More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0694 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_0694  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  100 
 
 
247 aa  501  1e-141  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.210241  hitchhiker  0.0000263723 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0059  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.06 
 
 
256 aa  209  4e-53  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0313  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.06 
 
 
251 aa  187  1e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1298  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.57 
 
 
261 aa  187  2e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4477  precorrin-4 C11-methyltransferase  38.55 
 
 
610 aa  182  3e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00717843  normal  0.120162 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3607  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.2 
 
 
261 aa  182  6e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2711  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.65 
 
 
248 aa  181  1e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00379668  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0050  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.11 
 
 
255 aa  181  1e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0039  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.5 
 
 
258 aa  180  1e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1288  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.53 
 
 
626 aa  180  2e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0702  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.37 
 
 
244 aa  180  2e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1013  precorrin-4 C11-methyltransferase  38.65 
 
 
253 aa  180  2e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0473  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.97 
 
 
252 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04601  precorrin-4 C11-methyltransferase  38.55 
 
 
250 aa  177  1e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.909229  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1092  precorrin-4 C11-methyltransferase  38.8 
 
 
254 aa  177  1e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0962  precorrin-4 C11-methyltransferase  39.13 
 
 
254 aa  177  2e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.6045  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1229  precorrin-4 C11-methyltransferase  39.02 
 
 
264 aa  176  2e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0594011 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0483  precorrin-4 C11-methyltransferase  39.53 
 
 
258 aa  176  3e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0934  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.4 
 
 
250 aa  176  3e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1014  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.53 
 
 
626 aa  176  3e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3650  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.87 
 
 
252 aa  175  5e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.796321  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0301  precorrin-4 C11-methyltransferase  39.29 
 
 
260 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0342995  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3541  precorrin-4 C11-methyltransferase  39.6 
 
 
261 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1887  precorrin-4 C11-methyltransferase  38.4 
 
 
262 aa  173  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0177135  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04841  putative precorrin-4 C11-methyltransferase  36.03 
 
 
251 aa  173  2.9999999999999996e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1791  precorrin-4 C11-methyltransferase  37.65 
 
 
250 aa  173  2.9999999999999996e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0933  precorrin-4 C11-methyltransferase  42 
 
 
260 aa  172  3.9999999999999995e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00452437 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1342  precorrin-4 C11-methyltransferase  39.43 
 
 
254 aa  170  2e-41  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05141  putative precorrin-4 C11-methyltransferase  36.47 
 
 
252 aa  169  5e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.614023  normal  0.388015 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1716  precorrin-4 C11-methyltransferase  38.49 
 
 
253 aa  168  6e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06621  putative precorrin-4 C11-methyltransferase  36.14 
 
 
251 aa  168  8e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3231  precorrin-4 C11-methyltransferase  36.65 
 
 
258 aa  168  8e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00900029  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05151  putative precorrin-4 C11-methyltransferase  35.22 
 
 
251 aa  168  9e-41  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.190612  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0934  precorrin-4 C11-methyltransferase  38.34 
 
 
254 aa  167  1e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.23833  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1968  precorrin-4 C11-methyltransferase  37.2 
 
 
261 aa  167  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.264672  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1747  precorrin-4 C11-methyltransferase  37.8 
 
 
254 aa  167  2e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.129763  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0459  precorrin-4 C11-methyltransferase  35.22 
 
 
251 aa  166  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.20999  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1552  precorrin-4 C11-methyltransferase  37.2 
 
 
283 aa  166  2.9999999999999998e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.886587 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05231  putative precorrin-4 C11-methyltransferase  34.82 
 
 
251 aa  166  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1737  precorrin-4 C11-methyltransferase region  39.68 
 
 
251 aa  166  4e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.489626  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2994  precorrin-4 C11-methyltransferase  38.8 
 
 
264 aa  165  5e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1521  precorrin-4 C11-methyltransferase  39.76 
 
 
261 aa  166  5e-40  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000101409 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1294  precorrin-4 C11-methyltransferase  39.76 
 
 
248 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.04031 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0614  precorrin-4 C11-methyltransferase  37.85 
 
 
249 aa  163  2.0000000000000002e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00328163  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1011  precorrin-4 C11-methyltransferase  37.55 
 
 
254 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.04114  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0211  cobalamin biosynthesis protein CbiG/precorrin-4 C11-methyltransferase  36.59 
 
 
614 aa  162  3e-39  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2129  precorrin-4 C11-methyltransferase  36.08 
 
 
259 aa  163  3e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000738255 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0114  precorrin-4 C11-methyltransferase  36.61 
 
 
262 aa  162  5.0000000000000005e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.177043  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4243  precorrin-4 C11-methyltransferase  35.06 
 
 
257 aa  161  8.000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1376  precorrin-4 C11-methyltransferase  36.95 
 
 
252 aa  160  2e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2635  precorrin-4 C11-methyltransferase  36.14 
 
 
263 aa  160  2e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.231618  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1721  Precorrin-4 C(11)-methyltransferase  39.17 
 
