More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1697 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1697  oxidoreductase molybdopterin binding  100 
 
 		 249 aa  513  1e-144  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2751  oxidoreductase molybdopterin binding  83.13 
 
 		 249 aa  431  1e-120  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0587289 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0541  oxidoreductase, molybdopterin binding  61.07 
 
 		 263 aa  319  1.9999999999999998e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2730  oxidoreductase, molybdopterin binding  60.66 
 
 		 263 aa  317  1e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.195614 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1510  oxidoreductase molybdopterin binding  58.37 
 
 		 262 aa  310  1e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.832441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4930  oxidoreductase molybdopterin binding  59.32 
 
 		 258 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.73484  normal  0.226199 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3134  oxidoreductase molybdopterin binding  62.86 
 
 		 263 aa  305  5.0000000000000004e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1752  oxidoreductase, molybdopterin-binding protein  58.9 
 
 		 258 aa  305  5.0000000000000004e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.175218  normal  0.213675 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1201  oxidoreductase molybdopterin binding protein  60.43 
 
 		 259 aa  303  1.0000000000000001e-81  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2990  oxidoreductase molybdopterin binding  60.41 
 
 		 263 aa  299  2e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.587027  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1495  oxidoreductase molybdopterin binding  59.57 
 
 		 255 aa  300  2e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1518  oxidoreductase, molybdopterin binding  61.94 
 
 		 263 aa  299  3e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1198  oxidoreductase molybdopterin binding  58.06 
 
 		 262 aa  297  1e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0452128  normal  0.688101 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0744  oxidoreductase, molybdopterin binding  58.47 
 
 		 262 aa  297  1e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1225  oxidoreductase, molybdopterin binding  58.47 
 
 		 262 aa  297  1e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0297  oxidoreductase molybdopterin binding  61.98 
 
 		 263 aa  295  7e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0309  oxidoreductase molybdopterin binding  61.98 
 
 		 263 aa  294  8e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.261244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1533  oxidoreductase, molybdopterin-binding  58.23 
 
 		 263 aa  293  1e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1405  oxidoreductase, molybdopterin-binding  58.23 
 
 		 263 aa  293  1e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0620  hypothetical protein  60.64 
 
 		 257 aa  293  2e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3085  oxidoreductase, molybdopterin-binding  57.83 
 
 		 263 aa  292  3e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0486  oxidoreductase, molybdopterin-binding  57.83 
 
 		 263 aa  292  4e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1400  oxidoreductase, molybdopterin-binding  57.83 
 
 		 263 aa  292  4e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1201  oxidoreductase, molybdopterin-binding  57.83 
 
 		 263 aa  292  4e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.463291  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0666  oxidoreductase, molybdopterin-binding  57.83 
 
 		 263 aa  292  4e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.540729  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3725  oxidoreductase molybdopterin binding  57.02 
 
 		 255 aa  290  1e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3371  oxidoreductase, molybdopterin binding  55.74 
 
 		 256 aa  290  2e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0860075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1108  oxidoreductase, molybdopterin binding  56.45 
 
 		 262 aa  289  4e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.906624  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2592  oxidoreductase, molybdopterin binding  64.02 
 
 		 262 aa  288  5.0000000000000004e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.938521  normal  0.743537 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4334  oxidoreductase, molybdopterin binding  56.45 
 
 		 262 aa  288  6e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.868418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1108  oxidoreductase molybdopterin binding  56.45 
 
 		 262 aa  288  6e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.255199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2840  oxidoreductase, molybdopterin-binding  56.63 
 
 		 263 aa  288  7e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6422  oxidoreductase molybdopterin binding  57.63 
 
 		 263 aa  287  1e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.603539  normal  0.600006 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2177  putative oxidoreductase, molybdopterin binding  55.65 
 
 		 258 aa  287  1e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.60597 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2666  oxidoreductase molybdopterin binding  55.2 
 
 		 263 aa  285  2.9999999999999996e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6764  oxidoreductase molybdopterin binding  57.02 
 
 		 257 aa  279  4e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5020  oxidoreductase molybdopterin binding  57.43 
 
 		 258 aa  275  4e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.159564 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0242  twin-arginine translocation pathway signal  52.26 
 
 		 259 aa  275  4e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.297118  normal  0.0333661 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0487  twin-arginine translocation pathway signal  56.96 
 
 		 259 aa  275  6e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.254321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0223  oxidoreductase molybdopterin binding  53.31 
 
 		 259 aa  274  9e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.613741  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0333  twin-arginine translocation pathway signal  54.96 
 
 		 259 aa  273  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0338  putative oxidoreductase molybdopterin binding  54.27 
 
 		 260 aa  271  5.000000000000001e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.0092485  normal  0.0273242 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3600  oxidoreductase, molybdopterin-binding protein  57.01 
 
 		 215 aa  271  7e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64540  hypothetical protein  59.07 
 
 		 255 aa  268  7e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5604  hypothetical protein  58.6 
 
 		 255 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2994  oxidoreductase, molybdopterin binding  54.66 
 
 		 239 aa  261  6.999999999999999e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0961  oxidoreductase molybdopterin binding  50.43 
 
 		 263 aa  258  9e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3598  oxidoreductase, molybdopterin binding  51.08 
 
 		 261 aa  255  4e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3286  oxidoreductase molybdopterin binding  49.34 
 
 		 241 aa  246  2e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.18954  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4897  oxidoreductase molybdopterin binding  48.48 
 
 		 241 aa  225  6e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00490947  decreased coverage  0.000741335 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0864  oxidoreductase molybdopterin binding  41.43 
 
