More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0192 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_0192  molybdopterin oxidoreductase/precorrin-4 methylase  100 
 
 
607 aa  1250    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.620214  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0191  precorrin-4 methylase  41.47 
 
 
556 aa  414  1e-114  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0475  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  30.47 
 
 
270 aa  121  3e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0225719 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1250  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  29.77 
 
 
296 aa  103  7e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0851  precorrin-4 methylase-like protein  29.46 
 
 
294 aa  98.2  4e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000304158  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0312  precorrin-2 C20-methyltransferase  32.24 
 
 
224 aa  87.4  6e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1271  precorrin-2 C20-methyltransferase  28.88 
 
 
226 aa  74.7  0.000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0620  precorrin-4 C11-methyltransferase protein  30.32 
 
 
271 aa  74.3  0.000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.263132  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06621  putative precorrin-4 C11-methyltransferase  26.85 
 
 
251 aa  73.6  0.000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0694  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  25.69 
 
 
247 aa  73.6  0.00000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.210241  hitchhiker  0.0000263723 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1342  precorrin-4 C11-methyltransferase  26.36 
 
 
254 aa  73.2  0.00000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0459  precorrin-4 C11-methyltransferase  27.31 
 
 
251 aa  72.4  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.20999  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4641  uroporphyrin-III C-methyltransferase  24.58 
 
 
262 aa  72  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1237  cobalt-precorrin-2 C(20)-methyltransferase  30.43 
 
 
220 aa  72  0.00000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.433092  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1791  precorrin-4 C11-methyltransferase  26.02 
 
 
250 aa  71.2  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0702  precorrin-4 C11-methyltransferase  29.64 
 
 
244 aa  71.2  0.00000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2314  precorrin-2 C20-methyltransferase  28.08 
 
 
256 aa  71.2  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.144109 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05231  putative precorrin-4 C11-methyltransferase  26.39 
 
 
251 aa  70.9  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1716  precorrin-4 C11-methyltransferase  27.97 
 
 
253 aa  70.9  0.00000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1887  precorrin-4 C11-methyltransferase  26.58 
 
 
262 aa  70.5  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0177135  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2357  precorrin-4 C11-methyltransferase  27.73 
 
 
259 aa  69.7  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.342045  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1431  cobalt-precorrin-2 C(20)-methyltransferase  29.81 
 
 
220 aa  70.1  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0227456  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2735  precorrin-2 C20-methyltransferase  31.07 
 
 
236 aa  70.1  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000618723  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1968  precorrin-4 C11-methyltransferase  25.4 
 
 
261 aa  68.9  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.264672  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2345  oxidoreductase molybdopterin binding protein  39.42 
 
 
170 aa  68.9  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.194853  normal  0.901736 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1747  precorrin-4 C11-methyltransferase  24.71 
 
 
254 aa  68.2  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.129763  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05141  putative precorrin-4 C11-methyltransferase  24.8 
 
 
252 aa  68.2  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.614023  normal  0.388015 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04841  putative precorrin-4 C11-methyltransferase  25.94 
 
 
251 aa  67  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0554  precorrin-2 C20-methyltransferase  25.91 
 
 
240 aa  66.6  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05151  putative precorrin-4 C11-methyltransferase  25 
 
 
251 aa  67  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.190612  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0934  precorrin-4 C11-methyltransferase  25.29 
 
 
254 aa  65.9  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.23833  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0313  precorrin-4 C11-methyltransferase  23.14 
 
 
251 aa  65.9  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6035  precorrin-4 C11-methyltransferase  25 
 
 
275 aa  65.9  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2326  precorrin 6A synthase  35.06 
 
 
253 aa  65.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.414205  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0962  precorrin-4 C11-methyltransferase  24.43 
 
 
254 aa  66.2  0.000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.6045  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1552  precorrin-4 C11-methyltransferase  24.79 
 
 
283 aa  65.9  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.886587 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1375  precorrin-4 C11-methyltransferase  25.39 
 
 
257 aa  65.5  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0286247 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1012  precorrin-2 C20-methyltransferase  23.55 
 
 
238 aa  65.5  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1011  precorrin-4 C11-methyltransferase  24.71 
 
 
254 aa  64.3  0.000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.04114  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0905  precorrin-4 C11-methyltransferase  24.66 
 
 
269 aa  62.8  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1013  precorrin-4 C11-methyltransferase  22.82 
 
 
253 aa  62.8  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1557  precorrin-4 C11-methyltransferase  27.59 
 
 
256 aa  62.8  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1721  Precorrin-4 C(11)-methyltransferase  27.73 
 
 
240 aa  62.4  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1375  precorrin-2 C20-methyltransferase  32.09 
 
 
227 aa  62.8  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1559  oxidoreductase molybdopterin binding protein  37 
 
 
168 aa  62  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0799  precorrin-2 C20-methyltransferase  25.13 
 
 
236 aa  62  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04401  precorrin-2-C20-methyltransferase  29.89 
 
 
251 aa  61.6  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0625  precorrin-4 C11-methyltransferase  27.49 
 
 
253 aa  61.6  0.00000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3107  cobalt-factor II C20-methyltransferase / precorrin-2 C20-methyltransferase  30.71 
 
 
239 aa  61.6  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1293  precorrin-2 C20-methyltransferase  26.71 
 
 
236 aa  61.6  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.116679 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1314  precorrin-4 C11-methyltransferase  26.36 
 
