More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3632 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007778  RPB_3632  oxidoreductase, molybdopterin binding  100 
 
 
221 aa  454  1e-127  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.712603 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1931  oxidoreductase molybdopterin binding  85.97 
 
 
221 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00345807  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2875  hypothetical protein  75.91 
 
 
220 aa  358  3e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.188731  normal  0.0133652 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1672  oxidoreductase, molybdopterin binding  76.47 
 
 
221 aa  355  2.9999999999999997e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.476748  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0323  oxidoreductase molybdopterin binding  64.71 
 
 
229 aa  304  5.0000000000000004e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.204614  normal  0.422647 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3171  oxidoreductase molybdopterin binding  66.97 
 
 
220 aa  303  1.0000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0537179  normal  0.5179 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3462  oxidoreductase molybdopterin binding  65.16 
 
 
220 aa  295  4e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.167102  normal  0.590309 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4200  oxidoreductase molybdopterin binding  62.84 
 
 
220 aa  291  6e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.483422  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1906  oxidoreductase, molybdopterin binding  52.88 
 
 
229 aa  237  9e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0593419  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3000  oxidoreductase molybdopterin binding protein  52.46 
 
 
198 aa  209  3e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2471  oxidoreductase molybdopterin binding protein  49.24 
 
 
197 aa  208  7e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0382  oxidoreductase molybdopterin binding  46.26 
 
 
228 aa  202  2e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.761682 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1055  oxidoreductase molybdopterin binding  48.72 
 
 
202 aa  202  3e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.44844  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2056  oxidoreductase molybdopterin binding  48.47 
 
 
197 aa  201  9e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4058  oxidoreductase molybdopterin binding  48.99 
 
 
200 aa  200  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.319932  normal  0.230858 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5298  oxidoreductase molybdopterin binding  48.74 
 
 
198 aa  199  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2080  oxidoreductase molybdopterin binding  48.47 
 
 
197 aa  199  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.404197  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4470  oxidoreductase molybdopterin binding  46.94 
 
 
201 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000629984 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1719  oxidoreductase, molybdopterin binding  50.54 
 
 
198 aa  197  1.0000000000000001e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.135393  normal  0.135819 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2603  oxidoreductase, molybdopterin binding  46.43 
 
 
198 aa  196  3e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.181564 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3614  oxidoreductase, molybdopterin binding  44.72 
 
 
196 aa  194  1e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.507139  normal  0.737608 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0923  oxidoreductase molybdopterin binding protein  48.48 
 
 
204 aa  193  2e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1055  oxidoreductase molybdopterin binding protein  50 
 
 
202 aa  192  3e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2409  oxidoreductase molybdopterin binding  46.35 
 
 
230 aa  192  4e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00600031  normal  0.457141 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5182  oxidoreductase molybdopterin binding  44.9 
 
 
201 aa  191  6e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.122307  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0122  molybdopterin binding oxidoreductase  43.08 
 
 
215 aa  191  1e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2682  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  48.65 
 
 
199 aa  189  2e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3360  oxidoreductase molybdopterin binding  48.15 
 
 
211 aa  188  4e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.46158 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0014  oxidoreductase molybdopterin binding  47.12 
 
 
230 aa  188  5.999999999999999e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.266694 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0604  oxidoreductase molybdopterin binding  48.51 
 
 
201 aa  188  5.999999999999999e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0108  oxidoreductase, molybdopterin binding  43.37 
 
 
201 aa  187  7e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.532472  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0340  oxidoreductase molybdopterin binding  47.31 
 
 
205 aa  186  3e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5578  oxidoreductase molybdopterin binding  49.18 
 
 
199 aa  185  4e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.275007  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6291  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  48.44 
 
 
202 aa  185  4e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.436126  normal  0.0912306 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2401  oxidoreductase molybdopterin binding  43.88 
 
 
201 aa  185  5e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.242306  normal  0.764459 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1040  hypothetical protein  47.85 
 
 
200 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.686628  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2124  oxidoreductase molybdopterin binding  43.37 
 
 
201 aa  183  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.188559  normal  0.117329 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4091  oxidoreductase molybdopterin binding  46.03 
 
 
199 aa  183  2.0000000000000003e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.228121 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2079  oxidoreductase molybdopterin binding  43.37 
 
 
201 aa  182  3e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.393771  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2564  oxidoreductase molybdopterin binding protein  44.39 
 
 
230 aa  179  2.9999999999999997e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2268  oxidoreductase molybdopterin binding  45.5 
 
 
196 aa  179  2.9999999999999997e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.954043  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4218  oxidoreductase molybdopterin binding  44.02 
 
 
231 aa  179  4e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3262  oxidoreductase molybdopterin binding protein  44.92 
 
 
199 aa  179  4e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.843102  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3399  oxidoreductase molybdopterin binding  42.35 
 
 
201 aa  179  4e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.647105  hitchhiker  0.00928486 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3725  oxidoreductase, molybdopterin binding  45.13 
 
 
200 aa  177  1e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0391  oxidoreductase molybdopterin binding  44.02 
 
 
231 aa  176  3e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0389  oxidoreductase molybdopterin binding  43.54 
 
 
231 aa  176  3e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2793  oxidoreductase molybdopterin binding  43.92 
 
 
206 aa  175  4e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0361  molybdopterin-binding oxidoreductase  44.5 
 
 
231 aa  175  5e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1086  oxidoreductase, molybdopterin binding  43.85 
 
