More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1495 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_1495  oxidoreductase molybdopterin binding  100 
 
 
255 aa  530  1e-149  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3725  oxidoreductase molybdopterin binding  84.31 
 
 
255 aa  459  9.999999999999999e-129  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3371  oxidoreductase, molybdopterin binding  79.01 
 
 
256 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0860075  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1752  oxidoreductase, molybdopterin-binding protein  74.06 
 
 
258 aa  380  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.175218  normal  0.213675 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4930  oxidoreductase molybdopterin binding  71.95 
 
 
258 aa  379  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.73484  normal  0.226199 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3600  oxidoreductase, molybdopterin-binding protein  79.53 
 
 
215 aa  373  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64540  hypothetical protein  70.59 
 
 
255 aa  371  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5604  hypothetical protein  70.2 
 
 
255 aa  369  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1510  oxidoreductase molybdopterin binding  61.86 
 
 
262 aa  315  3e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.832441  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0541  oxidoreductase, molybdopterin binding  60.7 
 
 
263 aa  305  4.0000000000000004e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4334  oxidoreductase, molybdopterin binding  58.85 
 
 
262 aa  304  8.000000000000001e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.868418  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2730  oxidoreductase, molybdopterin binding  60.7 
 
 
263 aa  304  8.000000000000001e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.195614 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1108  oxidoreductase, molybdopterin binding  59.26 
 
 
262 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.906624  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1108  oxidoreductase molybdopterin binding  56.32 
 
 
262 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.255199  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0744  oxidoreductase, molybdopterin binding  57.09 
 
 
262 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1225  oxidoreductase, molybdopterin binding  57.09 
 
 
262 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1198  oxidoreductase molybdopterin binding  56.7 
 
 
262 aa  302  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0452128  normal  0.688101 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1697  oxidoreductase molybdopterin binding  59.57 
 
 
249 aa  300  2e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2840  oxidoreductase, molybdopterin-binding  59.92 
 
 
263 aa  299  2e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1201  oxidoreductase molybdopterin binding protein  58.12 
 
 
259 aa  300  2e-80  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2666  oxidoreductase molybdopterin binding  59.07 
 
 
263 aa  299  3e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3085  oxidoreductase, molybdopterin-binding  59.92 
 
 
263 aa  298  4e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1201  oxidoreductase, molybdopterin-binding  59.92 
 
 
263 aa  298  5e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.463291  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1405  oxidoreductase, molybdopterin-binding  59.92 
 
 
263 aa  298  5e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0666  oxidoreductase, molybdopterin-binding  59.92 
 
 
263 aa  298  5e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.540729  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1533  oxidoreductase, molybdopterin-binding  59.92 
 
 
263 aa  298  5e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0486  oxidoreductase, molybdopterin-binding  59.92 
 
 
263 aa  298  5e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1400  oxidoreductase, molybdopterin-binding  59.92 
 
 
263 aa  298  6e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2177  putative oxidoreductase, molybdopterin binding  55.47 
 
 
258 aa  297  1e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.60597 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0620  hypothetical protein  58.9 
 
 
257 aa  289  2e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2751  oxidoreductase molybdopterin binding  57.87 
 
 
249 aa  284  9e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0587289 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6422  oxidoreductase molybdopterin binding  56.96 
 
 
263 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.603539  normal  0.600006 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6764  oxidoreductase molybdopterin binding  55.25 
 
 
257 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1518  oxidoreductase, molybdopterin binding  59.83 
 
 
263 aa  280  1e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5020  oxidoreductase molybdopterin binding  59.07 
 
 
258 aa  279  2e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.159564 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2990  oxidoreductase molybdopterin binding  58.05 
 
 
263 aa  279  3e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.587027  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3134  oxidoreductase molybdopterin binding  57.63 
 
 
263 aa  277  1e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2592  oxidoreductase, molybdopterin binding  59.75 
 
 
262 aa  275  4e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.938521  normal  0.743537 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2994  oxidoreductase, molybdopterin binding  57.2 
 
 
239 aa  272  3e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0309  oxidoreductase molybdopterin binding  56.9 
 
 
263 aa  269  2.9999999999999997e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.261244  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0297  oxidoreductase molybdopterin binding  56.49 
 
 
263 aa  267  1e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0338  putative oxidoreductase molybdopterin binding  51.68 
 
 
260 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.0092485  normal  0.0273242 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0333  twin-arginine translocation pathway signal  53.65 
 
 
259 aa  265  5e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0223  oxidoreductase molybdopterin binding  51.48 
 
 
259 aa  265  8e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.613741  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0242  twin-arginine translocation pathway signal  52.12 
 
 
259 aa  260  1e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.297118  normal  0.0333661 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3598  oxidoreductase, molybdopterin binding  50.63 
 
 
261 aa  260  1e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0487  twin-arginine translocation pathway signal  51.69 
 
 
259 aa  258  6e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.254321  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3286  oxidoreductase molybdopterin binding  49.79 
 
 
241 aa  258  9e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.18954  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4897  oxidoreductase molybdopterin binding  51.07 
 
 
241 aa  246  2e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00490947  decreased coverage  0.000741335 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0961  oxidoreductase molybdopterin binding  46.46 
 
 
263 aa  243  1.9999999999999999e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4816  oxidoreductase molybdopterin binding  38.74 
 