 		 259 aa  177  2e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4816  oxidoreductase molybdopterin binding  40.47 
 
 		 258 aa  176  4e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.553663  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2568  oxidoreductase molybdopterin binding  40 
 
 		 258 aa  174  8e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0385834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1812  oxidoreductase, molybdopterin binding  41.37 
 
 		 249 aa  169  3e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.218509  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0563  oxidoreductase, molybdopterin binding  42.57 
 
 		 251 aa  168  8e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.276964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3628  oxidoreductase molybdopterin binding  43.91 
 
 		 234 aa  165  6.9999999999999995e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0640094 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2349  hypothetical protein  40.64 
 
 		 256 aa  165  6.9999999999999995e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.672728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0015  oxidoreductase, molybdopterin-binding  40.47 
 
 		 262 aa  165  8e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.642429  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0018  oxidoreductase, molybdopterin-binding  40.47 
 
 		 262 aa  164  9e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4106  oxidoreductase molybdopterin binding  38.76 
 
 		 262 aa  161  9e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0491  oxidoreductase, molybdopterin binding  41.15 
 
 		 256 aa  157  2e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.727181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3845  oxidoreductase molybdopterin binding  40.66 
 
 		 247 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.624438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1638  oxidoreductase molybdopterin binding  40.43 
 
 		 234 aa  155  6e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.934019  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1560  oxidoreductase molybdopterin binding  40 
 
 		 234 aa  155  6e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4154  oxidoreductase molybdopterin binding  40.5 
 
 		 247 aa  153  2e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.177098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2311  molybdopterin-binding oxidoreductase  40.43 
 
 		 234 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4302  oxidoreductase molybdopterin binding  38.15 
 
 		 247 aa  151  1e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4346  oxidoreductase, molybdopterin binding  43.27 
 
 		 233 aa  149  6e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.315393  normal  0.221875 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1625  oxidoreductase molybdopterin binding  33.33 
 
 		 256 aa  145  5e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.464814  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0958  oxidoreductase, molybdopterin binding  36.4 
 
 		 240 aa  144  1e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4164  oxidoreductase molybdopterin binding  35.29 
 
 		 234 aa  128  9.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.430302 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3943  oxidoreductase, molybdopterin binding  36.22 
 
 		 253 aa  123  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.646893 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3509  oxidoreductase molybdopterin binding  42.35 
 
 		 318 aa  105  9e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3309  oxidoreductase molybdopterin binding  41.21 
 
 		 315 aa  104  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.62654 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3632  oxidoreductase molybdopterin binding  41.21 
 
 		 315 aa  105  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.363586 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1008  oxidoreductase molybdopterin binding  39.51 
 
 		 319 aa  100  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.700197  normal  0.289957 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2730  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  33.5 
 
 		 495 aa  99.4  4e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0908687  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4244  oxidoreductase molybdopterin binding protein  29.44 
 
 		 266 aa  94.4  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.978688  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0424  oxidoreductase molybdopterin binding  34.13 
 
 		 233 aa  94  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161573  normal  0.811394 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0316  oxidoreductase, molybdopterin binding  35.22 
 
 		 517 aa  93.2  4e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0349  putative sulfite oxidase subunit YedY  27.04 
 
 		 331 aa  91.7  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0106094 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3769  oxidoreductase molybdopterin binding protein  33.33 
 
 		 328 aa  90.1  3e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7397  oxidoreductase molybdopterin binding  33.16 
 
 		 242 aa  90.5  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.71227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0650  oxidoreductase, molybdopterin binding  34.75 
 
 		 237 aa  89.7  4e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0972302  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1007  putative sulfite oxidase subunit YedY  26.7 
 
 		 318 aa  89.7  4e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0460692  normal  0.0531219 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2804  putative sulfite oxidase subunit YedY  26.84 
 
 		 331 aa  89.4  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.321388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4674  putative sulfite oxidase subunit YedY  28.47 
 
 		 337 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000277637  hitchhiker  0.00000119887 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0284  putative sulfite oxidase subunit YedY  31.74 
 
 		 331 aa  87.4  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.212861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3571  oxidoreductase molybdopterin binding protein  32.19 
 
 		 232 aa  87.8  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4676  putative sulfite oxidase subunit YedY  28.83 
 
 		 341 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0107716  hitchhiker  0.00951249 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0987  putative sulfite oxidase subunit YedY  29.15 
 
 		 331 aa  86.7  3e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.273453  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0584  oxidoreductase molybdopterin binding protein  30.92 
 
 		 501 aa  86.7  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1564  putative sulfite oxidase subunit YedY  34.23 
 
 		 311 aa  86.3  4e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0532333  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2724  putative sulfite oxidase subunit YedY  31.14 
 
 		 331 aa  85.9  5e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4540  putative sulfite oxidase subunit YedY  28.47 
 
 		 337 aa  85.9  5e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000750768  hitchhiker  0.0010274 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0302  putative sulfite oxidase subunit YedY  29.21 
 
 		 344 aa  85.9  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0383  putative sulfite oxidase subunit YedY  31.14 
 
 		 331 aa  85.9  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3608  putative sulfite oxidase subunit YedY  26.02 
 
 		 331 aa  85.9  6e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0264425  hitchhiker  0.0000000362399 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0362  putative sulfite oxidase subunit YedY  31.14 
 
 		 331 aa  85.9  6e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.24616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0311  putative sulfite oxidase subunit YedY  29.21 
 
 		 331 aa  85.5  7e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.810304  normal  0.333907 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>