 
205 aa  172  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.214927 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2341  oxidoreductase, molybdopterin binding  44.32 
 
 
221 aa  171  9e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0559328  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0237  oxidoreductase molybdopterin binding  38.83 
 
 
189 aa  169  4e-41  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.164235  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6040  oxidoreductase molybdopterin binding  46.03 
 
 
208 aa  166  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.233498  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5386  oxidoreductase molybdopterin binding protein  42.86 
 
 
243 aa  166  2.9999999999999998e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.406653  normal  0.237779 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3045  oxidoreductase molybdopterin binding  44.44 
 
 
202 aa  165  4e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00029473 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3038  oxidoreductase molybdopterin binding protein  42.02 
 
 
207 aa  161  6e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00373285  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1471  oxidoreductase molybdopterin binding  40 
 
 
196 aa  159  2e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000177918  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1488  oxidoreductase molybdopterin binding  40.44 
 
 
218 aa  157  8e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.725964  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3101  oxidoreductase molybdopterin binding  42.41 
 
 
205 aa  155  4e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2760  putative molybdopterin-containing oxidoreductase  39.57 
 
 
206 aa  154  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.12409  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3124  oxidoreductase molybdopterin binding protein  45.26 
 
 
213 aa  152  2.9999999999999998e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.837634  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1785  oxidoreductase molybdopterin binding protein  39.9 
 
 
200 aa  150  1e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0938  oxidoreductase molybdopterin binding protein  36.41 
 
 
199 aa  146  2.0000000000000003e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.378305  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1907  oxidoreductase molybdopterin binding  39.36 
 
 
201 aa  144  1e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.121605  hitchhiker  0.000642174 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0362  oxidoreductase, molybdopterin binding  34.59 
 
 
200 aa  141  8e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.659486  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3571  oxidoreductase molybdopterin binding protein  39.13 
 
 
232 aa  140  9.999999999999999e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1597  oxidoreductase molybdopterin binding  35.38 
 
 
201 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2571  oxidoreductase molybdopterin binding protein  34.87 
 
 
204 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1229  oxidoreductase molybdopterin binding  34.44 
 
 
220 aa  126  3e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00326003  normal  0.661197 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0309  oxidoreductase molybdopterin binding  37.43 
 
 
202 aa  123  2e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.74907  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1263  oxidoreductase, molybdopterin binding  38.89 
 
 
204 aa  122  3e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.164998 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0833  oxidoreductase, molybdopterin binding  36.96 
 
 
204 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.358869 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6515  oxidoreductase molybdopterin binding  38.31 
 
 
227 aa  108  5e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.576413  normal  0.0950137 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7397  oxidoreductase molybdopterin binding  38.46 
 
 
242 aa  102  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.71227  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0424  oxidoreductase molybdopterin binding  36.08 
 
 
233 aa  101  8e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161573  normal  0.811394 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1771  oxidoreductase molybdopterin binding protein  38.82 
 
 
532 aa  99  5e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0572452  normal  0.0309546 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0290  oxidoreductase molybdopterin binding  38 
 
 
374 aa  97.8  1e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0650  oxidoreductase, molybdopterin binding  32.26 
 
 
237 aa  94.7  9e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0972302  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3066  oxidoreductase molybdopterin binding protein  32.26 
 
 
465 aa  93.6  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.419919  normal  0.473348 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0584  oxidoreductase molybdopterin binding protein  29.94 
 
 
501 aa  91.7  9e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1443  oxidoreductase, molybdopterin binding  35.56 
 
 
520 aa  87.4  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.63286  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1480  oxidoreductase molybdopterin binding  31.06 
 
 
270 aa  87.4  2e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.68285  normal  0.18047 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5094  oxidoreductase molybdopterin binding  32.94 
 
 
570 aa  87  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4346  oxidoreductase, molybdopterin binding  37.09 
 
 
233 aa  86.3  4e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.315393  normal  0.221875 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0643  oxidoreductase molybdopterin binding protein  31.37 
 
 
209 aa  85.5  5e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4816  oxidoreductase molybdopterin binding  34.59 
 
 
258 aa  85.9  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.553663  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0541  oxidoreductase, molybdopterin binding  32.89 
 
 
263 aa  85.1  7e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1366  oxidoreductase, molybdopterin binding  36.89 
 
 
155 aa  84.7  9e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.000000322712  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2730  oxidoreductase, molybdopterin binding  32.89 
 
 
263 aa  84.3  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.195614 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0297  oxidoreductase molybdopterin binding  33.56 
 
 
263 aa  84  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2994  oxidoreductase, molybdopterin binding  30.46 
 
 
239 aa  84  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1388  oxidoreductase molybdopterin binding protein  34.78 
 
 
515 aa  83.6  0.000000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3134  oxidoreductase molybdopterin binding  31.54 
 
 
263 aa  84  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1697  oxidoreductase molybdopterin binding  32.39 
 
 
249 aa  84  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64540  hypothetical protein  32.67 
 
 
255 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0309  oxidoreductase molybdopterin binding  33.56 
 
 
263 aa  83.6  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.261244  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2568  oxidoreductase molybdopterin binding  33.33 
 
 
258 aa  83.2  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0385834  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5604  hypothetical protein  32 
 
 
255 aa  82  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1495  oxidoreductase molybdopterin binding  30.67 
 
 
255 aa  82  0.000000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4320  oxidoreductase, molybdopterin binding  32.31 
 
 
505 aa  81.6  0.000000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>