 
240 aa  160  2e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1557  precorrin-4 C11-methyltransferase  36.95 
 
 
256 aa  159  5e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2151  precorrin-4 C11-methyltransferase  38.06 
 
 
257 aa  158  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0163963  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2205  precorrin-4 C11-methyltransferase  37.65 
 
 
257 aa  158  8e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2198  precorrin-4 C11-methyltransferase  37.65 
 
 
257 aa  158  8e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.333099  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1236  precorrin-4 C11-methyltransferase  37.3 
 
 
251 aa  158  8e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1596  precorrin-4 C11-methyltransferase  36.55 
 
 
242 aa  157  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.727098  normal  0.416998 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1430  precorrin-4 C11-methyltransferase  37.3 
 
 
251 aa  158  1e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0323621  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2609  precorrin-4 C11-methyltransferase  37.2 
 
 
257 aa  157  1e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2087  precorrin-3 methylase  36.4 
 
 
257 aa  157  2e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0625  precorrin-4 C11-methyltransferase  38.62 
 
 
253 aa  156  2e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2251  precorrin-4 C11-methyltransferase  37.65 
 
 
257 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.476505  normal  0.353064 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0176  precorrin-4 C11-methyltransferase  39.76 
 
 
258 aa  157  2e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0121511  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4344  precorrin-4 C11-methyltransferase  36 
 
 
264 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2364  precorrin-4 C11-methyltransferase  37.65 
 
 
257 aa  156  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1853  precorrin-4 C11-methyltransferase  37.66 
 
 
247 aa  157  2e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25920  precorrin-3 methylase  37.4 
 
 
250 aa  156  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0297541  normal  0.071417 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2213  precorrin-3 methylase  36.14 
 
 
250 aa  156  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.578417  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1578  precorrin-4 C11-methyltransferase  36.13 
 
 
242 aa  156  3e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00147705  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3152  precorrin-4 C11-methyltransferase  35.74 
 
 
253 aa  155  4e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.422575  normal  0.404272 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3154  precorrin-4 C11-methyltransferase  36.99 
 
 
249 aa  155  6e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.134288  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3020  precorrin-4 C11-methyltransferase  36.99 
 
 
249 aa  155  6e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.157987 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3384  precorrin-4 C11-methyltransferase  36.65 
 
 
253 aa  155  6e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.215023  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3139  precorrin-4 C11-methyltransferase  37.39 
 
 
243 aa  154  9e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.103399  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2352  precorrin-4 C11-methyltransferase  36.18 
 
 
250 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1564  precorrin-4 C11-methyltransferase  35.29 
 
 
242 aa  154  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.253118  normal  0.214845 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1078  hypothetical protein  38.91 
 
 
237 aa  154  1e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2374  precorrin-4 C11-methyltransferase  35.86 
 
 
259 aa  153  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21210  precorrin-4 C11-methyltransferase  36.84 
 
 
867 aa  154  2e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0808  precorrin-4 C11-methyltransferase  36.14 
 
 
254 aa  154  2e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2779  precorrin-4 C11-methyltransferase  36.59 
 
 
250 aa  153  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.545494  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4829  precorrin-4 C11-methyltransferase  35.29 
 
 
242 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0449828 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1314  precorrin-4 C11-methyltransferase  35.08 
 
 
268 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0144548  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0905  precorrin-4 C11-methyltransferase  35.46 
 
 
269 aa  153  2.9999999999999998e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2530  precorrin-4 C11-methyltransferase  36.59 
 
 
250 aa  152  4e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00855327 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0620  precorrin-4 C11-methyltransferase protein  37.25 
 
 
271 aa  152  4e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.263132  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4305  precorrin-4 C11-methyltransferase  35.06 
 
 
257 aa  152  4e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.118024 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1651  precorrin-4 C11-methyltransferase  35.29 
 
 
242 aa  152  5e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1198  precorrin-4 C11-methyltransferase  35.29 
 
 
242 aa  152  5e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1678  precorrin-4 C11-methyltransferase  35.29 
 
 
242 aa  152  5e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0635313  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0510  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  38.02 
 
 
238 aa  152  7e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0640  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.4 
 
 
257 aa  151  8e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.194872  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2394  precorrin-4 C11-methyltransferase  35.29 
 
 
241 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3410  precorrin-4 C11-methyltransferase  35.77 
 
 
250 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.231837 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3103  precorrin-4 C11-methyltransferase  36.59 
 
 
248 aa  150  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7180  precorrin-4 C11-methyltransferase  33.86 
 
 
252 aa  149  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.987588  normal  0.0970048 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1972  precorrin-4 C11-methyltransferase  34.87 
 
 
241 aa  148  9e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2117  precorrin-4 C11-methyltransferase  34.87 
 
 
241 aa  148  9e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.105353  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1955  precorrin-4 C11-methyltransferase  34.87 
 
 
241 aa  148  9e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.132176  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>