 
268 aa  61.6  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0144548  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1258  uroporphyrin-III C-methyltransferase  28.63 
 
 
508 aa  61.2  0.00000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.323904  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0385  cobalt-factor II C20-methyltransferase  29.34 
 
 
251 aa  60.8  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4047  oxidoreductase molybdopterin binding  34.15 
 
 
165 aa  60.5  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.298645  normal  0.0635461 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0476  precorrin-2 C20-methyltransferase  28.78 
 
 
256 aa  60.5  0.00000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4477  precorrin-4 C11-methyltransferase  21.92 
 
 
610 aa  60.1  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00717843  normal  0.120162 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1714  precorrin-2 C20-methyltransferase  22.17 
 
 
236 aa  60.1  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1288  precorrin-4 C11-methyltransferase  25.23 
 
 
626 aa  60.1  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04091  precorrin-2 C20-methyltransferase  29.59 
 
 
251 aa  59.7  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04601  precorrin-4 C11-methyltransferase  22.94 
 
 
250 aa  60.5  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.909229  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1297  precorrin-2 C20-methyltransferase  29.7 
 
 
247 aa  58.9  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2207  uroporphyrin-III C-methyltransferase  28.75 
 
 
507 aa  59.7  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00880064  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1014  precorrin-4 C11-methyltransferase  25.65 
 
 
626 aa  59.7  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2767  precorrin-3 methyltransferase / precorrin-6Y C5,15-methyltransferase (decarboxylating)  28.14 
 
 
331 aa  58.9  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.545278  normal  0.0717753 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3281  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  26.67 
 
 
274 aa  59.7  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.429285  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4344  precorrin-4 C11-methyltransferase  24.4 
 
 
264 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3374  precorrin-2 C20-methyltransferase  28.47 
 
 
246 aa  59.7  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.299047 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0789  uroporphyrin-III C-methyltransferase  24.43 
 
 
239 aa  58.9  0.0000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.194909  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1778  uroporphyrin-III C-methyltransferase  25.32 
 
 
250 aa  58.5  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0293205  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2358  precorrin-4 C11-methyltransferase / cobalt-factor II C20-methyltransferase  25.79 
 
 
243 aa  58.5  0.0000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0322  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  25.11 
 
 
277 aa  58.2  0.0000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4243  precorrin-4 C11-methyltransferase  23.51 
 
 
257 aa  57.8  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3164  bifunctional uroporphyrinogen-III methyltransferase/uroporphyrinogen-III synthase  28 
 
 
474 aa  57.4  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.975111  normal  0.530795 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0343  uroporphyrin-III C-methyltransferase  29.88 
 
 
248 aa  57.4  0.0000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00230836  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1500  precorrin-2 C20-methyltransferase  24.89 
 
 
259 aa  57.4  0.0000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0627  cobalt-factor II C20-methyltransferase / precorrin-4 C11-methyltransferase  26.59 
 
 
242 aa  57.4  0.0000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03851  precorrin-2 C20-methyltransferase  27.92 
 
 
273 aa  57.4  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41563  uroporphyrin-III C-methyltransferase  25.1 
 
 
245 aa  57.4  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0110837  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0146  precorrin-4 C11-methyltransferase  28.38 
 
 
245 aa  57.4  0.0000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.448492  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3697  uroporphyrin-III C-methyltransferase  27.43 
 
 
254 aa  57  0.0000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.748365 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0489  uroporphyrinogen-III methylase  26.05 
 
 
417 aa  57  0.0000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2995  precorrin-2 C20-methyltransferase  27.44 
 
 
236 aa  56.6  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1947  bifunctional uroporphyrinogen-III methyltransferase/uroporphyrinogen-III synthase  27.6 
 
 
474 aa  56.6  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1556  precorrin-2 C20-methyltransferase  28.75 
 
 
233 aa  57  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2609  precorrin-4 C11-methyltransferase  25.48 
 
 
257 aa  56.6  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1498  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  28.11 
 
 
262 aa  56.6  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.3554 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2636  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  25.83 
 
 
256 aa  56.6  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2291  bifunctional uroporphyrinogen-III methyltransferase/uroporphyrinogen-III synthase  27.6 
 
 
474 aa  56.6  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7180  precorrin-4 C11-methyltransferase  26.64 
 
 
252 aa  56.6  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.987588  normal  0.0970048 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3528  uroporphyrin-III C-methyltransferase  23.6 
 
 
245 aa  57  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0179276  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3502  precorrin-2 C20-methyltransferase  26.22 
 
 
234 aa  56.6  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000438049  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1298  precorrin-4 C11-methyltransferase  24.27 
 
 
261 aa  55.8  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0483  precorrin-4 C11-methyltransferase  25.32 
 
 
258 aa  55.8  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1229  precorrin-4 C11-methyltransferase  25.34 
 
 
264 aa  56.2  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0594011 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0932  precorrin-2 C20-methyltransferase  27.04 
 
 
290 aa  56.2  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00318756 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1349  uroporphyrin-III C-methyltransferase  24.62 
 
 
258 aa  56.2  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.758533  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1689  uroporphyrin-III C-methyltransferase  23.28 
 
 
239 aa  56.2  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2135  precorrin-2 C20-methyltransferase  24.39 
 
 
239 aa  56.2  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0352605 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3607  precorrin-4 C11-methyltransferase  26.1 
 
 
261 aa  55.8  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0039  precorrin-4 C11-methyltransferase  27.48 
 
 
258 aa  56.2  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>