 
258 aa  165  6.9999999999999995e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.553663  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0958  oxidoreductase, molybdopterin binding  39.92 
 
 
240 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2568  oxidoreductase molybdopterin binding  38.74 
 
 
258 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0385834  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2349  hypothetical protein  38.96 
 
 
256 aa  158  8e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.672728  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3628  oxidoreductase molybdopterin binding  39.66 
 
 
234 aa  154  1e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0640094 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0864  oxidoreductase molybdopterin binding  37.3 
 
 
259 aa  154  2e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0018  oxidoreductase, molybdopterin-binding  37.55 
 
 
262 aa  153  2.9999999999999998e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0015  oxidoreductase, molybdopterin-binding  37.55 
 
 
262 aa  153  2.9999999999999998e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.642429  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1625  oxidoreductase molybdopterin binding  36.95 
 
 
256 aa  152  4e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.464814  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4106  oxidoreductase molybdopterin binding  36.74 
 
 
262 aa  152  4e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0563  oxidoreductase, molybdopterin binding  39.2 
 
 
251 aa  150  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.276964  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4346  oxidoreductase, molybdopterin binding  43.48 
 
 
233 aa  150  3e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.315393  normal  0.221875 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4154  oxidoreductase molybdopterin binding  36.48 
 
 
247 aa  143  3e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.177098  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1812  oxidoreductase, molybdopterin binding  41 
 
 
249 aa  143  3e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.218509  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1638  oxidoreductase molybdopterin binding  36.8 
 
 
234 aa  142  7e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.934019  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3845  oxidoreductase molybdopterin binding  35.8 
 
 
247 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.624438  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2311  molybdopterin-binding oxidoreductase  36.8 
 
 
234 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1560  oxidoreductase molybdopterin binding  35.5 
 
 
234 aa  139  6e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4164  oxidoreductase molybdopterin binding  36.25 
 
 
234 aa  137  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.430302 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4302  oxidoreductase molybdopterin binding  36.07 
 
 
247 aa  137  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0491  oxidoreductase, molybdopterin binding  35.34 
 
 
256 aa  137  2e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.727181  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3943  oxidoreductase, molybdopterin binding  34.01 
 
 
253 aa  115  6e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.646893 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4244  oxidoreductase molybdopterin binding protein  30.92 
 
 
266 aa  113  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.978688  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2730  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  38.86 
 
 
495 aa  112  7.000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0908687  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0650  oxidoreductase, molybdopterin binding  31.7 
 
 
237 aa  102  5e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0972302  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0938  oxidoreductase molybdopterin binding protein  33.33 
 
 
199 aa  102  7e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.378305  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0584  oxidoreductase molybdopterin binding protein  34.88 
 
 
501 aa  97.1  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1564  putative sulfite oxidase subunit YedY  30.95 
 
 
311 aa  97.4  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0532333  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2817  putative sulfite oxidase subunit YedY  31.13 
 
 
301 aa  95.1  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.333802  normal  0.368407 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0987  putative sulfite oxidase subunit YedY  32.46 
 
 
331 aa  94.7  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.273453  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1410  putative sulfite oxidase subunit YedY  28.57 
 
 
301 aa  91.7  9e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3509  oxidoreductase molybdopterin binding  34.95 
 
 
318 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0077  putative sulfite oxidase subunit YedY  28.57 
 
 
301 aa  91.7  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0663  oxidoreductase, molybdopterin binding  33.11 
 
 
229 aa  91.7  1e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000387868  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0290  oxidoreductase molybdopterin binding  35.4 
 
 
374 aa  91.3  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00718  putative sulfite oxidase subunit YedY  32.98 
 
 
322 aa  91.3  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0719411  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3632  oxidoreductase molybdopterin binding  53.66 
 
 
315 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.363586 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3680  putative sulfite oxidase subunit YedY  31.05 
 
 
331 aa  90.9  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0844677  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6515  oxidoreductase molybdopterin binding  32.95 
 
 
227 aa  90.5  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.576413  normal  0.0950137 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3309  oxidoreductase molybdopterin binding  53.66 
 
 
315 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.62654 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1134  putative sulfite oxidase subunit YedY  32.46 
 
 
336 aa  90.1  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.843909  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1229  oxidoreductase molybdopterin binding  33.54 
 
 
220 aa  89.4  5e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00326003  normal  0.661197 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1008  oxidoreductase molybdopterin binding  35.33 
 
 
319 aa  89  6e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.700197  normal  0.289957 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0713  putative sulfite oxidase subunit YedY  31.41 
 
 
332 aa  89  7e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.348188 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3981  putative sulfite oxidase subunit YedY  31.1 
 
 
326 aa  88.6  8e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.678928 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0382  oxidoreductase molybdopterin binding  30.46 
 
 
228 aa  87.8  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.761682 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0362  oxidoreductase, molybdopterin binding  28.03 
 
 
200 aa  87.8  1e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.659486  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0316  oxidoreductase, molybdopterin binding  33.12 
 
 
517 aa  87.8  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0424  oxidoreductase molybdopterin binding  31.74 
 
 
233 aa  87.4  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161573  normal  0.811394 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0667  putative sulfite oxidase subunit YedY  30.89 
 
 
332 aa  87  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00975982 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>