More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_2401 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_2401  oxidoreductase molybdopterin binding  100 
 
 
201 aa  410  1e-114  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.242306  normal  0.764459 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2124  oxidoreductase molybdopterin binding  99 
 
 
201 aa  407  1e-113  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.188559  normal  0.117329 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2079  oxidoreductase molybdopterin binding  95.52 
 
 
201 aa  395  1e-109  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.393771  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5182  oxidoreductase molybdopterin binding  82.09 
 
 
201 aa  342  2e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.122307  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4470  oxidoreductase molybdopterin binding  80.1 
 
 
201 aa  335  3.9999999999999995e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000629984 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3399  oxidoreductase molybdopterin binding  76.62 
 
 
201 aa  327  8e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.647105  hitchhiker  0.00928486 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0108  oxidoreductase, molybdopterin binding  65.17 
 
 
201 aa  282  3.0000000000000004e-75  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.532472  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0122  molybdopterin binding oxidoreductase  63.68 
 
 
215 aa  272  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1055  oxidoreductase molybdopterin binding  57.77 
 
 
202 aa  235  3e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.44844  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3262  oxidoreductase molybdopterin binding protein  56.22 
 
 
199 aa  226  2e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.843102  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3360  oxidoreductase molybdopterin binding  56.22 
 
 
211 aa  224  1e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.46158 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3725  oxidoreductase, molybdopterin binding  52.76 
 
 
200 aa  223  1e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4091  oxidoreductase molybdopterin binding  57.29 
 
 
199 aa  219  9.999999999999999e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.228121 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6291  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  54.23 
 
 
202 aa  219  3e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.436126  normal  0.0912306 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1055  oxidoreductase molybdopterin binding protein  56 
 
 
202 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5578  oxidoreductase molybdopterin binding  54.73 
 
 
199 aa  212  2.9999999999999995e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.275007  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2268  oxidoreductase molybdopterin binding  52.79 
 
 
196 aa  211  4.9999999999999996e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.954043  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0923  oxidoreductase molybdopterin binding protein  54.46 
 
 
204 aa  204  5e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0604  oxidoreductase molybdopterin binding  53 
 
 
201 aa  204  9e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3171  oxidoreductase molybdopterin binding  50.27 
 
 
220 aa  201  5e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0537179  normal  0.5179 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3462  oxidoreductase molybdopterin binding  47.72 
 
 
220 aa  201  8e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.167102  normal  0.590309 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0323  oxidoreductase molybdopterin binding  49.73 
 
 
229 aa  192  4e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.204614  normal  0.422647 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0340  oxidoreductase molybdopterin binding  52.46 
 
 
205 aa  190  1e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4200  oxidoreductase molybdopterin binding  47.21 
 
 
220 aa  187  8e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.483422  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1672  oxidoreductase, molybdopterin binding  44.67 
 
 
221 aa  187  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.476748  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2875  hypothetical protein  46.99 
 
 
220 aa  185  4e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.188731  normal  0.0133652 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3632  oxidoreductase, molybdopterin binding  43.88 
 
 
221 aa  185  4e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.712603 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1931  oxidoreductase molybdopterin binding  44.86 
 
 
221 aa  184  7e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00345807  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2341  oxidoreductase, molybdopterin binding  45.05 
 
 
221 aa  183  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0559328  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2471  oxidoreductase molybdopterin binding protein  44.44 
 
 
197 aa  183  1.0000000000000001e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3614  oxidoreductase, molybdopterin binding  41.88 
 
 
196 aa  180  1e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.507139  normal  0.737608 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2080  oxidoreductase molybdopterin binding  41.05 
 
 
197 aa  177  5.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.404197  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2682  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  48.11 
 
 
199 aa  177  1e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3000  oxidoreductase molybdopterin binding protein  45.11 
 
 
198 aa  176  2e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5298  oxidoreductase molybdopterin binding  43.16 
 
 
198 aa  176  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0382  oxidoreductase molybdopterin binding  44.62 
 
 
228 aa  174  6e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.761682 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2603  oxidoreductase, molybdopterin binding  40.53 
 
 
198 aa  174  8e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.181564 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2056  oxidoreductase molybdopterin binding  40 
 
 
197 aa  172  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4058  oxidoreductase molybdopterin binding  40.51 
 
 
200 aa  171  6.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.319932  normal  0.230858 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1719  oxidoreductase, molybdopterin binding  43.01 
 
 
198 aa  170  1e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.135393  normal  0.135819 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3038  oxidoreductase molybdopterin binding protein  44.81 
 
 
207 aa  165  5e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00373285  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3045  oxidoreductase molybdopterin binding  44.44 
 
 
202 aa  160  1e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00029473 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1906  oxidoreductase, molybdopterin binding  41.92 
 
 
229 aa  160  1e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0593419  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2793  oxidoreductase molybdopterin binding  40.62 
 
 
206 aa  157  9e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3101  oxidoreductase molybdopterin binding  42.42 
 
 
205 aa  157  1e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1086  oxidoreductase, molybdopterin binding  41.8 
 
 
205 aa  157  1e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.214927 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3124  oxidoreductase molybdopterin binding protein  43.55 
 
 
213 aa  156  3e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.837634  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1785  oxidoreductase molybdopterin binding protein  42.62 
 
 
200 aa  153  2e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0014  oxidoreductase molybdopterin binding  39.01 
 
 
230 aa  152  5e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.266694 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1040  hypothetical protein  39.67 
 
 
200 aa  151  8e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.686628  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1488  oxidoreductase molybdopterin binding  40.1 
 
