More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0340 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_0340  oxidoreductase molybdopterin binding  100 
 
 
205 aa  421  1e-117  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2793  oxidoreductase molybdopterin binding  57.67 
 
 
206 aa  229  3e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1086  oxidoreductase, molybdopterin binding  55.56 
 
 
205 aa  220  9.999999999999999e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.214927 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2341  oxidoreductase, molybdopterin binding  54.1 
 
 
221 aa  212  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0559328  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2682  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  54.17 
 
 
199 aa  207  9e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3171  oxidoreductase molybdopterin binding  49.46 
 
 
220 aa  198  5e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0537179  normal  0.5179 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3462  oxidoreductase molybdopterin binding  49.21 
 
 
220 aa  198  6e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.167102  normal  0.590309 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1055  oxidoreductase molybdopterin binding  54.01 
 
 
202 aa  197  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.44844  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3101  oxidoreductase molybdopterin binding  51.32 
 
 
205 aa  195  3e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3045  oxidoreductase molybdopterin binding  52.91 
 
 
202 aa  195  4.0000000000000005e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00029473 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0923  oxidoreductase molybdopterin binding protein  55.08 
 
 
204 aa  194  5.000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3262  oxidoreductase molybdopterin binding protein  52.91 
 
 
199 aa  194  1e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.843102  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2401  oxidoreductase molybdopterin binding  52.46 
 
 
201 aa  190  1e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.242306  normal  0.764459 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2124  oxidoreductase molybdopterin binding  52.46 
 
 
201 aa  189  2e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.188559  normal  0.117329 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3360  oxidoreductase molybdopterin binding  51.74 
 
 
211 aa  189  2.9999999999999997e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.46158 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1040  hypothetical protein  50.81 
 
 
200 aa  187  9e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.686628  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5182  oxidoreductase molybdopterin binding  48.04 
 
 
201 aa  187  1e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.122307  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2079  oxidoreductase molybdopterin binding  53.01 
 
 
201 aa  187  1e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.393771  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3399  oxidoreductase molybdopterin binding  51.09 
 
 
201 aa  186  1e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.647105  hitchhiker  0.00928486 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3632  oxidoreductase, molybdopterin binding  47.31 
 
 
221 aa  186  2e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.712603 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4470  oxidoreductase molybdopterin binding  48.04 
 
 
201 aa  185  3e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000629984 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6291  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  52.6 
 
 
202 aa  184  8e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.436126  normal  0.0912306 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4091  oxidoreductase molybdopterin binding  53.3 
 
 
199 aa  183  2.0000000000000003e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.228121 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1055  oxidoreductase molybdopterin binding protein  51.49 
 
 
202 aa  182  3e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6040  oxidoreductase molybdopterin binding  50.26 
 
 
208 aa  182  4.0000000000000006e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.233498  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1931  oxidoreductase molybdopterin binding  45.74 
 
 
221 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00345807  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3000  oxidoreductase molybdopterin binding protein  50 
 
 
198 aa  182  4.0000000000000006e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2268  oxidoreductase molybdopterin binding  50.26 
 
 
196 aa  179  2.9999999999999997e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.954043  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1672  oxidoreductase, molybdopterin binding  46.24 
 
 
221 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.476748  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0382  oxidoreductase molybdopterin binding  47.57 
 
 
228 aa  179  2.9999999999999997e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.761682 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2056  oxidoreductase molybdopterin binding  45.16 
 
 
197 aa  179  4e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1719  oxidoreductase, molybdopterin binding  51.61 
 
 
198 aa  178  4.999999999999999e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.135393  normal  0.135819 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2080  oxidoreductase molybdopterin binding  45.16 
 
 
197 aa  177  9e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.404197  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5578  oxidoreductase molybdopterin binding  52.72 
 
 
199 aa  177  1e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.275007  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4200  oxidoreductase molybdopterin binding  46.2 
 
 
220 aa  176  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.483422  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2875  hypothetical protein  46.77 
 
 
220 aa  176  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.188731  normal  0.0133652 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2471  oxidoreductase molybdopterin binding protein  47.12 
 
 
197 aa  174  7e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0108  oxidoreductase, molybdopterin binding  48.99 
 
 
201 aa  174  8e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.532472  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5298  oxidoreductase molybdopterin binding  45 
 
 
198 aa  173  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0323  oxidoreductase molybdopterin binding  47.31 
 
 
229 aa  172  3.9999999999999995e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.204614  normal  0.422647 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3038  oxidoreductase molybdopterin binding protein  48.37 
 
 
207 aa  171  5e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00373285  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3725  oxidoreductase, molybdopterin binding  47.85 
 
 
200 aa  171  5.999999999999999e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4058  oxidoreductase molybdopterin binding  46.32 
 
 
200 aa  171  9e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.319932  normal  0.230858 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0122  molybdopterin binding oxidoreductase  49.74 
 
 
215 aa  169  3e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0604  oxidoreductase molybdopterin binding  48.95 
 
 
201 aa  164  5.9999999999999996e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1906  oxidoreductase, molybdopterin binding  45.99 
 
 
229 aa  164  5.9999999999999996e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0593419  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1471  oxidoreductase molybdopterin binding  42.16 
 
 
196 aa  163  1.0000000000000001e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000177918  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3614  oxidoreductase, molybdopterin binding  42.47 
 
 
196 aa  162  2.0000000000000002e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.507139  normal  0.737608 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5386  oxidoreductase molybdopterin binding protein  44.32 
 
 
243 aa  163  2.0000000000000002e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.406653  normal  0.237779 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2603  oxidoreductase, molybdopterin binding  42.5 
 
