26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2345 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_2345  oxidoreductase molybdopterin binding protein  100 
 
 
170 aa  340  5e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.194853  normal  0.901736 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5339  oxidoreductase molybdopterin binding  47.9 
 
 
169 aa  166  1e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.995742 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4047  oxidoreductase molybdopterin binding  46.34 
 
 
165 aa  153  1e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.298645  normal  0.0635461 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1559  oxidoreductase molybdopterin binding protein  36.48 
 
 
168 aa  97.1  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2730  hypothetical protein  39.85 
 
 
159 aa  86.7  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.122387 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1729  oxidoreductase molybdopterin binding  35.59 
 
 
162 aa  84.3  8e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.640414 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0978  hypothetical protein  37.04 
 
 
159 aa  82  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.757282  normal  0.549476 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0549  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  33.54 
 
 
171 aa  74.7  0.0000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0192  molybdopterin oxidoreductase/precorrin-4 methylase  38.85 
 
 
607 aa  68.9  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.620214  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3066  oxidoreductase molybdopterin binding protein  33.1 
 
 
465 aa  55.1  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.419919  normal  0.473348 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8654  hypothetical protein  27.86 
 
 
157 aa  54.7  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2471  oxidoreductase molybdopterin binding protein  31.21 
 
 
197 aa  52.4  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3171  oxidoreductase molybdopterin binding  32.86 
 
 
220 aa  48.5  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0537179  normal  0.5179 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4200  oxidoreductase molybdopterin binding  29.45 
 
 
220 aa  46.6  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.483422  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0191  precorrin-4 methylase  32.2 
 
 
556 aa  47.4  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0450  hypothetical protein  28.05 
 
 
183 aa  45.4  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3000  oxidoreductase molybdopterin binding protein  32.39 
 
 
198 aa  45.8  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3632  oxidoreductase, molybdopterin binding  28.29 
 
 
221 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.712603 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4409  hypothetical protein  26.9 
 
 
175 aa  45.1  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0361  molybdopterin-binding oxidoreductase  32.58 
 
 
231 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2579  oxidoreductase molybdopterin binding  33.09 
 
 
224 aa  43.5  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.666425 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0389  oxidoreductase molybdopterin binding  32.58 
 
 
231 aa  43.9  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0334  hypothetical protein  28.85 
 
 
170 aa  43.1  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0361924 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0626  hypothetical protein  25 
 
 
401 aa  42.7  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.110542  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3462  oxidoreductase molybdopterin binding  30.43 
 
 
220 aa  40.8  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.167102  normal  0.590309 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0290  oxidoreductase molybdopterin binding  31.65 
 
 
374 aa  40.4  0.01  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>