215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2819 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2819  precorrin 6A synthase  100 
 
 		 256 aa  518  1e-146  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.615759 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6018  precorrin 6A synthase  66.02 
 
 		 254 aa  337  9.999999999999999e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0516711  normal  0.289683 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7173  precorrin 6A synthase  65.1 
 
 		 254 aa  336  1.9999999999999998e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.92278  normal  0.266334 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1896  precorrin 6A synthase  55.2 
 
 		 252 aa  290  1e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.628437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3231  precorrin 6A synthase  55.6 
 
 		 252 aa  290  2e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00310534 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2326  precorrin 6A synthase  53.36 
 
 		 253 aa  281  5.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.414205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2061  precorrin 6A synthase  53.6 
 
 		 251 aa  280  2e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2657  precorrin 6A synthase  54.4 
 
 		 256 aa  275  7e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.14068  normal  0.163709 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6988  precorrin 6A synthase  52.4 
 
 		 261 aa  274  1.0000000000000001e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.444795  normal  0.650286 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3385  precorrin 6A synthase  55.56 
 
 		 252 aa  267  2e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.852211 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2709  tetrapyrrole methylase family protein  52.16 
 
 		 261 aa  266  2e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0861444  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3694  precorrin 6A synthase  55.56 
 
 		 252 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.529674 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3576  precorrin 6A synthase  56.75 
 
 		 252 aa  264  1e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.982294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4583  precorrin 6A synthase  52.8 
 
 		 253 aa  262  4e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2442  precorrin 6A synthase  51.19 
 
 		 252 aa  262  4.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0256861  decreased coverage  0.000262915 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3174  precorrin 6A synthase  51.2 
 
 		 253 aa  255  5e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2387  precorrin 6A synthase  49.41 
 
 		 254 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3763  precorrin 6A synthase  46.8 
 
 		 249 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.21445 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2224  precorrin 6A synthase  48.43 
 
 		 254 aa  239  2.9999999999999997e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2140  precorrin 6A synthase  46.8 
 
 		 249 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.1822  hitchhiker  0.0000632781 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2104  precorrin 6A synthase  47.6 
 
 		 251 aa  239  4e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.749049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2970  precorrin 6A synthase  48.03 
 
 		 257 aa  234  9e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.590816  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2000  precorrin 6A synthase  46 
 
 		 249 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00310446 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4338  precorrin 6A synthase  49.81 
 
 		 254 aa  232  5e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0501476  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4424  precorrin 6A synthase  49.81 
 
 		 254 aa  232  5e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.753252 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4718  precorrin 6A synthase  49.42 
 
 		 254 aa  229  3e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.502891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1538  precorrin 6A synthase  50.2 
 
 		 262 aa  228  1e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0200089  normal  0.0986349 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2504  precorrin-6A synthase  48 
 
 		 244 aa  224  1e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.488753 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0332  precorrin 6A synthase  46.61 
 
 		 254 aa  223  2e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4201  precorrin 6A synthase  46.59 
 
 		 266 aa  222  4e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1321  precorrin-6A synthase (deacetylating)  47.56 
 
 		 246 aa  221  7e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3353  precorrin-6A synthase (deacetylating)  47.66 
 
 		 253 aa  210  1e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.569272  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2542  precorrin 6A synthase  46.61 
 
 		 249 aa  210  2e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.786467 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0142  precorrin 6A synthase  46.61 
 
 		 297 aa  206  4e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5843  precorrin 6A synthase  45.74 
 
 		 265 aa  203  2e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2819  precorrin 6A synthase  45.67 
 
 		 254 aa  192  4e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.632211  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1477  precorrin 6A synthase  44.88 
 
 		 254 aa  190  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.756738  normal  0.444029 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17580  precorrin 6A synthase  42.75 
 
 		 252 aa  188  5.999999999999999e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0320  precorrin 6A synthase  40.54 
 
 		 262 aa  186  3e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1527  precorrin 6A synthase  44.05 
 
 		 245 aa  178  8e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.626854  normal  0.483999 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2920  precorrin 6A synthase  41.7 
 
 		 246 aa  177  2e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0390694 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2879  precorrin 6A synthase  40.8 
 
 		 239 aa  159  4e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0376  precorrin 6A synthase  40.23 
 
 		 254 aa  158  8e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0361  precorrin 6A synthase  41.86 
 
 		 273 aa  152  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0784549 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1612  precorrin-6A synthase (deacetylating)  38.58 
 
 		 247 aa  139  3e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0570  precorrin-2 C20-methyltransferase  28.82 
 
 		 242 aa  67.4  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.307877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2610  precorrin-2 C20-methyltransferase  30.73 
 
 		 233 aa  67.4  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1556  precorrin-2 C20-methyltransferase  28.48 
 
 		 233 aa  66.2  0.0000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0639  precorrin-2 C20-methyltransferase  28 
 
 		 242 aa  65.9  0.0000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1375  precorrin-2 C20-methyltransferase  25 
 
 		 227 aa  65.5  0.0000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1714  precorrin-2 C20-methyltransferase  28.36 
 
 		 236 aa  63.9  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1012  precorrin-2 C20-methyltransferase  29.8 
 
 		 238 aa  64.3  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0554  precorrin-2 C20-methyltransferase  25.79 
 
