More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0191 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_0191  precorrin-4 methylase  100 
 
 
556 aa  1143    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0192  molybdopterin oxidoreductase/precorrin-4 methylase  41.47 
 
 
607 aa  429  1e-119  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.620214  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1250  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  30.12 
 
 
296 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0475  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  29.92 
 
 
270 aa  109  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0225719 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0851  precorrin-4 methylase-like protein  26.59 
 
 
294 aa  86.7  9e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000304158  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0312  precorrin-2 C20-methyltransferase  32.7 
 
 
224 aa  86.7  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1271  precorrin-2 C20-methyltransferase  32.32 
 
 
226 aa  76.6  0.0000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1375  precorrin-2 C20-methyltransferase  32.86 
 
 
227 aa  71.6  0.00000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0313  precorrin-4 C11-methyltransferase  25.51 
 
 
251 aa  69.7  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0385  cobalt-factor II C20-methyltransferase  29.81 
 
 
251 aa  68.9  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1012  precorrin-2 C20-methyltransferase  33.11 
 
 
238 aa  68.2  0.0000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2357  precorrin-4 C11-methyltransferase  27.31 
 
 
259 aa  67.4  0.0000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.342045  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04401  precorrin-2-C20-methyltransferase  27.39 
 
 
251 aa  67  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03851  precorrin-2 C20-methyltransferase  28.4 
 
 
273 aa  67  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2083  precorrin-2 methyltransferase  32.62 
 
 
252 aa  66.6  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3863  uroporphyrin-III C-methyltransferase  28.97 
 
 
258 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.707668  hitchhiker  0.0000644403 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1549  uroporphyrin-III C-methyltransferase  28.29 
 
 
258 aa  65.9  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1335  uroporphyrin-III C-methyltransferase  28.29 
 
 
258 aa  65.9  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1308  uroporphyrin-III C-methyltransferase  28.29 
 
 
258 aa  65.9  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1587  uroporphyrin-III C-methyltransferase  28.29 
 
 
258 aa  65.9  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00363233  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1445  uroporphyrin-III C-methyltransferase  28.29 
 
 
258 aa  65.9  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.51628  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1517  uroporphyrin-III C-methyltransferase  28.29 
 
 
258 aa  65.9  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.58633e-17 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1481  uroporphyrin-III C-methyltransferase  28.85 
 
 
258 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.822435  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04091  precorrin-2 C20-methyltransferase  29.45 
 
 
251 aa  65.5  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0627  cobalt-factor II C20-methyltransferase / precorrin-4 C11-methyltransferase  28.44 
 
 
242 aa  65.1  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1309  uroporphyrin-III C-methyltransferase  27.82 
 
 
258 aa  64.7  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0058  precorrin-2 C20-methyltransferase  25.65 
 
 
240 aa  63.9  0.000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1375  precorrin-4 C11-methyltransferase  26.61 
 
 
257 aa  63.2  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0286247 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2358  precorrin-4 C11-methyltransferase / cobalt-factor II C20-methyltransferase  27.01 
 
 
243 aa  63.5  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1721  Precorrin-4 C(11)-methyltransferase  25.94 
 
 
240 aa  63.5  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2189  uroporphyrin-III C-methyltransferase, putative  29.46 
 
 
259 aa  62.8  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24850  precorrin-2 C20-methyltransferase  28.25 
 
 
233 aa  62.4  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3131  uroporphyrin-III C-methyltransferase  27.94 
 
 
286 aa  62.4  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.530041  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1349  uroporphyrin-III C-methyltransferase  27.94 
 
 
258 aa  62.8  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.758533  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1237  cobalt-precorrin-2 C(20)-methyltransferase  25.14 
 
 
220 aa  62.4  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.433092  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1091  cobalt-factor II C20-methyltransferase / precorrin-2 C20-methyltransferase  25.7 
 
 
237 aa  62  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1556  precorrin-2 C20-methyltransferase  32.35 
 
 
233 aa  61.2  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0799  precorrin-2 C20-methyltransferase  27.66 
 
 
236 aa  60.8  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1342  precorrin-4 C11-methyltransferase  26.4 
 
 
254 aa  60.8  0.00000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1505  uroporphyrin-III C-methyltransferase  25.2 
 
 
257 aa  60.5  0.00000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1431  cobalt-precorrin-2 C(20)-methyltransferase  24.59 
 
 
220 aa  60.5  0.00000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0227456  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2735  precorrin-2 C20-methyltransferase  27.63 
 
 
236 aa  60.1  0.00000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000618723  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2995  precorrin-2 C20-methyltransferase  33.1 
 
 
236 aa  60.1  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0554  precorrin-2 C20-methyltransferase  26.18 
 
 
240 aa  59.7  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1887  precorrin-4 C11-methyltransferase  24.11 
 
 
262 aa  59.7  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0177135  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2610  precorrin-2 C20-methyltransferase  30.77 
 
 
233 aa  60.1  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1897  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  31.51 
 
 
244 aa  59.7  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0807274  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3502  precorrin-2 C20-methyltransferase  29.29 
 
 
234 aa  59.7  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000438049  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3409  precorrin-3 methyltransferase / precorrin-2 C20-methyltransferase  29.84 
 
 
526 aa  59.7  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0118  precorrin-3B C17-methyltransferase  26.22 
 
 
250 aa  59.3  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4641  uroporphyrin-III C-methyltransferase  22.4 
 