 
198 aa  162  3e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.181564 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2760  putative molybdopterin-containing oxidoreductase  42.35 
 
 
206 aa  161  5.0000000000000005e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.12409  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0237  oxidoreductase molybdopterin binding  38.83 
 
 
189 aa  160  2e-38  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.164235  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0014  oxidoreductase molybdopterin binding  43.17 
 
 
230 aa  157  1e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.266694 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2571  oxidoreductase molybdopterin binding protein  39.18 
 
 
204 aa  155  3e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1597  oxidoreductase molybdopterin binding  38.27 
 
 
201 aa  153  2e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3571  oxidoreductase molybdopterin binding protein  42.93 
 
 
232 aa  150  1e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2409  oxidoreductase molybdopterin binding  41.08 
 
 
230 aa  149  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00600031  normal  0.457141 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4218  oxidoreductase molybdopterin binding  44.09 
 
 
231 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1785  oxidoreductase molybdopterin binding protein  42.33 
 
 
200 aa  150  2e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1907  oxidoreductase molybdopterin binding  43.48 
 
 
201 aa  149  3e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.121605  hitchhiker  0.000642174 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3124  oxidoreductase molybdopterin binding protein  42.35 
 
 
213 aa  149  4e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.837634  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0389  oxidoreductase molybdopterin binding  43.48 
 
 
231 aa  147  8e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2564  oxidoreductase molybdopterin binding protein  40.11 
 
 
230 aa  145  3e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0391  oxidoreductase molybdopterin binding  43.48 
 
 
231 aa  145  3e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1488  oxidoreductase molybdopterin binding  40.98 
 
 
218 aa  142  3e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.725964  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0361  molybdopterin-binding oxidoreductase  42.39 
 
 
231 aa  142  3e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0938  oxidoreductase molybdopterin binding protein  35.91 
 
 
199 aa  139  3.9999999999999997e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.378305  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0362  oxidoreductase, molybdopterin binding  36.02 
 
 
200 aa  134  7.000000000000001e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.659486  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1229  oxidoreductase molybdopterin binding  36.81 
 
 
220 aa  118  6e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00326003  normal  0.661197 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0309  oxidoreductase molybdopterin binding  34.43 
 
 
202 aa  107  2e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.74907  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0833  oxidoreductase, molybdopterin binding  35.87 
 
 
204 aa  105  3e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.358869 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1263  oxidoreductase, molybdopterin binding  35.68 
 
 
204 aa  100  1e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.164998 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0290  oxidoreductase molybdopterin binding  37.84 
 
 
374 aa  97.1  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1771  oxidoreductase molybdopterin binding protein  38.22 
 
 
532 aa  95.9  3e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0572452  normal  0.0309546 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1107  oxidoreductase, molybdopterin binding  33.56 
 
 
207 aa  92  5e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.266904  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5905  oxidoreductase molybdopterin binding protein  37.25 
 
 
508 aa  92  6e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.767401 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3407  oxidoreductase, molybdopterin binding  35.29 
 
 
525 aa  91.7  7e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0643  oxidoreductase molybdopterin binding protein  30.26 
 
 
209 aa  90.9  1e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4230  oxidoreductase molybdopterin binding  36.53 
 
 
531 aa  90.9  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.14088 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1480  oxidoreductase molybdopterin binding  32.2 
 
 
270 aa  90.5  1e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.68285  normal  0.18047 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0327  oxidoreductase molybdopterin binding  36.91 
 
 
554 aa  90.5  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3761  oxidoreductase molybdopterin binding  36.6 
 
 
523 aa  87.8  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0396091 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0650  oxidoreductase, molybdopterin binding  32.19 
 
 
237 aa  86.7  2e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0972302  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3840  oxidoreductase, molybdopterin binding  35.93 
 
 
531 aa  87  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2651  oxidoreductase molybdopterin binding protein  35.03 
 
 
509 aa  84.7  9e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.813391  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5094  oxidoreductase molybdopterin binding  35.33 
 
 
570 aa  83.6  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0663  oxidoreductase, molybdopterin binding  32.47 
 
 
229 aa  82  0.000000000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000387868  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3066  oxidoreductase molybdopterin binding protein  30.2 
 
 
465 aa  82  0.000000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.419919  normal  0.473348 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1445  oxidoreductase molybdopterin binding  35.95 
 
 
538 aa  81.6  0.000000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000237131 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3188  oxidoreductase molybdopterin binding  32.68 
 
 
528 aa  81.6  0.000000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0160  oxidoreductase molybdopterin binding  32.68 
 
 
531 aa  81.3  0.000000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6515  oxidoreductase molybdopterin binding  32.43 
 
 
227 aa  80.9  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.576413  normal  0.0950137 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4544  oxidoreductase molybdopterin binding protein  33.71 
 
 
512 aa  81.3  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1664  oxidoreductase molybdopterin binding  33.95 
 
 
524 aa  80.9  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.545601  normal  0.282195 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0079  oxidoreductase molybdopterin binding protein  33.56 
 
 
511 aa  80.1  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.256372  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1764  oxidoreductase molybdopterin binding  30.93 
 
 
505 aa  79.7  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3527  oxidoreductase molybdopterin binding  33.11 
 
 
534 aa  79.3  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.80252  normal  0.883441 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1388  oxidoreductase molybdopterin binding protein  35.44 
 
 
515 aa  79.3  0.00000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0584  oxidoreductase molybdopterin binding protein  26.79 
 
 
501 aa  79  0.00000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2513  oxidoreductase molybdopterin binding  28.74 
 
 
528 aa  78.6  0.00000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>