 		 240 aa  63.9  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0312  precorrin-2 C20-methyltransferase  29.3 
 
 		 224 aa  62.8  0.000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3374  precorrin-2 C20-methyltransferase  27.96 
 
 		 246 aa  62.8  0.000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.299047 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0693  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  26.67 
 
 		 172 aa  62.4  0.000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.152169  hitchhiker  0.0000247866 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0799  precorrin-2 C20-methyltransferase  29.66 
 
 		 236 aa  60.8  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1522  cobalt-precorrin-2 C(20)-methyltransferase  27.32 
 
 		 209 aa  61.2  0.00000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000310651 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1293  precorrin-2 C20-methyltransferase  30.92 
 
 		 236 aa  60.1  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.116679 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1271  precorrin-2 C20-methyltransferase  28.93 
 
 		 226 aa  59.7  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6036  precorrin-2 C20-methyltransferase  26.83 
 
 		 248 aa  60.1  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2479  precorrin-3B C17-methyltransferase  27.55 
 
 		 500 aa  59.3  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0466913  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0768  precorrin-2 C20-methyltransferase / cobalt-factor II C20-methyltransferase  30.92 
 
 		 232 aa  57.8  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.982265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2735  precorrin-2 C20-methyltransferase  33.11 
 
 		 236 aa  58.5  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000618723  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2190  precorrin-3B C17-methyltransferase  31.61 
 
 		 490 aa  57.4  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.501177  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1091  cobalt-factor II C20-methyltransferase / precorrin-2 C20-methyltransferase  26.78 
 
 		 237 aa  57.8  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2524  precorrin-2 C20-methyltransferase  30.77 
 
 		 247 aa  57.4  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00515181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1266  precorrin-2 C20-methyltransferase  26.14 
 
 		 240 aa  56.2  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3265  precorrin-2 C20-methyltransferase  25.16 
 
 		 247 aa  56.6  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.180313 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1781  precorrin-3B C17-methyltransferase  29.14 
 
 		 516 aa  56.2  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.629094  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1710  cobalt-precorrin-2 C(20)-methyltransferase  25.93 
 
 		 237 aa  56.2  0.0000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2135  precorrin-2 C20-methyltransferase  26.8 
 
 		 239 aa  56.2  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0352605 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3107  cobalt-factor II C20-methyltransferase / precorrin-2 C20-methyltransferase  29.05 
 
 		 239 aa  55.5  0.0000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1853  cobalt-factor II C20-methyltransferase / precorrin-2 C20-methyltransferase  28.5 
 
 		 234 aa  55.5  0.0000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.254503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2990  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  26.4 
 
 		 244 aa  54.7  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24850  precorrin-2 C20-methyltransferase  30.2 
 
 		 233 aa  53.9  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1500  precorrin-2 C20-methyltransferase  30.52 
 
 		 259 aa  54.3  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2706  precorrin-2 C20-methyltransferase  29.68 
 
 		 247 aa  54.3  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000899582 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0058  precorrin-2 C20-methyltransferase  22.18 
 
 		 240 aa  54.3  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3502  precorrin-2 C20-methyltransferase  24.84 
 
 		 234 aa  54.3  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000438049  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1897  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  27.12 
 
 		 244 aa  53.5  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0807274  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1237  cobalt-precorrin-2 C(20)-methyltransferase  27.52 
 
 		 220 aa  53.5  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.433092  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5595  Precorrin-3B methylase-like protein  26.02 
 
 		 509 aa  53.5  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0773745  normal  0.51395 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2995  precorrin-2 C20-methyltransferase  27.13 
 
 		 236 aa  53.1  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2314  precorrin-2 C20-methyltransferase  28.96 
 
 		 256 aa  53.1  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.144109 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2441  precorrin-2 C20-methyltransferase  27.1 
 
 		 262 aa  52.8  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.161962  normal  0.0706437 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1297  precorrin-2 C20-methyltransferase  26.59 
 
 		 247 aa  52.4  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2994  precorrin-4 C11-methyltransferase  30.57 
 
 		 264 aa  52.8  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2657  precorrin-2 C20-methyltransferase, putative  27.39 
 
 		 222 aa  52.8  0.000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2496  precorrin-3B C17-methyltransferase  29.5 
 
 		 495 aa  52.8  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.218921 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5690  precorrin-2 C20-methyltransferase  26.58 
 
 		 255 aa  52.4  0.000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.23715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2816  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  28.35 
 
 		 257 aa  52  0.000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.631326 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3542  precorrin-2 C20-methyltransferase  25.9 
 
 		 236 aa  51.6  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1721  Precorrin-4 C(11)-methyltransferase  23.43 
 
 		 240 aa  50.8  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2865  precorrin-2 C20-methyltransferase / cobalt-factor II C20-methyltransferase  25.64 
 
 		 234 aa  51.2  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3118  precorrin-2 C20-methyltransferase  27.67 
 
 		 259 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03851  precorrin-2 C20-methyltransferase  26.92 
 
 		 273 aa  50.4  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04091  precorrin-2 C20-methyltransferase  25.34 
 
 		 251 aa  50.8  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3145  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  27.23 
 
 		 251 aa  50.4  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.34411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0036  precorrin-2 C20-methyltransferase  26.06 
 
 		 244 aa  50.4  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>