More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_64540 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_64540  hypothetical protein  100 
 
 
255 aa  524  1e-148  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5604  hypothetical protein  98.82 
 
 
255 aa  519  1e-146  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3371  oxidoreductase, molybdopterin binding  70.7 
 
 
256 aa  402  1e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0860075  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3725  oxidoreductase molybdopterin binding  70.59 
 
 
255 aa  398  9.999999999999999e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1495  oxidoreductase molybdopterin binding  70.59 
 
 
255 aa  400  9.999999999999999e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4930  oxidoreductase molybdopterin binding  68.13 
 
 
258 aa  369  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.73484  normal  0.226199 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1752  oxidoreductase, molybdopterin-binding protein  67.33 
 
 
258 aa  368  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.175218  normal  0.213675 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3600  oxidoreductase, molybdopterin-binding protein  75.35 
 
 
215 aa  362  2e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2840  oxidoreductase, molybdopterin-binding  59.92 
 
 
263 aa  310  1e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2177  putative oxidoreductase, molybdopterin binding  57.37 
 
 
258 aa  306  1.0000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.60597 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1201  oxidoreductase, molybdopterin-binding  59.92 
 
 
263 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.463291  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3085  oxidoreductase, molybdopterin-binding  59.92 
 
 
263 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0666  oxidoreductase, molybdopterin-binding  59.92 
 
 
263 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.540729  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0486  oxidoreductase, molybdopterin-binding  59.92 
 
 
263 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1400  oxidoreductase, molybdopterin-binding  59.92 
 
 
263 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1533  oxidoreductase, molybdopterin-binding  59.92 
 
 
263 aa  305  3e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1405  oxidoreductase, molybdopterin-binding  59.92 
 
 
263 aa  305  3e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1108  oxidoreductase molybdopterin binding  58.3 
 
 
262 aa  305  4.0000000000000004e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.255199  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4334  oxidoreductase, molybdopterin binding  57.89 
 
 
262 aa  303  1.0000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.868418  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0744  oxidoreductase, molybdopterin binding  58.3 
 
 
262 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1225  oxidoreductase, molybdopterin binding  58.3 
 
 
262 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1510  oxidoreductase molybdopterin binding  57.63 
 
 
262 aa  302  3.0000000000000004e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.832441  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1108  oxidoreductase, molybdopterin binding  59.07 
 
 
262 aa  302  3.0000000000000004e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.906624  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0541  oxidoreductase, molybdopterin binding  59.83 
 
 
263 aa  301  6.000000000000001e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2666  oxidoreductase molybdopterin binding  57.38 
 
 
263 aa  301  6.000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2730  oxidoreductase, molybdopterin binding  57.74 
 
 
263 aa  300  1e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.195614 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1198  oxidoreductase molybdopterin binding  57.49 
 
 
262 aa  300  1e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0452128  normal  0.688101 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1697  oxidoreductase molybdopterin binding  57.55 
 
 
249 aa  289  3e-77  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5020  oxidoreductase molybdopterin binding  56.03 
 
 
258 aa  288  8e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.159564 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1201  oxidoreductase molybdopterin binding protein  50.79 
 
 
259 aa  287  1e-76  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3286  oxidoreductase molybdopterin binding  55.17 
 
 
241 aa  286  2e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.18954  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1518  oxidoreductase, molybdopterin binding  58.9 
 
 
263 aa  284  8e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0338  putative oxidoreductase molybdopterin binding  54.77 
 
 
260 aa  282  5.000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.0092485  normal  0.0273242 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0620  hypothetical protein  56.3 
 
 
257 aa  280  1e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0333  twin-arginine translocation pathway signal  55.65 
 
 
259 aa  280  1e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0223  oxidoreductase molybdopterin binding  53.56 
 
 
259 aa  280  2e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.613741  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6422  oxidoreductase molybdopterin binding  54.62 
 
 
263 aa  278  4e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.603539  normal  0.600006 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2751  oxidoreductase molybdopterin binding  54.72 
 
 
249 aa  278  7e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0587289 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0487  twin-arginine translocation pathway signal  55.04 
 
 
259 aa  277  1e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.254321  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2592  oxidoreductase, molybdopterin binding  57.63 
 
 
262 aa  274  8e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.938521  normal  0.743537 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6764  oxidoreductase molybdopterin binding  53.91 
 
 
257 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2990  oxidoreductase molybdopterin binding  54.66 
 
 
263 aa  269  4e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.587027  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0242  twin-arginine translocation pathway signal  53.71 
 
 
259 aa  266  2e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.297118  normal  0.0333661 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3134  oxidoreductase molybdopterin binding  53.81 
 
 
263 aa  266  2.9999999999999995e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3598  oxidoreductase, molybdopterin binding  51.06 
 
 
261 aa  266  2.9999999999999995e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4897  oxidoreductase molybdopterin binding  56.03 
 
 
241 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00490947  decreased coverage  0.000741335 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2994  oxidoreductase, molybdopterin binding  55.56 
 
 
239 aa  260  1e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0309  oxidoreductase molybdopterin binding  54.59 
 
 
263 aa  258  9e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.261244  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0297  oxidoreductase molybdopterin binding  54.15 
 
 
263 aa  255  4e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0961  oxidoreductase molybdopterin binding  48.54 
 
