263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_4583 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_4583  precorrin 6A synthase  100 
 
 		 253 aa  514  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2061  precorrin 6A synthase  60.4 
 
 		 251 aa  310  1e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2657  precorrin 6A synthase  55.2 
 
 		 256 aa  277  1e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.14068  normal  0.163709 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2709  tetrapyrrole methylase family protein  50.98 
 
 		 261 aa  264  8e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0861444  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2442  precorrin 6A synthase  50.8 
 
 		 252 aa  262  4e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0256861  decreased coverage  0.000262915 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2819  precorrin 6A synthase  52.8 
 
 		 256 aa  262  4e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.615759 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2326  precorrin 6A synthase  49.4 
 
 		 253 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.414205  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6988  precorrin 6A synthase  49 
 
 		 261 aa  251  8.000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.444795  normal  0.650286 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1896  precorrin 6A synthase  49.8 
 
 		 252 aa  245  4.9999999999999997e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.628437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3385  precorrin 6A synthase  51.59 
 
 		 252 aa  236  3e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.852211 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2104  precorrin 6A synthase  47.81 
 
 		 251 aa  235  4e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.749049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4718  precorrin 6A synthase  51.78 
 
 		 254 aa  234  9e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.502891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4338  precorrin 6A synthase  51.78 
 
 		 254 aa  234  9e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0501476  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4424  precorrin 6A synthase  51.78 
 
 		 254 aa  234  9e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.753252 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3694  precorrin 6A synthase  50.59 
 
 		 252 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.529674 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3576  precorrin 6A synthase  52 
 
 		 252 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.982294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4201  precorrin 6A synthase  50 
 
 		 266 aa  234  1.0000000000000001e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2387  precorrin 6A synthase  46.59 
 
 		 254 aa  231  8.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3763  precorrin 6A synthase  47.41 
 
 		 249 aa  230  2e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.21445 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3231  precorrin 6A synthase  46 
 
 		 252 aa  228  9e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00310534 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2140  precorrin 6A synthase  45.38 
 
 		 249 aa  227  1e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.1822  hitchhiker  0.0000632781 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2504  precorrin-6A synthase  48 
 
 		 244 aa  226  2e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.488753 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2000  precorrin 6A synthase  46 
 
 		 249 aa  226  3e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00310446 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3174  precorrin 6A synthase  47.79 
 
 		 253 aa  225  6e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6018  precorrin 6A synthase  48.4 
 
 		 254 aa  224  9e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0516711  normal  0.289683 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7173  precorrin 6A synthase  48.02 
 
 		 254 aa  222  3e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.92278  normal  0.266334 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0332  precorrin 6A synthase  47.81 
 
 		 254 aa  217  1e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3353  precorrin-6A synthase (deacetylating)  50.6 
 
 		 253 aa  216  2e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.569272  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2970  precorrin 6A synthase  45.42 
 
 		 257 aa  217  2e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.590816  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1321  precorrin-6A synthase (deacetylating)  47.56 
 
 		 246 aa  202  5e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0142  precorrin 6A synthase  44.62 
 
 		 297 aa  202  5e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2224  precorrin 6A synthase  42.29 
 
 		 254 aa  198  9e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2542  precorrin 6A synthase  45.42 
 
 		 249 aa  192  5e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.786467 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1538  precorrin 6A synthase  44 
 
 		 262 aa  191  7e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0200089  normal  0.0986349 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17580  precorrin 6A synthase  43.7 
 
 		 252 aa  183  3e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5843  precorrin 6A synthase  45.35 
 
 		 265 aa  181  1e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0320  precorrin 6A synthase  41.63 
 
 		 262 aa  177  1e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2819  precorrin 6A synthase  45.85 
 
 		 254 aa  177  1e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.632211  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1477  precorrin 6A synthase  44.66 
 
 		 254 aa  174  9e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.756738  normal  0.444029 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2920  precorrin 6A synthase  41.67 
 
 		 246 aa  169  5e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0390694 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1527  precorrin 6A synthase  44.62 
 
 		 245 aa  165  5e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.626854  normal  0.483999 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2879  precorrin 6A synthase  39.34 
 
 		 239 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0361  precorrin 6A synthase  37.89 
 
 		 273 aa  138  7.999999999999999e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0784549 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0376  precorrin 6A synthase  35.6 
 
 		 254 aa  132  5e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1612  precorrin-6A synthase (deacetylating)  38.4 
 
 		 247 aa  124  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6036  precorrin-2 C20-methyltransferase  31.41 
 
 		 248 aa  67  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2524  precorrin-2 C20-methyltransferase  31.61 
 
 		 247 aa  64.7  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00515181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2135  precorrin-2 C20-methyltransferase  27.64 
 
 		 239 aa  63.5  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0352605 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3107  cobalt-factor II C20-methyltransferase / precorrin-2 C20-methyltransferase  27.5 
 
 		 239 aa  63.2  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0312  precorrin-2 C20-methyltransferase  26.28 
 
 		 224 aa  61.6  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1556  precorrin-2 C20-methyltransferase  25.71 
 
 		 233 aa  60.8  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2706  precorrin-2 C20-methyltransferase  28.12 
 
 		 247 aa  59.7  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000899582 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1293  precorrin-2 C20-methyltransferase  26.28 
 