 
218 aa  150  8.999999999999999e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.725964  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3571  oxidoreductase molybdopterin binding protein  41.76 
 
 
232 aa  150  1e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1471  oxidoreductase molybdopterin binding  38.1 
 
 
196 aa  150  2e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000177918  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5386  oxidoreductase molybdopterin binding protein  39.34 
 
 
243 aa  149  2e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.406653  normal  0.237779 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2409  oxidoreductase molybdopterin binding  37.02 
 
 
230 aa  149  4e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00600031  normal  0.457141 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6040  oxidoreductase molybdopterin binding  39.78 
 
 
208 aa  144  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.233498  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2760  putative molybdopterin-containing oxidoreductase  40.22 
 
 
206 aa  142  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.12409  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0938  oxidoreductase molybdopterin binding protein  37.36 
 
 
199 aa  140  9.999999999999999e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.378305  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0237  oxidoreductase molybdopterin binding  37.97 
 
 
189 aa  140  9.999999999999999e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.164235  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1907  oxidoreductase molybdopterin binding  37.7 
 
 
201 aa  140  9.999999999999999e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.121605  hitchhiker  0.000642174 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1597  oxidoreductase molybdopterin binding  36.22 
 
 
201 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4218  oxidoreductase molybdopterin binding  37.57 
 
 
231 aa  139  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2564  oxidoreductase molybdopterin binding protein  34.81 
 
 
230 aa  139  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2571  oxidoreductase molybdopterin binding protein  36.22 
 
 
204 aa  138  4.999999999999999e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0389  oxidoreductase molybdopterin binding  38.12 
 
 
231 aa  136  2e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0361  molybdopterin-binding oxidoreductase  37.57 
 
 
231 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0391  oxidoreductase molybdopterin binding  37.02 
 
 
231 aa  132  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0362  oxidoreductase, molybdopterin binding  32.97 
 
 
200 aa  126  2.0000000000000002e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.659486  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1229  oxidoreductase molybdopterin binding  34.07 
 
 
220 aa  115  3e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00326003  normal  0.661197 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1263  oxidoreductase, molybdopterin binding  35.16 
 
 
204 aa  98.2  8e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.164998 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0833  oxidoreductase, molybdopterin binding  32.78 
 
 
204 aa  97.1  2e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.358869 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0309  oxidoreductase molybdopterin binding  39.02 
 
 
202 aa  92.8  3e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.74907  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0424  oxidoreductase molybdopterin binding  32.28 
 
 
233 aa  90.1  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161573  normal  0.811394 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4320  oxidoreductase, molybdopterin binding  31.96 
 
 
505 aa  80.9  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6515  oxidoreductase molybdopterin binding  34.78 
 
 
227 aa  79  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.576413  normal  0.0950137 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2026  oxidoreductase, molybdopterin binding  30.36 
 
 
505 aa  79  0.00000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.246614  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7397  oxidoreductase molybdopterin binding  32.35 
 
 
242 aa  78.2  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.71227  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0079  oxidoreductase molybdopterin binding protein  31.21 
 
 
511 aa  77.4  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.256372  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1480  oxidoreductase molybdopterin binding  27.16 
 
 
270 aa  76.6  0.0000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.68285  normal  0.18047 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1366  oxidoreductase, molybdopterin binding  37.78 
 
 
155 aa  76.6  0.0000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.000000322712  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1801  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  30.77 
 
 
512 aa  76.3  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.13158  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1848  oxidoreductase, molybdopterin binding  30.77 
 
 
512 aa  76.3  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.45213 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5094  oxidoreductase molybdopterin binding  29.11 
 
 
570 aa  76.3  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1782  oxidoreductase, molybdopterin binding  30.77 
 
 
512 aa  76.3  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.133498  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4544  oxidoreductase molybdopterin binding protein  31.06 
 
 
512 aa  75.5  0.0000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3134  oxidoreductase molybdopterin binding  28.48 
 
 
263 aa  75.1  0.0000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2990  oxidoreductase molybdopterin binding  28.48 
 
 
263 aa  73.9  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.587027  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1388  oxidoreductase molybdopterin binding protein  33.33 
 
 
515 aa  73.6  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26273  predicted protein  39.67 
 
 
601 aa  73.6  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00964514  normal  0.0789022 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1771  oxidoreductase molybdopterin binding protein  30.77 
 
 
532 aa  72.8  0.000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0572452  normal  0.0309546 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0327  oxidoreductase molybdopterin binding  29.94 
 
 
554 aa  72.4  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3761  oxidoreductase molybdopterin binding  33.33 
 
 
523 aa  72.4  0.000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0396091 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1764  oxidoreductase molybdopterin binding  28.07 
 
 
505 aa  72  0.000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6422  oxidoreductase molybdopterin binding  25.43 
 
 
263 aa  71.6  0.000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.603539  normal  0.600006 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3066  oxidoreductase molybdopterin binding protein  31.01 
 
 
465 aa  71.2  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.419919  normal  0.473348 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1697  oxidoreductase molybdopterin binding  27.92 
 
 
249 aa  70.9  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2513  oxidoreductase molybdopterin binding  28 
 
 
528 aa  70.9  0.00000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0309  oxidoreductase molybdopterin binding  26.32 
 
 
263 aa  70.5  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.261244  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0333  twin-arginine translocation pathway signal  25.48 
 
 
259 aa  70.1  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1107  oxidoreductase, molybdopterin binding  26.97 
 
 
207 aa  70.1  0.00000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.266904  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>