 
263 aa  243  1.9999999999999999e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2349  hypothetical protein  40.96 
 
 
256 aa  170  2e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.672728  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0958  oxidoreductase, molybdopterin binding  40 
 
 
240 aa  166  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0563  oxidoreductase, molybdopterin binding  41.04 
 
 
251 aa  159  3e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.276964  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1625  oxidoreductase molybdopterin binding  37.35 
 
 
256 aa  154  9e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.464814  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1638  oxidoreductase molybdopterin binding  40.52 
 
 
234 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.934019  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0864  oxidoreductase molybdopterin binding  36.86 
 
 
259 aa  149  3e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4816  oxidoreductase molybdopterin binding  35.57 
 
 
258 aa  150  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.553663  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1560  oxidoreductase molybdopterin binding  39.66 
 
 
234 aa  149  3e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1812  oxidoreductase, molybdopterin binding  38.43 
 
 
249 aa  149  4e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.218509  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4106  oxidoreductase molybdopterin binding  35.52 
 
 
262 aa  149  5e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2568  oxidoreductase molybdopterin binding  35.18 
 
 
258 aa  149  6e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0385834  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3628  oxidoreductase molybdopterin binding  40.25 
 
 
234 aa  148  7e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0640094 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2311  molybdopterin-binding oxidoreductase  40.52 
 
 
234 aa  148  8e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4164  oxidoreductase molybdopterin binding  38.75 
 
 
234 aa  145  6e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.430302 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0015  oxidoreductase, molybdopterin-binding  35.55 
 
 
262 aa  145  7.0000000000000006e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.642429  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0018  oxidoreductase, molybdopterin-binding  35.55 
 
 
262 aa  145  8.000000000000001e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4346  oxidoreductase, molybdopterin binding  42.51 
 
 
233 aa  144  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.315393  normal  0.221875 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0491  oxidoreductase, molybdopterin binding  36.28 
 
 
256 aa  139  3e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.727181  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4154  oxidoreductase molybdopterin binding  33.2 
 
 
247 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.177098  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3845  oxidoreductase molybdopterin binding  32.81 
 
 
247 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.624438  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4302  oxidoreductase molybdopterin binding  32.02 
 
 
247 aa  124  1e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3943  oxidoreductase, molybdopterin binding  32.84 
 
 
253 aa  115  6e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.646893 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4244  oxidoreductase molybdopterin binding protein  32.37 
 
 
266 aa  113  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.978688  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2730  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  41.61 
 
 
495 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0908687  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0650  oxidoreductase, molybdopterin binding  32.7 
 
 
237 aa  107  2e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0972302  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1564  putative sulfite oxidase subunit YedY  32.6 
 
 
311 aa  107  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0532333  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0938  oxidoreductase molybdopterin binding protein  33.33 
 
 
199 aa  106  5e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.378305  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0987  putative sulfite oxidase subunit YedY  35.08 
 
 
331 aa  102  8e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.273453  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0290  oxidoreductase molybdopterin binding  40.49 
 
 
374 aa  101  1e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0584  oxidoreductase molybdopterin binding protein  35.67 
 
 
501 aa  101  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0693  putative sulfite oxidase subunit YedY  33.51 
 
 
332 aa  99  7e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0713  putative sulfite oxidase subunit YedY  32.98 
 
 
332 aa  98.2  1e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.348188 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0667  putative sulfite oxidase subunit YedY  32.46 
 
 
332 aa  97.4  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00975982 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3482  putative sulfite oxidase subunit YedY  32.7 
 
 
331 aa  96.7  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0362  putative sulfite oxidase subunit YedY  32.7 
 
 
331 aa  96.7  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.24616  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0775  putative sulfite oxidase subunit YedY  33.51 
 
 
332 aa  96.7  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.746485  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2724  putative sulfite oxidase subunit YedY  32.7 
 
 
331 aa  96.7  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0383  putative sulfite oxidase subunit YedY  32.7 
 
 
331 aa  96.7  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4676  putative sulfite oxidase subunit YedY  31.44 
 
 
341 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0107716  hitchhiker  0.00951249 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00718  putative sulfite oxidase subunit YedY  34.55 
 
 
322 aa  96.7  4e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0719411  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0284  putative sulfite oxidase subunit YedY  33.01 
 
 
331 aa  96.3  4e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.212861  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0349  putative sulfite oxidase subunit YedY  28.16 
 
 
331 aa  95.9  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0106094 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0302  putative sulfite oxidase subunit YedY  32.69 
 
 
344 aa  95.5  6e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0311  putative sulfite oxidase subunit YedY  32.23 
 
 
331 aa  95.5  7e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.810304  normal  0.333907 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1134  putative sulfite oxidase subunit YedY  32.98 
 
 
336 aa  94.7  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.843909  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3033  putative sulfite oxidase subunit YedY  32.98 
 
 
331 aa  94.4  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3608  putative sulfite oxidase subunit YedY  31.41 
 
 
331 aa  94  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0264425  hitchhiker  0.0000000362399 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2804  putative sulfite oxidase subunit YedY  28.04 
 
 
331 aa  94  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.321388  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1013  putative sulfite oxidase subunit YedY  31.52 
 
 
313 aa  93.6  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.300604 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1360  putative sulfite oxidase subunit YedY  30.69 
 
 
315 aa  93.6  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0715758  normal  0.838202 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>