltransferase  28.12 
 
 		 240 aa  49.3  0.00006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4415  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  30.1 
 
 		 244 aa  48.9  0.00007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.407013 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1229  precorrin-4 C11-methyltransferase  28.4 
 
 		 264 aa  49.3  0.00007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0594011 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1500  precorrin-2 C20-methyltransferase  32.05 
 
 		 259 aa  49.3  0.00007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2400  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  28.57 
 
 		 244 aa  48.9  0.00008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0164224  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1710  cobalt-precorrin-2 C(20)-methyltransferase  23.18 
 
 		 237 aa  48.9  0.00008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1572  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  30.07 
 
 		 244 aa  48.9  0.00009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.477506  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1163  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  29.08 
 
 		 244 aa  48.5  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00204005  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1590  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  29.53 
 
 		 244 aa  48.5  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.388218 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2358  precorrin-4 C11-methyltransferase / cobalt-factor II C20-methyltransferase  25.62 
 
 		 243 aa  48.1  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4883  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  29.27 
 
 		 243 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0216  diphthine synthase  27.98 
 
 		 253 aa  48.5  0.0001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.257765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1604  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  29.08 
 
 		 244 aa  48.1  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.189665  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5849  precorrin-2 C20-methyltransferase  31.66 
 
 		 256 aa  48.1  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.934589 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4617  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  29.59 
 
 		 243 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.449076 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1723  precorrin-2 C20-methyltransferase / cobalt-factor II C20-methyltransferase  27.92 
 
 		 242 aa  47.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26510  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  27.94 
 
 		 250 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0109383  normal  0.778787 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>