 		 236 aa  58.9  0.00000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.116679 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0509  cobalt-precorrin-2 C(20)-methyltransferase  28.76 
 
 		 205 aa  58.2  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3542  precorrin-2 C20-methyltransferase  29.45 
 
 		 236 aa  57.8  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2610  precorrin-2 C20-methyltransferase  28.16 
 
 		 233 aa  56.6  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1012  precorrin-2 C20-methyltransferase  27.81 
 
 		 238 aa  56.6  0.0000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2314  precorrin-2 C20-methyltransferase  26.74 
 
 		 256 aa  56.2  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.144109 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3374  precorrin-2 C20-methyltransferase  24.47 
 
 		 246 aa  56.2  0.0000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.299047 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03851  precorrin-2 C20-methyltransferase  25.48 
 
 		 273 aa  56.2  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24850  precorrin-2 C20-methyltransferase  29.14 
 
 		 233 aa  56.2  0.0000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3502  precorrin-2 C20-methyltransferase  26.38 
 
 		 234 aa  55.8  0.0000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000438049  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1124  uroporphyrin-III C-methyltransferase  29.09 
 
 		 491 aa  55.5  0.0000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.219261  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1077  cobalt-precorrin-2 C(20)-methyltransferase  24.68 
 
 		 203 aa  54.7  0.000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1500  precorrin-2 C20-methyltransferase  26.74 
 
 		 259 aa  55.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1313  precorrin-2 C20-methyltransferase  28 
 
 		 239 aa  54.3  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0407603  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4161  precorrin-2 C20-methyltransferase  27.51 
 
 		 301 aa  54.3  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0393097  normal  0.411769 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1522  cobalt-precorrin-2 C(20)-methyltransferase  25.26 
 
 		 209 aa  53.9  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000310651 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1723  precorrin-2 C20-methyltransferase / cobalt-factor II C20-methyltransferase  24.68 
 
 		 242 aa  53.5  0.000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0693  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  24.67 
 
 		 172 aa  53.9  0.000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.152169  hitchhiker  0.0000247866 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3581  precorrin-2 dehydrogenase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  29.34 
 
 		 464 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249196  normal  0.492888 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0671  uroporphyrin-III C-methyltransferase  26.92 
 
 		 482 aa  53.9  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.523068  normal  0.0127709 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0554  precorrin-2 C20-methyltransferase  27.18 
 
 		 240 aa  53.5  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2735  precorrin-2 C20-methyltransferase  26.7 
 
 		 236 aa  53.9  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000618723  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1781  precorrin-3B C17-methyltransferase  26.63 
 
 		 516 aa  52.8  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.629094  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30340  siroheme synthase  29.94 
 
 		 465 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1271  precorrin-2 C20-methyltransferase  25.62 
 
 		 226 aa  52.8  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2479  precorrin-3B C17-methyltransferase  26.74 
 
 		 500 aa  52.8  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0466913  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2865  precorrin-2 C20-methyltransferase / cobalt-factor II C20-methyltransferase  25.29 
 
 		 234 aa  52  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1857  cobalt-precorrin-6Y C(5)-methyltransferase  27.63 
 
 		 252 aa  51.2  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.323877 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0905  precorrin-4 C11-methyltransferase  26.28 
 
 		 269 aa  51.6  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0799  precorrin-2 C20-methyltransferase  26.62 
 
 		 236 aa  52  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3999  uroporphyrin-III C-methyltransferase  26.95 
 
 		 463 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.426226  hitchhiker  0.00756787 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1834  uroporphyrin-III C-methyltransferase  26.95 
 
 		 463 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000289405 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2657  precorrin-2 C20-methyltransferase, putative  24.12 
 
 		 222 aa  50.8  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2383  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  27.54 
 
 		 462 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.806488  hitchhiker  0.00704026 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1229  precorrin-4 C11-methyltransferase  29.93 
 
 		 264 aa  51.2  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0594011 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0343  uroporphyrin-III C-methyltransferase  27.78 
 
 		 248 aa  51.2  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00230836  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1521  precorrin-2 C20-methyltransferase / cobalt-factor II C20-methyltransferase / precorrin-3 methyltransferase  27.71 
 
 		 526 aa  50.8  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0252228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3210  cobalt-precorrin-2 C(20)-methyltransferase  25 
 
 		 203 aa  50.8  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04091  precorrin-2 C20-methyltransferase  24.68 
 
 		 251 aa  50.8  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1297  precorrin-2 C20-methyltransferase  28.1 
 
 		 247 aa  51.2  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1107  uroporphyrin-III C-methyltransferase  24.75 
 
 		 487 aa  50.8  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2816  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  27.61 
 
 		 257 aa  50.1  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.631326 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1237  cobalt-precorrin-2 C(20)-methyltransferase  27.81 
 
 		 220 aa  50.1  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.433092  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2158  precorrin-2 C20-methyltransferase  28.19 
 
 		 273 aa  50.1  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.484967  normal  0.0911482 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4696  uroporphyrin-III C-methyltransferase  25.47 
 
 		 478 aa  50.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3676  uroporphyrin-III C-methyltransferase  29.68 
 
 		 272 aa  50.1  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1343  uroporphyrin-III C-methyltransferase  25.19 
 
 		 484 aa  50.1  0.00004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1019  precorrin-2 C20-methyltransferase  25.65 
 
 		 265 aa  49.7  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.864073  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>