171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3231 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3231  precorrin 6A synthase  100 
 
 		 252 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00310534 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2819  precorrin 6A synthase  55.6 
 
 		 256 aa  290  2e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.615759 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1896  precorrin 6A synthase  55.02 
 
 		 252 aa  286  2e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.628437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2657  precorrin 6A synthase  55.2 
 
 		 256 aa  284  1.0000000000000001e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.14068  normal  0.163709 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2387  precorrin 6A synthase  55.2 
 
 		 254 aa  283  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2326  precorrin 6A synthase  53.6 
 
 		 253 aa  276  2e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.414205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2061  precorrin 6A synthase  51 
 
 		 251 aa  272  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6988  precorrin 6A synthase  53.2 
 
 		 261 aa  272  5.000000000000001e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.444795  normal  0.650286 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3174  precorrin 6A synthase  56.4 
 
 		 253 aa  268  5.9999999999999995e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3385  precorrin 6A synthase  54.58 
 
 		 252 aa  261  4.999999999999999e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.852211 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3694  precorrin 6A synthase  54.58 
 
 		 252 aa  261  1e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.529674 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2709  tetrapyrrole methylase family protein  49.61 
 
 		 261 aa  260  2e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0861444  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2442  precorrin 6A synthase  49.4 
 
 		 252 aa  259  2e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0256861  decreased coverage  0.000262915 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3576  precorrin 6A synthase  52.19 
 
 		 252 aa  257  2e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.982294  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7173  precorrin 6A synthase  51.39 
 
 		 254 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.92278  normal  0.266334 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6018  precorrin 6A synthase  49.8 
 
 		 254 aa  249  3e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0516711  normal  0.289683 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2104  precorrin 6A synthase  48 
 
 		 251 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.749049  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3763  precorrin 6A synthase  47.62 
 
 		 249 aa  230  1e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.21445 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2000  precorrin 6A synthase  47.22 
 
 		 249 aa  228  6e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00310446 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2140  precorrin 6A synthase  46.03 
 
 		 249 aa  228  7e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.1822  hitchhiker  0.0000632781 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4583  precorrin 6A synthase  46 
 
 		 253 aa  228  9e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1321  precorrin-6A synthase (deacetylating)  48.78 
 
 		 246 aa  226  2e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4338  precorrin 6A synthase  46.88 
 
 		 254 aa  226  3e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0501476  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4424  precorrin 6A synthase  46.88 
 
 		 254 aa  226  3e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.753252 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4718  precorrin 6A synthase  46.88 
 
 		 254 aa  225  7e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.502891  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2504  precorrin-6A synthase  46.22 
 
 		 244 aa  223  2e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.488753 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2970  precorrin 6A synthase  45.02 
 
 		 257 aa  222  4.9999999999999996e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.590816  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1538  precorrin 6A synthase  50.6 
 
 		 262 aa  221  7e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0200089  normal  0.0986349 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0320  precorrin 6A synthase  46.3 
 
 		 262 aa  214  9e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2224  precorrin 6A synthase  45.28 
 
 		 254 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0142  precorrin 6A synthase  45.6 
 
 		 297 aa  212  4.9999999999999996e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4201  precorrin 6A synthase  44.98 
 
 		 266 aa  212  5.999999999999999e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0332  precorrin 6A synthase  44.4 
 
 		 254 aa  204  1e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2542  precorrin 6A synthase  43.6 
 
 		 249 aa  197  2.0000000000000003e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.786467 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17580  precorrin 6A synthase  43.92 
 
 		 252 aa  195  7e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3353  precorrin-6A synthase (deacetylating)  42.53 
 
 		 253 aa  192  4e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.569272  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5843  precorrin 6A synthase  42.35 
 
 		 265 aa  176  3e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2920  precorrin 6A synthase  41.04 
 
 		 246 aa  171  6.999999999999999e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0390694 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2879  precorrin 6A synthase  40.8 
 
 		 239 aa  171  1e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2819  precorrin 6A synthase  41.43 
 
 		 254 aa  167  1e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.632211  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1477  precorrin 6A synthase  41.04 
 
 		 254 aa  165  6.9999999999999995e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.756738  normal  0.444029 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1527  precorrin 6A synthase  41.67 
 
 		 245 aa  159  4e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.626854  normal  0.483999 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0376  precorrin 6A synthase  37.74 
 
 		 254 aa  156  3e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0361  precorrin 6A synthase  40.23 
 
 		 273 aa  154  9e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0784549 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1612  precorrin-6A synthase (deacetylating)  38.58 
 
 		 247 aa  154  1e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1271  precorrin-2 C20-methyltransferase  31.93 
 
 		 226 aa  70.5  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0639  precorrin-2 C20-methyltransferase  28.64 
 
 		 242 aa  67  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1556  precorrin-2 C20-methyltransferase  28.93 
 
 		 233 aa  63.9  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0554  precorrin-2 C20-methyltransferase  32.61 
 
 		 240 aa  62.4  0.000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0570  precorrin-2 C20-methyltransferase  29.28 
 
