23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4047 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4047  oxidoreductase molybdopterin binding  100 
 
 		 165 aa  333  5.999999999999999e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.298645  normal  0.0635461 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5339  oxidoreductase molybdopterin binding  49.4 
 
 		 169 aa  167  6e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.995742 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2345  oxidoreductase molybdopterin binding protein  46.34 
 
 		 170 aa  153  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.194853  normal  0.901736 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1559  oxidoreductase molybdopterin binding protein  37.25 
 
 		 168 aa  99.8  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2730  hypothetical protein  37.41 
 
 		 159 aa  96.3  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.122387 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1729  oxidoreductase molybdopterin binding  34.68 
 
 		 162 aa  87.4  8e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.640414 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0978  hypothetical protein  35 
 
 		 159 aa  80.1  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.757282  normal  0.549476 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0549  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  29.52 
 
 		 171 aa  70.1  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0192  molybdopterin oxidoreductase/precorrin-4 methylase  34.15 
 
 		 607 aa  60.5  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.620214  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8654  hypothetical protein  28.37 
 
 		 157 aa  52.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0191  precorrin-4 methylase  37.89 
 
 		 556 aa  51.2  0.000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0450  hypothetical protein  32.76 
 
 		 183 aa  50.4  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3171  oxidoreductase molybdopterin binding  31.69 
 
 		 220 aa  48.1  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0537179  normal  0.5179 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8530  oxidoreductase molybdopterin binding  30.15 
 
 		 349 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3761  oxidoreductase molybdopterin binding  31.33 
 
 		 523 aa  45.1  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0396091 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2471  oxidoreductase molybdopterin binding protein  34.75 
 
 		 197 aa  44.7  0.0007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3066  oxidoreductase molybdopterin binding protein  31.15 
 
 		 465 aa  43.5  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.419919  normal  0.473348 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0626  hypothetical protein  23.61 
 
 		 401 aa  43.5  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.110542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3394  twin-arginine translocation pathway signal  31.21 
 
 		 402 aa  42.7  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.115416  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5094  oxidoreductase molybdopterin binding  29.25 
 
 		 570 aa  42  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1262  oxidoreductase molybdopterin binding  25.53 
 
 		 367 aa  41.6  0.006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3706  hypothetical protein  28.23 
 
 		 163 aa  41.2  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.246828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4164  oxidoreductase molybdopterin binding  29.29 
 
 		 234 aa  40.8  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.430302 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>