 
262 aa  59.3  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1714  precorrin-2 C20-methyltransferase  25.69 
 
 
236 aa  59.7  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1716  precorrin-4 C11-methyltransferase  26.4 
 
 
253 aa  59.3  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41563  uroporphyrin-III C-methyltransferase  27.39 
 
 
245 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0110837  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1747  precorrin-4 C11-methyltransferase  24.6 
 
 
254 aa  59.3  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.129763  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2286  uroporphyrin-III C-methyltransferase  27.74 
 
 
258 aa  58.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0702  precorrin-4 C11-methyltransferase  24.9 
 
 
244 aa  58.5  0.0000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2135  precorrin-2 C20-methyltransferase  30.49 
 
 
239 aa  58.5  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0352605 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2337  uroporphyrin-III C-methyltransferase  27.74 
 
 
258 aa  58.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0962  precorrin-4 C11-methyltransferase  23.11 
 
 
254 aa  58.2  0.0000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.6045  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3374  precorrin-2 C20-methyltransferase  33.33 
 
 
246 aa  58.2  0.0000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.299047 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0407  uroporphyrin-III C-methyltransferase  28.86 
 
 
259 aa  58.2  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2657  precorrin-2 C20-methyltransferase, putative  28.89 
 
 
222 aa  56.2  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0808  precorrin-4 C11-methyltransferase  27.81 
 
 
254 aa  56.6  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0629  precorrin-3B C17-methyltransferase  24.79 
 
 
266 aa  57  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0934  precorrin-4 C11-methyltransferase  27.06 
 
 
250 aa  56.2  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1297  precorrin-2 C20-methyltransferase  27.85 
 
 
247 aa  56.2  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3107  cobalt-factor II C20-methyltransferase / precorrin-2 C20-methyltransferase  29.58 
 
 
239 aa  56.6  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1148  uroporphyrin-III C-methyltransferase  25.2 
 
 
258 aa  56.2  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.660594  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2314  precorrin-2 C20-methyltransferase  27.34 
 
 
256 aa  55.8  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.144109 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2837  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  28.19 
 
 
503 aa  55.8  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.452302  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2207  uroporphyrin-III C-methyltransferase  28.82 
 
 
507 aa  55.5  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00880064  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2892  precorrin-3 methyltransferase / precorrin-2 C20-methyltransferase  28.91 
 
 
507 aa  56.2  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0614  precorrin-4 C11-methyltransferase  26.61 
 
 
249 aa  55.1  0.000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00328163  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1288  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  31.72 
 
 
244 aa  55.1  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1013  precorrin-4 C11-methyltransferase  22.17 
 
 
253 aa  55.1  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1313  uroporphyrin-III C-methyltransferase  28.33 
 
 
248 aa  55.5  0.000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.511728 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0934  precorrin-4 C11-methyltransferase  23.79 
 
 
254 aa  55.5  0.000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.23833  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1251  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  31.72 
 
 
244 aa  55.1  0.000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0286047  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2321  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  27.27 
 
 
259 aa  55.5  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.842595  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3542  precorrin-2 C20-methyltransferase  30.37 
 
 
236 aa  55.1  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1077  cobalt-precorrin-2 C(20)-methyltransferase  30.26 
 
 
203 aa  55.1  0.000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0620  precorrin-4 C11-methyltransferase protein  30.59 
 
 
271 aa  54.7  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.263132  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0476  precorrin-2 C20-methyltransferase  26.42 
 
 
256 aa  55.1  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5405  uroporphyrin-III C-methyltransferase  27.4 
 
 
252 aa  54.7  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2636  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  24.46 
 
 
256 aa  54.7  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1995  bifunctional uroporphyrinogen-III methyltransferase/uroporphyrinogen-III synthase  25.64 
 
 
474 aa  54.3  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.081337  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2144  bifunctional uroporphyrinogen-III methyltransferase/uroporphyrinogen-III synthase  25.64 
 
 
474 aa  54.3  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.310632  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0319  uroporphyrin-III C-methyltransferase  26.02 
 
 
497 aa  54.7  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1988  bifunctional uroporphyrinogen-III methyltransferase/uroporphyrinogen-III synthase  25 
 
 
474 aa  54.7  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1682  uroporphyrin-III C-methyltransferase  26.38 
 
 
264 aa  54.3  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.577733 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3697  uroporphyrin-III C-methyltransferase  28.51 
 
 
254 aa  54.3  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.748365 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2175  bifunctional uroporphyrinogen-III methyltransferase/uroporphyrinogen-III synthase  25.64 
 
 
474 aa  53.9  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1059  precorrin-4 methylase  26.05 
 
 
250 aa  53.9  0.000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0126824  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3325  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  25.2 
 
 
512 aa  53.9  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1968  bifunctional uroporphyrinogen-III methyltransferase/uroporphyrinogen-III synthase  25.64 
 
 
474 aa  53.9  0.000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.333519  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2711  precorrin-4 C11-methyltransferase  26.51 
 
 
248 aa  53.9  0.000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00379668  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04401  precorrin-2 C20-methyltransferase  23.5 
 
 
242 aa  53.9  0.000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.614023  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4048  siroheme synthase  27.31 
 
 
459 aa  53.9  0.000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3528  uroporphyrin-III C-methyltransferase  25.65 
 
 
245 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0179276  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>