 		 242 aa  61.6  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.307877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24850  precorrin-2 C20-methyltransferase  30.93 
 
 		 233 aa  61.2  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2610  precorrin-2 C20-methyltransferase  31.29 
 
 		 233 aa  60.1  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1714  precorrin-2 C20-methyltransferase  29.73 
 
 		 236 aa  59.7  0.00000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6036  precorrin-2 C20-methyltransferase  28.02 
 
 		 248 aa  58.9  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04091  precorrin-2 C20-methyltransferase  28.22 
 
 		 251 aa  58.2  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3107  cobalt-factor II C20-methyltransferase / precorrin-2 C20-methyltransferase  32.12 
 
 		 239 aa  57  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0799  precorrin-2 C20-methyltransferase  30.77 
 
 		 236 aa  57  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1012  precorrin-2 C20-methyltransferase  27.63 
 
 		 238 aa  55.8  0.0000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3374  precorrin-2 C20-methyltransferase  26.18 
 
 		 246 aa  55.8  0.0000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.299047 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1522  cobalt-precorrin-2 C(20)-methyltransferase  30.77 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000310651 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1293  precorrin-2 C20-methyltransferase  26.98 
 
 		 236 aa  55.1  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.116679 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0312  precorrin-2 C20-methyltransferase  30.52 
 
 		 224 aa  54.3  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2400  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  28.19 
 
 		 244 aa  53.9  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0164224  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2314  precorrin-2 C20-methyltransferase  32.1 
 
 		 256 aa  54.3  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.144109 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04401  precorrin-2-C20-methyltransferase  28.22 
 
 		 251 aa  54.3  0.000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1375  precorrin-2 C20-methyltransferase  26.7 
 
 		 227 aa  53.9  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1163  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  27.6 
 
 		 244 aa  53.5  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00204005  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1604  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  27.6 
 
 		 244 aa  53.5  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.189665  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3502  precorrin-2 C20-methyltransferase  26.28 
 
 		 234 aa  53.1  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000438049  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1710  cobalt-precorrin-2 C(20)-methyltransferase  28.42 
 
 		 237 aa  53.1  0.000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1297  precorrin-2 C20-methyltransferase  32.1 
 
 		 247 aa  53.1  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2524  precorrin-2 C20-methyltransferase  29.27 
 
 		 247 aa  52.4  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00515181  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0115  precorrin-2 C20-methyltransferase  24 
 
 		 222 aa  52.4  0.000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.942057  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1313  precorrin-2 C20-methyltransferase  27.04 
 
 		 239 aa  52.4  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0407603  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1266  precorrin-2 C20-methyltransferase  28.26 
 
 		 240 aa  52.4  0.000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2995  precorrin-2 C20-methyltransferase  31.05 
 
 		 236 aa  52  0.000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0058  precorrin-2 C20-methyltransferase  24.58 
 
 		 240 aa  52  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2111  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  27.08 
 
 		 244 aa  52  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.414891  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0266  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  27.08 
 
 		 244 aa  52  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0493785  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1948  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  27.08 
 
 		 244 aa  52  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.180512  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1965  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  27.08 
 
 		 244 aa  52  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00527923  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0894  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  27.08 
 
 		 244 aa  52  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.19117  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1897  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  30.92 
 
 		 244 aa  51.2  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0807274  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2706  precorrin-2 C20-methyltransferase  28.05 
 
 		 247 aa  51.2  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000899582 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3145  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  27.78 
 
 		 251 aa  50.1  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.34411  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1500  precorrin-2 C20-methyltransferase  28.96 
 
 		 259 aa  50.4  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1237  cobalt-precorrin-2 C(20)-methyltransferase  30.56 
 
 		 220 aa  49.7  0.00004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.433092  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2083  precorrin-2 methyltransferase  26.92 
 
 		 252 aa  50.1  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0192  molybdopterin oxidoreductase/precorrin-4 methylase  35 
 
 		 607 aa  49.3  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.620214  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0385  cobalt-factor II C20-methyltransferase  25.77 
 
 		 251 aa  48.9  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2657  precorrin-2 C20-methyltransferase, putative  22.16 
 
 		 222 aa  48.5  0.00009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1968  precorrin-4 C11-methyltransferase  27.04 
 
 		 261 aa  48.5  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.264672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0248  precorrin-2 C20-methyltransferase  28.11 
 
 		 232 aa  48.1  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0704  uroporphyrin-III C-methyltransferase  25.91 
 
 		 231 aa  47.8  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3118  precorrin-2 C20-methyltransferase  28.47 
 
 		 259 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2357  precorrin-4 C11-methyltransferase  25.66 
 
 		 259 aa  47.8  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.342045  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1781  precorrin-3B C17-methyltransferase  25.68 
 
 		 516 aa  47.4  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.629094  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0142  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  25.64 
 
 		 462 aa  47.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0693  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  23.12 
 
 		 172 aa  47.4  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.152169  hitchhiker  0.0000247866 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2250  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  26.56 
 
 		 250 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.44804  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>